Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3AMK6

Protein Details
Accession M3AMK6    Localization Confidence Low Confidence Score 9.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
200-219NDKNKFIRRKWPLKRAPTVTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
206-214IRRKWPLKR
Subcellular Location(s) cyto 15.5, cyto_nucl 11.5, nucl 4.5, pero 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018606  Arb1  
IPR045180  La_dom_prot  
IPR006630  La_HTH  
IPR002344  Lupus_La  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0033167  C:ARC complex  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006396  P:RNA processing  
GO:0031047  P:RNA-mediated gene silencing  
KEGG pfj:MYCFIDRAFT_144312  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF09692  Arb1  
PF05383  La  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50961  HTH_LA  
Amino Acid Sequences MYEELIERRENDSPLNATSSAPSVGHPPTSADEHAVADEGSDNAAPEHNTRNDSTAAATATEAPSQATDRVHKENEPPKKSDPGTEFVDAPAGHESSKSTSEKEKPPAEGAADDDQPSLLSTLPSRLNASEHKDDIIKQVEFYLGDENLPGDAHLLARTGPAGDGWVSLNEILGFRKMRPYKPKAEVKEILKLSKMLEINDKNKFIRRKWPLKRAPTVTPKLDESKERNAKLAEQPWMTKAMLKPTGFESNANQGPLALGDYLEERPLYDAEESFVARIDRAVAEYQNRRKFHEMTAKVFGSYLKFGGFAGGQNMFAGRLNDKELKENYDKHEIAMMKARWGVADKVSEGVDEGKPTWVVDFEGMTKAFLSSEFMQHFDWTNSKTVLETTNILRNFFSYLNIHDVCPEYKKDIDKAVAATHLADSEFPKLAAVDAGLPGEFNKACSSLYGGYYAQYSPTDANADWVTNADKSFGMAKDLADQVFIIGTHAYCTSEQLEFFEAVKDDKKPADTCIVEESMGLEVTGVELETEQGNKYYDAPQYKNRFKKAGSLHCIRWTLPQASPRDLPKHVLEAEKAKQGKSLSFIVDEDLLKHFVPGMKLDAIIKTFGCGLSWIDAVECVYPSFFTWTLNERAMDWNEPGPPTEWMLRQEEMKKSGMGDEIIRREDEDEDETLD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.3
2 0.32
3 0.29
4 0.25
5 0.25
6 0.24
7 0.21
8 0.18
9 0.17
10 0.18
11 0.2
12 0.21
13 0.2
14 0.2
15 0.22
16 0.26
17 0.26
18 0.24
19 0.23
20 0.22
21 0.22
22 0.2
23 0.16
24 0.12
25 0.12
26 0.1
27 0.09
28 0.08
29 0.08
30 0.08
31 0.1
32 0.11
33 0.13
34 0.2
35 0.23
36 0.26
37 0.27
38 0.3
39 0.29
40 0.29
41 0.28
42 0.23
43 0.2
44 0.17
45 0.17
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.14
50 0.12
51 0.13
52 0.14
53 0.16
54 0.17
55 0.21
56 0.26
57 0.33
58 0.35
59 0.37
60 0.45
61 0.51
62 0.58
63 0.59
64 0.59
65 0.56
66 0.63
67 0.61
68 0.6
69 0.55
70 0.49
71 0.49
72 0.46
73 0.42
74 0.33
75 0.36
76 0.27
77 0.24
78 0.22
79 0.17
80 0.15
81 0.14
82 0.16
83 0.15
84 0.21
85 0.21
86 0.21
87 0.29
88 0.37
89 0.44
90 0.51
91 0.53
92 0.5
93 0.51
94 0.51
95 0.45
96 0.38
97 0.34
98 0.3
99 0.27
100 0.24
101 0.21
102 0.18
103 0.17
104 0.16
105 0.12
106 0.08
107 0.08
108 0.08
109 0.13
110 0.15
111 0.16
112 0.18
113 0.18
114 0.22
115 0.26
116 0.32
117 0.33
118 0.32
119 0.32
120 0.32
121 0.32
122 0.34
123 0.35
124 0.28
125 0.22
126 0.22
127 0.22
128 0.21
129 0.21
130 0.18
131 0.12
132 0.12
133 0.12
134 0.11
135 0.1
136 0.1
137 0.08
138 0.06
139 0.06
140 0.06
141 0.06
142 0.07
143 0.06
144 0.07
145 0.07
146 0.07
147 0.06
148 0.06
149 0.07
150 0.06
151 0.07
152 0.08
153 0.08
154 0.08
155 0.08
156 0.08
157 0.07
158 0.08
159 0.08
160 0.11
161 0.11
162 0.11
163 0.21
164 0.26
165 0.33
166 0.43
167 0.49
168 0.55
169 0.64
170 0.72
171 0.69
172 0.73
173 0.72
174 0.66
175 0.67
176 0.6
177 0.53
178 0.44
179 0.4
180 0.32
181 0.3
182 0.28
183 0.2
184 0.27
185 0.31
186 0.35
187 0.4
188 0.42
189 0.38
190 0.44
191 0.49
192 0.43
193 0.48
194 0.52
195 0.58
196 0.64
197 0.74
198 0.76
199 0.79
200 0.85
201 0.8
202 0.79
203 0.78
204 0.74
205 0.67
206 0.6
207 0.54
208 0.5
209 0.47
210 0.44
211 0.39
212 0.44
213 0.48
214 0.46
215 0.46
216 0.42
217 0.44
218 0.44
219 0.44
220 0.38
221 0.32
222 0.33
223 0.31
224 0.33
225 0.29
226 0.25
227 0.22
228 0.24
229 0.28
230 0.27
231 0.27
232 0.28
233 0.33
234 0.31
235 0.3
236 0.25
237 0.26
238 0.28
239 0.27
240 0.23
241 0.17
242 0.16
243 0.15
244 0.14
245 0.06
246 0.04
247 0.05
248 0.06
249 0.07
250 0.07
251 0.07
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.07
257 0.07
258 0.08
259 0.09
260 0.09
261 0.08
262 0.09
263 0.08
264 0.07
265 0.07
266 0.07
267 0.06
268 0.08
269 0.09
270 0.09
271 0.15
272 0.22
273 0.31
274 0.37
275 0.38
276 0.4
277 0.44
278 0.44
279 0.46
280 0.49
281 0.44
282 0.42
283 0.46
284 0.43
285 0.39
286 0.37
287 0.3
288 0.21
289 0.18
290 0.14
291 0.08
292 0.08
293 0.08
294 0.08
295 0.08
296 0.07
297 0.08
298 0.08
299 0.07
300 0.07
301 0.07
302 0.07
303 0.07
304 0.07
305 0.06
306 0.07
307 0.1
308 0.15
309 0.16
310 0.2
311 0.2
312 0.25
313 0.28
314 0.3
315 0.31
316 0.34
317 0.34
318 0.29
319 0.33
320 0.28
321 0.25
322 0.29
323 0.26
324 0.19
325 0.19
326 0.19
327 0.15
328 0.16
329 0.16
330 0.1
331 0.11
332 0.1
333 0.11
334 0.11
335 0.1
336 0.09
337 0.1
338 0.09
339 0.08
340 0.09
341 0.08
342 0.08
343 0.08
344 0.08
345 0.06
346 0.06
347 0.06
348 0.06
349 0.07
350 0.09
351 0.09
352 0.09
353 0.08
354 0.08
355 0.07
356 0.07
357 0.09
358 0.08
359 0.12
360 0.13
361 0.14
362 0.14
363 0.15
364 0.16
365 0.14
366 0.15
367 0.13
368 0.14
369 0.13
370 0.13
371 0.13
372 0.13
373 0.13
374 0.12
375 0.13
376 0.13
377 0.18
378 0.19
379 0.19
380 0.18
381 0.17
382 0.18
383 0.16
384 0.16
385 0.11
386 0.12
387 0.18
388 0.18
389 0.18
390 0.16
391 0.18
392 0.17
393 0.18
394 0.18
395 0.15
396 0.17
397 0.2
398 0.2
399 0.22
400 0.23
401 0.22
402 0.22
403 0.2
404 0.18
405 0.16
406 0.14
407 0.11
408 0.1
409 0.08
410 0.08
411 0.08
412 0.09
413 0.09
414 0.09
415 0.09
416 0.08
417 0.08
418 0.08
419 0.07
420 0.05
421 0.05
422 0.06
423 0.05
424 0.05
425 0.05
426 0.08
427 0.07
428 0.08
429 0.08
430 0.09
431 0.09
432 0.09
433 0.12
434 0.11
435 0.12
436 0.13
437 0.13
438 0.12
439 0.14
440 0.13
441 0.12
442 0.1
443 0.11
444 0.09
445 0.1
446 0.11
447 0.1
448 0.13
449 0.12
450 0.12
451 0.11
452 0.12
453 0.12
454 0.11
455 0.11
456 0.1
457 0.09
458 0.1
459 0.13
460 0.12
461 0.13
462 0.13
463 0.13
464 0.16
465 0.18
466 0.17
467 0.13
468 0.13
469 0.1
470 0.1
471 0.1
472 0.06
473 0.05
474 0.05
475 0.06
476 0.07
477 0.08
478 0.08
479 0.1
480 0.11
481 0.12
482 0.12
483 0.12
484 0.14
485 0.14
486 0.14
487 0.14
488 0.13
489 0.13
490 0.16
491 0.16
492 0.16
493 0.17
494 0.21
495 0.2
496 0.23
497 0.29
498 0.27
499 0.27
500 0.29
501 0.28
502 0.24
503 0.23
504 0.21
505 0.14
506 0.13
507 0.11
508 0.06
509 0.05
510 0.05
511 0.05
512 0.04
513 0.03
514 0.03
515 0.04
516 0.05
517 0.06
518 0.07
519 0.08
520 0.09
521 0.1
522 0.12
523 0.16
524 0.21
525 0.27
526 0.31
527 0.39
528 0.48
529 0.57
530 0.63
531 0.64
532 0.64
533 0.58
534 0.63
535 0.64
536 0.65
537 0.63
538 0.61
539 0.6
540 0.62
541 0.63
542 0.54
543 0.51
544 0.46
545 0.42
546 0.4
547 0.42
548 0.39
549 0.43
550 0.46
551 0.46
552 0.45
553 0.43
554 0.43
555 0.4
556 0.41
557 0.39
558 0.38
559 0.36
560 0.37
561 0.39
562 0.43
563 0.42
564 0.36
565 0.37
566 0.35
567 0.34
568 0.31
569 0.31
570 0.25
571 0.25
572 0.25
573 0.23
574 0.25
575 0.22
576 0.2
577 0.18
578 0.18
579 0.16
580 0.16
581 0.16
582 0.16
583 0.17
584 0.17
585 0.19
586 0.18
587 0.19
588 0.21
589 0.21
590 0.19
591 0.2
592 0.17
593 0.14
594 0.15
595 0.14
596 0.13
597 0.11
598 0.11
599 0.13
600 0.13
601 0.12
602 0.11
603 0.11
604 0.12
605 0.12
606 0.11
607 0.08
608 0.09
609 0.09
610 0.1
611 0.14
612 0.14
613 0.15
614 0.17
615 0.22
616 0.26
617 0.29
618 0.28
619 0.25
620 0.31
621 0.33
622 0.33
623 0.3
624 0.29
625 0.29
626 0.29
627 0.29
628 0.25
629 0.23
630 0.24
631 0.27
632 0.27
633 0.28
634 0.32
635 0.32
636 0.37
637 0.42
638 0.45
639 0.44
640 0.42
641 0.39
642 0.35
643 0.37
644 0.33
645 0.28
646 0.26
647 0.31
648 0.34
649 0.35
650 0.34
651 0.32
652 0.31
653 0.31
654 0.29
655 0.24