Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D5T7

Protein Details
Accession B0D5T7    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
216-235QRDKASGKKKPKAASKPGLGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
22-29PAKPSAAK
68-78PPKKKGTLKQK
215-234EQRDKASGKKKPKAASKPGL
Subcellular Location(s) nucl 19, cyto_nucl 14, cyto 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR023194  eIF3-like_dom_sf  
IPR013906  eIF3j  
Gene Ontology GO:0016282  C:eukaryotic 43S preinitiation complex  
GO:0033290  C:eukaryotic 48S preinitiation complex  
GO:0005852  C:eukaryotic translation initiation factor 3 complex  
GO:0003743  F:translation initiation factor activity  
GO:0001732  P:formation of cytoplasmic translation initiation complex  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_318032  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08597  eIF3_subunit  
Amino Acid Sequences MSDWEGSDSDTAPVVKGKPAAPAKPSAAKPIKSKWEGEDKEEEGPVSDWEESSEEESEEEAKPAPVAPPKKKGTLKQKLAEKEAEKALRQANGENSDEYDSDAVLDPREKARRDKEKELNADLNNAAELFGAAALGGTSSAELDALISAQPRTKEDFQKLSASIIEFIVKRHEAKPLYPSFVEHFARAVALPLKDVEVRKVASGLMTLANEKQKEQRDKASGKKKPKAASKPGLGGAKVSSRLDTGAYEEALDDFGNDDFM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.16
2 0.17
3 0.2
4 0.2
5 0.27
6 0.34
7 0.38
8 0.37
9 0.42
10 0.44
11 0.49
12 0.49
13 0.51
14 0.52
15 0.52
16 0.55
17 0.58
18 0.63
19 0.58
20 0.59
21 0.55
22 0.58
23 0.55
24 0.55
25 0.53
26 0.45
27 0.44
28 0.42
29 0.36
30 0.27
31 0.25
32 0.21
33 0.16
34 0.14
35 0.11
36 0.12
37 0.13
38 0.12
39 0.13
40 0.13
41 0.11
42 0.11
43 0.12
44 0.13
45 0.12
46 0.12
47 0.1
48 0.09
49 0.09
50 0.1
51 0.13
52 0.18
53 0.26
54 0.31
55 0.39
56 0.43
57 0.52
58 0.56
59 0.62
60 0.66
61 0.69
62 0.71
63 0.7
64 0.74
65 0.71
66 0.69
67 0.67
68 0.57
69 0.5
70 0.48
71 0.43
72 0.36
73 0.34
74 0.32
75 0.29
76 0.28
77 0.26
78 0.25
79 0.26
80 0.27
81 0.23
82 0.22
83 0.21
84 0.2
85 0.18
86 0.13
87 0.09
88 0.08
89 0.09
90 0.08
91 0.07
92 0.08
93 0.08
94 0.13
95 0.18
96 0.19
97 0.25
98 0.34
99 0.44
100 0.5
101 0.59
102 0.62
103 0.65
104 0.68
105 0.66
106 0.62
107 0.52
108 0.47
109 0.37
110 0.29
111 0.2
112 0.16
113 0.11
114 0.05
115 0.05
116 0.03
117 0.03
118 0.02
119 0.02
120 0.02
121 0.02
122 0.02
123 0.02
124 0.02
125 0.02
126 0.02
127 0.02
128 0.02
129 0.02
130 0.02
131 0.02
132 0.03
133 0.03
134 0.04
135 0.04
136 0.06
137 0.07
138 0.09
139 0.14
140 0.19
141 0.24
142 0.29
143 0.33
144 0.34
145 0.37
146 0.36
147 0.32
148 0.28
149 0.23
150 0.19
151 0.14
152 0.14
153 0.11
154 0.11
155 0.14
156 0.14
157 0.16
158 0.16
159 0.22
160 0.21
161 0.23
162 0.31
163 0.3
164 0.33
165 0.31
166 0.32
167 0.28
168 0.33
169 0.33
170 0.25
171 0.22
172 0.18
173 0.18
174 0.16
175 0.16
176 0.12
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.13
181 0.16
182 0.16
183 0.17
184 0.17
185 0.18
186 0.17
187 0.18
188 0.16
189 0.13
190 0.13
191 0.12
192 0.1
193 0.1
194 0.11
195 0.13
196 0.18
197 0.19
198 0.2
199 0.26
200 0.33
201 0.41
202 0.45
203 0.51
204 0.55
205 0.61
206 0.7
207 0.74
208 0.73
209 0.75
210 0.78
211 0.77
212 0.76
213 0.8
214 0.8
215 0.8
216 0.8
217 0.77
218 0.74
219 0.73
220 0.68
221 0.58
222 0.49
223 0.41
224 0.37
225 0.34
226 0.29
227 0.24
228 0.21
229 0.21
230 0.21
231 0.19
232 0.18
233 0.17
234 0.16
235 0.15
236 0.15
237 0.14
238 0.14
239 0.13
240 0.09
241 0.07