Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3AKB0

Protein Details
Accession M3AKB0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-33TFQLRYGLSQKRANKRRKRRITLINKAHELAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
13-22KRANKRRKRR
Subcellular Location(s) nucl 13.5, mito 11, cyto_nucl 8.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002100  TF_MADSbox  
IPR036879  TF_MADSbox_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0046983  F:protein dimerization activity  
GO:0006351  P:DNA-templated transcription  
GO:0045944  P:positive regulation of transcription by RNA polymerase II  
KEGG pfj:MYCFIDRAFT_173893  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00319  SRF-TF  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50066  MADS_BOX_2  
Amino Acid Sequences MKTFQLRYGLSQKRANKRRKRRITLINKAHELATKCEAQVYVLIRYGGRYYTYSSLDKPSWPPSPHDIQSSSYPLPVQLTACDLSNSDNAGVETVGSSLQTAKLLPPVPLPRSFSDPEITLSEPSEHSWTDTDPLGHELLYGQGEMEAYQASVVGNDSSLSKAAIAMSTLSPSMTFQVLAWRLPASINEFEISLPLYPTIVVGTRVNDDVPDPASYGRPFHDEISVDRPSGLHGSYIADVQFGRPPPELSLASFGGRSSDCDEAVMMETSGTPKLLMKLIHDEYVRTNISFKLSTHGEEKDLGRQQRGYLEASVGWNQKIMALMTAKIFTHIH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.76
2 0.8
3 0.81
4 0.84
5 0.88
6 0.92
7 0.92
8 0.92
9 0.93
10 0.94
11 0.94
12 0.93
13 0.9
14 0.82
15 0.73
16 0.65
17 0.59
18 0.51
19 0.44
20 0.38
21 0.31
22 0.27
23 0.28
24 0.26
25 0.22
26 0.24
27 0.22
28 0.21
29 0.2
30 0.21
31 0.19
32 0.2
33 0.2
34 0.17
35 0.16
36 0.15
37 0.17
38 0.2
39 0.24
40 0.26
41 0.27
42 0.31
43 0.3
44 0.33
45 0.33
46 0.35
47 0.39
48 0.39
49 0.41
50 0.42
51 0.48
52 0.47
53 0.48
54 0.44
55 0.38
56 0.41
57 0.42
58 0.36
59 0.29
60 0.27
61 0.23
62 0.22
63 0.2
64 0.17
65 0.11
66 0.14
67 0.13
68 0.14
69 0.13
70 0.12
71 0.13
72 0.14
73 0.14
74 0.11
75 0.11
76 0.11
77 0.11
78 0.1
79 0.08
80 0.06
81 0.06
82 0.05
83 0.05
84 0.05
85 0.05
86 0.06
87 0.06
88 0.06
89 0.07
90 0.11
91 0.13
92 0.13
93 0.18
94 0.23
95 0.26
96 0.29
97 0.32
98 0.29
99 0.34
100 0.35
101 0.31
102 0.28
103 0.25
104 0.24
105 0.23
106 0.22
107 0.17
108 0.16
109 0.15
110 0.14
111 0.14
112 0.14
113 0.11
114 0.11
115 0.11
116 0.11
117 0.12
118 0.12
119 0.11
120 0.1
121 0.12
122 0.11
123 0.1
124 0.09
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.05
130 0.05
131 0.05
132 0.05
133 0.05
134 0.04
135 0.03
136 0.03
137 0.04
138 0.03
139 0.03
140 0.04
141 0.03
142 0.03
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.04
149 0.05
150 0.05
151 0.05
152 0.04
153 0.05
154 0.05
155 0.05
156 0.05
157 0.05
158 0.05
159 0.05
160 0.06
161 0.05
162 0.05
163 0.05
164 0.11
165 0.12
166 0.12
167 0.12
168 0.11
169 0.11
170 0.11
171 0.12
172 0.11
173 0.11
174 0.12
175 0.11
176 0.11
177 0.11
178 0.11
179 0.11
180 0.06
181 0.06
182 0.05
183 0.05
184 0.05
185 0.05
186 0.05
187 0.05
188 0.07
189 0.07
190 0.09
191 0.1
192 0.1
193 0.1
194 0.1
195 0.1
196 0.09
197 0.1
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.12
202 0.12
203 0.13
204 0.13
205 0.15
206 0.16
207 0.16
208 0.18
209 0.17
210 0.19
211 0.24
212 0.24
213 0.21
214 0.2
215 0.18
216 0.17
217 0.17
218 0.15
219 0.09
220 0.08
221 0.1
222 0.1
223 0.11
224 0.1
225 0.09
226 0.09
227 0.1
228 0.13
229 0.12
230 0.15
231 0.15
232 0.16
233 0.18
234 0.22
235 0.22
236 0.19
237 0.22
238 0.2
239 0.2
240 0.19
241 0.17
242 0.15
243 0.14
244 0.15
245 0.14
246 0.14
247 0.14
248 0.14
249 0.14
250 0.13
251 0.15
252 0.13
253 0.1
254 0.08
255 0.08
256 0.1
257 0.1
258 0.09
259 0.08
260 0.08
261 0.1
262 0.14
263 0.14
264 0.16
265 0.24
266 0.26
267 0.31
268 0.3
269 0.29
270 0.28
271 0.33
272 0.32
273 0.24
274 0.23
275 0.2
276 0.24
277 0.25
278 0.22
279 0.23
280 0.23
281 0.25
282 0.28
283 0.28
284 0.26
285 0.28
286 0.29
287 0.32
288 0.38
289 0.38
290 0.38
291 0.38
292 0.38
293 0.4
294 0.41
295 0.35
296 0.29
297 0.27
298 0.25
299 0.27
300 0.31
301 0.28
302 0.25
303 0.23
304 0.22
305 0.21
306 0.22
307 0.19
308 0.17
309 0.16
310 0.17
311 0.19
312 0.21
313 0.2