Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2YVY6

Protein Details
Accession M2YVY6    Localization Confidence Medium Confidence Score 13.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-219SEPTRRSSAHFRRNRNEPTPHydrophilic
347-366LEVAAKRRRRENVRKLRSATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
352-358KRRRREN
Subcellular Location(s) nucl 12.5, cyto_nucl 10.5, cyto 7.5, plas 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
IPR019515  VPS54_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
KEGG pfj:MYCFIDRAFT_57099  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
PF10475  Vps54_N  
Amino Acid Sequences MAFSTRFSLDSPTDLTSPSSQTSAYPFPTSTQHGRPSSSRRMSRRGSTASQMSVGSIGGSLDIQTRRRSTVRETSQNAISTLLQPPIVRTGLLPHTHASAAAAGFKPPTTKDIPPVTLTNVPHVPPDHFRDYLNRIGPLFESFQRGSAESEQHAWLKKDKELEKAEALERRLSRDNSAPTTPVSPNALRHAPISPLQRPSEPTRRSSAHFRRNRNEPTPLSTIPNVYFDEDFHLENPRTFDVVSERSEIVRPPPGSQQAEQKSSNGAPQPPRKALATNAILQEKLSWYMDTVEVHLINSISTASSGFFAALGSLKELQTEAEESVAKIQSLRDDLRRLDKEVAVSGLEVAAKRRRRENVRKLRSATAQVQSVVENIVKADELVDAGAYSEAADQMDRVGRLVCGNQEPGQDNRELIDLRPLRALQGLDSGLQELQLRIGTGYAQSFASILMKDLREHVARVPSDQTLKRWSRQRGIPPTYMETDDSFRKDLLSALNGLARAGHTAPAAAAYREAVNKEVKSIIRRSLPSSSDDDADSMVSTSTRGGSRPSQQEKSVILSRNLRALDAEGAEKLFVSVYTSISEALRRVSTQTKIILDVTSQMQAPESKAPQRSPSEQGPNEHFAAGMKSDSMNAVREEITQALDMSSLLGQAVDTAQTQIGRVLKVRNEQAIRLPLHLFLRYFTLNRLFADECEAVSGHGGNVLKGIINAQLSGFVQVLGTAEAERTASLLENDSWNAEDFSEKDNIVLQRILASMSSDSPEWAKITTQIWEEPGPPPNANGDASPEQSNGTNDKPTNNGTTPATGGKAAVKPAYIDESRYVLVSSAASLLSIIDTFLSLTSWLPSMTSQISTSLLEVLRAFNSRTNQMILGAGATRVGGLKNITTKHLALASQALGFVIALIPYMRECIRRHIPAGQGGILAEFDKTKRLYQDHQSGVHDKLVDIMTSRSAFHIKTMRNVDFDKPGTDDKPNAYMEQFTKETLVLYRTLSRHLSEVDVGMIMRQIFATVREQWTQAYDDLDVKTRAGENRLLRDVELLEAKLGKLEGFEPVGREISGVVKAKVSLEDESPKKAEEEEKKTPEPTSEAFFDQDEEKADGGRQDEGEKKGDDGKT
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.24
2 0.26
3 0.24
4 0.25
5 0.24
6 0.22
7 0.19
8 0.2
9 0.25
10 0.27
11 0.28
12 0.27
13 0.26
14 0.27
15 0.32
16 0.37
17 0.38
18 0.41
19 0.46
20 0.47
21 0.51
22 0.56
23 0.6
24 0.64
25 0.67
26 0.68
27 0.67
28 0.73
29 0.75
30 0.76
31 0.76
32 0.73
33 0.68
34 0.66
35 0.64
36 0.57
37 0.52
38 0.44
39 0.35
40 0.28
41 0.23
42 0.16
43 0.11
44 0.08
45 0.06
46 0.06
47 0.06
48 0.11
49 0.16
50 0.19
51 0.25
52 0.27
53 0.32
54 0.36
55 0.39
56 0.42
57 0.49
58 0.55
59 0.59
60 0.61
61 0.61
62 0.63
63 0.61
64 0.54
65 0.45
66 0.36
67 0.3
68 0.28
69 0.25
70 0.21
71 0.19
72 0.2
73 0.23
74 0.22
75 0.19
76 0.16
77 0.21
78 0.26
79 0.29
80 0.29
81 0.25
82 0.27
83 0.27
84 0.26
85 0.21
86 0.16
87 0.14
88 0.17
89 0.16
90 0.15
91 0.16
92 0.16
93 0.18
94 0.17
95 0.21
96 0.22
97 0.25
98 0.32
99 0.38
100 0.41
101 0.42
102 0.43
103 0.43
104 0.44
105 0.42
106 0.4
107 0.35
108 0.33
109 0.32
110 0.32
111 0.31
112 0.31
113 0.37
114 0.36
115 0.34
116 0.35
117 0.39
118 0.42
119 0.46
120 0.44
121 0.39
122 0.34
123 0.34
124 0.34
125 0.3
126 0.29
127 0.23
128 0.25
129 0.23
130 0.26
131 0.26
132 0.26
133 0.27
134 0.28
135 0.29
136 0.24
137 0.27
138 0.26
139 0.29
140 0.32
141 0.3
142 0.32
143 0.32
144 0.34
145 0.4
146 0.41
147 0.46
148 0.48
149 0.5
150 0.48
151 0.49
152 0.5
153 0.46
154 0.45
155 0.43
156 0.38
157 0.39
158 0.41
159 0.39
160 0.38
161 0.41
162 0.45
163 0.43
164 0.44
165 0.4
166 0.35
167 0.38
168 0.35
169 0.3
170 0.3
171 0.27
172 0.27
173 0.32
174 0.33
175 0.29
176 0.3
177 0.29
178 0.26
179 0.3
180 0.34
181 0.33
182 0.36
183 0.38
184 0.39
185 0.42
186 0.47
187 0.52
188 0.49
189 0.47
190 0.48
191 0.49
192 0.51
193 0.57
194 0.59
195 0.6
196 0.65
197 0.7
198 0.71
199 0.77
200 0.82
201 0.76
202 0.74
203 0.67
204 0.65
205 0.62
206 0.56
207 0.51
208 0.44
209 0.41
210 0.33
211 0.33
212 0.28
213 0.23
214 0.22
215 0.18
216 0.22
217 0.2
218 0.2
219 0.17
220 0.22
221 0.21
222 0.22
223 0.25
224 0.2
225 0.2
226 0.19
227 0.19
228 0.19
229 0.22
230 0.23
231 0.23
232 0.22
233 0.23
234 0.24
235 0.24
236 0.21
237 0.25
238 0.24
239 0.24
240 0.3
241 0.36
242 0.39
243 0.4
244 0.46
245 0.45
246 0.49
247 0.48
248 0.42
249 0.38
250 0.35
251 0.38
252 0.32
253 0.32
254 0.35
255 0.42
256 0.48
257 0.47
258 0.49
259 0.45
260 0.43
261 0.4
262 0.4
263 0.35
264 0.33
265 0.34
266 0.33
267 0.31
268 0.29
269 0.27
270 0.2
271 0.19
272 0.15
273 0.11
274 0.11
275 0.13
276 0.15
277 0.14
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.12
284 0.1
285 0.09
286 0.08
287 0.05
288 0.05
289 0.05
290 0.05
291 0.06
292 0.06
293 0.06
294 0.05
295 0.05
296 0.06
297 0.06
298 0.06
299 0.07
300 0.09
301 0.09
302 0.09
303 0.09
304 0.09
305 0.09
306 0.1
307 0.09
308 0.09
309 0.09
310 0.09
311 0.13
312 0.13
313 0.12
314 0.11
315 0.11
316 0.12
317 0.16
318 0.19
319 0.2
320 0.23
321 0.26
322 0.34
323 0.36
324 0.37
325 0.36
326 0.35
327 0.32
328 0.29
329 0.28
330 0.18
331 0.16
332 0.13
333 0.1
334 0.09
335 0.08
336 0.1
337 0.17
338 0.22
339 0.25
340 0.31
341 0.39
342 0.49
343 0.6
344 0.68
345 0.72
346 0.76
347 0.81
348 0.79
349 0.76
350 0.7
351 0.64
352 0.59
353 0.51
354 0.44
355 0.37
356 0.33
357 0.28
358 0.24
359 0.19
360 0.13
361 0.09
362 0.07
363 0.07
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.04
368 0.04
369 0.04
370 0.04
371 0.04
372 0.04
373 0.04
374 0.03
375 0.04
376 0.04
377 0.04
378 0.04
379 0.04
380 0.04
381 0.05
382 0.07
383 0.07
384 0.07
385 0.07
386 0.08
387 0.09
388 0.1
389 0.11
390 0.11
391 0.14
392 0.15
393 0.17
394 0.19
395 0.2
396 0.21
397 0.19
398 0.17
399 0.16
400 0.16
401 0.14
402 0.12
403 0.19
404 0.19
405 0.19
406 0.21
407 0.2
408 0.19
409 0.21
410 0.21
411 0.12
412 0.14
413 0.13
414 0.12
415 0.12
416 0.12
417 0.09
418 0.1
419 0.1
420 0.06
421 0.07
422 0.06
423 0.06
424 0.05
425 0.06
426 0.05
427 0.06
428 0.06
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.07
435 0.06
436 0.07
437 0.09
438 0.1
439 0.1
440 0.12
441 0.15
442 0.14
443 0.15
444 0.17
445 0.2
446 0.2
447 0.21
448 0.21
449 0.2
450 0.24
451 0.25
452 0.25
453 0.28
454 0.31
455 0.35
456 0.41
457 0.44
458 0.46
459 0.51
460 0.59
461 0.6
462 0.62
463 0.6
464 0.55
465 0.53
466 0.48
467 0.42
468 0.34
469 0.25
470 0.22
471 0.2
472 0.19
473 0.17
474 0.15
475 0.14
476 0.13
477 0.13
478 0.12
479 0.11
480 0.1
481 0.1
482 0.11
483 0.11
484 0.1
485 0.09
486 0.07
487 0.07
488 0.07
489 0.07
490 0.06
491 0.06
492 0.06
493 0.07
494 0.08
495 0.07
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.08
500 0.09
501 0.09
502 0.12
503 0.12
504 0.13
505 0.15
506 0.16
507 0.19
508 0.21
509 0.23
510 0.25
511 0.26
512 0.29
513 0.3
514 0.3
515 0.29
516 0.31
517 0.27
518 0.23
519 0.22
520 0.19
521 0.15
522 0.13
523 0.1
524 0.06
525 0.05
526 0.04
527 0.04
528 0.04
529 0.06
530 0.06
531 0.06
532 0.09
533 0.12
534 0.19
535 0.28
536 0.33
537 0.34
538 0.35
539 0.37
540 0.36
541 0.37
542 0.36
543 0.29
544 0.26
545 0.28
546 0.28
547 0.29
548 0.28
549 0.23
550 0.18
551 0.17
552 0.15
553 0.11
554 0.11
555 0.07
556 0.07
557 0.07
558 0.06
559 0.05
560 0.04
561 0.03
562 0.04
563 0.05
564 0.06
565 0.06
566 0.07
567 0.07
568 0.08
569 0.09
570 0.07
571 0.08
572 0.08
573 0.08
574 0.1
575 0.13
576 0.15
577 0.16
578 0.19
579 0.18
580 0.19
581 0.19
582 0.17
583 0.13
584 0.13
585 0.12
586 0.1
587 0.1
588 0.08
589 0.08
590 0.09
591 0.1
592 0.11
593 0.13
594 0.16
595 0.19
596 0.21
597 0.25
598 0.29
599 0.31
600 0.33
601 0.37
602 0.41
603 0.41
604 0.43
605 0.41
606 0.4
607 0.37
608 0.32
609 0.26
610 0.17
611 0.16
612 0.13
613 0.09
614 0.06
615 0.06
616 0.06
617 0.07
618 0.07
619 0.08
620 0.08
621 0.09
622 0.09
623 0.1
624 0.1
625 0.1
626 0.1
627 0.08
628 0.08
629 0.07
630 0.07
631 0.06
632 0.05
633 0.05
634 0.04
635 0.04
636 0.04
637 0.03
638 0.03
639 0.04
640 0.04
641 0.04
642 0.04
643 0.05
644 0.05
645 0.06
646 0.08
647 0.1
648 0.1
649 0.11
650 0.14
651 0.17
652 0.21
653 0.23
654 0.27
655 0.26
656 0.27
657 0.29
658 0.33
659 0.3
660 0.28
661 0.26
662 0.23
663 0.23
664 0.24
665 0.19
666 0.13
667 0.16
668 0.15
669 0.15
670 0.15
671 0.18
672 0.18
673 0.18
674 0.21
675 0.18
676 0.17
677 0.22
678 0.2
679 0.15
680 0.15
681 0.14
682 0.11
683 0.1
684 0.1
685 0.05
686 0.08
687 0.08
688 0.07
689 0.07
690 0.07
691 0.07
692 0.07
693 0.08
694 0.07
695 0.07
696 0.07
697 0.07
698 0.08
699 0.08
700 0.09
701 0.08
702 0.06
703 0.06
704 0.06
705 0.06
706 0.05
707 0.06
708 0.04
709 0.04
710 0.05
711 0.05
712 0.05
713 0.04
714 0.04
715 0.05
716 0.05
717 0.07
718 0.07
719 0.09
720 0.09
721 0.09
722 0.1
723 0.1
724 0.1
725 0.08
726 0.08
727 0.09
728 0.11
729 0.13
730 0.12
731 0.11
732 0.15
733 0.16
734 0.17
735 0.15
736 0.13
737 0.12
738 0.12
739 0.12
740 0.08
741 0.09
742 0.08
743 0.08
744 0.09
745 0.08
746 0.08
747 0.09
748 0.1
749 0.09
750 0.09
751 0.09
752 0.11
753 0.12
754 0.14
755 0.15
756 0.16
757 0.17
758 0.18
759 0.19
760 0.19
761 0.23
762 0.23
763 0.21
764 0.21
765 0.2
766 0.21
767 0.2
768 0.18
769 0.18
770 0.18
771 0.2
772 0.21
773 0.19
774 0.18
775 0.18
776 0.2
777 0.17
778 0.17
779 0.2
780 0.2
781 0.21
782 0.23
783 0.25
784 0.29
785 0.27
786 0.27
787 0.23
788 0.24
789 0.24
790 0.22
791 0.21
792 0.15
793 0.15
794 0.16
795 0.16
796 0.17
797 0.16
798 0.14
799 0.14
800 0.15
801 0.2
802 0.16
803 0.17
804 0.16
805 0.18
806 0.18
807 0.18
808 0.17
809 0.11
810 0.12
811 0.1
812 0.09
813 0.07
814 0.07
815 0.06
816 0.06
817 0.06
818 0.05
819 0.05
820 0.04
821 0.04
822 0.04
823 0.04
824 0.04
825 0.04
826 0.05
827 0.05
828 0.06
829 0.07
830 0.06
831 0.07
832 0.07
833 0.1
834 0.11
835 0.12
836 0.11
837 0.12
838 0.14
839 0.13
840 0.14
841 0.14
842 0.13
843 0.12
844 0.12
845 0.13
846 0.13
847 0.14
848 0.15
849 0.15
850 0.19
851 0.2
852 0.21
853 0.22
854 0.2
855 0.2
856 0.19
857 0.15
858 0.13
859 0.11
860 0.09
861 0.08
862 0.07
863 0.06
864 0.06
865 0.06
866 0.07
867 0.07
868 0.1
869 0.15
870 0.16
871 0.19
872 0.21
873 0.21
874 0.22
875 0.23
876 0.21
877 0.17
878 0.19
879 0.17
880 0.15
881 0.14
882 0.12
883 0.09
884 0.09
885 0.08
886 0.05
887 0.04
888 0.04
889 0.04
890 0.04
891 0.05
892 0.07
893 0.09
894 0.14
895 0.15
896 0.24
897 0.32
898 0.35
899 0.38
900 0.42
901 0.45
902 0.45
903 0.47
904 0.39
905 0.32
906 0.28
907 0.25
908 0.19
909 0.15
910 0.1
911 0.08
912 0.08
913 0.12
914 0.14
915 0.17
916 0.22
917 0.27
918 0.33
919 0.41
920 0.5
921 0.51
922 0.54
923 0.55
924 0.53
925 0.5
926 0.47
927 0.38
928 0.28
929 0.26
930 0.23
931 0.19
932 0.16
933 0.15
934 0.16
935 0.16
936 0.17
937 0.15
938 0.17
939 0.17
940 0.21
941 0.28
942 0.26
943 0.34
944 0.41
945 0.42
946 0.43
947 0.46
948 0.44
949 0.44
950 0.43
951 0.37
952 0.33
953 0.34
954 0.33
955 0.34
956 0.34
957 0.3
958 0.34
959 0.33
960 0.32
961 0.28
962 0.3
963 0.28
964 0.31
965 0.29
966 0.24
967 0.23
968 0.22
969 0.22
970 0.19
971 0.19
972 0.15
973 0.17
974 0.22
975 0.22
976 0.26
977 0.28
978 0.26
979 0.27
980 0.27
981 0.27
982 0.22
983 0.21
984 0.18
985 0.16
986 0.15
987 0.12
988 0.13
989 0.1
990 0.09
991 0.08
992 0.08
993 0.08
994 0.1
995 0.14
996 0.18
997 0.22
998 0.24
999 0.25
1000 0.25
1001 0.27
1002 0.27
1003 0.24
1004 0.21
1005 0.18
1006 0.2
1007 0.21
1008 0.25
1009 0.23
1010 0.2
1011 0.21
1012 0.23
1013 0.25
1014 0.25
1015 0.31
1016 0.33
1017 0.39
1018 0.44
1019 0.43
1020 0.39
1021 0.38
1022 0.35
1023 0.31
1024 0.28
1025 0.21
1026 0.18
1027 0.18
1028 0.17
1029 0.16
1030 0.16
1031 0.12
1032 0.11
1033 0.11
1034 0.13
1035 0.15
1036 0.16
1037 0.17
1038 0.19
1039 0.2
1040 0.18
1041 0.18
1042 0.15
1043 0.15
1044 0.2
1045 0.21
1046 0.2
1047 0.2
1048 0.21
1049 0.22
1050 0.24
1051 0.24
1052 0.2
1053 0.22
1054 0.3
1055 0.31
1056 0.36
1057 0.36
1058 0.34
1059 0.32
1060 0.33
1061 0.38
1062 0.39
1063 0.45
1064 0.5
1065 0.57
1066 0.59
1067 0.61
1068 0.59
1069 0.53
1070 0.49
1071 0.42
1072 0.38
1073 0.34
1074 0.32
1075 0.32
1076 0.3
1077 0.29
1078 0.25
1079 0.24
1080 0.21
1081 0.2
1082 0.18
1083 0.17
1084 0.18
1085 0.19
1086 0.19
1087 0.21
1088 0.19
1089 0.22
1090 0.29
1091 0.31
1092 0.34
1093 0.32
1094 0.33