FuNGI

M3B2B4

Protein Details

Accession

M3B2B4

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
109-128	GVAPRAKMNQQRSRRFRSAQ	Hydrophilic
418-439	AERQKQREDRERRQSNKRARYS	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
409-435	RRRETEVKAAERQKQREDRERRQSNKR

Subcellular Location(s)

mito 11, cyto 8.5, cyto_nucl 8, nucl 6.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027073 5_3_exoribonuclease IPR041412 Xrn1_helical IPR004859 Xrn1_N IPR017151 Xrn2/3/4 IPR001878 Znf_CCHC IPR036875 Znf_CCHC_sf
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0004534 F:5'-3' RNA exonuclease activity GO:0003676 F:nucleic acid binding GO:0008270 F:zinc ion binding GO:0006353 P:DNA-templated transcription termination GO:0006397 P:mRNA processing
KEGG	pfj:MYCFIDRAFT_196796 -
Pfam	View protein in Pfam PF17846 XRN_M PF03159 XRN_N PF00098 zf-CCHC
PROSITE	View protein in PROSITE PS50158 ZF_CCHC
CDD	cd18673 PIN_XRN1-2-like

Amino Acid Sequences

MGVPALFRWLSKKYPKIISPVVEEQPGEIANEDGSVTKIPIDARGPNPNGEEMDNLYLDMNGIVHPCSHPEDRPPPANEEEMMVAIFEYTERVVNMVRPRKLLMIAVDGVAPRAKMNQQRSRRFRSAQEAAEKDAMAAEFHARMVAAGEAGGDDEKNSKPKKTWDSNSITPGTPFMDLLAASLRYWISYKLTTDPAWEKLKVIISDATVPGEGEHKIMNFVRSQRSSPDHDPNTRHVIYGLDADLIMLGLATHEPHFRVLREDVFANDTKPGHCRKCNQPGHIAANCTGKPKEEEDVVKPLKPFIWLHVGILREYLAVEMCVPNQGFRFDLERALDDWVFMCFFVGNDFLPHLPSLDIREDGIDTLIAIWRDNLPLMGGYVTKDGHVDLARAQMILEGLAKQEDAIFKRRRETEVKAAERQKQREDRERRQSNKRARYSNGAPTGFDETVIRRGARGGIVKGEAAADPNALPTFAPGAAQTMSDPRYRSSLTHADVVGSANQDNKSAAAALKERMMNSKKGADSQRAEIDALMAGAANGNDPPQALGKRTRDMIDDAAADEAGAPKFKMNTKTSQGLAGKITKDASYVPNSELTFPLESTQEEYTSLDSDESIKVSYHMPVLGSIHKSMLLPGVKFNEPVLDYNDIEMTRSRAERSGRSHGGVQLSVGGDRSDGRRINYAARDNGHHDNRNGGFGNGYGANGGYGQDHSRGPPPPRQDPYSNRAADAFANLPPHLAAQAAQHGFQSARAHPPPPPPQYGYPPRGPPPPQNGYGGYGGYDNRGGYENRGGYGGRGGYGGSRGGYQDRGGYGGGGGNYRGNNRRY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.58
2	0.62
3	0.66
4	0.68
5	0.64
6	0.62
7	0.62
8	0.57
9	0.51
10	0.47
11	0.39
12	0.34
13	0.29
14	0.22
15	0.16
16	0.13
17	0.1
18	0.1
19	0.1
20	0.08
21	0.09
22	0.09
23	0.09
24	0.09
25	0.11
26	0.12
27	0.16
28	0.19
29	0.25
30	0.29
31	0.39
32	0.4
33	0.42
34	0.43
35	0.41
36	0.39
37	0.34
38	0.31
39	0.24
40	0.25
41	0.22
42	0.2
43	0.17
44	0.15
45	0.14
46	0.12
47	0.09
48	0.07
49	0.08
50	0.08
51	0.09
52	0.09
53	0.12
54	0.17
55	0.21
56	0.22
57	0.31
58	0.38
59	0.45
60	0.52
61	0.52
62	0.53
63	0.52
64	0.52
65	0.44
66	0.37
67	0.31
68	0.24
69	0.2
70	0.15
71	0.11
72	0.08
73	0.08
74	0.06
75	0.05
76	0.06
77	0.07
78	0.07
79	0.08
80	0.1
81	0.15
82	0.25
83	0.33
84	0.35
85	0.36
86	0.38
87	0.4
88	0.4
89	0.38
90	0.31
91	0.27
92	0.25
93	0.23
94	0.23
95	0.2
96	0.19
97	0.17
98	0.14
99	0.1
100	0.12
101	0.18
102	0.25
103	0.36
104	0.44
105	0.54
106	0.65
107	0.73
108	0.79
109	0.81
110	0.78
111	0.75
112	0.74
113	0.72
114	0.68
115	0.69
116	0.62
117	0.57
118	0.55
119	0.47
120	0.37
121	0.31
122	0.24
123	0.15
124	0.13
125	0.11
126	0.09
127	0.09
128	0.1
129	0.08
130	0.07
131	0.08
132	0.08
133	0.06
134	0.05
135	0.05
136	0.05
137	0.05
138	0.06
139	0.05
140	0.05
141	0.08
142	0.1
143	0.19
144	0.21
145	0.24
146	0.28
147	0.38
148	0.47
149	0.55
150	0.6
151	0.62
152	0.68
153	0.7
154	0.72
155	0.66
156	0.56
157	0.46
158	0.4
159	0.32
160	0.24
161	0.18
162	0.12
163	0.1
164	0.09
165	0.09
166	0.11
167	0.1
168	0.09
169	0.11
170	0.1
171	0.1
172	0.11
173	0.12
174	0.13
175	0.14
176	0.17
177	0.19
178	0.23
179	0.22
180	0.27
181	0.29
182	0.31
183	0.33
184	0.32
185	0.29
186	0.29
187	0.33
188	0.28
189	0.27
190	0.23
191	0.2
192	0.22
193	0.22
194	0.19
195	0.14
196	0.14
197	0.12
198	0.12
199	0.11
200	0.09
201	0.09
202	0.09
203	0.12
204	0.13
205	0.14
206	0.16
207	0.2
208	0.27
209	0.29
210	0.3
211	0.32
212	0.36
213	0.41
214	0.45
215	0.5
216	0.49
217	0.53
218	0.55
219	0.54
220	0.58
221	0.51
222	0.44
223	0.35
224	0.29
225	0.24
226	0.22
227	0.18
228	0.1
229	0.09
230	0.09
231	0.08
232	0.07
233	0.06
234	0.03
235	0.02
236	0.02
237	0.03
238	0.04
239	0.05
240	0.06
241	0.07
242	0.1
243	0.12
244	0.12
245	0.16
246	0.18
247	0.19
248	0.2
249	0.2
250	0.18
251	0.21
252	0.21
253	0.17
254	0.18
255	0.17
256	0.16
257	0.2
258	0.26
259	0.29
260	0.34
261	0.4
262	0.46
263	0.57
264	0.63
265	0.62
266	0.62
267	0.62
268	0.64
269	0.6
270	0.52
271	0.44
272	0.42
273	0.39
274	0.35
275	0.29
276	0.23
277	0.23
278	0.23
279	0.23
280	0.21
281	0.24
282	0.23
283	0.33
284	0.33
285	0.33
286	0.31
287	0.29
288	0.26
289	0.26
290	0.23
291	0.16
292	0.22
293	0.2
294	0.21
295	0.23
296	0.23
297	0.2
298	0.2
299	0.17
300	0.09
301	0.09
302	0.08
303	0.05
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.08
309	0.08
310	0.09
311	0.09
312	0.1
313	0.1
314	0.11
315	0.14
316	0.12
317	0.15
318	0.14
319	0.15
320	0.15
321	0.17
322	0.15
323	0.12
324	0.11
325	0.1
326	0.09
327	0.07
328	0.07
329	0.04
330	0.04
331	0.05
332	0.06
333	0.05
334	0.05
335	0.06
336	0.06
337	0.07
338	0.07
339	0.07
340	0.06
341	0.07
342	0.09
343	0.1
344	0.1
345	0.1
346	0.1
347	0.1
348	0.09
349	0.09
350	0.06
351	0.04
352	0.04
353	0.06
354	0.05
355	0.05
356	0.06
357	0.06
358	0.07
359	0.07
360	0.06
361	0.05
362	0.05
363	0.05
364	0.05
365	0.05
366	0.05
367	0.06
368	0.07
369	0.06
370	0.07
371	0.06
372	0.08
373	0.08
374	0.08
375	0.07
376	0.1
377	0.1
378	0.09
379	0.09
380	0.08
381	0.07
382	0.07
383	0.07
384	0.05
385	0.05
386	0.05
387	0.05
388	0.04
389	0.05
390	0.08
391	0.09
392	0.17
393	0.22
394	0.23
395	0.29
396	0.31
397	0.34
398	0.37
399	0.4
400	0.41
401	0.46
402	0.49
403	0.51
404	0.53
405	0.57
406	0.58
407	0.56
408	0.54
409	0.53
410	0.54
411	0.58
412	0.63
413	0.65
414	0.7
415	0.76
416	0.75
417	0.77
418	0.8
419	0.8
420	0.81
421	0.78
422	0.72
423	0.66
424	0.67
425	0.61
426	0.6
427	0.57
428	0.47
429	0.4
430	0.37
431	0.38
432	0.3
433	0.26
434	0.18
435	0.12
436	0.15
437	0.17
438	0.15
439	0.1
440	0.11
441	0.12
442	0.14
443	0.15
444	0.12
445	0.13
446	0.13
447	0.13
448	0.13
449	0.12
450	0.09
451	0.08
452	0.08
453	0.06
454	0.06
455	0.06
456	0.06
457	0.06
458	0.05
459	0.05
460	0.06
461	0.05
462	0.06
463	0.05
464	0.07
465	0.07
466	0.07
467	0.07
468	0.09
469	0.11
470	0.13
471	0.14
472	0.13
473	0.16
474	0.17
475	0.17
476	0.21
477	0.25
478	0.25
479	0.27
480	0.26
481	0.24
482	0.23
483	0.23
484	0.18
485	0.12
486	0.11
487	0.11
488	0.11
489	0.11
490	0.11
491	0.1
492	0.09
493	0.09
494	0.09
495	0.09
496	0.1
497	0.11
498	0.14
499	0.15
500	0.15
501	0.22
502	0.24
503	0.24
504	0.25
505	0.3
506	0.27
507	0.32
508	0.35
509	0.35
510	0.35
511	0.36
512	0.36
513	0.32
514	0.31
515	0.25
516	0.22
517	0.15
518	0.12
519	0.08
520	0.05
521	0.04
522	0.04
523	0.04
524	0.04
525	0.03
526	0.04
527	0.04
528	0.04
529	0.05
530	0.08
531	0.1
532	0.12
533	0.2
534	0.23
535	0.26
536	0.28
537	0.28
538	0.27
539	0.29
540	0.28
541	0.22
542	0.19
543	0.17
544	0.15
545	0.13
546	0.11
547	0.09
548	0.09
549	0.07
550	0.07
551	0.07
552	0.07
553	0.1
554	0.15
555	0.22
556	0.23
557	0.3
558	0.35
559	0.39
560	0.38
561	0.43
562	0.4
563	0.35
564	0.35
565	0.32
566	0.28
567	0.25
568	0.25
569	0.18
570	0.17
571	0.17
572	0.18
573	0.18
574	0.19
575	0.19
576	0.22
577	0.23
578	0.23
579	0.22
580	0.21
581	0.18
582	0.16
583	0.16
584	0.13
585	0.13
586	0.14
587	0.15
588	0.12
589	0.12
590	0.12
591	0.12
592	0.12
593	0.12
594	0.09
595	0.09
596	0.1
597	0.1
598	0.1
599	0.1
600	0.09
601	0.1
602	0.11
603	0.12
604	0.11
605	0.11
606	0.11
607	0.11
608	0.13
609	0.17
610	0.18
611	0.17
612	0.16
613	0.16
614	0.16
615	0.15
616	0.19
617	0.18
618	0.16
619	0.19
620	0.23
621	0.23
622	0.24
623	0.23
624	0.21
625	0.2
626	0.21
627	0.21
628	0.2
629	0.2
630	0.2
631	0.22
632	0.18
633	0.18
634	0.17
635	0.16
636	0.16
637	0.17
638	0.18
639	0.21
640	0.25
641	0.31
642	0.37
643	0.43
644	0.43
645	0.44
646	0.46
647	0.44
648	0.43
649	0.36
650	0.3
651	0.23
652	0.2
653	0.18
654	0.16
655	0.12
656	0.09
657	0.11
658	0.13
659	0.17
660	0.19
661	0.21
662	0.25
663	0.27
664	0.34
665	0.39
666	0.43
667	0.42
668	0.42
669	0.43
670	0.43
671	0.5
672	0.51
673	0.48
674	0.43
675	0.46
676	0.44
677	0.46
678	0.41
679	0.32
680	0.25
681	0.21
682	0.23
683	0.16
684	0.15
685	0.1
686	0.09
687	0.09
688	0.09
689	0.09
690	0.06
691	0.07
692	0.09
693	0.11
694	0.12
695	0.14
696	0.2
697	0.26
698	0.3
699	0.35
700	0.42
701	0.49
702	0.54
703	0.59
704	0.62
705	0.63
706	0.64
707	0.67
708	0.61
709	0.52
710	0.46
711	0.41
712	0.33
713	0.3
714	0.26
715	0.18
716	0.2
717	0.19
718	0.18
719	0.17
720	0.16
721	0.13
722	0.11
723	0.1
724	0.1
725	0.18
726	0.19
727	0.19
728	0.18
729	0.2
730	0.2
731	0.23
732	0.24
733	0.19
734	0.27
735	0.3
736	0.32
737	0.35
738	0.45
739	0.51
740	0.52
741	0.56
742	0.52
743	0.56
744	0.64
745	0.69
746	0.66
747	0.64
748	0.64
749	0.63
750	0.66
751	0.65
752	0.64
753	0.64
754	0.64
755	0.59
756	0.57
757	0.54
758	0.49
759	0.46
760	0.37
761	0.29
762	0.24
763	0.21
764	0.19
765	0.18
766	0.14
767	0.14
768	0.16
769	0.17
770	0.18
771	0.26
772	0.25
773	0.24
774	0.26
775	0.25
776	0.23
777	0.27
778	0.24
779	0.16
780	0.15
781	0.14
782	0.14
783	0.16
784	0.16
785	0.12
786	0.12
787	0.14
788	0.16
789	0.18
790	0.18
791	0.2
792	0.19
793	0.2
794	0.19
795	0.18
796	0.15
797	0.16
798	0.17
799	0.14
800	0.14
801	0.16
802	0.19
803	0.25

M3B2B4

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer