Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1QIU0

Protein Details
Accession N1QIU0    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
112-133SPAVPRRRSSAQFRRNRNEPTPHydrophilic
256-276LEIAAKRRRRENVRKLRSATAHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
261-268KRRRRENV
Subcellular Location(s) mito 11, nucl 8.5, cyto_nucl 7.5, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039745  Vps54  
IPR012501  Vps54_C  
IPR019515  VPS54_N  
Gene Ontology GO:0005829  C:cytosol  
GO:0000938  C:GARP complex  
GO:0015031  P:protein transport  
GO:0042147  P:retrograde transport, endosome to Golgi  
Pfam View protein in Pfam  
PF07928  Vps54  
PF10475  Vps54_N  
Amino Acid Sequences MRTGLVPHTAAQAAASRFKAPTTRDIPPVTLTSVPHVPPEKFRDYLNRIGPLFESFQRRRSEPDQPAWLRKDRDLEKVEALERRLSRPDSSAPPTPTVAAPSSPAIMSPIESPAVPRRRSSAQFRRNRNEPTPLSTIPNVYFDENFHLENPRTFDVVSEKSEIVRPPPGSQPSTATPQMPRKSLANNAILQEKLSWYMDTVEVHLINSISTASTGFFTALGSLKELQTEAAQSVAKIQSLREDLKRLDQEIAVSGLEIAAKRRRRENVRKLRSATAQVQSVVDNVKRADELVDNGAYDEAADQMDRVGRLVCGQPEPGGEDGELIDLRPLKALQGLDTGLQELQLRIGTGFAQRFSSILIGDLRRHVQKVPTAETLKRWSRQRGIPPTYMETDDAFRKDLLSALTGLARAGHTAPASSKYRDDVNKEVKAIIRRFMPSSSDDDADSMMSTSTTMSRGGGKRSQQEKSLMLARHLKAMDAEDAEKLLADAYTSIGEALRRVSTQTKILLDVTSSMQPPEPKSPKSHSRSATVSSIEERLVNGGDLDTKSSVQEELSQALDMSSLLGQAVDTAQSQITRVLRVRNEQTIRLSKDHFLRYFTLNRLFADECEAISGRGGNVLRGIINAQISGFVQVLGTSETERVANMLDSDTWNAEDFTDARNELLQRILASMTKDPPEWAQGTASIWEEPQTNGNTANGTPAAPVTNGTAPTSAKGATAKPAYIDETRFILVPSASSLLDSIDTFLSLTSTLPSMTPQISTSLIDVLRTFNSRTNQLILGAGATKIAGLKNITTKHLALASQALSFVVAIIPYIRECVRRHNPAGQGGILAEFDKMKRLYQDHQSGIHDKLVEIMTSRSTAHVKAMSLIDFDSPAPDDEKPNTYMETLTKETLTLHRVLSRHLSELDVRLIMRQIFVGYREQWTKAFDGVDVESASGEKRLLRDAEAFEARLGRVEGFEEIGKEVLGLVRAKVSAEEKGEEGEKPQADAENNAKDDAAPAVDMKEETQVNGDGNEDDEKKTIPTTEGEGDDNTIDHKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.25
2 0.25
3 0.24
4 0.24
5 0.27
6 0.32
7 0.29
8 0.36
9 0.37
10 0.41
11 0.46
12 0.49
13 0.49
14 0.46
15 0.45
16 0.39
17 0.36
18 0.31
19 0.29
20 0.32
21 0.3
22 0.33
23 0.35
24 0.34
25 0.39
26 0.46
27 0.46
28 0.42
29 0.45
30 0.49
31 0.5
32 0.57
33 0.56
34 0.55
35 0.5
36 0.5
37 0.47
38 0.41
39 0.38
40 0.35
41 0.38
42 0.34
43 0.41
44 0.45
45 0.45
46 0.49
47 0.51
48 0.57
49 0.56
50 0.61
51 0.65
52 0.66
53 0.73
54 0.72
55 0.73
56 0.66
57 0.62
58 0.63
59 0.57
60 0.6
61 0.56
62 0.54
63 0.51
64 0.51
65 0.51
66 0.46
67 0.44
68 0.42
69 0.4
70 0.4
71 0.41
72 0.4
73 0.38
74 0.38
75 0.42
76 0.42
77 0.46
78 0.5
79 0.47
80 0.47
81 0.46
82 0.43
83 0.37
84 0.33
85 0.29
86 0.22
87 0.21
88 0.19
89 0.19
90 0.17
91 0.16
92 0.14
93 0.13
94 0.13
95 0.12
96 0.13
97 0.12
98 0.12
99 0.16
100 0.23
101 0.32
102 0.33
103 0.33
104 0.36
105 0.43
106 0.5
107 0.58
108 0.59
109 0.61
110 0.68
111 0.77
112 0.81
113 0.81
114 0.82
115 0.77
116 0.76
117 0.69
118 0.67
119 0.63
120 0.57
121 0.54
122 0.47
123 0.45
124 0.36
125 0.36
126 0.31
127 0.26
128 0.24
129 0.21
130 0.25
131 0.24
132 0.23
133 0.21
134 0.25
135 0.24
136 0.27
137 0.31
138 0.26
139 0.25
140 0.24
141 0.25
142 0.26
143 0.28
144 0.28
145 0.26
146 0.24
147 0.25
148 0.29
149 0.28
150 0.25
151 0.28
152 0.27
153 0.27
154 0.35
155 0.39
156 0.38
157 0.38
158 0.39
159 0.36
160 0.41
161 0.4
162 0.35
163 0.36
164 0.43
165 0.46
166 0.44
167 0.43
168 0.4
169 0.42
170 0.47
171 0.47
172 0.43
173 0.41
174 0.4
175 0.41
176 0.38
177 0.34
178 0.27
179 0.21
180 0.18
181 0.16
182 0.14
183 0.12
184 0.14
185 0.15
186 0.15
187 0.16
188 0.16
189 0.15
190 0.15
191 0.15
192 0.13
193 0.11
194 0.11
195 0.09
196 0.06
197 0.06
198 0.06
199 0.06
200 0.06
201 0.07
202 0.07
203 0.07
204 0.07
205 0.08
206 0.09
207 0.09
208 0.11
209 0.12
210 0.12
211 0.12
212 0.12
213 0.11
214 0.1
215 0.11
216 0.09
217 0.1
218 0.1
219 0.09
220 0.14
221 0.14
222 0.15
223 0.14
224 0.14
225 0.17
226 0.22
227 0.26
228 0.25
229 0.29
230 0.29
231 0.37
232 0.39
233 0.35
234 0.33
235 0.29
236 0.27
237 0.24
238 0.24
239 0.15
240 0.12
241 0.1
242 0.08
243 0.09
244 0.08
245 0.11
246 0.17
247 0.23
248 0.26
249 0.33
250 0.42
251 0.51
252 0.62
253 0.7
254 0.74
255 0.78
256 0.83
257 0.81
258 0.78
259 0.72
260 0.67
261 0.62
262 0.55
263 0.47
264 0.4
265 0.36
266 0.3
267 0.27
268 0.24
269 0.18
270 0.16
271 0.13
272 0.13
273 0.13
274 0.13
275 0.13
276 0.11
277 0.13
278 0.14
279 0.14
280 0.13
281 0.13
282 0.13
283 0.1
284 0.09
285 0.07
286 0.05
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.07
292 0.07
293 0.07
294 0.07
295 0.07
296 0.09
297 0.12
298 0.13
299 0.13
300 0.14
301 0.14
302 0.14
303 0.16
304 0.15
305 0.13
306 0.11
307 0.1
308 0.09
309 0.1
310 0.09
311 0.07
312 0.08
313 0.08
314 0.08
315 0.09
316 0.09
317 0.08
318 0.11
319 0.11
320 0.11
321 0.12
322 0.13
323 0.12
324 0.13
325 0.13
326 0.09
327 0.1
328 0.09
329 0.07
330 0.07
331 0.07
332 0.07
333 0.06
334 0.07
335 0.07
336 0.1
337 0.11
338 0.11
339 0.12
340 0.12
341 0.12
342 0.12
343 0.12
344 0.08
345 0.09
346 0.11
347 0.12
348 0.13
349 0.15
350 0.17
351 0.18
352 0.19
353 0.19
354 0.2
355 0.23
356 0.26
357 0.29
358 0.32
359 0.34
360 0.35
361 0.37
362 0.41
363 0.43
364 0.44
365 0.44
366 0.44
367 0.48
368 0.53
369 0.59
370 0.62
371 0.62
372 0.6
373 0.58
374 0.55
375 0.5
376 0.44
377 0.35
378 0.26
379 0.22
380 0.21
381 0.18
382 0.16
383 0.14
384 0.13
385 0.12
386 0.13
387 0.11
388 0.09
389 0.09
390 0.09
391 0.09
392 0.09
393 0.08
394 0.07
395 0.07
396 0.06
397 0.06
398 0.07
399 0.06
400 0.07
401 0.08
402 0.12
403 0.15
404 0.16
405 0.16
406 0.17
407 0.22
408 0.25
409 0.29
410 0.33
411 0.37
412 0.39
413 0.39
414 0.39
415 0.36
416 0.4
417 0.36
418 0.31
419 0.26
420 0.25
421 0.26
422 0.25
423 0.24
424 0.2
425 0.24
426 0.23
427 0.21
428 0.19
429 0.18
430 0.17
431 0.15
432 0.13
433 0.07
434 0.05
435 0.04
436 0.04
437 0.04
438 0.05
439 0.06
440 0.06
441 0.06
442 0.12
443 0.14
444 0.17
445 0.22
446 0.25
447 0.32
448 0.37
449 0.39
450 0.37
451 0.39
452 0.36
453 0.35
454 0.37
455 0.3
456 0.27
457 0.32
458 0.29
459 0.3
460 0.29
461 0.26
462 0.2
463 0.21
464 0.19
465 0.13
466 0.13
467 0.09
468 0.09
469 0.08
470 0.08
471 0.06
472 0.05
473 0.04
474 0.03
475 0.03
476 0.03
477 0.04
478 0.04
479 0.04
480 0.04
481 0.04
482 0.05
483 0.06
484 0.06
485 0.06
486 0.08
487 0.1
488 0.11
489 0.14
490 0.16
491 0.16
492 0.16
493 0.17
494 0.15
495 0.13
496 0.13
497 0.12
498 0.11
499 0.1
500 0.09
501 0.1
502 0.11
503 0.14
504 0.21
505 0.24
506 0.24
507 0.28
508 0.34
509 0.43
510 0.46
511 0.52
512 0.45
513 0.46
514 0.46
515 0.45
516 0.42
517 0.33
518 0.29
519 0.22
520 0.21
521 0.17
522 0.14
523 0.11
524 0.09
525 0.08
526 0.07
527 0.06
528 0.05
529 0.06
530 0.06
531 0.07
532 0.07
533 0.07
534 0.07
535 0.07
536 0.08
537 0.06
538 0.09
539 0.09
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.09
544 0.09
545 0.09
546 0.06
547 0.05
548 0.04
549 0.03
550 0.03
551 0.03
552 0.03
553 0.03
554 0.03
555 0.03
556 0.04
557 0.04
558 0.05
559 0.05
560 0.06
561 0.09
562 0.09
563 0.11
564 0.13
565 0.17
566 0.19
567 0.24
568 0.26
569 0.31
570 0.32
571 0.32
572 0.36
573 0.38
574 0.39
575 0.37
576 0.36
577 0.32
578 0.36
579 0.4
580 0.35
581 0.31
582 0.3
583 0.32
584 0.34
585 0.33
586 0.33
587 0.28
588 0.27
589 0.28
590 0.26
591 0.22
592 0.23
593 0.2
594 0.14
595 0.15
596 0.15
597 0.11
598 0.11
599 0.11
600 0.05
601 0.09
602 0.09
603 0.08
604 0.08
605 0.09
606 0.08
607 0.08
608 0.09
609 0.07
610 0.07
611 0.07
612 0.06
613 0.06
614 0.06
615 0.07
616 0.07
617 0.05
618 0.05
619 0.05
620 0.06
621 0.06
622 0.06
623 0.06
624 0.06
625 0.06
626 0.07
627 0.06
628 0.06
629 0.06
630 0.06
631 0.06
632 0.06
633 0.06
634 0.07
635 0.08
636 0.08
637 0.08
638 0.08
639 0.08
640 0.07
641 0.08
642 0.08
643 0.08
644 0.09
645 0.09
646 0.09
647 0.11
648 0.11
649 0.11
650 0.11
651 0.1
652 0.09
653 0.1
654 0.1
655 0.1
656 0.11
657 0.13
658 0.15
659 0.15
660 0.15
661 0.16
662 0.16
663 0.18
664 0.17
665 0.16
666 0.14
667 0.13
668 0.14
669 0.14
670 0.14
671 0.11
672 0.1
673 0.1
674 0.1
675 0.1
676 0.13
677 0.13
678 0.13
679 0.13
680 0.14
681 0.14
682 0.13
683 0.14
684 0.11
685 0.1
686 0.09
687 0.09
688 0.09
689 0.08
690 0.09
691 0.09
692 0.11
693 0.11
694 0.12
695 0.13
696 0.12
697 0.13
698 0.14
699 0.11
700 0.1
701 0.11
702 0.11
703 0.15
704 0.17
705 0.16
706 0.16
707 0.17
708 0.19
709 0.2
710 0.21
711 0.17
712 0.17
713 0.18
714 0.17
715 0.16
716 0.13
717 0.11
718 0.1
719 0.1
720 0.09
721 0.09
722 0.09
723 0.09
724 0.08
725 0.08
726 0.08
727 0.08
728 0.06
729 0.06
730 0.06
731 0.06
732 0.06
733 0.06
734 0.06
735 0.05
736 0.06
737 0.06
738 0.06
739 0.07
740 0.09
741 0.09
742 0.1
743 0.1
744 0.12
745 0.13
746 0.13
747 0.13
748 0.14
749 0.13
750 0.13
751 0.13
752 0.13
753 0.14
754 0.15
755 0.16
756 0.18
757 0.21
758 0.23
759 0.24
760 0.25
761 0.24
762 0.23
763 0.22
764 0.17
765 0.15
766 0.13
767 0.11
768 0.08
769 0.07
770 0.06
771 0.07
772 0.07
773 0.08
774 0.08
775 0.1
776 0.16
777 0.19
778 0.21
779 0.23
780 0.23
781 0.23
782 0.24
783 0.22
784 0.17
785 0.19
786 0.17
787 0.15
788 0.15
789 0.12
790 0.1
791 0.1
792 0.09
793 0.05
794 0.04
795 0.04
796 0.04
797 0.05
798 0.05
799 0.08
800 0.09
801 0.14
802 0.15
803 0.26
804 0.34
805 0.41
806 0.46
807 0.51
808 0.55
809 0.55
810 0.57
811 0.47
812 0.38
813 0.3
814 0.27
815 0.2
816 0.15
817 0.1
818 0.09
819 0.08
820 0.13
821 0.14
822 0.15
823 0.19
824 0.23
825 0.28
826 0.37
827 0.45
828 0.43
829 0.46
830 0.49
831 0.48
832 0.46
833 0.43
834 0.34
835 0.25
836 0.25
837 0.22
838 0.18
839 0.16
840 0.15
841 0.13
842 0.14
843 0.15
844 0.14
845 0.15
846 0.15
847 0.18
848 0.2
849 0.19
850 0.21
851 0.23
852 0.21
853 0.19
854 0.19
855 0.16
856 0.14
857 0.13
858 0.12
859 0.11
860 0.11
861 0.13
862 0.13
863 0.16
864 0.19
865 0.23
866 0.23
867 0.24
868 0.24
869 0.23
870 0.23
871 0.22
872 0.25
873 0.24
874 0.23
875 0.22
876 0.21
877 0.22
878 0.24
879 0.25
880 0.21
881 0.21
882 0.24
883 0.24
884 0.27
885 0.32
886 0.31
887 0.3
888 0.29
889 0.29
890 0.27
891 0.29
892 0.29
893 0.23
894 0.21
895 0.19
896 0.21
897 0.19
898 0.17
899 0.14
900 0.13
901 0.13
902 0.15
903 0.19
904 0.18
905 0.24
906 0.26
907 0.28
908 0.28
909 0.29
910 0.29
911 0.27
912 0.26
913 0.2
914 0.2
915 0.19
916 0.2
917 0.17
918 0.15
919 0.13
920 0.13
921 0.13
922 0.1
923 0.1
924 0.1
925 0.11
926 0.16
927 0.17
928 0.2
929 0.24
930 0.26
931 0.32
932 0.33
933 0.32
934 0.28
935 0.29
936 0.26
937 0.23
938 0.22
939 0.15
940 0.13
941 0.14
942 0.14
943 0.13
944 0.14
945 0.13
946 0.13
947 0.13
948 0.12
949 0.1
950 0.1
951 0.09
952 0.12
953 0.11
954 0.11
955 0.13
956 0.13
957 0.14
958 0.17
959 0.18
960 0.19
961 0.22
962 0.23
963 0.21
964 0.24
965 0.25
966 0.23
967 0.23
968 0.25
969 0.23
970 0.22
971 0.23
972 0.24
973 0.24
974 0.29
975 0.33
976 0.34
977 0.34
978 0.33
979 0.32
980 0.28
981 0.27
982 0.24
983 0.18
984 0.11
985 0.1
986 0.11
987 0.12
988 0.13
989 0.12
990 0.16
991 0.16
992 0.16
993 0.18
994 0.19
995 0.18
996 0.18
997 0.19
998 0.13
999 0.15
1000 0.2
1001 0.19
1002 0.18
1003 0.19
1004 0.2
1005 0.2
1006 0.21
1007 0.21
1008 0.18
1009 0.19
1010 0.23
1011 0.26
1012 0.28
1013 0.29
1014 0.28
1015 0.27
1016 0.25
1017 0.23