Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1QBX1

Protein Details
Accession N1QBX1    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
425-446MSDAPPKRGRGRPKQPKEAPEVBasic
565-595ATGNDRGRGRKGKKPNKGKGKKRSRMGDGTVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
430-441PKRGRGRPKQPK
567-589GNDRGRGRKGKKPNKGKGKKRSR
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 11.5, mito 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011665  BRF1_TBP-bd_dom  
IPR036915  Cyclin-like_sf  
IPR000812  TFIIB  
IPR013150  TFIIB_cyclin  
Gene Ontology GO:0017025  F:TBP-class protein binding  
GO:0070897  P:transcription preinitiation complex assembly  
KEGG pfj:MYCFIDRAFT_107563  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07741  BRF1  
PF00382  TFIIB  
CDD cd20554  CYCLIN_TFIIIB90_rpt2  
Amino Acid Sequences PRGPKIAQENAARSCPSCKGTDLADDEGQLICKNCYTQVSESDIVSDITFADAANGKATVQGGTVSDNSRHARTLGAGAFHKVGGGERNTLADIQHAGKKALEALTPKLPIEETVAMQANQIWTLAANINFSAGRKTDEVVAACLYAACRRQKQNKVLLMDIAELVKINVFRLGEVYKDMCRELYFNNESVGQQHLVDLEPLIYKYCDKLQFGSKTQDVAADALKIIKRMNRDWIVSGRHPAGLCGACIILAARMNNFQRTVREVVFVSKVADITIAKRVEEFRRTKSAGLTVEQFREYGNKMVYQHDPPSRYAKEERLQKLANRREDASKRKRDDEHDGTEAADAASEDESPHDRYNAPKRRRLAAPVTEDPSLQSPAAATLPPSQVAYQDWRLRADGFVGPPRSQRANTADPSLRNTRESSVMSDAPPKRGRGRPKQPKEAPEVDISQEELDVETYLEDQIDRYLADGEVQESKNEVDKLKEEERILQEEKRAAFFGAIPEWNPGDKLDAADLEMEFENDLEVANCLLSPEEVKIKSQIWVAHNEDWLRKQAEKDMLAKVAKATGNDRGRGRKGKKPNKGKGKKRSRMGDGTVITESSTPIETPADAARAMLEKRAPMKSQFVDFSALQRIYGRTPSRASSTTPGASASRQG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.41
3 0.37
4 0.32
5 0.3
6 0.28
7 0.3
8 0.36
9 0.36
10 0.36
11 0.34
12 0.31
13 0.3
14 0.28
15 0.26
16 0.21
17 0.18
18 0.13
19 0.14
20 0.14
21 0.16
22 0.19
23 0.23
24 0.25
25 0.29
26 0.36
27 0.36
28 0.35
29 0.34
30 0.31
31 0.26
32 0.22
33 0.17
34 0.1
35 0.09
36 0.09
37 0.07
38 0.09
39 0.1
40 0.11
41 0.12
42 0.12
43 0.11
44 0.13
45 0.13
46 0.11
47 0.09
48 0.1
49 0.1
50 0.12
51 0.15
52 0.16
53 0.17
54 0.22
55 0.25
56 0.26
57 0.26
58 0.24
59 0.23
60 0.22
61 0.27
62 0.23
63 0.25
64 0.24
65 0.25
66 0.26
67 0.24
68 0.22
69 0.16
70 0.15
71 0.17
72 0.18
73 0.18
74 0.18
75 0.2
76 0.2
77 0.2
78 0.19
79 0.15
80 0.16
81 0.16
82 0.2
83 0.2
84 0.2
85 0.2
86 0.2
87 0.22
88 0.21
89 0.21
90 0.19
91 0.22
92 0.27
93 0.28
94 0.27
95 0.25
96 0.23
97 0.21
98 0.23
99 0.21
100 0.16
101 0.19
102 0.21
103 0.2
104 0.2
105 0.21
106 0.16
107 0.14
108 0.13
109 0.09
110 0.07
111 0.09
112 0.12
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.12
117 0.13
118 0.13
119 0.14
120 0.12
121 0.14
122 0.14
123 0.15
124 0.17
125 0.2
126 0.21
127 0.2
128 0.19
129 0.16
130 0.15
131 0.15
132 0.12
133 0.12
134 0.16
135 0.21
136 0.27
137 0.36
138 0.46
139 0.55
140 0.63
141 0.7
142 0.71
143 0.69
144 0.63
145 0.57
146 0.48
147 0.4
148 0.31
149 0.22
150 0.15
151 0.11
152 0.09
153 0.09
154 0.08
155 0.07
156 0.09
157 0.08
158 0.08
159 0.11
160 0.12
161 0.11
162 0.13
163 0.15
164 0.15
165 0.16
166 0.16
167 0.15
168 0.15
169 0.16
170 0.15
171 0.21
172 0.22
173 0.21
174 0.22
175 0.22
176 0.22
177 0.21
178 0.22
179 0.14
180 0.12
181 0.11
182 0.11
183 0.1
184 0.1
185 0.09
186 0.07
187 0.07
188 0.07
189 0.08
190 0.08
191 0.08
192 0.1
193 0.16
194 0.19
195 0.19
196 0.22
197 0.29
198 0.35
199 0.38
200 0.42
201 0.37
202 0.34
203 0.33
204 0.31
205 0.24
206 0.19
207 0.16
208 0.11
209 0.1
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.12
214 0.14
215 0.17
216 0.19
217 0.27
218 0.28
219 0.29
220 0.31
221 0.35
222 0.39
223 0.36
224 0.37
225 0.3
226 0.28
227 0.27
228 0.24
229 0.22
230 0.17
231 0.15
232 0.12
233 0.11
234 0.08
235 0.09
236 0.08
237 0.05
238 0.07
239 0.07
240 0.07
241 0.12
242 0.13
243 0.15
244 0.16
245 0.16
246 0.17
247 0.21
248 0.24
249 0.2
250 0.2
251 0.19
252 0.2
253 0.21
254 0.19
255 0.16
256 0.13
257 0.12
258 0.1
259 0.11
260 0.09
261 0.09
262 0.15
263 0.14
264 0.13
265 0.14
266 0.18
267 0.21
268 0.29
269 0.31
270 0.29
271 0.36
272 0.37
273 0.37
274 0.36
275 0.36
276 0.3
277 0.28
278 0.28
279 0.23
280 0.23
281 0.22
282 0.2
283 0.16
284 0.16
285 0.16
286 0.14
287 0.13
288 0.14
289 0.15
290 0.18
291 0.21
292 0.22
293 0.26
294 0.27
295 0.28
296 0.27
297 0.33
298 0.31
299 0.32
300 0.32
301 0.32
302 0.35
303 0.41
304 0.42
305 0.41
306 0.42
307 0.42
308 0.49
309 0.5
310 0.49
311 0.42
312 0.41
313 0.43
314 0.48
315 0.55
316 0.55
317 0.58
318 0.55
319 0.59
320 0.61
321 0.58
322 0.61
323 0.57
324 0.52
325 0.44
326 0.41
327 0.36
328 0.32
329 0.28
330 0.18
331 0.11
332 0.06
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.05
338 0.07
339 0.09
340 0.1
341 0.1
342 0.11
343 0.17
344 0.28
345 0.37
346 0.41
347 0.44
348 0.47
349 0.52
350 0.54
351 0.54
352 0.51
353 0.48
354 0.5
355 0.48
356 0.48
357 0.42
358 0.39
359 0.34
360 0.28
361 0.22
362 0.14
363 0.1
364 0.08
365 0.08
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.1
370 0.11
371 0.11
372 0.12
373 0.11
374 0.11
375 0.13
376 0.16
377 0.19
378 0.22
379 0.23
380 0.24
381 0.24
382 0.24
383 0.23
384 0.21
385 0.17
386 0.15
387 0.2
388 0.21
389 0.21
390 0.22
391 0.26
392 0.26
393 0.24
394 0.26
395 0.27
396 0.31
397 0.32
398 0.36
399 0.36
400 0.34
401 0.39
402 0.4
403 0.35
404 0.31
405 0.3
406 0.26
407 0.27
408 0.27
409 0.25
410 0.23
411 0.23
412 0.23
413 0.3
414 0.3
415 0.33
416 0.35
417 0.34
418 0.37
419 0.42
420 0.51
421 0.53
422 0.63
423 0.68
424 0.74
425 0.82
426 0.82
427 0.81
428 0.8
429 0.74
430 0.65
431 0.57
432 0.5
433 0.4
434 0.34
435 0.29
436 0.21
437 0.15
438 0.12
439 0.09
440 0.07
441 0.06
442 0.05
443 0.05
444 0.05
445 0.05
446 0.05
447 0.05
448 0.05
449 0.05
450 0.06
451 0.05
452 0.06
453 0.07
454 0.07
455 0.08
456 0.08
457 0.09
458 0.14
459 0.15
460 0.14
461 0.14
462 0.15
463 0.18
464 0.2
465 0.19
466 0.16
467 0.18
468 0.25
469 0.28
470 0.31
471 0.28
472 0.33
473 0.35
474 0.39
475 0.39
476 0.35
477 0.34
478 0.34
479 0.35
480 0.3
481 0.27
482 0.21
483 0.19
484 0.18
485 0.17
486 0.16
487 0.16
488 0.15
489 0.16
490 0.17
491 0.16
492 0.16
493 0.13
494 0.13
495 0.13
496 0.13
497 0.12
498 0.11
499 0.12
500 0.12
501 0.12
502 0.11
503 0.11
504 0.1
505 0.08
506 0.08
507 0.08
508 0.06
509 0.06
510 0.04
511 0.05
512 0.05
513 0.05
514 0.05
515 0.05
516 0.05
517 0.06
518 0.06
519 0.08
520 0.15
521 0.15
522 0.17
523 0.2
524 0.21
525 0.23
526 0.26
527 0.3
528 0.26
529 0.33
530 0.36
531 0.37
532 0.4
533 0.4
534 0.4
535 0.36
536 0.39
537 0.35
538 0.32
539 0.3
540 0.34
541 0.39
542 0.39
543 0.41
544 0.39
545 0.42
546 0.41
547 0.39
548 0.33
549 0.3
550 0.28
551 0.26
552 0.25
553 0.29
554 0.33
555 0.38
556 0.43
557 0.46
558 0.52
559 0.6
560 0.63
561 0.63
562 0.69
563 0.74
564 0.8
565 0.83
566 0.86
567 0.87
568 0.92
569 0.93
570 0.93
571 0.94
572 0.92
573 0.91
574 0.9
575 0.87
576 0.85
577 0.8
578 0.78
579 0.68
580 0.62
581 0.53
582 0.44
583 0.36
584 0.27
585 0.22
586 0.14
587 0.14
588 0.1
589 0.1
590 0.11
591 0.11
592 0.13
593 0.14
594 0.14
595 0.13
596 0.13
597 0.13
598 0.17
599 0.17
600 0.19
601 0.19
602 0.22
603 0.28
604 0.33
605 0.35
606 0.35
607 0.43
608 0.43
609 0.46
610 0.44
611 0.41
612 0.4
613 0.37
614 0.37
615 0.37
616 0.33
617 0.28
618 0.28
619 0.28
620 0.27
621 0.35
622 0.35
623 0.32
624 0.36
625 0.39
626 0.43
627 0.43
628 0.44
629 0.41
630 0.44
631 0.41
632 0.38
633 0.37
634 0.32