Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DJH4

Protein Details
Accession B0DJH4    Localization Confidence High Confidence Score 25.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
123-149YVKRSNALKNLRFRKNKSQDKTQPEASHydrophilic
200-230RQLSPPPSHPPPREKPKPRPIKKPQATTVDAHydrophilic
741-765QEDRKRIECRGRRTRKGKAKETIQEBasic
771-793DVVFVPQKPKPRPRPINKSSSSGHydrophilic
825-846IGDVKSQRPKRPTAKKFPFDLDHydrophilic
884-908TNSPPLAVKKRPQTRAKTRRGSSSEHydrophilic
919-941GDRSDASRTRRGRKIQKVESFMDHydrophilic
1000-1029SESSTTKPLEWARRRRQEKQAKDRAQRGHGHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
205-224PPSHPPPREKPKPRPIKKPQ
750-759RGRRTRKGKA
1012-1026RRRRQEKQAKDRAQR
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039024  RTC4  
IPR028094  RTC4_C  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0005634  C:nucleus  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_303446  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF14474  RTC4  
Amino Acid Sequences MENLESELEANEETLQTSTAIRLPKRHGLNLTAKVNGKAFTDLGGSNFEVKSSGASSGTRKPITTYMSRSKGQRGALPLVVDSGSSSPDELDSLSQSDTHSPTKKPRKMFDEDVQAESVDNEYVKRSNALKNLRFRKNKSQDKTQPEASGSKAPPSKENEPRVVKDAGIASKRSLASKPAKPRLDDCETSRPLGDKSPNRQLSPPPSHPPPREKPKPRPIKKPQATTVDAAPKTTKKPNIPTVKKPHFPLPVKRAPLPSETEESRAAHSNLGISSKTRLPDQFPFLSPTSQHTPRATSSKTAERLPFSPPKSRVDDFPFPSPLASDNRGKKITPSAFPMPSPQSFDASLKGKGKALTVSAEDDEEDEDGSYGRKSKGTRLEPFPMNTQILRSVSSPSVQSSQAMKRNSDGICSDGDQHVKKRRKDDEDDMLPGHHAFEDDDDTLFMSPSVDPKTLCPYCDTPLPTSPTPFLESLLAKVCKKSTRDPRPANPLGRKAPLATFIAVCQRHRFESQILPEAEQKGWPKTIDWAKVGGRVEAMRDSLQALINDRDANDGVEFFWPTEGPRSKCVFWRDVVSEVKQKGSRAVAGVRGQFANFEKTQPGYYGELGSVIIHQTLYNLFPPSELDPDLISPLTSNEFIQRILVPEVAVRLIKEDQNLEGDVGTTEALQILRESSAYGVAMFPEDSGESAGVGPSRGFRGQRREDEMDAGDLIVMERARKRRKELEEEDEHEKEQEEQEQEDRKRIECRGRRTRKGKAKETIQEEDSGSDVVFVPQKPKPRPRPINKSSSSGALANADVEDEVVVSVREAKASRKMSNATLTDIGDVKSQRPKRPTAKKFPFDLDSAVDSTDDDSSSLLDPSPRHRSLSANETGNQSVRVSPTNSPPLAVKKRPQTRAKTRRGSSSEVNLYSTSESEGDRSDASRTRRGRKIQKVESFMDTAVHSLEIEDDDDLHGDHYTKTPIAKRDRQSTVEITDDDTPKPVRSPPSRVSSAVSAASESSTTKPLEWARRRRQEKQAKDRAQRGHG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.09
2 0.1
3 0.09
4 0.1
5 0.11
6 0.14
7 0.21
8 0.23
9 0.3
10 0.36
11 0.44
12 0.5
13 0.54
14 0.55
15 0.56
16 0.62
17 0.65
18 0.62
19 0.59
20 0.55
21 0.51
22 0.49
23 0.43
24 0.35
25 0.29
26 0.25
27 0.21
28 0.21
29 0.19
30 0.18
31 0.2
32 0.19
33 0.2
34 0.19
35 0.18
36 0.16
37 0.15
38 0.16
39 0.14
40 0.15
41 0.13
42 0.16
43 0.21
44 0.28
45 0.36
46 0.36
47 0.35
48 0.36
49 0.4
50 0.44
51 0.46
52 0.47
53 0.49
54 0.53
55 0.57
56 0.57
57 0.6
58 0.59
59 0.56
60 0.52
61 0.48
62 0.48
63 0.46
64 0.43
65 0.36
66 0.32
67 0.28
68 0.22
69 0.17
70 0.12
71 0.11
72 0.1
73 0.1
74 0.08
75 0.09
76 0.09
77 0.09
78 0.1
79 0.1
80 0.12
81 0.12
82 0.13
83 0.13
84 0.17
85 0.2
86 0.26
87 0.29
88 0.33
89 0.43
90 0.54
91 0.6
92 0.64
93 0.69
94 0.7
95 0.73
96 0.77
97 0.74
98 0.74
99 0.7
100 0.64
101 0.56
102 0.48
103 0.4
104 0.32
105 0.24
106 0.14
107 0.11
108 0.09
109 0.11
110 0.12
111 0.13
112 0.17
113 0.2
114 0.26
115 0.34
116 0.44
117 0.48
118 0.57
119 0.66
120 0.73
121 0.78
122 0.79
123 0.82
124 0.82
125 0.86
126 0.83
127 0.84
128 0.83
129 0.83
130 0.83
131 0.77
132 0.7
133 0.63
134 0.58
135 0.5
136 0.49
137 0.41
138 0.42
139 0.4
140 0.37
141 0.4
142 0.45
143 0.5
144 0.51
145 0.57
146 0.59
147 0.62
148 0.64
149 0.63
150 0.57
151 0.47
152 0.41
153 0.39
154 0.36
155 0.33
156 0.3
157 0.27
158 0.31
159 0.32
160 0.32
161 0.28
162 0.3
163 0.35
164 0.42
165 0.52
166 0.56
167 0.59
168 0.6
169 0.63
170 0.63
171 0.62
172 0.58
173 0.53
174 0.54
175 0.51
176 0.5
177 0.47
178 0.41
179 0.34
180 0.37
181 0.39
182 0.38
183 0.43
184 0.52
185 0.56
186 0.57
187 0.59
188 0.6
189 0.61
190 0.62
191 0.61
192 0.57
193 0.6
194 0.67
195 0.7
196 0.72
197 0.72
198 0.73
199 0.77
200 0.8
201 0.83
202 0.85
203 0.9
204 0.89
205 0.9
206 0.9
207 0.91
208 0.89
209 0.88
210 0.85
211 0.82
212 0.76
213 0.67
214 0.63
215 0.6
216 0.52
217 0.44
218 0.4
219 0.35
220 0.37
221 0.42
222 0.43
223 0.41
224 0.49
225 0.57
226 0.65
227 0.69
228 0.74
229 0.77
230 0.79
231 0.77
232 0.73
233 0.71
234 0.7
235 0.69
236 0.69
237 0.67
238 0.67
239 0.66
240 0.66
241 0.62
242 0.55
243 0.52
244 0.48
245 0.42
246 0.39
247 0.35
248 0.35
249 0.33
250 0.31
251 0.29
252 0.28
253 0.25
254 0.21
255 0.19
256 0.18
257 0.16
258 0.17
259 0.15
260 0.13
261 0.15
262 0.17
263 0.18
264 0.19
265 0.21
266 0.24
267 0.29
268 0.34
269 0.35
270 0.33
271 0.37
272 0.35
273 0.34
274 0.3
275 0.3
276 0.31
277 0.31
278 0.33
279 0.3
280 0.32
281 0.34
282 0.4
283 0.36
284 0.34
285 0.35
286 0.39
287 0.4
288 0.42
289 0.41
290 0.38
291 0.38
292 0.4
293 0.43
294 0.39
295 0.44
296 0.43
297 0.45
298 0.48
299 0.48
300 0.47
301 0.47
302 0.52
303 0.47
304 0.48
305 0.45
306 0.38
307 0.37
308 0.32
309 0.26
310 0.23
311 0.23
312 0.26
313 0.29
314 0.35
315 0.36
316 0.36
317 0.35
318 0.4
319 0.42
320 0.37
321 0.38
322 0.38
323 0.38
324 0.38
325 0.41
326 0.36
327 0.32
328 0.35
329 0.29
330 0.25
331 0.25
332 0.26
333 0.25
334 0.24
335 0.27
336 0.25
337 0.25
338 0.25
339 0.24
340 0.25
341 0.22
342 0.2
343 0.17
344 0.16
345 0.17
346 0.15
347 0.14
348 0.13
349 0.12
350 0.11
351 0.09
352 0.07
353 0.05
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.06
358 0.08
359 0.09
360 0.12
361 0.13
362 0.21
363 0.3
364 0.37
365 0.44
366 0.47
367 0.53
368 0.53
369 0.54
370 0.5
371 0.44
372 0.38
373 0.31
374 0.26
375 0.22
376 0.2
377 0.19
378 0.16
379 0.16
380 0.15
381 0.16
382 0.16
383 0.14
384 0.16
385 0.14
386 0.16
387 0.18
388 0.23
389 0.28
390 0.29
391 0.28
392 0.27
393 0.32
394 0.3
395 0.28
396 0.22
397 0.17
398 0.16
399 0.17
400 0.17
401 0.14
402 0.18
403 0.17
404 0.23
405 0.31
406 0.38
407 0.41
408 0.48
409 0.55
410 0.58
411 0.64
412 0.65
413 0.64
414 0.61
415 0.59
416 0.51
417 0.43
418 0.35
419 0.28
420 0.21
421 0.12
422 0.08
423 0.05
424 0.06
425 0.08
426 0.08
427 0.08
428 0.08
429 0.08
430 0.08
431 0.08
432 0.07
433 0.05
434 0.05
435 0.07
436 0.1
437 0.1
438 0.11
439 0.12
440 0.21
441 0.21
442 0.21
443 0.22
444 0.21
445 0.23
446 0.27
447 0.28
448 0.22
449 0.26
450 0.3
451 0.28
452 0.27
453 0.26
454 0.23
455 0.23
456 0.21
457 0.17
458 0.14
459 0.14
460 0.14
461 0.18
462 0.19
463 0.17
464 0.18
465 0.2
466 0.22
467 0.25
468 0.32
469 0.38
470 0.46
471 0.56
472 0.62
473 0.66
474 0.71
475 0.74
476 0.72
477 0.66
478 0.62
479 0.55
480 0.5
481 0.45
482 0.36
483 0.31
484 0.26
485 0.22
486 0.16
487 0.13
488 0.12
489 0.18
490 0.18
491 0.18
492 0.18
493 0.18
494 0.2
495 0.2
496 0.21
497 0.18
498 0.22
499 0.24
500 0.28
501 0.27
502 0.26
503 0.27
504 0.27
505 0.24
506 0.22
507 0.2
508 0.15
509 0.16
510 0.15
511 0.14
512 0.18
513 0.23
514 0.24
515 0.23
516 0.25
517 0.24
518 0.29
519 0.28
520 0.22
521 0.18
522 0.15
523 0.15
524 0.12
525 0.13
526 0.08
527 0.08
528 0.09
529 0.09
530 0.1
531 0.1
532 0.11
533 0.1
534 0.11
535 0.11
536 0.11
537 0.11
538 0.09
539 0.1
540 0.08
541 0.07
542 0.07
543 0.07
544 0.07
545 0.06
546 0.06
547 0.06
548 0.06
549 0.13
550 0.18
551 0.19
552 0.25
553 0.28
554 0.29
555 0.34
556 0.38
557 0.34
558 0.29
559 0.32
560 0.28
561 0.29
562 0.3
563 0.28
564 0.29
565 0.27
566 0.3
567 0.27
568 0.26
569 0.24
570 0.23
571 0.22
572 0.18
573 0.19
574 0.2
575 0.21
576 0.22
577 0.2
578 0.19
579 0.18
580 0.18
581 0.17
582 0.17
583 0.14
584 0.14
585 0.14
586 0.15
587 0.16
588 0.15
589 0.16
590 0.14
591 0.14
592 0.14
593 0.12
594 0.11
595 0.11
596 0.1
597 0.08
598 0.06
599 0.05
600 0.05
601 0.05
602 0.05
603 0.06
604 0.07
605 0.08
606 0.09
607 0.08
608 0.09
609 0.1
610 0.12
611 0.13
612 0.12
613 0.11
614 0.11
615 0.11
616 0.12
617 0.1
618 0.08
619 0.06
620 0.07
621 0.08
622 0.08
623 0.08
624 0.09
625 0.1
626 0.1
627 0.11
628 0.11
629 0.11
630 0.12
631 0.12
632 0.1
633 0.09
634 0.1
635 0.1
636 0.1
637 0.07
638 0.09
639 0.1
640 0.11
641 0.12
642 0.13
643 0.13
644 0.14
645 0.15
646 0.12
647 0.1
648 0.09
649 0.08
650 0.07
651 0.07
652 0.05
653 0.04
654 0.05
655 0.05
656 0.05
657 0.05
658 0.05
659 0.05
660 0.06
661 0.06
662 0.05
663 0.06
664 0.06
665 0.06
666 0.05
667 0.05
668 0.06
669 0.06
670 0.05
671 0.05
672 0.05
673 0.05
674 0.06
675 0.05
676 0.05
677 0.05
678 0.06
679 0.05
680 0.06
681 0.06
682 0.06
683 0.09
684 0.11
685 0.14
686 0.19
687 0.29
688 0.36
689 0.42
690 0.49
691 0.5
692 0.49
693 0.49
694 0.44
695 0.36
696 0.28
697 0.22
698 0.14
699 0.1
700 0.09
701 0.07
702 0.06
703 0.07
704 0.12
705 0.21
706 0.29
707 0.33
708 0.4
709 0.48
710 0.56
711 0.65
712 0.68
713 0.68
714 0.68
715 0.68
716 0.68
717 0.6
718 0.52
719 0.42
720 0.35
721 0.27
722 0.2
723 0.21
724 0.16
725 0.17
726 0.22
727 0.3
728 0.3
729 0.35
730 0.35
731 0.32
732 0.35
733 0.39
734 0.45
735 0.44
736 0.54
737 0.59
738 0.68
739 0.76
740 0.79
741 0.84
742 0.84
743 0.86
744 0.85
745 0.82
746 0.81
747 0.79
748 0.78
749 0.73
750 0.64
751 0.56
752 0.47
753 0.39
754 0.3
755 0.23
756 0.15
757 0.11
758 0.1
759 0.09
760 0.11
761 0.11
762 0.15
763 0.18
764 0.27
765 0.35
766 0.45
767 0.54
768 0.62
769 0.73
770 0.79
771 0.87
772 0.86
773 0.88
774 0.81
775 0.76
776 0.66
777 0.59
778 0.51
779 0.4
780 0.33
781 0.24
782 0.2
783 0.16
784 0.14
785 0.1
786 0.07
787 0.07
788 0.05
789 0.04
790 0.04
791 0.04
792 0.04
793 0.04
794 0.07
795 0.07
796 0.09
797 0.1
798 0.14
799 0.23
800 0.28
801 0.31
802 0.33
803 0.36
804 0.38
805 0.45
806 0.43
807 0.38
808 0.35
809 0.33
810 0.29
811 0.27
812 0.24
813 0.2
814 0.2
815 0.19
816 0.26
817 0.33
818 0.38
819 0.43
820 0.51
821 0.58
822 0.69
823 0.75
824 0.78
825 0.82
826 0.81
827 0.81
828 0.77
829 0.7
830 0.61
831 0.53
832 0.44
833 0.36
834 0.3
835 0.25
836 0.19
837 0.16
838 0.15
839 0.13
840 0.1
841 0.08
842 0.07
843 0.08
844 0.09
845 0.09
846 0.09
847 0.11
848 0.13
849 0.2
850 0.29
851 0.29
852 0.31
853 0.32
854 0.37
855 0.39
856 0.45
857 0.45
858 0.4
859 0.41
860 0.41
861 0.42
862 0.38
863 0.34
864 0.27
865 0.22
866 0.21
867 0.22
868 0.22
869 0.23
870 0.3
871 0.37
872 0.36
873 0.34
874 0.36
875 0.42
876 0.48
877 0.52
878 0.52
879 0.54
880 0.64
881 0.72
882 0.78
883 0.79
884 0.81
885 0.85
886 0.88
887 0.88
888 0.83
889 0.84
890 0.79
891 0.75
892 0.7
893 0.69
894 0.66
895 0.57
896 0.55
897 0.44
898 0.41
899 0.35
900 0.29
901 0.21
902 0.15
903 0.14
904 0.13
905 0.14
906 0.14
907 0.14
908 0.15
909 0.18
910 0.23
911 0.27
912 0.35
913 0.41
914 0.49
915 0.56
916 0.65
917 0.72
918 0.77
919 0.82
920 0.84
921 0.85
922 0.83
923 0.78
924 0.72
925 0.64
926 0.53
927 0.44
928 0.34
929 0.25
930 0.19
931 0.16
932 0.11
933 0.09
934 0.1
935 0.08
936 0.09
937 0.08
938 0.08
939 0.08
940 0.09
941 0.09
942 0.09
943 0.09
944 0.09
945 0.1
946 0.12
947 0.15
948 0.16
949 0.22
950 0.27
951 0.35
952 0.44
953 0.52
954 0.58
955 0.64
956 0.7
957 0.68
958 0.68
959 0.64
960 0.58
961 0.54
962 0.46
963 0.39
964 0.39
965 0.38
966 0.32
967 0.31
968 0.29
969 0.26
970 0.28
971 0.31
972 0.34
973 0.39
974 0.47
975 0.51
976 0.57
977 0.6
978 0.59
979 0.58
980 0.52
981 0.48
982 0.42
983 0.35
984 0.27
985 0.23
986 0.22
987 0.19
988 0.17
989 0.16
990 0.17
991 0.17
992 0.17
993 0.23
994 0.3
995 0.41
996 0.49
997 0.58
998 0.65
999 0.75
1000 0.83
1001 0.85
1002 0.88
1003 0.88
1004 0.89
1005 0.9
1006 0.9
1007 0.89
1008 0.91
1009 0.9