Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2YVA2

Protein Details
Accession M2YVA2    Localization Confidence High Confidence Score 15.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
395-419RDGDRDRREREKQRAERKQEAKREMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
227-243PKHKIKKIPRGPPSPPP
351-370KAAAATRRRGSDRGRSRSRS
382-426SRSRSRSRSRSGGRDGDRDRREREKQRAERKQEAKREMARKNMGH
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito 10, cyto_nucl 9, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
KEGG pfj:MYCFIDRAFT_154328  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MSLAASRTSISSALPKPKYTGEDEELPTHTQQKGPRVVGARELESSQLVVKRSGPPPYGQRSGWRPRNAEDFGDGGAFPEVPMAQYPLDMGRKNQPSTSNALALQVDSEGKVKYDAIARRGHGENRIVHASFKDLIPLRQRADVGDISLERPSEEEVQASKERTQKALQGLVDGTLAAQKPKNVKGTTRPEPTFVRYTPANQMGDTSKKQDRIMKIVQRQQDPMEPPKHKIKKIPRGPPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQEAWKIPPPVSNWKNPKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEALHTADRHAREEVQQRHRMQQRLAEKEKEAQEEHLRQLAMKAREDKAAAATRRRGSDRGRSRSRSVNSRSSYSSYSSRSRSRSRSRSGGRDGDRDRREREKQRAERKQEAKREMARKNMGHERKMQMMAREQNRDIGEKVALGLAKPTQSKEAMYDSRLFNQSSGFAAGFNEDQAYDKPLFADRDALNSIYRPTVGDEDDGEDGGETLEKIQGTKRFDTLGRAPKSGFKGTETAEARSGPVQFERDRGDDPFGIEAGIAAASGGSKRAADDDAGGKGKRARVDDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.4
3 0.42
4 0.46
5 0.49
6 0.47
7 0.48
8 0.43
9 0.47
10 0.49
11 0.49
12 0.47
13 0.45
14 0.4
15 0.37
16 0.33
17 0.3
18 0.32
19 0.37
20 0.43
21 0.43
22 0.47
23 0.48
24 0.48
25 0.52
26 0.51
27 0.44
28 0.38
29 0.36
30 0.31
31 0.26
32 0.25
33 0.21
34 0.2
35 0.19
36 0.19
37 0.22
38 0.28
39 0.32
40 0.39
41 0.37
42 0.39
43 0.46
44 0.52
45 0.54
46 0.48
47 0.52
48 0.54
49 0.63
50 0.67
51 0.66
52 0.61
53 0.6
54 0.67
55 0.62
56 0.55
57 0.47
58 0.39
59 0.31
60 0.29
61 0.24
62 0.16
63 0.14
64 0.11
65 0.09
66 0.09
67 0.08
68 0.07
69 0.08
70 0.09
71 0.09
72 0.09
73 0.1
74 0.14
75 0.19
76 0.2
77 0.22
78 0.29
79 0.36
80 0.38
81 0.41
82 0.41
83 0.38
84 0.44
85 0.45
86 0.39
87 0.32
88 0.33
89 0.29
90 0.24
91 0.21
92 0.16
93 0.13
94 0.1
95 0.11
96 0.09
97 0.09
98 0.1
99 0.1
100 0.11
101 0.18
102 0.22
103 0.25
104 0.3
105 0.3
106 0.35
107 0.38
108 0.39
109 0.38
110 0.39
111 0.38
112 0.38
113 0.41
114 0.36
115 0.33
116 0.31
117 0.29
118 0.24
119 0.21
120 0.22
121 0.19
122 0.23
123 0.29
124 0.34
125 0.32
126 0.34
127 0.34
128 0.29
129 0.32
130 0.28
131 0.22
132 0.2
133 0.19
134 0.16
135 0.17
136 0.16
137 0.11
138 0.11
139 0.13
140 0.13
141 0.13
142 0.14
143 0.14
144 0.19
145 0.22
146 0.23
147 0.26
148 0.28
149 0.3
150 0.31
151 0.32
152 0.32
153 0.34
154 0.38
155 0.33
156 0.29
157 0.28
158 0.25
159 0.23
160 0.17
161 0.12
162 0.1
163 0.1
164 0.1
165 0.1
166 0.13
167 0.18
168 0.23
169 0.31
170 0.3
171 0.34
172 0.42
173 0.5
174 0.56
175 0.6
176 0.55
177 0.52
178 0.53
179 0.54
180 0.5
181 0.41
182 0.36
183 0.28
184 0.3
185 0.33
186 0.35
187 0.31
188 0.25
189 0.27
190 0.27
191 0.31
192 0.29
193 0.28
194 0.27
195 0.29
196 0.32
197 0.36
198 0.36
199 0.38
200 0.45
201 0.48
202 0.52
203 0.55
204 0.58
205 0.55
206 0.53
207 0.48
208 0.45
209 0.41
210 0.41
211 0.43
212 0.39
213 0.41
214 0.49
215 0.54
216 0.52
217 0.57
218 0.6
219 0.62
220 0.7
221 0.76
222 0.74
223 0.75
224 0.76
225 0.76
226 0.73
227 0.69
228 0.63
229 0.55
230 0.51
231 0.49
232 0.49
233 0.49
234 0.49
235 0.47
236 0.48
237 0.51
238 0.46
239 0.42
240 0.42
241 0.41
242 0.4
243 0.36
244 0.34
245 0.32
246 0.32
247 0.3
248 0.28
249 0.21
250 0.16
251 0.18
252 0.19
253 0.28
254 0.3
255 0.38
256 0.42
257 0.47
258 0.52
259 0.49
260 0.49
261 0.42
262 0.41
263 0.37
264 0.4
265 0.38
266 0.38
267 0.39
268 0.35
269 0.33
270 0.32
271 0.28
272 0.19
273 0.17
274 0.14
275 0.14
276 0.14
277 0.14
278 0.11
279 0.12
280 0.12
281 0.15
282 0.13
283 0.12
284 0.12
285 0.12
286 0.13
287 0.11
288 0.11
289 0.06
290 0.06
291 0.08
292 0.09
293 0.1
294 0.1
295 0.1
296 0.09
297 0.12
298 0.13
299 0.12
300 0.11
301 0.12
302 0.17
303 0.26
304 0.34
305 0.4
306 0.46
307 0.46
308 0.53
309 0.58
310 0.57
311 0.49
312 0.47
313 0.47
314 0.49
315 0.52
316 0.46
317 0.42
318 0.44
319 0.46
320 0.42
321 0.34
322 0.29
323 0.31
324 0.31
325 0.32
326 0.29
327 0.25
328 0.22
329 0.24
330 0.27
331 0.24
332 0.24
333 0.27
334 0.25
335 0.27
336 0.28
337 0.25
338 0.23
339 0.28
340 0.27
341 0.28
342 0.32
343 0.33
344 0.36
345 0.39
346 0.38
347 0.36
348 0.44
349 0.49
350 0.53
351 0.59
352 0.6
353 0.61
354 0.66
355 0.66
356 0.65
357 0.61
358 0.6
359 0.54
360 0.53
361 0.52
362 0.46
363 0.44
364 0.38
365 0.36
366 0.31
367 0.34
368 0.35
369 0.39
370 0.42
371 0.47
372 0.53
373 0.59
374 0.64
375 0.65
376 0.7
377 0.71
378 0.73
379 0.73
380 0.72
381 0.65
382 0.65
383 0.63
384 0.63
385 0.62
386 0.59
387 0.56
388 0.56
389 0.61
390 0.62
391 0.68
392 0.69
393 0.73
394 0.79
395 0.85
396 0.85
397 0.85
398 0.85
399 0.84
400 0.82
401 0.78
402 0.75
403 0.73
404 0.74
405 0.68
406 0.68
407 0.67
408 0.59
409 0.6
410 0.63
411 0.6
412 0.54
413 0.57
414 0.51
415 0.49
416 0.53
417 0.48
418 0.41
419 0.43
420 0.48
421 0.48
422 0.5
423 0.44
424 0.45
425 0.44
426 0.42
427 0.35
428 0.29
429 0.23
430 0.17
431 0.17
432 0.14
433 0.13
434 0.1
435 0.11
436 0.1
437 0.14
438 0.15
439 0.16
440 0.17
441 0.18
442 0.19
443 0.2
444 0.27
445 0.26
446 0.27
447 0.31
448 0.3
449 0.34
450 0.36
451 0.34
452 0.27
453 0.25
454 0.23
455 0.2
456 0.2
457 0.14
458 0.11
459 0.11
460 0.13
461 0.12
462 0.11
463 0.1
464 0.08
465 0.1
466 0.1
467 0.14
468 0.13
469 0.13
470 0.14
471 0.18
472 0.2
473 0.18
474 0.24
475 0.21
476 0.25
477 0.26
478 0.26
479 0.23
480 0.22
481 0.23
482 0.17
483 0.17
484 0.13
485 0.14
486 0.17
487 0.17
488 0.17
489 0.17
490 0.18
491 0.18
492 0.18
493 0.15
494 0.11
495 0.1
496 0.09
497 0.08
498 0.05
499 0.06
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.14
504 0.2
505 0.25
506 0.28
507 0.29
508 0.3
509 0.32
510 0.38
511 0.42
512 0.46
513 0.45
514 0.45
515 0.44
516 0.47
517 0.52
518 0.5
519 0.43
520 0.36
521 0.36
522 0.36
523 0.45
524 0.4
525 0.37
526 0.34
527 0.33
528 0.31
529 0.29
530 0.28
531 0.21
532 0.22
533 0.25
534 0.24
535 0.28
536 0.31
537 0.32
538 0.33
539 0.34
540 0.36
541 0.32
542 0.32
543 0.29
544 0.24
545 0.21
546 0.18
547 0.15
548 0.1
549 0.08
550 0.06
551 0.04
552 0.04
553 0.04
554 0.05
555 0.06
556 0.06
557 0.07
558 0.08
559 0.1
560 0.12
561 0.12
562 0.16
563 0.18
564 0.24
565 0.28
566 0.28
567 0.29
568 0.32
569 0.35
570 0.37