Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CPQ8

Protein Details
Accession B0CPQ8    Localization Confidence High Confidence Score 17.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
239-259KATKEEKTKRKQGKGGWWMKEBasic
278-314GGSRAVKKAIEKKQKKVSQKEKKSRPYPPSRKKRRVEBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
242-253KEEKTKRKQGKG
281-314RAVKKAIEKKQKKVSQKEKKSRPYPPSRKKRRVE
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009292  RRP36  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:1990904  C:ribonucleoprotein complex  
GO:0000469  P:cleavage involved in rRNA processing  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_300621  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06102  RRP36  
Amino Acid Sequences MKDLSLDEDSDGVDAPRAAQWVDDNDTSGSGESAAEDSSTEASSSRLKTLQSNLSNLPLGALRKAQRVLKQVEPISDSDDSSGDELEDDTGESESEHEPGLGSSKGKEWSVKPRFDISKRSSKHAPTEVTSKRPVTRRRTVVEVPKLVARDPRFLPTAGEFAEEKFQKQYAFLTDAHKTELRTLRENLKRARKFLASSPREHREEREQEVYRLEQAVKRTESLVNKDRLDQVLREALGKATKEEKTKRKQGKGGWWMKESDKRELLTQARYEALAADGGSRAVKKAIEKKQKKVSQKEKKSRPYPPSRKKRRVE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.08
2 0.09
3 0.1
4 0.11
5 0.1
6 0.11
7 0.13
8 0.17
9 0.22
10 0.21
11 0.21
12 0.21
13 0.21
14 0.21
15 0.18
16 0.14
17 0.09
18 0.09
19 0.07
20 0.08
21 0.07
22 0.07
23 0.06
24 0.07
25 0.08
26 0.09
27 0.08
28 0.08
29 0.09
30 0.15
31 0.16
32 0.18
33 0.19
34 0.2
35 0.25
36 0.31
37 0.39
38 0.37
39 0.4
40 0.39
41 0.39
42 0.39
43 0.34
44 0.28
45 0.21
46 0.19
47 0.16
48 0.2
49 0.19
50 0.23
51 0.28
52 0.31
53 0.35
54 0.41
55 0.44
56 0.45
57 0.5
58 0.48
59 0.46
60 0.44
61 0.39
62 0.36
63 0.31
64 0.25
65 0.19
66 0.17
67 0.15
68 0.13
69 0.12
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.06
74 0.06
75 0.05
76 0.05
77 0.05
78 0.05
79 0.05
80 0.07
81 0.07
82 0.08
83 0.08
84 0.07
85 0.07
86 0.07
87 0.09
88 0.09
89 0.09
90 0.09
91 0.12
92 0.14
93 0.15
94 0.18
95 0.19
96 0.3
97 0.37
98 0.39
99 0.38
100 0.43
101 0.49
102 0.5
103 0.55
104 0.5
105 0.53
106 0.51
107 0.54
108 0.53
109 0.5
110 0.52
111 0.5
112 0.46
113 0.39
114 0.46
115 0.45
116 0.43
117 0.43
118 0.39
119 0.38
120 0.43
121 0.49
122 0.48
123 0.53
124 0.55
125 0.54
126 0.58
127 0.59
128 0.6
129 0.58
130 0.51
131 0.43
132 0.39
133 0.37
134 0.31
135 0.31
136 0.24
137 0.21
138 0.21
139 0.23
140 0.22
141 0.22
142 0.22
143 0.18
144 0.18
145 0.13
146 0.14
147 0.11
148 0.1
149 0.15
150 0.14
151 0.14
152 0.13
153 0.14
154 0.13
155 0.13
156 0.14
157 0.11
158 0.14
159 0.15
160 0.18
161 0.19
162 0.19
163 0.22
164 0.22
165 0.19
166 0.23
167 0.28
168 0.27
169 0.29
170 0.31
171 0.38
172 0.42
173 0.48
174 0.49
175 0.53
176 0.53
177 0.52
178 0.54
179 0.47
180 0.44
181 0.46
182 0.49
183 0.42
184 0.45
185 0.5
186 0.52
187 0.52
188 0.51
189 0.47
190 0.46
191 0.48
192 0.48
193 0.49
194 0.45
195 0.42
196 0.44
197 0.41
198 0.32
199 0.28
200 0.25
201 0.18
202 0.19
203 0.24
204 0.23
205 0.23
206 0.23
207 0.26
208 0.29
209 0.34
210 0.39
211 0.38
212 0.38
213 0.4
214 0.41
215 0.39
216 0.37
217 0.3
218 0.26
219 0.25
220 0.25
221 0.23
222 0.2
223 0.19
224 0.2
225 0.2
226 0.19
227 0.2
228 0.24
229 0.31
230 0.39
231 0.48
232 0.54
233 0.64
234 0.71
235 0.75
236 0.78
237 0.78
238 0.8
239 0.81
240 0.81
241 0.77
242 0.69
243 0.64
244 0.62
245 0.63
246 0.56
247 0.53
248 0.48
249 0.43
250 0.43
251 0.47
252 0.46
253 0.44
254 0.42
255 0.36
256 0.32
257 0.31
258 0.28
259 0.21
260 0.18
261 0.12
262 0.1
263 0.09
264 0.08
265 0.09
266 0.1
267 0.1
268 0.1
269 0.11
270 0.13
271 0.2
272 0.3
273 0.4
274 0.5
275 0.58
276 0.66
277 0.75
278 0.82
279 0.84
280 0.86
281 0.86
282 0.87
283 0.9
284 0.92
285 0.91
286 0.94
287 0.93
288 0.92
289 0.91
290 0.91
291 0.91
292 0.92
293 0.92
294 0.93