Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D2U8

Protein Details
Accession B0D2U8    Localization Confidence High Confidence Score 18.7
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
17-46TPEPTISVKKTSKKSKDKGKQKSSTGQGKNHydrophilic
242-265VKEVASQKKEKKVNDKKKDEAVEEHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
25-38KKTSKKSKDKGKQK
153-160KKGKKGKL
250-259KEKKVNDKKK
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 11.5, cyto 4.5, mito 2, pero 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013240  DNA-dir_RNA_pol1_su_RPA34  
Gene Ontology GO:0006360  P:transcription by RNA polymerase I  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_293309  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF08208  RNA_polI_A34  
Amino Acid Sequences MSSPSPSGSGSSRSSATPEPTISVKKTSKKSKDKGKQKSSTGQGKNEGVDQNWAYKPPAGAVLIEEDVDAGEFDWDKVNSDDVDLWLIRVPESVKPKYLENLQVEVPSSSKSTRIGTVKRKHATFDIWSIGGDDDDLPIGGEEIKSISCLLPKKGKKGKLYPAPKPFARHLVIAAQAVVPSPIAPSESGPDPETGKYKSVPRQRYPTELLKHRFMPYGSVGGVDESVVGPANAGDVAMDVDVKEVASQKKEKKVNDKKKDEAVEEKDTRKSPVVETKKSKALR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.29
3 0.31
4 0.3
5 0.28
6 0.28
7 0.31
8 0.35
9 0.33
10 0.38
11 0.41
12 0.45
13 0.54
14 0.62
15 0.68
16 0.74
17 0.81
18 0.84
19 0.87
20 0.9
21 0.91
22 0.91
23 0.9
24 0.86
25 0.86
26 0.84
27 0.84
28 0.79
29 0.74
30 0.69
31 0.63
32 0.57
33 0.53
34 0.45
35 0.35
36 0.34
37 0.29
38 0.28
39 0.27
40 0.27
41 0.24
42 0.23
43 0.23
44 0.19
45 0.21
46 0.15
47 0.14
48 0.14
49 0.15
50 0.14
51 0.13
52 0.12
53 0.09
54 0.08
55 0.08
56 0.07
57 0.04
58 0.04
59 0.04
60 0.05
61 0.08
62 0.08
63 0.1
64 0.1
65 0.12
66 0.11
67 0.12
68 0.12
69 0.1
70 0.13
71 0.11
72 0.11
73 0.11
74 0.11
75 0.1
76 0.1
77 0.11
78 0.14
79 0.21
80 0.22
81 0.24
82 0.25
83 0.27
84 0.29
85 0.32
86 0.34
87 0.3
88 0.31
89 0.28
90 0.27
91 0.27
92 0.24
93 0.2
94 0.13
95 0.12
96 0.1
97 0.11
98 0.12
99 0.13
100 0.17
101 0.23
102 0.29
103 0.38
104 0.45
105 0.53
106 0.56
107 0.55
108 0.52
109 0.48
110 0.44
111 0.37
112 0.32
113 0.25
114 0.21
115 0.2
116 0.19
117 0.16
118 0.12
119 0.1
120 0.06
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.03
125 0.03
126 0.03
127 0.03
128 0.03
129 0.03
130 0.04
131 0.04
132 0.04
133 0.05
134 0.05
135 0.08
136 0.1
137 0.13
138 0.22
139 0.24
140 0.33
141 0.4
142 0.47
143 0.51
144 0.57
145 0.64
146 0.65
147 0.7
148 0.7
149 0.71
150 0.7
151 0.65
152 0.61
153 0.54
154 0.5
155 0.44
156 0.36
157 0.29
158 0.25
159 0.25
160 0.21
161 0.19
162 0.12
163 0.1
164 0.09
165 0.08
166 0.06
167 0.04
168 0.04
169 0.04
170 0.05
171 0.05
172 0.06
173 0.08
174 0.1
175 0.12
176 0.13
177 0.14
178 0.15
179 0.16
180 0.19
181 0.18
182 0.18
183 0.19
184 0.25
185 0.32
186 0.4
187 0.47
188 0.51
189 0.58
190 0.6
191 0.64
192 0.64
193 0.64
194 0.63
195 0.63
196 0.61
197 0.57
198 0.57
199 0.52
200 0.49
201 0.41
202 0.36
203 0.29
204 0.27
205 0.23
206 0.2
207 0.18
208 0.15
209 0.14
210 0.1
211 0.09
212 0.06
213 0.06
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.04
218 0.05
219 0.04
220 0.04
221 0.03
222 0.04
223 0.04
224 0.04
225 0.05
226 0.04
227 0.05
228 0.05
229 0.05
230 0.06
231 0.11
232 0.14
233 0.2
234 0.28
235 0.35
236 0.44
237 0.51
238 0.58
239 0.64
240 0.72
241 0.78
242 0.81
243 0.83
244 0.81
245 0.83
246 0.82
247 0.76
248 0.74
249 0.7
250 0.69
251 0.66
252 0.63
253 0.6
254 0.56
255 0.54
256 0.5
257 0.45
258 0.42
259 0.47
260 0.52
261 0.56
262 0.62
263 0.65