Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PRN4

Protein Details
Accession A0A1D8PRN4    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
217-243TQSGSSTPKRKKAKSRKRDVKNLEVQIHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
224-235PKRKKAKSRKRD
Subcellular Location(s) nucl 24, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR024061  NDT80_DNA-bd_dom  
IPR037141  NDT80_DNA-bd_dom_sf  
IPR008967  p53-like_TF_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0000228  C:nuclear chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003700  F:DNA-binding transcription factor activity  
GO:0051321  P:meiotic cell cycle  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG cal:CAALFM_CR00140WA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05224  NDT80_PhoG  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51517  NDT80  
Amino Acid Sequences MDSNKERIEDLASLFLPDLLRPSTVNSSPSNATSPHASKSEDYDMGSVFLKDSKLTNAPSNSGLPSSFQEFLSNNNFINRSNDMEDGQEERSQQQPQQYSHHYNGYMPFEMNPSVSQHMMSYNPGMQSMFQQPNNPQQQSFLSSTLPGQQQMVSNFPRTGSYAKYPGEYDEWFASTNSSITNLNGLYQQQLLQSQALQQPQPMPQPQNGAKDTRMDTQSGSSTPKRKKAKSRKRDVKNLEVQIDYKPSKLKRLLDLKQSGATSSNDYKIIDKDNNEVTIDFNGFLNGRFLTNDIDNNNYIFTQNESQRGEDELPKTVVNKKENPKVVSCYRRNYIQISANMSIRGFKNDSKLLKLQTSEYGYTTTRVIKYFKIEVSAAANNSNSKGVPIIIKNENKDIEREREKEARKMSLPSNYEYKADNVSPTYINTNEYVIILNDEPISNGMIDKYFVVKKLQFKNATPNNGSLTFQNYYHLKAKLSCIVADIYYDDYDIDVANDGGGGNNEILLAELVSEPIIVRGRNPSFYAERNDILIKGRSASSKSSFKIAGQSSELKFRAAADAEEDEDDGFVVEHEDEPEDEDDHHNHSEGDVAGQEDQLPHTQNGTGESPISSGDDDEKDNTQIPPLSYSTNQLALDVKSVDKYKYYPINSVYYLPPINVVYFPHRAHQSQKDDQEQTSIVQENRKSSNVYFK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.22
3 0.18
4 0.15
5 0.17
6 0.13
7 0.14
8 0.14
9 0.19
10 0.24
11 0.26
12 0.3
13 0.28
14 0.32
15 0.33
16 0.35
17 0.33
18 0.27
19 0.27
20 0.31
21 0.31
22 0.31
23 0.31
24 0.32
25 0.3
26 0.36
27 0.4
28 0.34
29 0.33
30 0.3
31 0.28
32 0.27
33 0.26
34 0.2
35 0.14
36 0.14
37 0.14
38 0.13
39 0.14
40 0.18
41 0.22
42 0.25
43 0.32
44 0.33
45 0.34
46 0.36
47 0.37
48 0.33
49 0.3
50 0.27
51 0.22
52 0.21
53 0.23
54 0.22
55 0.2
56 0.22
57 0.21
58 0.25
59 0.3
60 0.29
61 0.25
62 0.28
63 0.29
64 0.26
65 0.31
66 0.28
67 0.27
68 0.27
69 0.28
70 0.24
71 0.25
72 0.26
73 0.24
74 0.24
75 0.21
76 0.2
77 0.2
78 0.24
79 0.26
80 0.27
81 0.31
82 0.36
83 0.37
84 0.43
85 0.49
86 0.52
87 0.53
88 0.55
89 0.48
90 0.44
91 0.46
92 0.43
93 0.37
94 0.3
95 0.27
96 0.24
97 0.24
98 0.23
99 0.18
100 0.17
101 0.17
102 0.17
103 0.16
104 0.15
105 0.16
106 0.16
107 0.17
108 0.17
109 0.17
110 0.17
111 0.17
112 0.17
113 0.15
114 0.18
115 0.25
116 0.28
117 0.27
118 0.31
119 0.33
120 0.43
121 0.51
122 0.49
123 0.4
124 0.37
125 0.38
126 0.39
127 0.39
128 0.3
129 0.23
130 0.22
131 0.23
132 0.26
133 0.24
134 0.2
135 0.18
136 0.18
137 0.21
138 0.22
139 0.27
140 0.23
141 0.25
142 0.24
143 0.24
144 0.23
145 0.22
146 0.22
147 0.21
148 0.23
149 0.27
150 0.27
151 0.29
152 0.28
153 0.28
154 0.29
155 0.26
156 0.24
157 0.19
158 0.19
159 0.18
160 0.18
161 0.16
162 0.13
163 0.13
164 0.1
165 0.1
166 0.09
167 0.09
168 0.11
169 0.1
170 0.11
171 0.12
172 0.12
173 0.12
174 0.12
175 0.13
176 0.11
177 0.12
178 0.13
179 0.12
180 0.12
181 0.15
182 0.18
183 0.2
184 0.19
185 0.19
186 0.21
187 0.24
188 0.29
189 0.29
190 0.28
191 0.27
192 0.35
193 0.38
194 0.43
195 0.42
196 0.39
197 0.35
198 0.38
199 0.39
200 0.37
201 0.33
202 0.27
203 0.25
204 0.25
205 0.26
206 0.22
207 0.25
208 0.24
209 0.31
210 0.36
211 0.45
212 0.51
213 0.57
214 0.66
215 0.73
216 0.79
217 0.81
218 0.87
219 0.89
220 0.89
221 0.92
222 0.88
223 0.87
224 0.85
225 0.79
226 0.7
227 0.61
228 0.53
229 0.44
230 0.43
231 0.33
232 0.25
233 0.26
234 0.24
235 0.3
236 0.35
237 0.37
238 0.39
239 0.48
240 0.52
241 0.55
242 0.58
243 0.52
244 0.5
245 0.46
246 0.38
247 0.31
248 0.26
249 0.21
250 0.2
251 0.2
252 0.18
253 0.18
254 0.19
255 0.18
256 0.22
257 0.21
258 0.2
259 0.22
260 0.23
261 0.23
262 0.22
263 0.21
264 0.17
265 0.15
266 0.15
267 0.11
268 0.09
269 0.08
270 0.08
271 0.08
272 0.08
273 0.07
274 0.07
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.12
280 0.12
281 0.14
282 0.14
283 0.14
284 0.13
285 0.11
286 0.11
287 0.09
288 0.1
289 0.13
290 0.14
291 0.2
292 0.2
293 0.2
294 0.21
295 0.23
296 0.22
297 0.21
298 0.2
299 0.17
300 0.18
301 0.17
302 0.18
303 0.22
304 0.26
305 0.26
306 0.33
307 0.37
308 0.43
309 0.49
310 0.5
311 0.47
312 0.47
313 0.5
314 0.52
315 0.5
316 0.48
317 0.44
318 0.45
319 0.45
320 0.41
321 0.38
322 0.34
323 0.32
324 0.32
325 0.32
326 0.29
327 0.27
328 0.25
329 0.22
330 0.17
331 0.17
332 0.14
333 0.14
334 0.17
335 0.22
336 0.23
337 0.24
338 0.27
339 0.26
340 0.26
341 0.25
342 0.23
343 0.22
344 0.23
345 0.2
346 0.18
347 0.18
348 0.17
349 0.17
350 0.17
351 0.16
352 0.14
353 0.15
354 0.16
355 0.16
356 0.19
357 0.21
358 0.2
359 0.2
360 0.18
361 0.18
362 0.2
363 0.2
364 0.17
365 0.15
366 0.15
367 0.13
368 0.13
369 0.13
370 0.09
371 0.07
372 0.07
373 0.07
374 0.09
375 0.1
376 0.15
377 0.21
378 0.24
379 0.25
380 0.28
381 0.29
382 0.27
383 0.29
384 0.28
385 0.29
386 0.32
387 0.34
388 0.35
389 0.41
390 0.43
391 0.46
392 0.45
393 0.43
394 0.38
395 0.4
396 0.38
397 0.37
398 0.37
399 0.33
400 0.35
401 0.31
402 0.3
403 0.27
404 0.26
405 0.21
406 0.19
407 0.18
408 0.14
409 0.15
410 0.14
411 0.14
412 0.15
413 0.13
414 0.14
415 0.13
416 0.13
417 0.11
418 0.11
419 0.11
420 0.08
421 0.09
422 0.08
423 0.08
424 0.08
425 0.07
426 0.07
427 0.07
428 0.08
429 0.06
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.06
435 0.09
436 0.1
437 0.11
438 0.15
439 0.19
440 0.27
441 0.34
442 0.42
443 0.43
444 0.43
445 0.53
446 0.56
447 0.58
448 0.52
449 0.47
450 0.42
451 0.39
452 0.38
453 0.28
454 0.26
455 0.21
456 0.19
457 0.21
458 0.18
459 0.21
460 0.25
461 0.26
462 0.23
463 0.23
464 0.27
465 0.28
466 0.29
467 0.25
468 0.21
469 0.21
470 0.19
471 0.17
472 0.15
473 0.11
474 0.1
475 0.1
476 0.08
477 0.07
478 0.07
479 0.07
480 0.06
481 0.05
482 0.05
483 0.04
484 0.04
485 0.04
486 0.04
487 0.05
488 0.05
489 0.04
490 0.04
491 0.05
492 0.04
493 0.05
494 0.04
495 0.04
496 0.04
497 0.04
498 0.04
499 0.04
500 0.04
501 0.04
502 0.07
503 0.09
504 0.08
505 0.09
506 0.18
507 0.2
508 0.22
509 0.24
510 0.26
511 0.28
512 0.32
513 0.37
514 0.33
515 0.31
516 0.31
517 0.31
518 0.27
519 0.27
520 0.26
521 0.2
522 0.18
523 0.2
524 0.2
525 0.22
526 0.25
527 0.28
528 0.32
529 0.32
530 0.35
531 0.34
532 0.33
533 0.38
534 0.35
535 0.32
536 0.29
537 0.35
538 0.32
539 0.38
540 0.38
541 0.3
542 0.28
543 0.26
544 0.26
545 0.21
546 0.2
547 0.15
548 0.16
549 0.17
550 0.17
551 0.17
552 0.12
553 0.11
554 0.1
555 0.07
556 0.06
557 0.04
558 0.05
559 0.05
560 0.06
561 0.07
562 0.08
563 0.08
564 0.11
565 0.12
566 0.12
567 0.13
568 0.15
569 0.16
570 0.19
571 0.2
572 0.18
573 0.16
574 0.15
575 0.17
576 0.14
577 0.14
578 0.11
579 0.11
580 0.11
581 0.11
582 0.12
583 0.1
584 0.11
585 0.13
586 0.15
587 0.15
588 0.16
589 0.17
590 0.17
591 0.21
592 0.21
593 0.19
594 0.17
595 0.17
596 0.16
597 0.15
598 0.15
599 0.11
600 0.1
601 0.13
602 0.14
603 0.16
604 0.18
605 0.19
606 0.2
607 0.22
608 0.21
609 0.21
610 0.23
611 0.22
612 0.23
613 0.23
614 0.25
615 0.24
616 0.28
617 0.28
618 0.29
619 0.28
620 0.25
621 0.27
622 0.23
623 0.25
624 0.22
625 0.2
626 0.19
627 0.22
628 0.22
629 0.22
630 0.23
631 0.29
632 0.36
633 0.39
634 0.41
635 0.42
636 0.47
637 0.46
638 0.48
639 0.41
640 0.38
641 0.35
642 0.29
643 0.28
644 0.23
645 0.23
646 0.2
647 0.22
648 0.22
649 0.28
650 0.29
651 0.33
652 0.37
653 0.38
654 0.45
655 0.51
656 0.55
657 0.57
658 0.64
659 0.66
660 0.65
661 0.63
662 0.6
663 0.51
664 0.44
665 0.4
666 0.37
667 0.31
668 0.34
669 0.36
670 0.38
671 0.41
672 0.42
673 0.41