FuNGI

M3B790

Protein Details

Accession

M3B790

Localization Confidence

High

Confidence Score

17.1

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
134-166	AEEEAERERKKKKKEKKREKPSSRKRRGGEDED	Basic
176-196	GKRSRKSKGSKPSQSSRRERT	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
129-161	KRKRTAEEEAERERKKKKKEKKREKPSSRKRRG
176-193	GKRSRKSKGSKPSQSSRR

Subcellular Location(s)

nucl 19.5, cyto_nucl 13, cyto 5.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR035441 TFIIS/LEDGF_dom_sf IPR017923 TFIIS_N
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus
Pfam	View protein in Pfam PF08711 Med26
PROSITE	View protein in PROSITE PS51319 TFIIS_N

Amino Acid Sequences

MEDLEQPDVPTVDSIDNEPQANADPNDPLRPEIEEEDNAGGTPPMADPHADTEVQENGGSKSADELMDDEADAEKPVNGEDDNEDNDDESELEELDEQEFADFDATALNIPDKPIDVDESNVALLGVHKRKRTAEEEAERERKKKKKEKKREKPSSRKRRGGEDEDDFEGGPEMDGKRSRKSKGSKPSQSSRRERTPIDLDTLPPDERRRRALDAKMDEALKTHRVSRRKAAQDMEERADQEIAEMRTRIAKACELDAQARSRGDVAVQKLKILPEVVELMNRNTIQSQLVDPDINILESVRFMLEPADQDAALPNYQIQRELFAILSRLNIGKEALVASAVGKVVLFYTKSTQPQPDIKRQAEHLVAEWTRVILNKGKDARSKPVETRGYDPMAAAASQRMGPSQVDRATLAAEKRKRALEAPGPQNRARVQGGVGTYTVAPVSNMSNAQGVSQRKTQGANDETFRRIAARSSQKMGKR

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.16
2	0.19
3	0.22
4	0.22
5	0.21
6	0.2
7	0.21
8	0.25
9	0.23
10	0.2
11	0.22
12	0.24
13	0.29
14	0.3
15	0.28
16	0.24
17	0.26
18	0.27
19	0.27
20	0.29
21	0.25
22	0.26
23	0.27
24	0.25
25	0.22
26	0.19
27	0.15
28	0.1
29	0.1
30	0.08
31	0.08
32	0.08
33	0.09
34	0.1
35	0.14
36	0.18
37	0.17
38	0.17
39	0.18
40	0.2
41	0.2
42	0.19
43	0.16
44	0.14
45	0.17
46	0.17
47	0.14
48	0.14
49	0.15
50	0.15
51	0.14
52	0.14
53	0.13
54	0.13
55	0.13
56	0.11
57	0.1
58	0.1
59	0.1
60	0.1
61	0.08
62	0.08
63	0.08
64	0.09
65	0.08
66	0.1
67	0.13
68	0.16
69	0.17
70	0.18
71	0.18
72	0.17
73	0.17
74	0.16
75	0.13
76	0.1
77	0.08
78	0.07
79	0.07
80	0.07
81	0.07
82	0.07
83	0.07
84	0.06
85	0.06
86	0.06
87	0.06
88	0.06
89	0.05
90	0.05
91	0.05
92	0.05
93	0.06
94	0.06
95	0.07
96	0.07
97	0.08
98	0.08
99	0.08
100	0.09
101	0.1
102	0.13
103	0.13
104	0.14
105	0.14
106	0.15
107	0.14
108	0.13
109	0.11
110	0.08
111	0.09
112	0.15
113	0.22
114	0.25
115	0.27
116	0.31
117	0.34
118	0.39
119	0.43
120	0.44
121	0.46
122	0.5
123	0.55
124	0.61
125	0.67
126	0.64
127	0.63
128	0.63
129	0.61
130	0.64
131	0.67
132	0.69
133	0.72
134	0.81
135	0.88
136	0.91
137	0.95
138	0.96
139	0.97
140	0.97
141	0.97
142	0.97
143	0.96
144	0.93
145	0.84
146	0.83
147	0.8
148	0.76
149	0.72
150	0.65
151	0.58
152	0.51
153	0.48
154	0.38
155	0.29
156	0.22
157	0.15
158	0.09
159	0.08
160	0.07
161	0.09
162	0.14
163	0.17
164	0.24
165	0.29
166	0.32
167	0.38
168	0.45
169	0.52
170	0.58
171	0.67
172	0.69
173	0.71
174	0.78
175	0.79
176	0.81
177	0.81
178	0.78
179	0.75
180	0.71
181	0.64
182	0.61
183	0.57
184	0.49
185	0.45
186	0.38
187	0.29
188	0.28
189	0.29
190	0.23
191	0.19
192	0.23
193	0.25
194	0.26
195	0.31
196	0.32
197	0.35
198	0.41
199	0.45
200	0.48
201	0.46
202	0.46
203	0.43
204	0.39
205	0.33
206	0.28
207	0.24
208	0.19
209	0.16
210	0.19
211	0.22
212	0.27
213	0.3
214	0.38
215	0.45
216	0.47
217	0.51
218	0.48
219	0.5
220	0.51
221	0.52
222	0.46
223	0.38
224	0.33
225	0.29
226	0.26
227	0.19
228	0.12
229	0.12
230	0.11
231	0.1
232	0.1
233	0.1
234	0.12
235	0.13
236	0.13
237	0.11
238	0.12
239	0.12
240	0.14
241	0.16
242	0.15
243	0.17
244	0.18
245	0.19
246	0.19
247	0.18
248	0.16
249	0.14
250	0.13
251	0.12
252	0.14
253	0.16
254	0.2
255	0.2
256	0.21
257	0.22
258	0.22
259	0.21
260	0.18
261	0.14
262	0.09
263	0.11
264	0.11
265	0.12
266	0.13
267	0.13
268	0.15
269	0.15
270	0.14
271	0.11
272	0.12
273	0.11
274	0.11
275	0.11
276	0.09
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.11
281	0.1
282	0.09
283	0.08
284	0.07
285	0.06
286	0.06
287	0.06
288	0.05
289	0.04
290	0.04
291	0.06
292	0.06
293	0.07
294	0.09
295	0.1
296	0.09
297	0.09
298	0.11
299	0.11
300	0.1
301	0.09
302	0.09
303	0.11
304	0.12
305	0.14
306	0.12
307	0.13
308	0.13
309	0.15
310	0.13
311	0.11
312	0.12
313	0.1
314	0.11
315	0.1
316	0.1
317	0.09
318	0.09
319	0.09
320	0.08
321	0.08
322	0.08
323	0.07
324	0.06
325	0.06
326	0.06
327	0.07
328	0.07
329	0.06
330	0.05
331	0.05
332	0.06
333	0.07
334	0.08
335	0.08
336	0.12
337	0.17
338	0.2
339	0.24
340	0.27
341	0.3
342	0.39
343	0.45
344	0.51
345	0.55
346	0.54
347	0.54
348	0.53
349	0.53
350	0.47
351	0.41
352	0.33
353	0.31
354	0.29
355	0.26
356	0.24
357	0.19
358	0.16
359	0.16
360	0.17
361	0.16
362	0.18
363	0.25
364	0.31
365	0.36
366	0.42
367	0.45
368	0.52
369	0.53
370	0.57
371	0.54
372	0.58
373	0.6
374	0.56
375	0.56
376	0.52
377	0.48
378	0.43
379	0.38
380	0.29
381	0.24
382	0.21
383	0.17
384	0.12
385	0.1
386	0.11
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.12
391	0.15
392	0.21
393	0.21
394	0.22
395	0.22
396	0.22
397	0.22
398	0.25
399	0.27
400	0.29
401	0.32
402	0.35
403	0.39
404	0.42
405	0.42
406	0.41
407	0.45
408	0.46
409	0.5
410	0.56
411	0.61
412	0.63
413	0.62
414	0.65
415	0.58
416	0.53
417	0.45
418	0.37
419	0.29
420	0.28
421	0.29
422	0.25
423	0.23
424	0.19
425	0.17
426	0.16
427	0.15
428	0.1
429	0.09
430	0.08
431	0.1
432	0.12
433	0.12
434	0.13
435	0.15
436	0.15
437	0.17
438	0.22
439	0.24
440	0.26
441	0.31
442	0.33
443	0.33
444	0.37
445	0.39
446	0.42
447	0.43
448	0.44
449	0.45
450	0.46
451	0.46
452	0.43
453	0.41
454	0.33
455	0.28
456	0.27
457	0.31
458	0.37
459	0.4
460	0.47

M3B790

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer