FuNGI

M3DA28

Protein Details

Accession

M3DA28

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
1-22	MAAMERRRKRDLKEQNVRAWNG	Hydrophilic
1117-1142	NGPRYDKSGNTRSKQRARKLQLGDID	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 11.5, cyto 6.5, mito 5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR016024 ARM-type_fold IPR003890 MIF4G-like_typ-3 IPR039762 Nmd2/UPF2 IPR007193 Upf2/Nmd2_C
Gene Ontology	GO:0005737 C:cytoplasm GO:0003723 F:RNA binding GO:0000184 P:nuclear-transcribed mRNA catabolic process, nonsense-mediated decay
Pfam	View protein in Pfam PF02854 MIF4G PF04050 Upf2

Amino Acid Sequences

MAAMERRRKRDLKEQNVRAWNGEHVFDVQGSLDSNMKKNTAFIKRLRTAITSSNTPTFLQEIRSLSLHKYLTEIISACYEGLTKLKVAADISAGVEIISALHQRFGPDDFTSYLGWYVGRGLATPDRAQLKALAADVREREEKDRILRQRTLLRVATELWLVGVLKSLEDIAQPAEAGKVGKGTEGPVKPKVNGTRPDVADPEPFPLEVLKDMLSHDREHVNLPLVVLFVKTFAWDILGSKHGKTEGRQKIADDGATTTVSGNFDSATSTEHDDGSTPDPPLTPPELQQRFRNILQRYFDDVKAHILRDQQRLTAQGKRNAEAYVKSGEVFEDRQTNHEKAQKSQEKLVSSAQTLAEVLGAEMPDLSEKDSSHAGLEGSIGLVKTGEYLRGQAEGAGIWEDEDERRFYENLVDLKDRVPGILLEDSKKKKAENDEQVGKKVEEGADAKEKPMGSDESSTAIANKTVGAQVDALLARLHELSTKDQVDQLAIDFCFLNSKASRNRLVKAIEDIPKGRTDLLPLYARLIAILGRHLQDVPEAIIKYLDDEFRSLQRRKSKDFLGQVRMINMRYIAELTKFGVVPEHVIFHCLKVCLDDFSRMNIEIIANLLENCGRYLLRNPETSPRMASFLETLQRKKTAQHIGQQERMLVENAVYYVNPPERAAIQQKERTTLDLFVRKLVYTDLSKKSLDKVIKQIRKLHWEESEVVDVLRKIFVKPGKIRFGNIFLLAMMLAALYRFHTGFAITVLDELLERVTVGLEINDFKYNQRRIAEAKYLGELYMYRVVDSALIFDTLYKILNYGHATYAQPGEVCAMDLPDDYFRIRLACALLETCGHCFEKGAARKKLDFYLSFLQYYINVKDPIPMDIEFVVQDTFNVLRPQWKLVLNDFPEAARIFGEACKQNYQDTAAGKMQEAEEPEDPDADVTLSDDEHREGEEHLADGDNAPSGSDDGKAQGDDDEGRANEQSDEEEHIVVTRPEDHRDPEADAEFDRELAKLMAESVDSRKFERKTAFDLPLPMRRTVRDAATPAAAGGDEETPAPPSTNGAGTMKFALLSKKGNRQQTRSIDMPSDSAFAVAMRSQQEAERAEQQRIKNLVLNYDLTNDQEDGSFESLHNGPRYDKSGNTRSKQRARKLQLGDIDWT

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.82
2	0.83
3	0.85
4	0.8
5	0.71
6	0.62
7	0.57
8	0.49
9	0.41
10	0.32
11	0.26
12	0.25
13	0.22
14	0.2
15	0.14
16	0.13
17	0.13
18	0.13
19	0.16
20	0.17
21	0.21
22	0.24
23	0.25
24	0.24
25	0.27
26	0.35
27	0.4
28	0.45
29	0.48
30	0.55
31	0.59
32	0.63
33	0.62
34	0.56
35	0.5
36	0.51
37	0.49
38	0.45
39	0.44
40	0.44
41	0.42
42	0.39
43	0.37
44	0.32
45	0.28
46	0.26
47	0.27
48	0.26
49	0.27
50	0.28
51	0.28
52	0.27
53	0.32
54	0.3
55	0.25
56	0.25
57	0.24
58	0.23
59	0.25
60	0.24
61	0.18
62	0.19
63	0.19
64	0.16
65	0.14
66	0.13
67	0.11
68	0.13
69	0.13
70	0.11
71	0.14
72	0.15
73	0.17
74	0.17
75	0.17
76	0.16
77	0.15
78	0.16
79	0.13
80	0.12
81	0.1
82	0.09
83	0.08
84	0.06
85	0.07
86	0.09
87	0.09
88	0.11
89	0.12
90	0.12
91	0.14
92	0.16
93	0.18
94	0.17
95	0.19
96	0.19
97	0.2
98	0.2
99	0.19
100	0.18
101	0.15
102	0.13
103	0.11
104	0.11
105	0.11
106	0.1
107	0.1
108	0.13
109	0.17
110	0.21
111	0.22
112	0.25
113	0.27
114	0.27
115	0.28
116	0.26
117	0.25
118	0.23
119	0.24
120	0.22
121	0.19
122	0.23
123	0.24
124	0.26
125	0.28
126	0.28
127	0.3
128	0.32
129	0.36
130	0.39
131	0.47
132	0.51
133	0.54
134	0.57
135	0.59
136	0.62
137	0.62
138	0.62
139	0.56
140	0.49
141	0.43
142	0.4
143	0.36
144	0.28
145	0.23
146	0.15
147	0.13
148	0.12
149	0.09
150	0.11
151	0.09
152	0.08
153	0.09
154	0.09
155	0.08
156	0.08
157	0.09
158	0.07
159	0.08
160	0.08
161	0.08
162	0.08
163	0.08
164	0.09
165	0.08
166	0.1
167	0.09
168	0.1
169	0.11
170	0.13
171	0.2
172	0.24
173	0.29
174	0.34
175	0.37
176	0.38
177	0.45
178	0.5
179	0.51
180	0.53
181	0.54
182	0.55
183	0.54
184	0.57
185	0.52
186	0.46
187	0.42
188	0.36
189	0.34
190	0.26
191	0.23
192	0.2
193	0.18
194	0.17
195	0.13
196	0.14
197	0.11
198	0.1
199	0.12
200	0.18
201	0.19
202	0.19
203	0.21
204	0.21
205	0.22
206	0.23
207	0.24
208	0.22
209	0.2
210	0.19
211	0.17
212	0.15
213	0.14
214	0.12
215	0.1
216	0.07
217	0.07
218	0.07
219	0.07
220	0.06
221	0.08
222	0.08
223	0.09
224	0.11
225	0.16
226	0.17
227	0.17
228	0.19
229	0.21
230	0.23
231	0.25
232	0.33
233	0.38
234	0.43
235	0.44
236	0.42
237	0.45
238	0.44
239	0.42
240	0.32
241	0.24
242	0.2
243	0.19
244	0.18
245	0.13
246	0.12
247	0.12
248	0.11
249	0.1
250	0.08
251	0.07
252	0.08
253	0.08
254	0.08
255	0.09
256	0.12
257	0.13
258	0.13
259	0.13
260	0.13
261	0.15
262	0.17
263	0.17
264	0.15
265	0.14
266	0.15
267	0.15
268	0.19
269	0.21
270	0.19
271	0.2
272	0.3
273	0.38
274	0.4
275	0.44
276	0.47
277	0.48
278	0.51
279	0.55
280	0.48
281	0.47
282	0.48
283	0.47
284	0.48
285	0.46
286	0.44
287	0.38
288	0.35
289	0.36
290	0.34
291	0.31
292	0.26
293	0.29
294	0.34
295	0.39
296	0.4
297	0.35
298	0.34
299	0.38
300	0.38
301	0.4
302	0.41
303	0.4
304	0.42
305	0.41
306	0.41
307	0.38
308	0.37
309	0.29
310	0.25
311	0.21
312	0.18
313	0.17
314	0.16
315	0.15
316	0.15
317	0.14
318	0.14
319	0.17
320	0.17
321	0.21
322	0.26
323	0.27
324	0.3
325	0.34
326	0.34
327	0.33
328	0.43
329	0.47
330	0.46
331	0.5
332	0.5
333	0.46
334	0.47
335	0.47
336	0.38
337	0.31
338	0.3
339	0.24
340	0.19
341	0.17
342	0.15
343	0.11
344	0.08
345	0.07
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.04
350	0.04
351	0.05
352	0.05
353	0.06
354	0.07
355	0.07
356	0.09
357	0.1
358	0.11
359	0.1
360	0.11
361	0.1
362	0.08
363	0.09
364	0.07
365	0.06
366	0.06
367	0.05
368	0.05
369	0.05
370	0.04
371	0.06
372	0.06
373	0.07
374	0.07
375	0.09
376	0.09
377	0.1
378	0.1
379	0.09
380	0.09
381	0.07
382	0.08
383	0.07
384	0.06
385	0.05
386	0.05
387	0.06
388	0.06
389	0.08
390	0.08
391	0.08
392	0.11
393	0.11
394	0.11
395	0.14
396	0.18
397	0.19
398	0.21
399	0.22
400	0.21
401	0.21
402	0.23
403	0.2
404	0.15
405	0.13
406	0.1
407	0.11
408	0.15
409	0.15
410	0.15
411	0.23
412	0.26
413	0.29
414	0.3
415	0.28
416	0.29
417	0.37
418	0.44
419	0.47
420	0.52
421	0.57
422	0.58
423	0.6
424	0.57
425	0.48
426	0.38
427	0.3
428	0.22
429	0.17
430	0.16
431	0.16
432	0.21
433	0.21
434	0.21
435	0.22
436	0.21
437	0.18
438	0.19
439	0.18
440	0.13
441	0.15
442	0.15
443	0.15
444	0.16
445	0.15
446	0.13
447	0.12
448	0.1
449	0.08
450	0.08
451	0.07
452	0.07
453	0.07
454	0.07
455	0.07
456	0.07
457	0.09
458	0.08
459	0.08
460	0.07
461	0.07
462	0.07
463	0.07
464	0.06
465	0.07
466	0.08
467	0.1
468	0.15
469	0.16
470	0.16
471	0.17
472	0.17
473	0.15
474	0.14
475	0.12
476	0.1
477	0.09
478	0.09
479	0.08
480	0.07
481	0.09
482	0.09
483	0.11
484	0.1
485	0.14
486	0.19
487	0.23
488	0.31
489	0.31
490	0.33
491	0.35
492	0.36
493	0.32
494	0.32
495	0.34
496	0.31
497	0.3
498	0.3
499	0.26
500	0.26
501	0.25
502	0.21
503	0.15
504	0.13
505	0.12
506	0.15
507	0.16
508	0.15
509	0.16
510	0.16
511	0.15
512	0.13
513	0.11
514	0.08
515	0.06
516	0.08
517	0.07
518	0.07
519	0.08
520	0.08
521	0.08
522	0.07
523	0.08
524	0.08
525	0.09
526	0.09
527	0.08
528	0.08
529	0.08
530	0.09
531	0.1
532	0.1
533	0.07
534	0.09
535	0.1
536	0.15
537	0.22
538	0.22
539	0.26
540	0.34
541	0.38
542	0.41
543	0.44
544	0.44
545	0.44
546	0.5
547	0.51
548	0.49
549	0.48
550	0.44
551	0.42
552	0.4
553	0.33
554	0.25
555	0.19
556	0.13
557	0.1
558	0.1
559	0.08
560	0.07
561	0.07
562	0.08
563	0.09
564	0.08
565	0.08
566	0.08
567	0.07
568	0.09
569	0.09
570	0.1
571	0.08
572	0.1
573	0.1
574	0.1
575	0.12
576	0.1
577	0.1
578	0.09
579	0.1
580	0.1
581	0.11
582	0.14
583	0.13
584	0.14
585	0.16
586	0.14
587	0.14
588	0.12
589	0.11
590	0.08
591	0.08
592	0.06
593	0.05
594	0.05
595	0.05
596	0.05
597	0.05
598	0.05
599	0.05
600	0.05
601	0.06
602	0.1
603	0.18
604	0.21
605	0.22
606	0.24
607	0.3
608	0.32
609	0.33
610	0.3
611	0.23
612	0.23
613	0.21
614	0.2
615	0.14
616	0.14
617	0.18
618	0.19
619	0.2
620	0.2
621	0.22
622	0.22
623	0.23
624	0.29
625	0.33
626	0.34
627	0.39
628	0.47
629	0.49
630	0.53
631	0.52
632	0.45
633	0.36
634	0.33
635	0.26
636	0.16
637	0.11
638	0.07
639	0.07
640	0.07
641	0.06
642	0.05
643	0.08
644	0.09
645	0.09
646	0.09
647	0.1
648	0.1
649	0.14
650	0.19
651	0.21
652	0.26
653	0.31
654	0.32
655	0.35
656	0.35
657	0.34
658	0.3
659	0.29
660	0.27
661	0.28
662	0.28
663	0.26
664	0.26
665	0.23
666	0.22
667	0.19
668	0.17
669	0.15
670	0.21
671	0.23
672	0.25
673	0.25
674	0.25
675	0.28
676	0.31
677	0.31
678	0.27
679	0.34
680	0.41
681	0.46
682	0.5
683	0.55
684	0.54
685	0.6
686	0.59
687	0.53
688	0.46
689	0.44
690	0.41
691	0.36
692	0.33
693	0.24
694	0.21
695	0.18
696	0.14
697	0.12
698	0.12
699	0.1
700	0.08
701	0.14
702	0.17
703	0.24
704	0.3
705	0.37
706	0.44
707	0.44
708	0.46
709	0.43
710	0.45
711	0.39
712	0.32
713	0.25
714	0.16
715	0.15
716	0.13
717	0.1
718	0.06
719	0.03
720	0.03
721	0.03
722	0.03
723	0.03
724	0.05
725	0.05
726	0.05
727	0.06
728	0.06
729	0.06
730	0.07
731	0.07
732	0.06
733	0.06
734	0.06
735	0.06
736	0.05
737	0.05
738	0.04
739	0.03
740	0.03
741	0.03
742	0.03
743	0.04
744	0.04
745	0.04
746	0.05
747	0.06
748	0.08
749	0.1
750	0.1
751	0.12
752	0.21
753	0.23
754	0.27
755	0.27
756	0.28
757	0.3
758	0.36
759	0.4
760	0.34
761	0.33
762	0.29
763	0.28
764	0.25
765	0.22
766	0.17
767	0.13
768	0.17
769	0.15
770	0.14
771	0.14
772	0.14
773	0.14
774	0.14
775	0.12
776	0.07
777	0.07
778	0.07
779	0.07
780	0.08
781	0.07
782	0.08
783	0.07
784	0.07
785	0.07
786	0.11
787	0.13
788	0.13
789	0.13
790	0.15
791	0.15
792	0.17
793	0.17
794	0.14
795	0.12
796	0.11
797	0.11
798	0.09
799	0.09
800	0.07
801	0.06
802	0.06
803	0.07
804	0.08
805	0.07
806	0.08
807	0.08
808	0.09
809	0.09
810	0.09
811	0.09
812	0.1
813	0.1
814	0.09
815	0.1
816	0.1
817	0.1
818	0.11
819	0.12
820	0.11
821	0.13
822	0.13
823	0.12
824	0.12
825	0.14
826	0.21
827	0.29
828	0.37
829	0.4
830	0.44
831	0.47
832	0.49
833	0.51
834	0.48
835	0.4
836	0.37
837	0.38
838	0.37
839	0.34
840	0.32
841	0.27
842	0.24
843	0.26
844	0.22
845	0.19
846	0.18
847	0.18
848	0.21
849	0.22
850	0.21
851	0.21
852	0.19
853	0.17
854	0.16
855	0.16
856	0.12
857	0.12
858	0.11
859	0.08
860	0.08
861	0.08
862	0.08
863	0.1
864	0.12
865	0.11
866	0.17
867	0.18
868	0.22
869	0.24
870	0.28
871	0.28
872	0.31
873	0.39
874	0.36
875	0.36
876	0.33
877	0.29
878	0.27
879	0.24
880	0.21
881	0.12
882	0.1
883	0.09
884	0.1
885	0.17
886	0.19
887	0.21
888	0.25
889	0.26
890	0.27
891	0.28
892	0.29
893	0.27
894	0.24
895	0.26
896	0.25
897	0.25
898	0.23
899	0.23
900	0.21
901	0.19
902	0.2
903	0.19
904	0.18
905	0.19
906	0.19
907	0.18
908	0.17
909	0.15
910	0.14
911	0.1
912	0.08
913	0.06
914	0.06
915	0.06
916	0.07
917	0.08
918	0.09
919	0.09
920	0.1
921	0.1
922	0.1
923	0.12
924	0.12
925	0.11
926	0.11
927	0.11
928	0.11
929	0.11
930	0.1
931	0.09
932	0.08
933	0.07
934	0.07
935	0.07
936	0.08
937	0.08
938	0.08
939	0.09
940	0.11
941	0.11
942	0.11
943	0.11
944	0.12
945	0.12
946	0.13
947	0.15
948	0.14
949	0.15
950	0.15
951	0.16
952	0.15
953	0.14
954	0.14
955	0.12
956	0.16
957	0.16
958	0.16
959	0.15
960	0.15
961	0.16
962	0.15
963	0.14
964	0.16
965	0.17
966	0.22
967	0.25
968	0.28
969	0.3
970	0.32
971	0.34
972	0.32
973	0.32
974	0.28
975	0.26
976	0.26
977	0.21
978	0.2
979	0.17
980	0.13
981	0.12
982	0.11
983	0.11
984	0.08
985	0.08
986	0.08
987	0.09
988	0.11
989	0.15
990	0.21
991	0.22
992	0.25
993	0.32
994	0.33
995	0.38
996	0.44
997	0.43
998	0.45
999	0.51
1000	0.53
1001	0.48
1002	0.54
1003	0.54
1004	0.54
1005	0.53
1006	0.49
1007	0.44
1008	0.4
1009	0.43
1010	0.39
1011	0.39
1012	0.37
1013	0.36
1014	0.35
1015	0.34
1016	0.33
1017	0.27
1018	0.23
1019	0.18
1020	0.12
1021	0.11
1022	0.09
1023	0.07
1024	0.08
1025	0.08
1026	0.1
1027	0.11
1028	0.12
1029	0.11
1030	0.12
1031	0.14
1032	0.15
1033	0.18
1034	0.18
1035	0.18
1036	0.19
1037	0.2
1038	0.18
1039	0.17
1040	0.17
1041	0.18
1042	0.19
1043	0.27
1044	0.31
1045	0.4
1046	0.47
1047	0.57
1048	0.63
1049	0.66
1050	0.72
1051	0.73
1052	0.73
1053	0.66
1054	0.63
1055	0.57
1056	0.5
1057	0.46
1058	0.37
1059	0.3
1060	0.23
1061	0.19
1062	0.16
1063	0.12
1064	0.12
1065	0.11
1066	0.13
1067	0.13
1068	0.15
1069	0.16
1070	0.17
1071	0.23
1072	0.24
1073	0.27
1074	0.33
1075	0.34
1076	0.4
1077	0.45
1078	0.46
1079	0.49
1080	0.5
1081	0.48
1082	0.44
1083	0.43
1084	0.4
1085	0.38
1086	0.39
1087	0.31
1088	0.31
1089	0.29
1090	0.25
1091	0.25
1092	0.21
1093	0.18
1094	0.16
1095	0.16
1096	0.16
1097	0.17
1098	0.16
1099	0.14
1100	0.18
1101	0.2
1102	0.24
1103	0.26
1104	0.25
1105	0.26
1106	0.3
1107	0.35
1108	0.34
1109	0.38
1110	0.42
1111	0.49
1112	0.57
1113	0.61
1114	0.66
1115	0.72
1116	0.79
1117	0.82
1118	0.84
1119	0.85
1120	0.84
1121	0.87
1122	0.83
1123	0.81
1124	0.78

M3DA28

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer