FuNGI

M3D6C2

Protein Details

Accession

M3D6C2

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

11.9

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
404-426	HSWSWKLQSRRNNDGQRSKGKER	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 18, cyto 5, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR040450 TFIIF_beta_HTH IPR036388 WH-like_DNA-bd_sf IPR036390 WH_DNA-bd_sf
Pfam	View protein in Pfam PF02270 TFIIF_beta

Amino Acid Sequences

MTNRPYEMDMPSLPKLMNMEDAASHWTFRASSTDRGRRLDKCDVHNDILYTPHGENRAGCSPSQLSGRDGREEHPVQCNAARDTDPSTEYIDLHHMDGLSEKEEDVRLHLRGGVDDSESCSESDMDTTCGSVVTSTDTCIDLSAPADHDDQEAKDHDLSTRFAGSLQLVYHESYGGWFLQDRQRPLLLELLDRNDAELNRLKRSLAERTDLPVEGPGPDHSCGEGDGCGIHLGSGSAGGFQVAQEVMEERHERSISAQGSVDSRVNTIGLAESTERMEGLSFDLNPSRGRSRVSRWTTDNMPDDIGRQTDIQESKFLGSIGQQTTLRDSNGKGRATSPRYPANSRPFKIPQDQLIVLLRKCFASKPYWTASDLSQSFQQPETHIVDALREIAVFGPWQSDFPQHSWSWKLQSRRNNDGQRSKGKERAESANRIARLPRLCYCRGPDCGYCQSESWTVCDVRDL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.27
2	0.26
3	0.23
4	0.24
5	0.2
6	0.19
7	0.17
8	0.19
9	0.22
10	0.21
11	0.19
12	0.15
13	0.15
14	0.14
15	0.15
16	0.22
17	0.21
18	0.29
19	0.4
20	0.48
21	0.53
22	0.58
23	0.63
24	0.61
25	0.64
26	0.65
27	0.62
28	0.6
29	0.64
30	0.65
31	0.63
32	0.59
33	0.53
34	0.43
35	0.39
36	0.33
37	0.28
38	0.22
39	0.22
40	0.21
41	0.21
42	0.21
43	0.25
44	0.31
45	0.28
46	0.27
47	0.29
48	0.28
49	0.3
50	0.34
51	0.29
52	0.25
53	0.31
54	0.34
55	0.35
56	0.35
57	0.33
58	0.38
59	0.4
60	0.39
61	0.39
62	0.38
63	0.35
64	0.36
65	0.39
66	0.31
67	0.32
68	0.29
69	0.23
70	0.27
71	0.27
72	0.25
73	0.22
74	0.23
75	0.21
76	0.2
77	0.2
78	0.19
79	0.17
80	0.17
81	0.17
82	0.14
83	0.13
84	0.15
85	0.14
86	0.12
87	0.11
88	0.11
89	0.11
90	0.13
91	0.13
92	0.15
93	0.17
94	0.16
95	0.17
96	0.19
97	0.18
98	0.17
99	0.19
100	0.16
101	0.14
102	0.14
103	0.16
104	0.15
105	0.16
106	0.15
107	0.13
108	0.12
109	0.11
110	0.12
111	0.11
112	0.11
113	0.1
114	0.1
115	0.09
116	0.09
117	0.08
118	0.07
119	0.06
120	0.09
121	0.09
122	0.1
123	0.11
124	0.11
125	0.11
126	0.11
127	0.11
128	0.07
129	0.08
130	0.09
131	0.09
132	0.1
133	0.11
134	0.11
135	0.12
136	0.13
137	0.12
138	0.13
139	0.14
140	0.14
141	0.14
142	0.14
143	0.15
144	0.16
145	0.17
146	0.16
147	0.15
148	0.13
149	0.13
150	0.13
151	0.12
152	0.11
153	0.1
154	0.1
155	0.1
156	0.11
157	0.11
158	0.1
159	0.09
160	0.08
161	0.09
162	0.07
163	0.06
164	0.06
165	0.09
166	0.15
167	0.19
168	0.21
169	0.22
170	0.24
171	0.24
172	0.25
173	0.26
174	0.2
175	0.19
176	0.19
177	0.19
178	0.19
179	0.18
180	0.17
181	0.15
182	0.14
183	0.14
184	0.19
185	0.18
186	0.19
187	0.2
188	0.2
189	0.21
190	0.25
191	0.29
192	0.26
193	0.27
194	0.25
195	0.27
196	0.29
197	0.26
198	0.23
199	0.16
200	0.13
201	0.11
202	0.11
203	0.09
204	0.09
205	0.1
206	0.1
207	0.09
208	0.09
209	0.09
210	0.09
211	0.08
212	0.05
213	0.05
214	0.05
215	0.05
216	0.04
217	0.04
218	0.03
219	0.03
220	0.03
221	0.03
222	0.03
223	0.03
224	0.03
225	0.03
226	0.03
227	0.03
228	0.04
229	0.03
230	0.03
231	0.03
232	0.04
233	0.05
234	0.07
235	0.09
236	0.09
237	0.12
238	0.12
239	0.12
240	0.13
241	0.19
242	0.17
243	0.17
244	0.17
245	0.15
246	0.16
247	0.17
248	0.17
249	0.11
250	0.11
251	0.1
252	0.09
253	0.08
254	0.07
255	0.06
256	0.05
257	0.06
258	0.06
259	0.06
260	0.06
261	0.07
262	0.06
263	0.06
264	0.06
265	0.05
266	0.07
267	0.07
268	0.07
269	0.08
270	0.1
271	0.11
272	0.12
273	0.15
274	0.15
275	0.15
276	0.18
277	0.21
278	0.27
279	0.36
280	0.41
281	0.43
282	0.44
283	0.47
284	0.48
285	0.5
286	0.47
287	0.37
288	0.33
289	0.28
290	0.26
291	0.22
292	0.19
293	0.14
294	0.11
295	0.11
296	0.16
297	0.17
298	0.17
299	0.17
300	0.17
301	0.17
302	0.18
303	0.16
304	0.11
305	0.11
306	0.16
307	0.15
308	0.17
309	0.17
310	0.17
311	0.21
312	0.23
313	0.22
314	0.18
315	0.19
316	0.24
317	0.3
318	0.31
319	0.27
320	0.29
321	0.38
322	0.43
323	0.47
324	0.44
325	0.46
326	0.49
327	0.54
328	0.58
329	0.6
330	0.63
331	0.59
332	0.61
333	0.59
334	0.59
335	0.61
336	0.57
337	0.52
338	0.49
339	0.47
340	0.42
341	0.43
342	0.41
343	0.34
344	0.32
345	0.28
346	0.22
347	0.22
348	0.21
349	0.19
350	0.2
351	0.25
352	0.29
353	0.33
354	0.35
355	0.36
356	0.36
357	0.34
358	0.37
359	0.33
360	0.29
361	0.28
362	0.28
363	0.28
364	0.28
365	0.28
366	0.21
367	0.25
368	0.27
369	0.23
370	0.23
371	0.21
372	0.2
373	0.19
374	0.19
375	0.14
376	0.1
377	0.09
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.07
382	0.09
383	0.09
384	0.1
385	0.12
386	0.17
387	0.19
388	0.21
389	0.27
390	0.25
391	0.29
392	0.33
393	0.35
394	0.39
395	0.41
396	0.48
397	0.5
398	0.58
399	0.63
400	0.68
401	0.74
402	0.75
403	0.79
404	0.8
405	0.81
406	0.82
407	0.82
408	0.8
409	0.76
410	0.71
411	0.68
412	0.64
413	0.66
414	0.63
415	0.62
416	0.62
417	0.63
418	0.6
419	0.55
420	0.52
421	0.49
422	0.46
423	0.44
424	0.44
425	0.44
426	0.46
427	0.5
428	0.55
429	0.55
430	0.56
431	0.57
432	0.53
433	0.54
434	0.58
435	0.55
436	0.5
437	0.44
438	0.42
439	0.42
440	0.39
441	0.35
442	0.32
443	0.3

M3D6C2

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer