Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DY96

Protein Details
Accession B0DY96    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
4-24SGINTHKPDQDQKRPRLQSFSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
295-298KRKG
Subcellular Location(s) nucl 12, cyto_nucl 12, cyto 10, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR036864  Zn2-C6_fun-type_DNA-bd_sf  
IPR001138  Zn2Cys6_DnaBD  
Gene Ontology GO:0000981  F:DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific  
GO:0008270  F:zinc ion binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_334157  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00172  Zn_clus  
Amino Acid Sequences MGGSGINTHKPDQDQKRPRLQSFSVFGPVLVQTGYNQFKTGFSAKYAITFAILLNECKNCPKAKVIVVHDSNWCSAIQDSDIDWTSTAQDLPRRIQEAFYDVEKDNGTVYLEEKARLSQDLITSSGVSVRAEVEDQSLLQRRKSRRSQLIHPFETSPSDVEIDSARSPKKTVNGDIKSHTCRGSGKLETFGGKACNASHRSKLQCEGTAPCTNCFYASKKCTFTDGADPPVLTRPLHKPESASPSNNPSQPSQLSSARERLLFSLPYQRPNRNLPIPPSLSQPDHGDHHNDAERKRKGPVRGRLGSSAAPESFTQPHKTNFPPVTSIWDDRNPLSPLAVVIALITHIIVSNPMP
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.61
2 0.68
3 0.77
4 0.81
5 0.8
6 0.78
7 0.72
8 0.69
9 0.63
10 0.58
11 0.53
12 0.44
13 0.4
14 0.33
15 0.3
16 0.22
17 0.18
18 0.13
19 0.09
20 0.17
21 0.21
22 0.2
23 0.21
24 0.21
25 0.21
26 0.26
27 0.29
28 0.23
29 0.21
30 0.24
31 0.23
32 0.25
33 0.26
34 0.2
35 0.17
36 0.16
37 0.14
38 0.17
39 0.18
40 0.16
41 0.19
42 0.2
43 0.2
44 0.24
45 0.28
46 0.23
47 0.25
48 0.28
49 0.31
50 0.35
51 0.43
52 0.44
53 0.5
54 0.51
55 0.51
56 0.5
57 0.46
58 0.4
59 0.33
60 0.27
61 0.19
62 0.16
63 0.14
64 0.11
65 0.11
66 0.11
67 0.13
68 0.14
69 0.13
70 0.13
71 0.12
72 0.12
73 0.12
74 0.12
75 0.11
76 0.15
77 0.17
78 0.21
79 0.24
80 0.26
81 0.26
82 0.26
83 0.25
84 0.24
85 0.23
86 0.21
87 0.21
88 0.18
89 0.2
90 0.19
91 0.18
92 0.15
93 0.13
94 0.13
95 0.09
96 0.1
97 0.13
98 0.13
99 0.14
100 0.14
101 0.14
102 0.14
103 0.14
104 0.15
105 0.12
106 0.13
107 0.14
108 0.15
109 0.15
110 0.14
111 0.13
112 0.13
113 0.12
114 0.1
115 0.08
116 0.07
117 0.07
118 0.08
119 0.08
120 0.07
121 0.07
122 0.07
123 0.1
124 0.17
125 0.17
126 0.2
127 0.27
128 0.3
129 0.39
130 0.48
131 0.54
132 0.57
133 0.62
134 0.69
135 0.73
136 0.77
137 0.7
138 0.63
139 0.55
140 0.46
141 0.42
142 0.33
143 0.22
144 0.14
145 0.12
146 0.1
147 0.1
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.13
152 0.13
153 0.12
154 0.13
155 0.15
156 0.2
157 0.21
158 0.26
159 0.33
160 0.37
161 0.39
162 0.42
163 0.44
164 0.41
165 0.4
166 0.34
167 0.25
168 0.22
169 0.23
170 0.25
171 0.23
172 0.22
173 0.22
174 0.23
175 0.23
176 0.22
177 0.19
178 0.15
179 0.13
180 0.12
181 0.1
182 0.15
183 0.18
184 0.2
185 0.24
186 0.29
187 0.32
188 0.33
189 0.37
190 0.34
191 0.31
192 0.31
193 0.3
194 0.29
195 0.32
196 0.31
197 0.27
198 0.26
199 0.24
200 0.23
201 0.22
202 0.21
203 0.23
204 0.27
205 0.31
206 0.33
207 0.33
208 0.35
209 0.35
210 0.33
211 0.34
212 0.32
213 0.31
214 0.28
215 0.28
216 0.25
217 0.27
218 0.26
219 0.17
220 0.18
221 0.21
222 0.27
223 0.3
224 0.29
225 0.29
226 0.33
227 0.42
228 0.43
229 0.4
230 0.36
231 0.39
232 0.43
233 0.43
234 0.39
235 0.31
236 0.32
237 0.3
238 0.3
239 0.29
240 0.29
241 0.3
242 0.32
243 0.36
244 0.33
245 0.32
246 0.3
247 0.28
248 0.27
249 0.24
250 0.22
251 0.28
252 0.28
253 0.36
254 0.4
255 0.42
256 0.44
257 0.49
258 0.55
259 0.52
260 0.55
261 0.51
262 0.55
263 0.55
264 0.51
265 0.51
266 0.47
267 0.41
268 0.38
269 0.36
270 0.31
271 0.29
272 0.3
273 0.29
274 0.25
275 0.3
276 0.34
277 0.35
278 0.34
279 0.42
280 0.45
281 0.43
282 0.49
283 0.49
284 0.53
285 0.59
286 0.66
287 0.66
288 0.68
289 0.71
290 0.67
291 0.64
292 0.57
293 0.5
294 0.44
295 0.34
296 0.29
297 0.25
298 0.25
299 0.26
300 0.28
301 0.3
302 0.3
303 0.34
304 0.38
305 0.41
306 0.47
307 0.46
308 0.46
309 0.44
310 0.4
311 0.44
312 0.43
313 0.43
314 0.39
315 0.4
316 0.4
317 0.38
318 0.44
319 0.38
320 0.33
321 0.31
322 0.26
323 0.21
324 0.2
325 0.18
326 0.11
327 0.09
328 0.08
329 0.07
330 0.07
331 0.06
332 0.04
333 0.04
334 0.05