Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3AKD3

Protein Details
Accession M3AKD3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
12-40AVGGAEKRVKSKKQWRVPKKGENGFQQAKHydrophilic
204-223QEPFKKRKFAIRPTIRNHTAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
15-31GAEKRVKSKKQWRVPKK
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR004114  THUMP_dom  
IPR040183  THUMPD1-like  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006400  P:tRNA modification  
KEGG pfj:MYCFIDRAFT_168502  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF02926  THUMP  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51165  THUMP  
CDD cd11717  THUMP_THUMPD1_like  
Amino Acid Sequences MADTHKRKANDAVGGAEKRVKSKKQWRVPKKGENGFQQAKNTIQPGDSGIWVSCDKGRENKCIHEVMDLFGEYAERLYPQAQHVAADNETAEGGDVAAENKDDSITANIEDEIKAEVRDIRKPSTPGLFTPIMLNVPCVVFFKTSHPVEAVSFVKTICEDALKDSSHKRTRFAKRLSPMTLVGRASTEGLDKVAAEVLKPHFHQEPFKKRKFAIRPTIRNHTALTRDAVIKQVASIVGPGHQVDLNHYELLIVVEVYQNICGVSVLDDSFERLKRYNISEIFEP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.46
2 0.44
3 0.42
4 0.36
5 0.37
6 0.42
7 0.43
8 0.46
9 0.56
10 0.65
11 0.7
12 0.8
13 0.84
14 0.87
15 0.92
16 0.91
17 0.91
18 0.89
19 0.86
20 0.83
21 0.82
22 0.78
23 0.72
24 0.65
25 0.58
26 0.51
27 0.47
28 0.4
29 0.32
30 0.25
31 0.22
32 0.21
33 0.2
34 0.18
35 0.16
36 0.14
37 0.15
38 0.15
39 0.16
40 0.15
41 0.16
42 0.18
43 0.26
44 0.3
45 0.35
46 0.39
47 0.43
48 0.45
49 0.46
50 0.44
51 0.4
52 0.36
53 0.3
54 0.28
55 0.22
56 0.18
57 0.14
58 0.14
59 0.08
60 0.08
61 0.07
62 0.05
63 0.06
64 0.07
65 0.09
66 0.1
67 0.14
68 0.14
69 0.14
70 0.16
71 0.17
72 0.16
73 0.15
74 0.13
75 0.09
76 0.09
77 0.08
78 0.07
79 0.04
80 0.04
81 0.03
82 0.03
83 0.04
84 0.04
85 0.04
86 0.04
87 0.04
88 0.04
89 0.04
90 0.05
91 0.06
92 0.07
93 0.07
94 0.08
95 0.08
96 0.09
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.07
102 0.07
103 0.1
104 0.12
105 0.17
106 0.19
107 0.21
108 0.24
109 0.26
110 0.28
111 0.3
112 0.29
113 0.24
114 0.27
115 0.24
116 0.21
117 0.2
118 0.18
119 0.14
120 0.13
121 0.12
122 0.07
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.08
129 0.12
130 0.18
131 0.18
132 0.18
133 0.18
134 0.17
135 0.17
136 0.2
137 0.17
138 0.11
139 0.11
140 0.11
141 0.11
142 0.1
143 0.1
144 0.07
145 0.07
146 0.06
147 0.08
148 0.12
149 0.12
150 0.14
151 0.17
152 0.26
153 0.33
154 0.34
155 0.36
156 0.43
157 0.53
158 0.6
159 0.63
160 0.62
161 0.61
162 0.67
163 0.65
164 0.58
165 0.51
166 0.44
167 0.42
168 0.33
169 0.27
170 0.21
171 0.18
172 0.16
173 0.13
174 0.11
175 0.08
176 0.08
177 0.08
178 0.07
179 0.07
180 0.08
181 0.08
182 0.07
183 0.1
184 0.12
185 0.16
186 0.16
187 0.19
188 0.21
189 0.24
190 0.32
191 0.39
192 0.48
193 0.54
194 0.6
195 0.62
196 0.6
197 0.69
198 0.7
199 0.69
200 0.69
201 0.7
202 0.73
203 0.75
204 0.83
205 0.76
206 0.68
207 0.6
208 0.54
209 0.47
210 0.4
211 0.35
212 0.29
213 0.28
214 0.26
215 0.27
216 0.22
217 0.18
218 0.16
219 0.15
220 0.12
221 0.11
222 0.11
223 0.08
224 0.09
225 0.1
226 0.1
227 0.1
228 0.11
229 0.11
230 0.14
231 0.18
232 0.18
233 0.17
234 0.17
235 0.15
236 0.14
237 0.15
238 0.11
239 0.08
240 0.06
241 0.07
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.07
247 0.07
248 0.07
249 0.06
250 0.08
251 0.09
252 0.09
253 0.1
254 0.1
255 0.13
256 0.18
257 0.2
258 0.22
259 0.22
260 0.26
261 0.31
262 0.36
263 0.42
264 0.41