Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1QBV7

Protein Details
Accession N1QBV7    Localization Confidence High Confidence Score 24.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
31-54AVDIFHKKKKPAVRRPLQPGQRVVHydrophilic
197-238GGDPSKQIKKKQQKKVEEGRDESDPKRQKRSKLRYEEARPWHBasic
420-449EQLEKLEERKKQKRMRRQLRKREHQGQYSDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
24-46APARKKPAVDIFHKKKKPAVRRP
202-228KQIKKKQQKKVEEGRDESDPKRQKRSK
426-441EERKKQKRMRRQLRKR
575-584KGRSGAPKIK
Subcellular Location(s) nucl 23, mito 2, cyto 2, cyto_mito 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008851  TFIIF-alpha  
IPR011039  TFIIF_interaction  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0032968  P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II  
GO:0006367  P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter  
KEGG pfj:MYCFIDRAFT_213387  -  
Amino Acid Sequences MSASPARPPSGPNSVTPTTGGPPAPARKKPAVDIFHKKKKPAVRRPLQPGQRVVPPSTQNNGPPLHSFQQPINGTVRNVNPTVPAAAPSKEPEEGTYSEFPIVISKRQLEAGLRFHAMKLQSRIDDGEPVTVNPYDEHQFTRPLRLHRRFPGDKPEAADQSDAASGVDDKERELNNARRAERQAEREENQKLIAPTGGDPSKQIKKKQQKKVEEGRDESDPKRQKRSKLRYEEARPWHLEDFESKNVWVGSYEQALSERSIMLEVKDDGTFGMVPIEKWYRFQQANRVNTIPSDDVDKMMAKRIQPSRWAMKTHAVTDEAAREAHMKKMAMRRAKREDEDVARRSKDDGEFDADRDMLDVEMGDLNEFQDDDEGVLFQIEDDDDAKELEMRLFLEMRDAGLGGTGVKDEALDVEGQLRKEQLEKLEERKKQKRMRRQLRKREHQGQYSDSDDSDDPYADSSDSMDSEDEREEERKKEEAKKAAQVNGDKSGASTKGTNTPTGRPEKRDPSRLGASLKRPGSPDVSDLSGNESSRKKVKSLNGKPMAASSGAARSLSPDASKKGAGSGSDTDTSRKGRSGAPKIKLKNSPAATPSASRAASPARSPLSSTGFPTIDEVKAAIPIEGIDIKSLVQLFKLRVAGKTADFIKMVKLAGKQSTDPASKGKIVPK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.41
2 0.41
3 0.39
4 0.36
5 0.29
6 0.31
7 0.28
8 0.23
9 0.29
10 0.37
11 0.45
12 0.47
13 0.52
14 0.55
15 0.59
16 0.63
17 0.65
18 0.63
19 0.64
20 0.7
21 0.73
22 0.76
23 0.78
24 0.73
25 0.71
26 0.74
27 0.75
28 0.75
29 0.76
30 0.75
31 0.8
32 0.87
33 0.9
34 0.88
35 0.84
36 0.8
37 0.73
38 0.71
39 0.65
40 0.58
41 0.55
42 0.52
43 0.5
44 0.48
45 0.48
46 0.43
47 0.45
48 0.44
49 0.39
50 0.37
51 0.38
52 0.37
53 0.36
54 0.35
55 0.31
56 0.38
57 0.37
58 0.36
59 0.34
60 0.33
61 0.31
62 0.34
63 0.37
64 0.32
65 0.31
66 0.29
67 0.26
68 0.25
69 0.27
70 0.21
71 0.2
72 0.19
73 0.19
74 0.21
75 0.22
76 0.23
77 0.22
78 0.22
79 0.21
80 0.23
81 0.23
82 0.27
83 0.26
84 0.24
85 0.23
86 0.22
87 0.21
88 0.22
89 0.22
90 0.21
91 0.23
92 0.24
93 0.25
94 0.26
95 0.28
96 0.26
97 0.3
98 0.31
99 0.3
100 0.3
101 0.29
102 0.28
103 0.3
104 0.29
105 0.29
106 0.3
107 0.31
108 0.3
109 0.31
110 0.34
111 0.31
112 0.32
113 0.27
114 0.26
115 0.21
116 0.21
117 0.22
118 0.19
119 0.19
120 0.15
121 0.17
122 0.15
123 0.16
124 0.2
125 0.19
126 0.26
127 0.27
128 0.35
129 0.37
130 0.44
131 0.53
132 0.57
133 0.64
134 0.64
135 0.73
136 0.7
137 0.69
138 0.71
139 0.66
140 0.6
141 0.56
142 0.54
143 0.46
144 0.42
145 0.37
146 0.27
147 0.23
148 0.2
149 0.17
150 0.1
151 0.08
152 0.07
153 0.08
154 0.11
155 0.09
156 0.09
157 0.15
158 0.15
159 0.18
160 0.26
161 0.32
162 0.37
163 0.45
164 0.46
165 0.46
166 0.48
167 0.52
168 0.5
169 0.5
170 0.5
171 0.5
172 0.5
173 0.52
174 0.51
175 0.45
176 0.4
177 0.36
178 0.29
179 0.22
180 0.21
181 0.15
182 0.14
183 0.19
184 0.19
185 0.15
186 0.17
187 0.22
188 0.3
189 0.35
190 0.4
191 0.45
192 0.55
193 0.66
194 0.74
195 0.78
196 0.79
197 0.84
198 0.88
199 0.88
200 0.85
201 0.78
202 0.7
203 0.66
204 0.6
205 0.52
206 0.5
207 0.48
208 0.45
209 0.52
210 0.54
211 0.57
212 0.65
213 0.74
214 0.75
215 0.77
216 0.81
217 0.81
218 0.83
219 0.83
220 0.79
221 0.74
222 0.65
223 0.58
224 0.51
225 0.41
226 0.34
227 0.29
228 0.28
229 0.25
230 0.24
231 0.21
232 0.21
233 0.2
234 0.19
235 0.16
236 0.12
237 0.11
238 0.11
239 0.12
240 0.1
241 0.11
242 0.12
243 0.12
244 0.1
245 0.09
246 0.07
247 0.08
248 0.08
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.09
254 0.09
255 0.08
256 0.08
257 0.08
258 0.06
259 0.08
260 0.07
261 0.07
262 0.1
263 0.14
264 0.13
265 0.15
266 0.18
267 0.22
268 0.25
269 0.26
270 0.33
271 0.38
272 0.42
273 0.44
274 0.42
275 0.36
276 0.33
277 0.34
278 0.25
279 0.17
280 0.17
281 0.13
282 0.12
283 0.13
284 0.14
285 0.12
286 0.16
287 0.18
288 0.15
289 0.22
290 0.27
291 0.28
292 0.31
293 0.36
294 0.39
295 0.41
296 0.43
297 0.37
298 0.39
299 0.39
300 0.36
301 0.33
302 0.26
303 0.22
304 0.21
305 0.2
306 0.14
307 0.11
308 0.1
309 0.11
310 0.1
311 0.12
312 0.14
313 0.12
314 0.16
315 0.23
316 0.29
317 0.35
318 0.38
319 0.44
320 0.5
321 0.54
322 0.52
323 0.48
324 0.47
325 0.46
326 0.49
327 0.45
328 0.41
329 0.36
330 0.35
331 0.33
332 0.31
333 0.26
334 0.21
335 0.19
336 0.2
337 0.2
338 0.2
339 0.2
340 0.17
341 0.15
342 0.13
343 0.11
344 0.05
345 0.05
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.04
351 0.04
352 0.04
353 0.04
354 0.05
355 0.04
356 0.03
357 0.04
358 0.04
359 0.04
360 0.04
361 0.04
362 0.04
363 0.04
364 0.03
365 0.03
366 0.03
367 0.03
368 0.04
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.06
377 0.06
378 0.07
379 0.07
380 0.07
381 0.08
382 0.08
383 0.08
384 0.07
385 0.07
386 0.06
387 0.05
388 0.06
389 0.04
390 0.04
391 0.04
392 0.03
393 0.03
394 0.03
395 0.03
396 0.03
397 0.04
398 0.04
399 0.04
400 0.08
401 0.11
402 0.11
403 0.12
404 0.12
405 0.12
406 0.14
407 0.16
408 0.15
409 0.2
410 0.23
411 0.31
412 0.39
413 0.45
414 0.53
415 0.59
416 0.65
417 0.68
418 0.75
419 0.77
420 0.8
421 0.86
422 0.88
423 0.9
424 0.92
425 0.94
426 0.95
427 0.94
428 0.93
429 0.89
430 0.84
431 0.78
432 0.7
433 0.62
434 0.54
435 0.44
436 0.34
437 0.29
438 0.21
439 0.19
440 0.16
441 0.13
442 0.1
443 0.1
444 0.11
445 0.08
446 0.08
447 0.07
448 0.07
449 0.07
450 0.08
451 0.08
452 0.07
453 0.09
454 0.09
455 0.1
456 0.11
457 0.14
458 0.16
459 0.18
460 0.21
461 0.25
462 0.3
463 0.38
464 0.44
465 0.49
466 0.52
467 0.57
468 0.59
469 0.59
470 0.58
471 0.53
472 0.49
473 0.45
474 0.41
475 0.33
476 0.28
477 0.26
478 0.21
479 0.19
480 0.17
481 0.14
482 0.22
483 0.24
484 0.28
485 0.28
486 0.32
487 0.38
488 0.46
489 0.48
490 0.47
491 0.54
492 0.59
493 0.64
494 0.68
495 0.65
496 0.62
497 0.64
498 0.61
499 0.59
500 0.55
501 0.53
502 0.52
503 0.5
504 0.45
505 0.42
506 0.4
507 0.39
508 0.33
509 0.3
510 0.24
511 0.25
512 0.22
513 0.21
514 0.23
515 0.22
516 0.2
517 0.23
518 0.23
519 0.25
520 0.31
521 0.33
522 0.31
523 0.35
524 0.44
525 0.5
526 0.57
527 0.65
528 0.66
529 0.65
530 0.63
531 0.57
532 0.5
533 0.39
534 0.3
535 0.2
536 0.16
537 0.15
538 0.15
539 0.13
540 0.14
541 0.15
542 0.17
543 0.18
544 0.18
545 0.2
546 0.23
547 0.24
548 0.22
549 0.23
550 0.23
551 0.21
552 0.22
553 0.23
554 0.24
555 0.27
556 0.27
557 0.26
558 0.28
559 0.31
560 0.28
561 0.26
562 0.25
563 0.28
564 0.38
565 0.47
566 0.52
567 0.57
568 0.64
569 0.68
570 0.75
571 0.76
572 0.7
573 0.69
574 0.63
575 0.6
576 0.54
577 0.52
578 0.47
579 0.41
580 0.4
581 0.36
582 0.33
583 0.27
584 0.27
585 0.28
586 0.29
587 0.28
588 0.31
589 0.29
590 0.29
591 0.31
592 0.33
593 0.35
594 0.33
595 0.35
596 0.34
597 0.3
598 0.3
599 0.31
600 0.29
601 0.23
602 0.22
603 0.19
604 0.14
605 0.17
606 0.17
607 0.13
608 0.1
609 0.1
610 0.12
611 0.14
612 0.14
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.14
617 0.15
618 0.12
619 0.13
620 0.17
621 0.18
622 0.23
623 0.29
624 0.28
625 0.28
626 0.33
627 0.34
628 0.31
629 0.36
630 0.33
631 0.3
632 0.29
633 0.28
634 0.27
635 0.26
636 0.26
637 0.23
638 0.25
639 0.28
640 0.33
641 0.36
642 0.34
643 0.37
644 0.44
645 0.43
646 0.41
647 0.41
648 0.4
649 0.41