Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CY30

Protein Details
Accession B0CY30    Localization Confidence Low Confidence Score 9.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
21-40LPDAKRRKITKPTETKPLGKBasic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 14, cyto 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR019529  Syntaxin-18_N  
IPR000727  T_SNARE_dom  
Gene Ontology GO:0016020  C:membrane  
GO:0015031  P:protein transport  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_246237  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF10496  Syntaxin-18_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50192  T_SNARE  
Amino Acid Sequences MPFCDRTNDFQQTLHDKERALPDAKRRKITKPTETKPLGKEYVTEAYTILNHINTLTRMLSNVRSPYLNVDSRSSPLARQGSRNIDLNQADTPWTSIRHLTNEEREQIDLQARVILTRCSSRIKEMEALEKRRAELVASSVNPLARFLPARLRQDETTLTSDVIAAHHAGMTWYLTRRLTEASQTQKEMQEERVKRQLERTRTLGSSAARDMPPPERIHKSGSWLGGSLLAATIGASSSSSYESSQPTNATNSTYVSDEDEDEEIELSASQILQFEAENANILRTVQDTLESVQQAESRLMDISALQMELVSHLTRQTELTDQLYEDAIATTSTVEKGNVQLKEAKRRAKDGRLFILVFLIGASLSLLFLHYY
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.45
3 0.39
4 0.43
5 0.48
6 0.47
7 0.45
8 0.44
9 0.49
10 0.57
11 0.64
12 0.68
13 0.65
14 0.68
15 0.74
16 0.78
17 0.78
18 0.78
19 0.77
20 0.78
21 0.8
22 0.78
23 0.73
24 0.7
25 0.63
26 0.52
27 0.48
28 0.43
29 0.43
30 0.36
31 0.32
32 0.24
33 0.22
34 0.22
35 0.21
36 0.17
37 0.1
38 0.1
39 0.1
40 0.13
41 0.12
42 0.14
43 0.14
44 0.13
45 0.14
46 0.17
47 0.2
48 0.22
49 0.24
50 0.24
51 0.24
52 0.24
53 0.29
54 0.33
55 0.34
56 0.3
57 0.31
58 0.31
59 0.32
60 0.35
61 0.3
62 0.23
63 0.27
64 0.32
65 0.31
66 0.34
67 0.39
68 0.43
69 0.45
70 0.49
71 0.43
72 0.42
73 0.4
74 0.37
75 0.31
76 0.25
77 0.22
78 0.17
79 0.18
80 0.13
81 0.14
82 0.13
83 0.17
84 0.19
85 0.22
86 0.27
87 0.3
88 0.37
89 0.39
90 0.41
91 0.38
92 0.37
93 0.33
94 0.3
95 0.28
96 0.21
97 0.17
98 0.16
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.13
103 0.12
104 0.14
105 0.16
106 0.19
107 0.2
108 0.24
109 0.25
110 0.28
111 0.31
112 0.31
113 0.38
114 0.41
115 0.44
116 0.44
117 0.43
118 0.4
119 0.36
120 0.34
121 0.25
122 0.18
123 0.17
124 0.17
125 0.17
126 0.18
127 0.17
128 0.18
129 0.17
130 0.17
131 0.14
132 0.1
133 0.11
134 0.1
135 0.19
136 0.24
137 0.29
138 0.31
139 0.34
140 0.33
141 0.34
142 0.35
143 0.29
144 0.26
145 0.22
146 0.2
147 0.16
148 0.16
149 0.14
150 0.12
151 0.09
152 0.06
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.06
160 0.06
161 0.08
162 0.09
163 0.09
164 0.1
165 0.12
166 0.12
167 0.14
168 0.19
169 0.24
170 0.26
171 0.27
172 0.28
173 0.28
174 0.29
175 0.27
176 0.26
177 0.28
178 0.28
179 0.31
180 0.37
181 0.35
182 0.35
183 0.42
184 0.44
185 0.42
186 0.44
187 0.44
188 0.4
189 0.39
190 0.4
191 0.34
192 0.28
193 0.24
194 0.21
195 0.2
196 0.17
197 0.17
198 0.18
199 0.17
200 0.21
201 0.21
202 0.24
203 0.25
204 0.27
205 0.31
206 0.3
207 0.33
208 0.32
209 0.31
210 0.27
211 0.23
212 0.22
213 0.18
214 0.17
215 0.11
216 0.07
217 0.06
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.04
226 0.05
227 0.06
228 0.07
229 0.1
230 0.12
231 0.13
232 0.15
233 0.15
234 0.15
235 0.17
236 0.17
237 0.17
238 0.16
239 0.15
240 0.15
241 0.15
242 0.14
243 0.13
244 0.14
245 0.12
246 0.13
247 0.12
248 0.11
249 0.1
250 0.1
251 0.08
252 0.07
253 0.06
254 0.05
255 0.05
256 0.04
257 0.04
258 0.05
259 0.05
260 0.05
261 0.05
262 0.06
263 0.07
264 0.07
265 0.09
266 0.09
267 0.09
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.08
272 0.09
273 0.08
274 0.09
275 0.1
276 0.11
277 0.15
278 0.15
279 0.14
280 0.15
281 0.16
282 0.16
283 0.16
284 0.15
285 0.11
286 0.11
287 0.11
288 0.1
289 0.08
290 0.09
291 0.08
292 0.08
293 0.07
294 0.06
295 0.06
296 0.07
297 0.09
298 0.08
299 0.08
300 0.09
301 0.1
302 0.11
303 0.12
304 0.13
305 0.15
306 0.18
307 0.2
308 0.19
309 0.19
310 0.19
311 0.19
312 0.17
313 0.13
314 0.11
315 0.09
316 0.07
317 0.07
318 0.07
319 0.08
320 0.09
321 0.09
322 0.1
323 0.1
324 0.16
325 0.23
326 0.23
327 0.25
328 0.32
329 0.37
330 0.48
331 0.54
332 0.57
333 0.55
334 0.63
335 0.69
336 0.72
337 0.74
338 0.72
339 0.72
340 0.7
341 0.66
342 0.57
343 0.51
344 0.4
345 0.31
346 0.22
347 0.14
348 0.07
349 0.07
350 0.07
351 0.04
352 0.04
353 0.04