FuNGI

M3BW04

Protein Details

Accession

M3BW04

Localization Confidence

High

Confidence Score

22.3

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
33-58	VNIFNTSSKKKPIKKPAAVGKRPTPA	Hydrophilic
197-220	GGESNKPQQKKKMQKKVEEGRDES	Hydrophilic
418-447	EQLERLEEKKKQKKLRKQLRKREHQGQYSD	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
40-55	SKKKPIKKPAAVGKRP
425-439	EKKKQKKLRKQLRKR

Subcellular Location(s)

nucl 19, mito 4, cyto 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR008851 TFIIF-alpha IPR011039 TFIIF_interaction
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003677 F:DNA binding GO:0032968 P:positive regulation of transcription elongation by RNA polymerase II GO:0006367 P:transcription initiation at RNA polymerase II promoter

Amino Acid Sequences

MSNSPAQPPSGPNSVTPTAGGPVAPIVRKRPAVNIFNTSSKKKPIKKPAAVGKRPTPAPATKTSQSSNGQQQPTQGTTHNMPQSAAPSNEPDPSTYSEFPIVITKSQLSKGLRYHAMKLQSRAGDDGQPIEVNPYDQQQFPRPARLHRRFARDRMASLEPTEAVSGPDDKEREQMNARRAERQAEREENQKLIAPTGGESNKPQQKKKMQKKVEEGRDESNPIRQKRSQLRYEEARPWHLEDYEAKNVWVGSYEEALSARSIMLVVSNEGTFEMVPIEKWYRFQQTNKVNVMTSDEVEKFMLLKHAPGRWALGTHKAGEQQRADDRHSRVAALRASRDDDDDRKRDSTGDFDADRDMLDLDVKDEFQDDDEGMLFQGEDGEDGDEIERRIYLEMRDAGLGGTGVKNEDQDVEAEHHREQLERLEEKKKQKKLRKQLRKREHQGQYSDDSDSDPYAESSDSMDSEEEAEEERKKAEEAKKAEEAKKTISNGDKSGTSTKATNAPTGRPEQRDPSRLGASLKRPGSPDASDLSGNESSRKKVKSINGRPVSATPSVARGASSTNVPKTKASRAGGSGSGSDTDTSRTGRVKLKLKNSPTGSPAAATPNGSRPGSPTASGTATPIGGTSFPTLEEVRAAIPAAGIAMKALVAKFKSRVGTRTAEFIQLVKKAGQLSKDPAKVGLIELKPGV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.36
2	0.34
3	0.31
4	0.27
5	0.22
6	0.21
7	0.19
8	0.12
9	0.14
10	0.18
11	0.21
12	0.22
13	0.26
14	0.32
15	0.37
16	0.38
17	0.44
18	0.49
19	0.52
20	0.55
21	0.57
22	0.54
23	0.59
24	0.62
25	0.58
26	0.54
27	0.57
28	0.61
29	0.64
30	0.7
31	0.73
32	0.79
33	0.82
34	0.87
35	0.88
36	0.9
37	0.88
38	0.85
39	0.82
40	0.79
41	0.71
42	0.65
43	0.6
44	0.55
45	0.52
46	0.52
47	0.51
48	0.48
49	0.51
50	0.5
51	0.51
52	0.49
53	0.51
54	0.53
55	0.54
56	0.53
57	0.49
58	0.51
59	0.5
60	0.48
61	0.43
62	0.35
63	0.31
64	0.31
65	0.38
66	0.38
67	0.33
68	0.31
69	0.3
70	0.32
71	0.33
72	0.31
73	0.24
74	0.25
75	0.26
76	0.3
77	0.29
78	0.26
79	0.24
80	0.28
81	0.32
82	0.28
83	0.29
84	0.27
85	0.26
86	0.25
87	0.27
88	0.24
89	0.19
90	0.2
91	0.21
92	0.22
93	0.24
94	0.29
95	0.27
96	0.3
97	0.34
98	0.39
99	0.44
100	0.44
101	0.46
102	0.45
103	0.52
104	0.51
105	0.51
106	0.5
107	0.45
108	0.44
109	0.42
110	0.38
111	0.33
112	0.29
113	0.27
114	0.22
115	0.19
116	0.18
117	0.17
118	0.16
119	0.13
120	0.13
121	0.16
122	0.16
123	0.18
124	0.22
125	0.26
126	0.35
127	0.36
128	0.44
129	0.43
130	0.51
131	0.6
132	0.65
133	0.68
134	0.67
135	0.75
136	0.73
137	0.77
138	0.77
139	0.69
140	0.62
141	0.58
142	0.54
143	0.45
144	0.39
145	0.34
146	0.24
147	0.22
148	0.2
149	0.15
150	0.11
151	0.11
152	0.12
153	0.11
154	0.15
155	0.15
156	0.15
157	0.2
158	0.2
159	0.23
160	0.29
161	0.34
162	0.37
163	0.45
164	0.46
165	0.48
166	0.48
167	0.52
168	0.5
169	0.51
170	0.51
171	0.49
172	0.5
173	0.5
174	0.51
175	0.45
176	0.4
177	0.37
178	0.29
179	0.23
180	0.21
181	0.15
182	0.13
183	0.18
184	0.19
185	0.16
186	0.18
187	0.26
188	0.32
189	0.38
190	0.41
191	0.44
192	0.54
193	0.64
194	0.72
195	0.75
196	0.76
197	0.8
198	0.87
199	0.87
200	0.87
201	0.83
202	0.75
203	0.68
204	0.62
205	0.57
206	0.47
207	0.44
208	0.41
209	0.37
210	0.4
211	0.38
212	0.44
213	0.51
214	0.59
215	0.59
216	0.57
217	0.61
218	0.62
219	0.65
220	0.64
221	0.57
222	0.53
223	0.47
224	0.44
225	0.39
226	0.32
227	0.28
228	0.25
229	0.28
230	0.3
231	0.28
232	0.25
233	0.24
234	0.24
235	0.22
236	0.19
237	0.13
238	0.08
239	0.09
240	0.09
241	0.09
242	0.09
243	0.1
244	0.08
245	0.07
246	0.06
247	0.05
248	0.05
249	0.04
250	0.05
251	0.05
252	0.06
253	0.06
254	0.06
255	0.06
256	0.06
257	0.07
258	0.05
259	0.05
260	0.05
261	0.04
262	0.05
263	0.07
264	0.1
265	0.1
266	0.12
267	0.16
268	0.22
269	0.25
270	0.28
271	0.35
272	0.4
273	0.48
274	0.49
275	0.46
276	0.4
277	0.36
278	0.38
279	0.3
280	0.22
281	0.17
282	0.15
283	0.14
284	0.14
285	0.14
286	0.1
287	0.09
288	0.11
289	0.08
290	0.1
291	0.13
292	0.14
293	0.15
294	0.16
295	0.17
296	0.14
297	0.16
298	0.15
299	0.19
300	0.18
301	0.19
302	0.2
303	0.23
304	0.24
305	0.26
306	0.26
307	0.22
308	0.26
309	0.28
310	0.29
311	0.31
312	0.31
313	0.32
314	0.31
315	0.29
316	0.25
317	0.27
318	0.27
319	0.22
320	0.22
321	0.18
322	0.2
323	0.2
324	0.21
325	0.19
326	0.22
327	0.26
328	0.27
329	0.29
330	0.27
331	0.27
332	0.26
333	0.24
334	0.22
335	0.18
336	0.18
337	0.16
338	0.16
339	0.16
340	0.15
341	0.14
342	0.11
343	0.08
344	0.05
345	0.05
346	0.05
347	0.05
348	0.05
349	0.05
350	0.05
351	0.05
352	0.05
353	0.05
354	0.06
355	0.05
356	0.05
357	0.06
358	0.06
359	0.05
360	0.05
361	0.04
362	0.03
363	0.04
364	0.03
365	0.03
366	0.03
367	0.04
368	0.04
369	0.04
370	0.04
371	0.05
372	0.05
373	0.05
374	0.05
375	0.05
376	0.06
377	0.07
378	0.07
379	0.1
380	0.11
381	0.12
382	0.12
383	0.12
384	0.11
385	0.1
386	0.09
387	0.06
388	0.05
389	0.04
390	0.05
391	0.05
392	0.05
393	0.05
394	0.06
395	0.06
396	0.06
397	0.07
398	0.1
399	0.11
400	0.13
401	0.13
402	0.15
403	0.15
404	0.15
405	0.15
406	0.17
407	0.21
408	0.22
409	0.26
410	0.3
411	0.36
412	0.46
413	0.55
414	0.58
415	0.63
416	0.7
417	0.77
418	0.81
419	0.86
420	0.87
421	0.9
422	0.92
423	0.93
424	0.94
425	0.91
426	0.91
427	0.88
428	0.83
429	0.76
430	0.69
431	0.62
432	0.53
433	0.45
434	0.35
435	0.27
436	0.21
437	0.17
438	0.13
439	0.1
440	0.08
441	0.08
442	0.08
443	0.07
444	0.08
445	0.08
446	0.08
447	0.08
448	0.08
449	0.07
450	0.08
451	0.08
452	0.07
453	0.08
454	0.1
455	0.1
456	0.11
457	0.12
458	0.11
459	0.12
460	0.19
461	0.24
462	0.31
463	0.34
464	0.39
465	0.46
466	0.52
467	0.57
468	0.54
469	0.5
470	0.46
471	0.47
472	0.42
473	0.4
474	0.4
475	0.38
476	0.35
477	0.35
478	0.31
479	0.29
480	0.31
481	0.27
482	0.23
483	0.21
484	0.21
485	0.26
486	0.26
487	0.29
488	0.27
489	0.29
490	0.31
491	0.37
492	0.41
493	0.38
494	0.4
495	0.44
496	0.49
497	0.51
498	0.5
499	0.49
500	0.46
501	0.43
502	0.44
503	0.41
504	0.4
505	0.43
506	0.41
507	0.38
508	0.37
509	0.37
510	0.38
511	0.33
512	0.29
513	0.24
514	0.24
515	0.22
516	0.2
517	0.23
518	0.21
519	0.2
520	0.23
521	0.22
522	0.24
523	0.31
524	0.32
525	0.3
526	0.34
527	0.43
528	0.49
529	0.58
530	0.65
531	0.64
532	0.64
533	0.64
534	0.59
535	0.55
536	0.45
537	0.36
538	0.26
539	0.23
540	0.22
541	0.2
542	0.18
543	0.14
544	0.15
545	0.14
546	0.18
547	0.21
548	0.26
549	0.29
550	0.3
551	0.34
552	0.36
553	0.42
554	0.46
555	0.43
556	0.41
557	0.41
558	0.43
559	0.42
560	0.39
561	0.32
562	0.24
563	0.23
564	0.19
565	0.16
566	0.13
567	0.13
568	0.14
569	0.15
570	0.17
571	0.19
572	0.23
573	0.3
574	0.37
575	0.43
576	0.49
577	0.58
578	0.64
579	0.67
580	0.72
581	0.69
582	0.66
583	0.6
584	0.57
585	0.47
586	0.39
587	0.35
588	0.31
589	0.27
590	0.25
591	0.24
592	0.26
593	0.31
594	0.3
595	0.28
596	0.27
597	0.32
598	0.33
599	0.31
600	0.26
601	0.25
602	0.27
603	0.27
604	0.25
605	0.2
606	0.17
607	0.16
608	0.14
609	0.12
610	0.09
611	0.11
612	0.12
613	0.1
614	0.11
615	0.14
616	0.14
617	0.14
618	0.15
619	0.14
620	0.12
621	0.12
622	0.12
623	0.09
624	0.09
625	0.08
626	0.08
627	0.07
628	0.06
629	0.05
630	0.05
631	0.05
632	0.07
633	0.07
634	0.11
635	0.13
636	0.17
637	0.2
638	0.25
639	0.32
640	0.34
641	0.38
642	0.39
643	0.44
644	0.42
645	0.47
646	0.44
647	0.4
648	0.37
649	0.36
650	0.36
651	0.31
652	0.32
653	0.26
654	0.27
655	0.28
656	0.31
657	0.33
658	0.33
659	0.38
660	0.45
661	0.48
662	0.46
663	0.42
664	0.41
665	0.37
666	0.35
667	0.36
668	0.27

M3BW04

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer