FuNGI

M3D5T3

Protein Details

Accession

M3D5T3

Localization Confidence

Low

Confidence Score

9.6

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
29-50	TNLPKFRTTQFRDIRRKHSEFQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 17.5, cyto_nucl 13, cyto 7.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR027267 AH/BAR_dom_sf IPR001683 PX_dom IPR036871 PX_dom_sf IPR014461 Retromer_complex_Vps17 IPR037907 Vps17_PX IPR015404 Vps5_C
Gene Ontology	GO:0005829 C:cytosol GO:0030904 C:retromer complex GO:0035091 F:phosphatidylinositol binding GO:0015031 P:protein transport GO:0042147 P:retrograde transport, endosome to Golgi
Pfam	View protein in Pfam PF00787 PX PF09325 Vps5
PROSITE	View protein in PROSITE PS50195 PX
CDD	cd06891 PX_Vps17p

Amino Acid Sequences

MPQYKLQAKITGLERSDKKDPILRFDVHTNLPKFRTTQFRDIRRKHSEFQKLGAHLIASNPEALVPAVPPGSSSAGLGTDDDERITKKALQRWLDVVCSNDVLMRDEEMVFFVESDFGYSPVVRKKQAATGMRRKVLKQFAPPPDDTPELLESRPVVKAFYLGSMDAQQKVDRVVKSRRSLGVAESDLGNKMATLSTNEQHNGLANAYRKLGKVVQNTGDFHSAQGTAEATSLSDPLAYHSSDAFIVKETLTNRHILLRELAQAQNATRSKLQAADRLKASSSVKRDKVDEAISALEEARSHEAYLQQKTQRVTQNLVLEKRKWFARTAGEMRTAIREYVIREIEAERRTLATLEQVRPDVRNIDASGGLSRLGREAHPVVRRSSMASSQGPKGDAWSGVPRRPDGLNRSISGSFAPGVPGAVPEESEEDGTEGGGGRKRATSSAHSLGKLAEDDDDDRIDARNAASRLAQTTF

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.46
2	0.47
3	0.53
4	0.49
5	0.48
6	0.48
7	0.49
8	0.48
9	0.51
10	0.47
11	0.44
12	0.46
13	0.48
14	0.47
15	0.53
16	0.48
17	0.47
18	0.47
19	0.45
20	0.43
21	0.44
22	0.48
23	0.47
24	0.54
25	0.58
26	0.66
27	0.75
28	0.8
29	0.83
30	0.83
31	0.81
32	0.79
33	0.8
34	0.8
35	0.72
36	0.7
37	0.69
38	0.6
39	0.55
40	0.48
41	0.38
42	0.28
43	0.26
44	0.23
45	0.16
46	0.14
47	0.12
48	0.11
49	0.11
50	0.1
51	0.09
52	0.07
53	0.08
54	0.08
55	0.08
56	0.08
57	0.1
58	0.13
59	0.12
60	0.12
61	0.11
62	0.12
63	0.12
64	0.12
65	0.11
66	0.11
67	0.11
68	0.11
69	0.12
70	0.12
71	0.13
72	0.16
73	0.19
74	0.23
75	0.29
76	0.37
77	0.4
78	0.42
79	0.45
80	0.45
81	0.44
82	0.39
83	0.35
84	0.28
85	0.24
86	0.21
87	0.18
88	0.16
89	0.15
90	0.14
91	0.13
92	0.13
93	0.13
94	0.13
95	0.12
96	0.12
97	0.1
98	0.09
99	0.08
100	0.08
101	0.07
102	0.09
103	0.09
104	0.08
105	0.09
106	0.09
107	0.12
108	0.19
109	0.23
110	0.23
111	0.25
112	0.27
113	0.32
114	0.4
115	0.45
116	0.47
117	0.54
118	0.6
119	0.63
120	0.64
121	0.59
122	0.59
123	0.59
124	0.55
125	0.53
126	0.55
127	0.57
128	0.61
129	0.6
130	0.55
131	0.51
132	0.47
133	0.39
134	0.32
135	0.27
136	0.23
137	0.21
138	0.19
139	0.16
140	0.15
141	0.17
142	0.14
143	0.12
144	0.1
145	0.12
146	0.11
147	0.12
148	0.12
149	0.1
150	0.1
151	0.14
152	0.15
153	0.15
154	0.16
155	0.14
156	0.14
157	0.17
158	0.21
159	0.18
160	0.23
161	0.3
162	0.37
163	0.4
164	0.45
165	0.44
166	0.42
167	0.41
168	0.37
169	0.34
170	0.27
171	0.24
172	0.19
173	0.18
174	0.15
175	0.15
176	0.12
177	0.07
178	0.06
179	0.06
180	0.06
181	0.08
182	0.11
183	0.13
184	0.15
185	0.16
186	0.16
187	0.15
188	0.16
189	0.13
190	0.11
191	0.13
192	0.12
193	0.13
194	0.14
195	0.15
196	0.15
197	0.16
198	0.21
199	0.23
200	0.25
201	0.29
202	0.32
203	0.34
204	0.35
205	0.35
206	0.32
207	0.26
208	0.21
209	0.18
210	0.14
211	0.11
212	0.1
213	0.08
214	0.06
215	0.06
216	0.06
217	0.05
218	0.05
219	0.05
220	0.04
221	0.04
222	0.04
223	0.06
224	0.07
225	0.07
226	0.07
227	0.07
228	0.08
229	0.08
230	0.09
231	0.07
232	0.06
233	0.07
234	0.06
235	0.09
236	0.09
237	0.13
238	0.13
239	0.14
240	0.14
241	0.17
242	0.18
243	0.16
244	0.17
245	0.15
246	0.16
247	0.18
248	0.17
249	0.15
250	0.14
251	0.14
252	0.2
253	0.19
254	0.18
255	0.17
256	0.17
257	0.17
258	0.22
259	0.24
260	0.24
261	0.26
262	0.28
263	0.29
264	0.29
265	0.29
266	0.27
267	0.28
268	0.26
269	0.3
270	0.34
271	0.37
272	0.37
273	0.39
274	0.37
275	0.39
276	0.35
277	0.28
278	0.22
279	0.18
280	0.16
281	0.15
282	0.13
283	0.09
284	0.07
285	0.08
286	0.1
287	0.09
288	0.09
289	0.1
290	0.15
291	0.2
292	0.23
293	0.28
294	0.29
295	0.32
296	0.34
297	0.39
298	0.41
299	0.39
300	0.39
301	0.38
302	0.42
303	0.44
304	0.49
305	0.46
306	0.42
307	0.41
308	0.41
309	0.39
310	0.34
311	0.3
312	0.29
313	0.32
314	0.38
315	0.41
316	0.41
317	0.41
318	0.4
319	0.39
320	0.37
321	0.31
322	0.23
323	0.19
324	0.17
325	0.15
326	0.21
327	0.21
328	0.17
329	0.17
330	0.19
331	0.25
332	0.24
333	0.23
334	0.17
335	0.17
336	0.18
337	0.17
338	0.15
339	0.17
340	0.23
341	0.24
342	0.26
343	0.28
344	0.29
345	0.29
346	0.31
347	0.25
348	0.19
349	0.2
350	0.18
351	0.18
352	0.17
353	0.17
354	0.16
355	0.14
356	0.14
357	0.11
358	0.1
359	0.1
360	0.11
361	0.1
362	0.14
363	0.17
364	0.23
365	0.29
366	0.32
367	0.33
368	0.35
369	0.35
370	0.33
371	0.34
372	0.31
373	0.31
374	0.34
375	0.35
376	0.36
377	0.38
378	0.36
379	0.32
380	0.3
381	0.26
382	0.22
383	0.21
384	0.27
385	0.3
386	0.32
387	0.35
388	0.34
389	0.34
390	0.37
391	0.41
392	0.38
393	0.41
394	0.42
395	0.41
396	0.45
397	0.42
398	0.39
399	0.33
400	0.27
401	0.2
402	0.15
403	0.15
404	0.1
405	0.1
406	0.1
407	0.1
408	0.1
409	0.1
410	0.1
411	0.1
412	0.12
413	0.13
414	0.13
415	0.12
416	0.11
417	0.11
418	0.1
419	0.1
420	0.08
421	0.11
422	0.14
423	0.15
424	0.16
425	0.19
426	0.2
427	0.23
428	0.26
429	0.29
430	0.34
431	0.42
432	0.46
433	0.44
434	0.43
435	0.41
436	0.38
437	0.33
438	0.26
439	0.18
440	0.15
441	0.17
442	0.18
443	0.18
444	0.16
445	0.16
446	0.17
447	0.17
448	0.16
449	0.15
450	0.2
451	0.2
452	0.21
453	0.23
454	0.24

M3D5T3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer