Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1QFW0

Protein Details
Accession N1QFW0    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
220-241MEPPKHKIKKVPRKDPSPPPPVBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
222-238PPKHKIKKVPRKDPSPP
383-426GSGSRSRSRGGGRDDGDRELRAREKARAERKREAKDELRKKNMG
Subcellular Location(s) nucl 17.5, cyto_nucl 12.5, cyto 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017862  SKI-int_prot_SKIP  
IPR004015  SKI-int_prot_SKIP_SNW-dom  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF02731  SKIP_SNW  
Amino Acid Sequences MSRTSILGSLPKPKYSGEDEELPTHTQQKGPKVIAARELESSQLTVKRSGPPAYGQRAGWRPRGAEDFGDGGAFPEIPMAQYPLDMGRKNMPSSSNALALQVDREGKIKYDAIARRGHSETRIVHASFKDLIPLRQRADAGEINLEKPSEEEVEATKQRTQLALQGLVSGALAAQKPKNIKGTSRAEPTFVRYTPADQMGDKSKKQDRIIKIVPRQQDPMEPPKHKIKKVPRKDPSPPPPVMHSPPRKLTAEDQENWKIPPPVSNWKNAKGYTVPLDKRLAADGRGLQDVTINDKFAQFAEGLHTADRHAREEVQQRAKMQQRLAEKEKEAKEENLRQLAMKARADKQAAMAQRRGSDRGRSRSRSVDSRSSYSSYSSRSRSGSGSRSRSRGGGRDDGDRELRAREKARAERKREAKDELRKKNMGHERRVQMMAREQNRDISEKVALGLAKPTQNKEAMYDSRLFNQSSGLAAGFNEDQAYDKPLFASRDALNSIYQPQAGDDDGEDEGETLEKIQGTKRFDGLGRAPKEGFKGTDTAEARSGPVQFERDRGDDPFGVEAMIAEASEKASKRAAEEEAGGRSKKARVDDD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.39
2 0.39
3 0.44
4 0.39
5 0.44
6 0.45
7 0.47
8 0.49
9 0.46
10 0.41
11 0.38
12 0.34
13 0.3
14 0.32
15 0.37
16 0.43
17 0.43
18 0.45
19 0.47
20 0.48
21 0.52
22 0.51
23 0.44
24 0.39
25 0.37
26 0.34
27 0.29
28 0.27
29 0.23
30 0.23
31 0.23
32 0.23
33 0.26
34 0.31
35 0.35
36 0.38
37 0.36
38 0.39
39 0.46
40 0.49
41 0.5
42 0.44
43 0.48
44 0.53
45 0.55
46 0.55
47 0.51
48 0.45
49 0.46
50 0.5
51 0.44
52 0.37
53 0.35
54 0.29
55 0.25
56 0.24
57 0.19
58 0.14
59 0.13
60 0.11
61 0.08
62 0.07
63 0.07
64 0.07
65 0.08
66 0.1
67 0.09
68 0.09
69 0.1
70 0.14
71 0.2
72 0.2
73 0.21
74 0.27
75 0.31
76 0.33
77 0.35
78 0.32
79 0.29
80 0.33
81 0.34
82 0.3
83 0.26
84 0.25
85 0.23
86 0.21
87 0.2
88 0.18
89 0.17
90 0.14
91 0.15
92 0.15
93 0.16
94 0.19
95 0.19
96 0.17
97 0.25
98 0.28
99 0.31
100 0.37
101 0.37
102 0.39
103 0.41
104 0.41
105 0.34
106 0.37
107 0.34
108 0.33
109 0.37
110 0.32
111 0.33
112 0.31
113 0.32
114 0.28
115 0.26
116 0.27
117 0.23
118 0.27
119 0.3
120 0.35
121 0.33
122 0.34
123 0.35
124 0.29
125 0.33
126 0.31
127 0.25
128 0.27
129 0.26
130 0.23
131 0.24
132 0.23
133 0.17
134 0.15
135 0.16
136 0.11
137 0.1
138 0.11
139 0.12
140 0.19
141 0.22
142 0.23
143 0.24
144 0.24
145 0.24
146 0.25
147 0.23
148 0.22
149 0.23
150 0.23
151 0.21
152 0.2
153 0.19
154 0.17
155 0.16
156 0.11
157 0.06
158 0.06
159 0.06
160 0.08
161 0.09
162 0.13
163 0.15
164 0.19
165 0.27
166 0.27
167 0.29
168 0.36
169 0.42
170 0.45
171 0.51
172 0.48
173 0.43
174 0.42
175 0.45
176 0.41
177 0.34
178 0.31
179 0.23
180 0.25
181 0.26
182 0.28
183 0.24
184 0.19
185 0.22
186 0.28
187 0.32
188 0.3
189 0.34
190 0.37
191 0.42
192 0.47
193 0.53
194 0.48
195 0.53
196 0.6
197 0.62
198 0.63
199 0.62
200 0.62
201 0.57
202 0.55
203 0.46
204 0.44
205 0.4
206 0.43
207 0.45
208 0.42
209 0.43
210 0.51
211 0.57
212 0.54
213 0.59
214 0.61
215 0.63
216 0.72
217 0.79
218 0.77
219 0.78
220 0.83
221 0.85
222 0.83
223 0.79
224 0.71
225 0.62
226 0.58
227 0.55
228 0.51
229 0.5
230 0.49
231 0.46
232 0.47
233 0.5
234 0.46
235 0.43
236 0.43
237 0.43
238 0.42
239 0.39
240 0.41
241 0.4
242 0.4
243 0.38
244 0.36
245 0.28
246 0.22
247 0.24
248 0.23
249 0.29
250 0.3
251 0.39
252 0.4
253 0.43
254 0.47
255 0.43
256 0.41
257 0.32
258 0.32
259 0.29
260 0.33
261 0.29
262 0.27
263 0.29
264 0.27
265 0.26
266 0.26
267 0.21
268 0.14
269 0.15
270 0.14
271 0.14
272 0.15
273 0.14
274 0.11
275 0.13
276 0.12
277 0.15
278 0.13
279 0.12
280 0.12
281 0.12
282 0.13
283 0.11
284 0.11
285 0.06
286 0.06
287 0.08
288 0.09
289 0.1
290 0.09
291 0.1
292 0.09
293 0.12
294 0.13
295 0.12
296 0.11
297 0.12
298 0.17
299 0.24
300 0.31
301 0.35
302 0.36
303 0.36
304 0.42
305 0.47
306 0.46
307 0.4
308 0.37
309 0.36
310 0.41
311 0.45
312 0.42
313 0.38
314 0.42
315 0.42
316 0.42
317 0.38
318 0.34
319 0.36
320 0.39
321 0.41
322 0.37
323 0.35
324 0.31
325 0.31
326 0.33
327 0.31
328 0.26
329 0.26
330 0.26
331 0.31
332 0.32
333 0.3
334 0.27
335 0.27
336 0.29
337 0.29
338 0.28
339 0.25
340 0.28
341 0.3
342 0.31
343 0.28
344 0.33
345 0.37
346 0.44
347 0.51
348 0.52
349 0.54
350 0.57
351 0.59
352 0.58
353 0.56
354 0.55
355 0.51
356 0.49
357 0.49
358 0.43
359 0.4
360 0.35
361 0.31
362 0.27
363 0.28
364 0.27
365 0.28
366 0.27
367 0.28
368 0.29
369 0.32
370 0.35
371 0.39
372 0.45
373 0.46
374 0.48
375 0.47
376 0.48
377 0.46
378 0.44
379 0.41
380 0.4
381 0.37
382 0.41
383 0.41
384 0.4
385 0.39
386 0.33
387 0.29
388 0.25
389 0.26
390 0.25
391 0.26
392 0.28
393 0.35
394 0.43
395 0.53
396 0.59
397 0.63
398 0.68
399 0.74
400 0.77
401 0.72
402 0.71
403 0.7
404 0.71
405 0.74
406 0.74
407 0.73
408 0.69
409 0.65
410 0.68
411 0.68
412 0.65
413 0.62
414 0.62
415 0.58
416 0.59
417 0.62
418 0.53
419 0.46
420 0.46
421 0.47
422 0.43
423 0.44
424 0.39
425 0.41
426 0.42
427 0.42
428 0.34
429 0.28
430 0.24
431 0.2
432 0.2
433 0.16
434 0.15
435 0.12
436 0.14
437 0.15
438 0.19
439 0.21
440 0.23
441 0.24
442 0.27
443 0.27
444 0.27
445 0.31
446 0.29
447 0.3
448 0.32
449 0.3
450 0.33
451 0.35
452 0.32
453 0.25
454 0.24
455 0.21
456 0.18
457 0.17
458 0.12
459 0.09
460 0.09
461 0.11
462 0.09
463 0.09
464 0.08
465 0.07
466 0.09
467 0.1
468 0.14
469 0.12
470 0.12
471 0.13
472 0.18
473 0.2
474 0.19
475 0.23
476 0.2
477 0.24
478 0.25
479 0.25
480 0.22
481 0.21
482 0.23
483 0.2
484 0.19
485 0.15
486 0.14
487 0.15
488 0.14
489 0.13
490 0.1
491 0.11
492 0.11
493 0.11
494 0.1
495 0.08
496 0.08
497 0.08
498 0.07
499 0.06
500 0.08
501 0.08
502 0.09
503 0.15
504 0.2
505 0.25
506 0.28
507 0.29
508 0.31
509 0.31
510 0.37
511 0.4
512 0.44
513 0.42
514 0.43
515 0.42
516 0.41
517 0.44
518 0.41
519 0.35
520 0.27
521 0.27
522 0.25
523 0.33
524 0.32
525 0.31
526 0.3
527 0.28
528 0.27
529 0.27
530 0.26
531 0.2
532 0.22
533 0.25
534 0.24
535 0.28
536 0.31
537 0.32
538 0.33
539 0.34
540 0.35
541 0.31
542 0.32
543 0.29
544 0.24
545 0.21
546 0.18
547 0.15
548 0.11
549 0.09
550 0.07
551 0.06
552 0.06
553 0.08
554 0.12
555 0.13
556 0.14
557 0.18
558 0.19
559 0.22
560 0.26
561 0.28
562 0.26
563 0.3
564 0.32
565 0.35
566 0.39
567 0.37
568 0.34
569 0.34
570 0.35
571 0.36