Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DR85

Protein Details
Accession B0DR85    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
1-21MSNVPGKKRIRISSPPNTRKTHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 15.5, cyto_nucl 10, mito 7, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR040648  HMGXB3_CxC4  
IPR007527  Znf_SWIM  
Gene Ontology GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_307932  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF18717  CxC4  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50966  ZF_SWIM  
Amino Acid Sequences MSNVPGKKRIRISSPPNTRKTIRLAEPELQHGVPSTSQRRQLGIGSPQRQIRTSGPARSSNNKGSVGRLQTPEEQQTCVLPQTEGARERIDWDEGLEIQLDEGCEYRAEGEGVGNVNDAALAMPQEPDIQSSNSMFVEEVFDEHLPFWQLTETFFVANGWDVRARKPTARWYHVQISGIGDELIVSCMCPASTSRSTGLSASCFHIKFLLEYLEVKFPRSSQPYPLQDDSEVILFSRERGSQEGIWINHFSIPSTDINQTSLKARAVVQFDGDDEGTGSWACSKDSGQRCPHIAAASKFMMPDLGEDDRIEKASSDMNAQMIPRRRLRGKGPISYLPIPPPLWARIPSDPDFPQCTKPVDICGPPPLIMLTSGGTCHCANPRPEYDSSRPLRTRKCVIYGLNCAWESMIEVQPCGTCAKRNIGPDCQDLGLFNYDNDRLVTHALMDDYTSAYTVSEQTFTSWVTLLTRRYETMRSNTRFLTEGSFLDIWFAYVQLQCFDGDMICGVCGPTPEDTIWDGVTLAYGKKHVLPTLRPPTIIPDDAPSRGSRYVRHQQAIPGRDLRDAIRRVCRTKVIRLVITDMQETTENLQDVEEGEDEEQFEVDRAVQQRKAKAEKKSMEEYKRRLDDIPMISKGLAEVCSGLQTIFLQEYGMPALDAGSTPNDSYRLLLLHLAAEESVLQMANRPALKDLAIFVTEPTMRNASALVKIPALHGALRHEFAAPSGVSQTLLEVAHWLYKRGKEILQELIQNNSGLPERCLPSEHDGEDWIETGCCYSMRPIRLRPAYPNLKHDVRGDFNGQRGHKCSKYWDLYGKGSLTGGLMCVWCPHSVCYGFHNIPKGEGRNDVFSAIVTRWEKAPKRIIYDFACALGPYCMTREPQFFADTQFAVDGFHAKDHTKCSSASFLSTYTNIDPRLKDINTSAAECGNSGIKRMRKSVRWMSQDRAIIYAKIFLSVWNRNRIRAMDKKSPTETAKIEGMVPRNRDFKI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.82
3 0.8
4 0.79
5 0.74
6 0.69
7 0.68
8 0.66
9 0.63
10 0.62
11 0.62
12 0.63
13 0.63
14 0.62
15 0.57
16 0.48
17 0.4
18 0.32
19 0.28
20 0.24
21 0.29
22 0.32
23 0.34
24 0.42
25 0.44
26 0.45
27 0.45
28 0.46
29 0.46
30 0.48
31 0.52
32 0.49
33 0.53
34 0.56
35 0.56
36 0.53
37 0.5
38 0.43
39 0.44
40 0.45
41 0.48
42 0.49
43 0.54
44 0.59
45 0.62
46 0.65
47 0.63
48 0.62
49 0.6
50 0.55
51 0.52
52 0.54
53 0.53
54 0.52
55 0.48
56 0.46
57 0.46
58 0.51
59 0.54
60 0.47
61 0.42
62 0.36
63 0.35
64 0.33
65 0.3
66 0.26
67 0.18
68 0.19
69 0.22
70 0.28
71 0.29
72 0.29
73 0.28
74 0.27
75 0.31
76 0.31
77 0.28
78 0.21
79 0.2
80 0.2
81 0.18
82 0.19
83 0.16
84 0.12
85 0.1
86 0.11
87 0.1
88 0.08
89 0.08
90 0.08
91 0.08
92 0.08
93 0.09
94 0.09
95 0.09
96 0.09
97 0.09
98 0.11
99 0.12
100 0.12
101 0.12
102 0.1
103 0.09
104 0.09
105 0.08
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.06
110 0.06
111 0.07
112 0.09
113 0.09
114 0.11
115 0.13
116 0.14
117 0.16
118 0.16
119 0.18
120 0.16
121 0.17
122 0.14
123 0.12
124 0.14
125 0.12
126 0.12
127 0.12
128 0.12
129 0.12
130 0.13
131 0.14
132 0.12
133 0.12
134 0.12
135 0.12
136 0.12
137 0.12
138 0.16
139 0.16
140 0.14
141 0.14
142 0.14
143 0.12
144 0.14
145 0.14
146 0.11
147 0.15
148 0.16
149 0.19
150 0.26
151 0.29
152 0.32
153 0.36
154 0.45
155 0.5
156 0.55
157 0.57
158 0.57
159 0.62
160 0.61
161 0.56
162 0.47
163 0.4
164 0.34
165 0.3
166 0.23
167 0.15
168 0.11
169 0.1
170 0.1
171 0.06
172 0.06
173 0.05
174 0.06
175 0.06
176 0.06
177 0.07
178 0.14
179 0.17
180 0.2
181 0.21
182 0.23
183 0.25
184 0.25
185 0.26
186 0.2
187 0.19
188 0.2
189 0.24
190 0.22
191 0.21
192 0.22
193 0.21
194 0.19
195 0.2
196 0.19
197 0.14
198 0.16
199 0.18
200 0.24
201 0.23
202 0.25
203 0.23
204 0.22
205 0.28
206 0.34
207 0.33
208 0.33
209 0.43
210 0.47
211 0.53
212 0.54
213 0.48
214 0.42
215 0.41
216 0.34
217 0.26
218 0.19
219 0.12
220 0.12
221 0.1
222 0.1
223 0.12
224 0.12
225 0.13
226 0.15
227 0.19
228 0.18
229 0.23
230 0.28
231 0.26
232 0.27
233 0.27
234 0.25
235 0.23
236 0.23
237 0.18
238 0.13
239 0.15
240 0.14
241 0.16
242 0.18
243 0.16
244 0.19
245 0.19
246 0.19
247 0.19
248 0.2
249 0.18
250 0.17
251 0.18
252 0.21
253 0.23
254 0.23
255 0.21
256 0.19
257 0.19
258 0.19
259 0.17
260 0.12
261 0.09
262 0.08
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.07
268 0.07
269 0.08
270 0.09
271 0.18
272 0.25
273 0.33
274 0.36
275 0.4
276 0.42
277 0.43
278 0.44
279 0.38
280 0.37
281 0.3
282 0.3
283 0.27
284 0.25
285 0.24
286 0.21
287 0.19
288 0.13
289 0.12
290 0.11
291 0.11
292 0.11
293 0.11
294 0.13
295 0.13
296 0.14
297 0.13
298 0.09
299 0.09
300 0.11
301 0.12
302 0.12
303 0.12
304 0.12
305 0.13
306 0.14
307 0.18
308 0.23
309 0.27
310 0.3
311 0.35
312 0.38
313 0.41
314 0.47
315 0.52
316 0.52
317 0.54
318 0.54
319 0.53
320 0.56
321 0.54
322 0.49
323 0.41
324 0.37
325 0.3
326 0.26
327 0.24
328 0.2
329 0.2
330 0.21
331 0.23
332 0.24
333 0.29
334 0.3
335 0.32
336 0.31
337 0.32
338 0.35
339 0.33
340 0.32
341 0.29
342 0.3
343 0.27
344 0.26
345 0.26
346 0.25
347 0.25
348 0.23
349 0.24
350 0.23
351 0.21
352 0.21
353 0.17
354 0.13
355 0.12
356 0.11
357 0.07
358 0.07
359 0.07
360 0.07
361 0.09
362 0.09
363 0.1
364 0.13
365 0.17
366 0.19
367 0.24
368 0.26
369 0.29
370 0.31
371 0.36
372 0.38
373 0.42
374 0.43
375 0.46
376 0.48
377 0.49
378 0.52
379 0.52
380 0.54
381 0.48
382 0.5
383 0.47
384 0.46
385 0.45
386 0.45
387 0.41
388 0.38
389 0.34
390 0.29
391 0.24
392 0.2
393 0.16
394 0.13
395 0.15
396 0.11
397 0.11
398 0.11
399 0.11
400 0.12
401 0.12
402 0.1
403 0.09
404 0.11
405 0.17
406 0.21
407 0.26
408 0.29
409 0.33
410 0.36
411 0.36
412 0.36
413 0.31
414 0.27
415 0.21
416 0.19
417 0.16
418 0.12
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.1
424 0.09
425 0.07
426 0.08
427 0.08
428 0.06
429 0.07
430 0.06
431 0.06
432 0.06
433 0.06
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.05
440 0.06
441 0.06
442 0.07
443 0.07
444 0.08
445 0.09
446 0.09
447 0.09
448 0.08
449 0.07
450 0.08
451 0.11
452 0.12
453 0.14
454 0.14
455 0.15
456 0.17
457 0.2
458 0.21
459 0.26
460 0.34
461 0.34
462 0.36
463 0.35
464 0.34
465 0.32
466 0.29
467 0.25
468 0.17
469 0.14
470 0.15
471 0.15
472 0.13
473 0.13
474 0.12
475 0.09
476 0.07
477 0.07
478 0.05
479 0.06
480 0.06
481 0.06
482 0.07
483 0.06
484 0.07
485 0.07
486 0.05
487 0.04
488 0.05
489 0.04
490 0.03
491 0.03
492 0.03
493 0.04
494 0.04
495 0.05
496 0.06
497 0.07
498 0.07
499 0.08
500 0.09
501 0.09
502 0.09
503 0.08
504 0.07
505 0.06
506 0.06
507 0.06
508 0.05
509 0.05
510 0.06
511 0.06
512 0.08
513 0.09
514 0.11
515 0.14
516 0.16
517 0.26
518 0.34
519 0.34
520 0.32
521 0.32
522 0.35
523 0.35
524 0.33
525 0.24
526 0.18
527 0.19
528 0.2
529 0.21
530 0.16
531 0.15
532 0.18
533 0.19
534 0.18
535 0.24
536 0.32
537 0.37
538 0.38
539 0.37
540 0.39
541 0.45
542 0.45
543 0.4
544 0.35
545 0.3
546 0.29
547 0.29
548 0.25
549 0.26
550 0.26
551 0.27
552 0.31
553 0.34
554 0.36
555 0.37
556 0.43
557 0.39
558 0.43
559 0.48
560 0.43
561 0.42
562 0.4
563 0.42
564 0.37
565 0.34
566 0.28
567 0.2
568 0.17
569 0.15
570 0.14
571 0.12
572 0.11
573 0.1
574 0.09
575 0.09
576 0.08
577 0.08
578 0.09
579 0.08
580 0.06
581 0.06
582 0.06
583 0.07
584 0.07
585 0.06
586 0.05
587 0.05
588 0.04
589 0.04
590 0.08
591 0.11
592 0.14
593 0.18
594 0.22
595 0.26
596 0.32
597 0.41
598 0.44
599 0.48
600 0.55
601 0.56
602 0.59
603 0.63
604 0.65
605 0.65
606 0.67
607 0.65
608 0.64
609 0.61
610 0.57
611 0.49
612 0.43
613 0.41
614 0.39
615 0.39
616 0.31
617 0.29
618 0.27
619 0.26
620 0.24
621 0.17
622 0.13
623 0.07
624 0.07
625 0.06
626 0.07
627 0.07
628 0.07
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.05
635 0.05
636 0.06
637 0.06
638 0.06
639 0.05
640 0.04
641 0.05
642 0.05
643 0.05
644 0.05
645 0.06
646 0.06
647 0.07
648 0.08
649 0.09
650 0.09
651 0.09
652 0.1
653 0.09
654 0.09
655 0.1
656 0.09
657 0.09
658 0.09
659 0.08
660 0.07
661 0.06
662 0.05
663 0.05
664 0.05
665 0.04
666 0.04
667 0.06
668 0.07
669 0.11
670 0.11
671 0.12
672 0.12
673 0.13
674 0.14
675 0.12
676 0.13
677 0.11
678 0.11
679 0.11
680 0.1
681 0.12
682 0.13
683 0.13
684 0.14
685 0.14
686 0.13
687 0.13
688 0.14
689 0.13
690 0.15
691 0.17
692 0.15
693 0.15
694 0.15
695 0.16
696 0.17
697 0.16
698 0.13
699 0.12
700 0.15
701 0.16
702 0.17
703 0.17
704 0.15
705 0.14
706 0.14
707 0.16
708 0.11
709 0.1
710 0.1
711 0.1
712 0.09
713 0.09
714 0.09
715 0.08
716 0.08
717 0.08
718 0.08
719 0.08
720 0.13
721 0.13
722 0.16
723 0.18
724 0.2
725 0.24
726 0.26
727 0.28
728 0.27
729 0.3
730 0.35
731 0.35
732 0.38
733 0.35
734 0.35
735 0.33
736 0.29
737 0.26
738 0.2
739 0.19
740 0.15
741 0.16
742 0.18
743 0.18
744 0.19
745 0.21
746 0.23
747 0.26
748 0.29
749 0.28
750 0.24
751 0.23
752 0.23
753 0.22
754 0.19
755 0.14
756 0.1
757 0.09
758 0.09
759 0.08
760 0.07
761 0.07
762 0.12
763 0.17
764 0.24
765 0.29
766 0.34
767 0.43
768 0.5
769 0.53
770 0.54
771 0.58
772 0.62
773 0.61
774 0.62
775 0.59
776 0.56
777 0.55
778 0.52
779 0.49
780 0.42
781 0.42
782 0.42
783 0.38
784 0.39
785 0.44
786 0.42
787 0.39
788 0.4
789 0.44
790 0.41
791 0.4
792 0.42
793 0.45
794 0.48
795 0.5
796 0.52
797 0.51
798 0.51
799 0.53
800 0.47
801 0.37
802 0.32
803 0.26
804 0.19
805 0.14
806 0.11
807 0.09
808 0.08
809 0.08
810 0.09
811 0.11
812 0.11
813 0.12
814 0.13
815 0.17
816 0.2
817 0.21
818 0.23
819 0.3
820 0.32
821 0.34
822 0.39
823 0.33
824 0.35
825 0.39
826 0.39
827 0.33
828 0.37
829 0.37
830 0.35
831 0.35
832 0.32
833 0.26
834 0.23
835 0.23
836 0.16
837 0.21
838 0.18
839 0.18
840 0.21
841 0.3
842 0.34
843 0.39
844 0.49
845 0.46
846 0.53
847 0.55
848 0.58
849 0.53
850 0.54
851 0.47
852 0.39
853 0.35
854 0.27
855 0.25
856 0.19
857 0.16
858 0.11
859 0.12
860 0.13
861 0.16
862 0.2
863 0.23
864 0.25
865 0.27
866 0.29
867 0.27
868 0.28
869 0.29
870 0.25
871 0.23
872 0.19
873 0.16
874 0.15
875 0.14
876 0.15
877 0.12
878 0.13
879 0.15
880 0.16
881 0.19
882 0.23
883 0.27
884 0.26
885 0.26
886 0.28
887 0.33
888 0.33
889 0.32
890 0.29
891 0.27
892 0.27
893 0.28
894 0.27
895 0.23
896 0.26
897 0.27
898 0.29
899 0.29
900 0.3
901 0.37
902 0.34
903 0.33
904 0.31
905 0.36
906 0.34
907 0.36
908 0.32
909 0.27
910 0.27
911 0.24
912 0.24
913 0.22
914 0.19
915 0.21
916 0.27
917 0.31
918 0.35
919 0.44
920 0.51
921 0.51
922 0.61
923 0.68
924 0.7
925 0.74
926 0.75
927 0.72
928 0.71
929 0.7
930 0.61
931 0.55
932 0.47
933 0.39
934 0.34
935 0.34
936 0.26
937 0.22
938 0.21
939 0.2
940 0.26
941 0.34
942 0.39
943 0.44
944 0.46
945 0.48
946 0.52
947 0.53
948 0.55
949 0.55
950 0.58
951 0.58
952 0.63
953 0.67
954 0.67
955 0.7
956 0.65
957 0.62
958 0.56
959 0.5
960 0.47
961 0.4
962 0.39
963 0.37
964 0.41
965 0.41
966 0.43
967 0.44