FuNGI

N1QJN1

Protein Details

Accession

N1QJN1

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
192-218	AEKTNGDAEKRKRARKRRWDNGGEETT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
200-209	EKRKRARKRR

Subcellular Location(s)

plas 15, cyto 6.5, cyto_nucl 5.5, nucl 3.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR011989 ARM-like IPR016024 ARM-type_fold IPR015016 SF3b_su1 IPR038737 SF3b_su1-like
Gene Ontology	GO:0005681 C:spliceosomal complex GO:0003729 F:mRNA binding GO:0000245 P:spliceosomal complex assembly
Pfam	View protein in Pfam PF08920 SF3b1

Amino Acid Sequences

MSDAAFDKVRQAQAERNAGKKGFKDSSSQRADTNKGVSLTENFDKDLYGNDSGDKFAGYNTTIDVNDDVDMEDEGGDSGRLVGQYTATDAQRSEWAQGETAEDDILESREKQAQIASRETDYQKRRFQRGLEGDGEKTYKEIMAEREIQREEDRVRKLIAEQNKEKIANGDDDEMEGVEHRATLKDKTPEPAEKTNGDAEKRKRARKRRWDNGGEETTEAKGSVPTSDTNGQATDSEVAPKKSRWDSLPAPEAEAAPLKKRSKWDMVSAAGGSGGQPNGAPEATPSGPVMAFGGDLSGRNAPLSDEELDEMLPGEGYKILIPPPGYEPLRAPVRRAAPSATPAPGGFMNQRSVDPRSMGKALPSDIPGVGDLQFFKAEDMAYFGKLVDGADENDLSVEELKQRKIMRLLLKVKNGTPPMRKTALRQLTDNARSFGAGPLFDQILPLLMEKSLEDQERHLLVKVIDRILYKLDDLVRPYVHKILVVIEPLLIDQDYYARVEGREIISNLAKAAGLATMISTMRPDIDHVDEYVRNTTARAFAVVASALGIPTLLPFLKAVCKSKKSWQARHTGVKIIQQIPILMGCAVLPHLKGLVDCIGENLNDEQAKVRTVTSLALAALAEASNPFGIESFDDILNPLWTGARKQRGKGLAGFLKAVGYIIPLMDEEYGNYYTSQIMEILLREFQSPDEEMKKVVLKVISQCAGGAGVTAAYLKETVLNDFFKSFWVRRMALDKRNYKQVVETTVDLGHKVGVGEIVERIVNNLKDESEAYRKMTVETIEKVVSAMGAADINERLEERLVDGILHSFQEQSVEDVVLLNGFGTVVNSLGTRCKPYLPQIVSTILFRLHNKSATVRQQAADLISRIAIVLKQCDEDVLLGKLGSVLYEYLGEEYPEVLGSILGAMRSIVTVVGISSMQPPIKDLLPRLTPILRNRHEKVQENTIDLVGRIADRGPESVNAREWMRICFELLDMLKAHKKGIRRAANNTFGFIAKAIGPQDVLATLLNNLRVQERQSRVCTAVAIGIVAETCAPFTVLPALMNEYRVPELNVQNGVLKSLSFLFEYIGEMAKDYVYAVTPLLEDALIDRDQVHRQTAASVVKHIALGVVGLGCEDAMLHLLNLLYPNLFETSPHVIDRVIEAIDAIRLAVGTGAVMNYVWAGLFHPARKVRVPYWRLYNDAYVQSADAMVPYYPAMDDEKMIRHELMVVL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.53
2	0.52
3	0.51
4	0.54
5	0.54
6	0.56
7	0.51
8	0.51
9	0.47
10	0.45
11	0.49
12	0.5
13	0.58
14	0.61
15	0.59
16	0.55
17	0.55
18	0.57
19	0.54
20	0.5
21	0.45
22	0.38
23	0.37
24	0.35
25	0.32
26	0.34
27	0.34
28	0.31
29	0.27
30	0.26
31	0.26
32	0.24
33	0.25
34	0.23
35	0.21
36	0.2
37	0.22
38	0.23
39	0.23
40	0.23
41	0.19
42	0.14
43	0.12
44	0.15
45	0.13
46	0.12
47	0.13
48	0.16
49	0.15
50	0.17
51	0.17
52	0.15
53	0.14
54	0.14
55	0.12
56	0.1
57	0.1
58	0.09
59	0.08
60	0.07
61	0.07
62	0.07
63	0.06
64	0.05
65	0.06
66	0.07
67	0.07
68	0.08
69	0.08
70	0.09
71	0.09
72	0.13
73	0.17
74	0.17
75	0.18
76	0.18
77	0.19
78	0.24
79	0.25
80	0.23
81	0.23
82	0.24
83	0.23
84	0.24
85	0.24
86	0.19
87	0.19
88	0.16
89	0.11
90	0.11
91	0.11
92	0.11
93	0.1
94	0.1
95	0.13
96	0.18
97	0.19
98	0.19
99	0.23
100	0.28
101	0.32
102	0.37
103	0.37
104	0.33
105	0.39
106	0.43
107	0.47
108	0.48
109	0.52
110	0.55
111	0.61
112	0.66
113	0.65
114	0.65
115	0.67
116	0.67
117	0.65
118	0.62
119	0.57
120	0.51
121	0.49
122	0.46
123	0.35
124	0.27
125	0.22
126	0.16
127	0.14
128	0.16
129	0.17
130	0.22
131	0.3
132	0.32
133	0.38
134	0.38
135	0.4
136	0.37
137	0.39
138	0.38
139	0.38
140	0.4
141	0.36
142	0.36
143	0.35
144	0.38
145	0.4
146	0.44
147	0.46
148	0.47
149	0.51
150	0.55
151	0.54
152	0.5
153	0.46
154	0.4
155	0.35
156	0.31
157	0.28
158	0.22
159	0.22
160	0.22
161	0.18
162	0.15
163	0.11
164	0.1
165	0.07
166	0.07
167	0.07
168	0.1
169	0.12
170	0.15
171	0.21
172	0.27
173	0.3
174	0.35
175	0.41
176	0.46
177	0.5
178	0.54
179	0.52
180	0.47
181	0.48
182	0.49
183	0.47
184	0.44
185	0.46
186	0.44
187	0.51
188	0.58
189	0.65
190	0.68
191	0.74
192	0.81
193	0.84
194	0.9
195	0.89
196	0.92
197	0.91
198	0.87
199	0.85
200	0.79
201	0.69
202	0.59
203	0.5
204	0.4
205	0.31
206	0.25
207	0.16
208	0.12
209	0.11
210	0.11
211	0.11
212	0.11
213	0.16
214	0.19
215	0.2
216	0.2
217	0.2
218	0.19
219	0.17
220	0.18
221	0.15
222	0.12
223	0.17
224	0.19
225	0.22
226	0.24
227	0.25
228	0.31
229	0.33
230	0.37
231	0.34
232	0.39
233	0.42
234	0.47
235	0.54
236	0.47
237	0.45
238	0.42
239	0.39
240	0.32
241	0.31
242	0.24
243	0.21
244	0.29
245	0.29
246	0.32
247	0.37
248	0.42
249	0.47
250	0.49
251	0.52
252	0.5
253	0.5
254	0.49
255	0.43
256	0.36
257	0.27
258	0.23
259	0.16
260	0.11
261	0.09
262	0.06
263	0.06
264	0.07
265	0.08
266	0.08
267	0.08
268	0.06
269	0.12
270	0.12
271	0.13
272	0.13
273	0.12
274	0.12
275	0.12
276	0.12
277	0.07
278	0.07
279	0.06
280	0.06
281	0.05
282	0.06
283	0.08
284	0.08
285	0.08
286	0.08
287	0.09
288	0.08
289	0.1
290	0.12
291	0.12
292	0.11
293	0.12
294	0.12
295	0.12
296	0.11
297	0.1
298	0.07
299	0.06
300	0.05
301	0.05
302	0.05
303	0.05
304	0.06
305	0.06
306	0.07
307	0.1
308	0.1
309	0.12
310	0.15
311	0.21
312	0.22
313	0.22
314	0.23
315	0.26
316	0.35
317	0.34
318	0.33
319	0.32
320	0.38
321	0.39
322	0.39
323	0.36
324	0.29
325	0.33
326	0.34
327	0.28
328	0.24
329	0.21
330	0.21
331	0.18
332	0.17
333	0.16
334	0.16
335	0.18
336	0.18
337	0.19
338	0.2
339	0.23
340	0.23
341	0.22
342	0.21
343	0.22
344	0.24
345	0.23
346	0.22
347	0.21
348	0.2
349	0.2
350	0.2
351	0.17
352	0.15
353	0.15
354	0.13
355	0.12
356	0.11
357	0.1
358	0.09
359	0.09
360	0.09
361	0.09
362	0.09
363	0.08
364	0.08
365	0.07
366	0.1
367	0.1
368	0.1
369	0.1
370	0.1
371	0.09
372	0.1
373	0.09
374	0.07
375	0.07
376	0.07
377	0.08
378	0.08
379	0.08
380	0.08
381	0.08
382	0.07
383	0.07
384	0.06
385	0.11
386	0.14
387	0.14
388	0.19
389	0.2
390	0.23
391	0.27
392	0.33
393	0.34
394	0.41
395	0.5
396	0.52
397	0.56
398	0.55
399	0.53
400	0.53
401	0.5
402	0.47
403	0.45
404	0.42
405	0.42
406	0.45
407	0.44
408	0.42
409	0.48
410	0.5
411	0.45
412	0.43
413	0.41
414	0.45
415	0.5
416	0.48
417	0.38
418	0.3
419	0.28
420	0.27
421	0.25
422	0.17
423	0.12
424	0.1
425	0.1
426	0.11
427	0.11
428	0.1
429	0.07
430	0.07
431	0.07
432	0.07
433	0.06
434	0.05
435	0.06
436	0.06
437	0.09
438	0.11
439	0.12
440	0.12
441	0.13
442	0.16
443	0.18
444	0.18
445	0.16
446	0.15
447	0.14
448	0.18
449	0.2
450	0.18
451	0.18
452	0.18
453	0.18
454	0.18
455	0.18
456	0.13
457	0.13
458	0.14
459	0.14
460	0.15
461	0.17
462	0.16
463	0.17
464	0.18
465	0.19
466	0.16
467	0.15
468	0.13
469	0.14
470	0.14
471	0.13
472	0.12
473	0.09
474	0.09
475	0.09
476	0.09
477	0.06
478	0.04
479	0.03
480	0.04
481	0.05
482	0.05
483	0.06
484	0.06
485	0.06
486	0.07
487	0.09
488	0.1
489	0.12
490	0.12
491	0.14
492	0.14
493	0.14
494	0.13
495	0.12
496	0.1
497	0.07
498	0.07
499	0.05
500	0.04
501	0.03
502	0.03
503	0.04
504	0.04
505	0.04
506	0.04
507	0.04
508	0.05
509	0.05
510	0.06
511	0.07
512	0.09
513	0.1
514	0.11
515	0.13
516	0.14
517	0.15
518	0.16
519	0.14
520	0.11
521	0.11
522	0.11
523	0.11
524	0.1
525	0.1
526	0.09
527	0.08
528	0.09
529	0.08
530	0.07
531	0.06
532	0.05
533	0.04
534	0.04
535	0.04
536	0.03
537	0.03
538	0.04
539	0.03
540	0.04
541	0.04
542	0.05
543	0.09
544	0.12
545	0.18
546	0.23
547	0.26
548	0.29
549	0.37
550	0.47
551	0.51
552	0.58
553	0.59
554	0.62
555	0.65
556	0.7
557	0.64
558	0.58
559	0.51
560	0.47
561	0.45
562	0.38
563	0.33
564	0.26
565	0.24
566	0.19
567	0.17
568	0.13
569	0.08
570	0.06
571	0.04
572	0.04
573	0.04
574	0.05
575	0.05
576	0.04
577	0.05
578	0.05
579	0.05
580	0.06
581	0.07
582	0.07
583	0.07
584	0.08
585	0.08
586	0.08
587	0.09
588	0.08
589	0.08
590	0.07
591	0.07
592	0.08
593	0.08
594	0.09
595	0.09
596	0.09
597	0.07
598	0.08
599	0.08
600	0.07
601	0.07
602	0.07
603	0.06
604	0.06
605	0.05
606	0.05
607	0.04
608	0.04
609	0.03
610	0.03
611	0.03
612	0.03
613	0.03
614	0.03
615	0.03
616	0.04
617	0.05
618	0.06
619	0.06
620	0.06
621	0.07
622	0.07
623	0.07
624	0.07
625	0.06
626	0.05
627	0.06
628	0.08
629	0.13
630	0.22
631	0.24
632	0.25
633	0.31
634	0.34
635	0.36
636	0.36
637	0.37
638	0.32
639	0.3
640	0.29
641	0.24
642	0.2
643	0.18
644	0.15
645	0.08
646	0.05
647	0.04
648	0.03
649	0.04
650	0.03
651	0.04
652	0.05
653	0.05
654	0.04
655	0.07
656	0.08
657	0.08
658	0.08
659	0.08
660	0.08
661	0.08
662	0.08
663	0.06
664	0.06
665	0.06
666	0.06
667	0.06
668	0.07
669	0.07
670	0.07
671	0.07
672	0.07
673	0.09
674	0.09
675	0.11
676	0.13
677	0.13
678	0.13
679	0.14
680	0.16
681	0.14
682	0.16
683	0.14
684	0.13
685	0.16
686	0.19
687	0.19
688	0.17
689	0.16
690	0.14
691	0.13
692	0.11
693	0.08
694	0.04
695	0.03
696	0.03
697	0.03
698	0.03
699	0.03
700	0.03
701	0.03
702	0.06
703	0.06
704	0.08
705	0.1
706	0.11
707	0.12
708	0.12
709	0.12
710	0.12
711	0.15
712	0.15
713	0.17
714	0.21
715	0.22
716	0.23
717	0.31
718	0.36
719	0.4
720	0.48
721	0.51
722	0.49
723	0.57
724	0.55
725	0.48
726	0.45
727	0.4
728	0.36
729	0.31
730	0.29
731	0.21
732	0.23
733	0.23
734	0.19
735	0.16
736	0.11
737	0.09
738	0.08
739	0.07
740	0.05
741	0.05
742	0.05
743	0.05
744	0.06
745	0.06
746	0.05
747	0.07
748	0.1
749	0.1
750	0.11
751	0.11
752	0.11
753	0.12
754	0.13
755	0.16
756	0.18
757	0.19
758	0.2
759	0.22
760	0.22
761	0.22
762	0.23
763	0.21
764	0.19
765	0.19
766	0.19
767	0.17
768	0.17
769	0.16
770	0.14
771	0.11
772	0.08
773	0.06
774	0.04
775	0.04
776	0.04
777	0.05
778	0.05
779	0.05
780	0.06
781	0.06
782	0.06
783	0.06
784	0.06
785	0.06
786	0.07
787	0.07
788	0.07
789	0.07
790	0.08
791	0.08
792	0.08
793	0.07
794	0.06
795	0.06
796	0.08
797	0.08
798	0.08
799	0.09
800	0.08
801	0.08
802	0.08
803	0.08
804	0.06
805	0.06
806	0.04
807	0.03
808	0.03
809	0.03
810	0.03
811	0.03
812	0.04
813	0.04
814	0.04
815	0.05
816	0.09
817	0.1
818	0.13
819	0.14
820	0.16
821	0.18
822	0.24
823	0.33
824	0.32
825	0.34
826	0.34
827	0.36
828	0.35
829	0.32
830	0.27
831	0.19
832	0.19
833	0.18
834	0.2
835	0.2
836	0.21
837	0.22
838	0.25
839	0.31
840	0.37
841	0.41
842	0.38
843	0.36
844	0.35
845	0.35
846	0.32
847	0.27
848	0.2
849	0.14
850	0.12
851	0.12
852	0.1
853	0.1
854	0.09
855	0.08
856	0.1
857	0.1
858	0.11
859	0.11
860	0.11
861	0.11
862	0.11
863	0.12
864	0.1
865	0.09
866	0.08
867	0.09
868	0.09
869	0.08
870	0.07
871	0.06
872	0.05
873	0.05
874	0.06
875	0.06
876	0.07
877	0.07
878	0.08
879	0.07
880	0.07
881	0.07
882	0.06
883	0.06
884	0.05
885	0.04
886	0.04
887	0.04
888	0.05
889	0.04
890	0.04
891	0.04
892	0.04
893	0.04
894	0.04
895	0.04
896	0.03
897	0.04
898	0.04
899	0.05
900	0.05
901	0.05
902	0.07
903	0.1
904	0.1
905	0.1
906	0.12
907	0.13
908	0.16
909	0.18
910	0.18
911	0.22
912	0.24
913	0.25
914	0.28
915	0.3
916	0.32
917	0.37
918	0.46
919	0.45
920	0.5
921	0.53
922	0.59
923	0.62
924	0.64
925	0.61
926	0.61
927	0.57
928	0.53
929	0.5
930	0.42
931	0.35
932	0.28
933	0.23
934	0.14
935	0.11
936	0.08
937	0.08
938	0.08
939	0.09
940	0.1
941	0.11
942	0.14
943	0.17
944	0.19
945	0.22
946	0.23
947	0.23
948	0.25
949	0.25
950	0.24
951	0.24
952	0.22
953	0.21
954	0.19
955	0.18
956	0.19
957	0.19
958	0.19
959	0.15
960	0.18
961	0.22
962	0.22
963	0.24
964	0.22
965	0.27
966	0.33
967	0.43
968	0.49
969	0.5
970	0.59
971	0.65
972	0.72
973	0.67
974	0.6
975	0.51
976	0.41
977	0.36
978	0.28
979	0.2
980	0.11
981	0.13
982	0.13
983	0.12
984	0.11
985	0.11
986	0.11
987	0.1
988	0.1
989	0.07
990	0.07
991	0.08
992	0.1
993	0.12
994	0.12
995	0.13
996	0.14
997	0.16
998	0.19
999	0.26
1000	0.31
1001	0.35
1002	0.38
1003	0.42
1004	0.42
1005	0.41
1006	0.38
1007	0.29
1008	0.25
1009	0.19
1010	0.15
1011	0.11
1012	0.09
1013	0.08
1014	0.07
1015	0.06
1016	0.04
1017	0.04
1018	0.04
1019	0.05
1020	0.05
1021	0.06
1022	0.09
1023	0.1
1024	0.1
1025	0.11
1026	0.16
1027	0.16
1028	0.18
1029	0.18
1030	0.17
1031	0.18
1032	0.18
1033	0.19
1034	0.2
1035	0.23
1036	0.25
1037	0.26
1038	0.25
1039	0.28
1040	0.27
1041	0.26
1042	0.2
1043	0.17
1044	0.14
1045	0.14
1046	0.15
1047	0.11
1048	0.11
1049	0.11
1050	0.11
1051	0.13
1052	0.12
1053	0.12
1054	0.11
1055	0.11
1056	0.11
1057	0.1
1058	0.1
1059	0.09
1060	0.08
1061	0.07
1062	0.08
1063	0.08
1064	0.08
1065	0.08
1066	0.08
1067	0.08
1068	0.07
1069	0.06
1070	0.07
1071	0.1
1072	0.1
1073	0.1
1074	0.11
1075	0.14
1076	0.19
1077	0.21
1078	0.23
1079	0.2
1080	0.2
1081	0.22
1082	0.27
1083	0.3
1084	0.27
1085	0.27
1086	0.26
1087	0.26
1088	0.25
1089	0.23
1090	0.18
1091	0.11
1092	0.1
1093	0.08
1094	0.06
1095	0.05
1096	0.05
1097	0.05
1098	0.04
1099	0.04
1100	0.04
1101	0.03
1102	0.04
1103	0.05
1104	0.05
1105	0.06
1106	0.06
1107	0.07
1108	0.09
1109	0.09
1110	0.08
1111	0.08
1112	0.1
1113	0.11
1114	0.11
1115	0.1
1116	0.14
1117	0.21
1118	0.23
1119	0.24
1120	0.23
1121	0.21
1122	0.22
1123	0.23
1124	0.21
1125	0.14
1126	0.11
1127	0.11
1128	0.11
1129	0.11
1130	0.1
1131	0.08
1132	0.06
1133	0.05
1134	0.05
1135	0.05
1136	0.05
1137	0.04
1138	0.05
1139	0.05
1140	0.05
1141	0.05
1142	0.05
1143	0.05
1144	0.05
1145	0.05
1146	0.04
1147	0.06
1148	0.11
1149	0.15
1150	0.17
1151	0.25
1152	0.3
1153	0.34
1154	0.4
1155	0.45
1156	0.47
1157	0.54
1158	0.57
1159	0.57
1160	0.63
1161	0.63
1162	0.61
1163	0.58
1164	0.57
1165	0.52
1166	0.5
1167	0.44
1168	0.34
1169	0.3
1170	0.26
1171	0.23
1172	0.17
1173	0.12
1174	0.1
1175	0.08
1176	0.08
1177	0.08
1178	0.08
1179	0.08
1180	0.09
1181	0.13
1182	0.12
1183	0.14
1184	0.17
1185	0.23
1186	0.25
1187	0.27
1188	0.26
1189	0.22

N1QJN1

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer