Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3BQN1

Protein Details
Accession M3BQN1    Localization Confidence High Confidence Score 17.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
56-82VSEKTVKEKEKKGSKKASKKVVEEKEVBasic
390-417AEKTTKRKSKSGEVKVTKEKAKKRKTKABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
6-49KGKKRKSGDNVEPLAKKAKTTPATVKKSADRPLPAKSALKTAKS
58-75EKTVKEKEKKGSKKASKK
268-316KGTKAVKGNGKARPRNRIEGSRLRKGTDREGWEKRITRESERRKEKAEK
394-417TKRKSKSGEVKVTKEKAKKRKTKA
Subcellular Location(s) nucl 12.5, mito_nucl 10, cyto 8, mito 6.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003723  F:RNA binding  
Pfam View protein in Pfam  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50102  RRM  
CDD cd12307  RRM_NIFK_like  
Amino Acid Sequences MSAETKGKKRKSGDNVEPLAKKAKTTPATVKKSADRPLPAKSALKTAKSENKTVVVSEKTVKEKEKKGSKKASKKVVEEKEVIVESKPEAEAVVAEATNDDSESDGGAELTPDQTAALLAGFSSDESEGEDDIDRDQDGIPIESLPALPKTEKAIARELKISRIKPKNINGASSDPEATPGVIYISRLPHGFYEKQLRAYLTQFGDVTNLRLARNKKTGKSQHYAFIEFAAAAVADIVVKTMDKYLMFGHILQCKRVPAEQVKEGMWKGTKAVKGNGKARPRNRIEGSRLRKGTDREGWEKRITRESERRKEKAEKLKEMGYDFDMPDVKPVEGVAAKEKKSIEQVSAGATAEEVVKAIQNGTEPGNGEIVEETVLATVNAGAEGQAIVAEKTTKRKSKSGEVKVTKEKAKKRKTKA
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.79
2 0.79
3 0.79
4 0.74
5 0.67
6 0.64
7 0.54
8 0.45
9 0.4
10 0.44
11 0.4
12 0.45
13 0.53
14 0.55
15 0.63
16 0.67
17 0.67
18 0.65
19 0.69
20 0.69
21 0.66
22 0.63
23 0.59
24 0.6
25 0.6
26 0.57
27 0.54
28 0.49
29 0.51
30 0.49
31 0.49
32 0.46
33 0.49
34 0.54
35 0.53
36 0.56
37 0.49
38 0.48
39 0.44
40 0.43
41 0.4
42 0.33
43 0.32
44 0.33
45 0.35
46 0.36
47 0.4
48 0.46
49 0.48
50 0.53
51 0.6
52 0.65
53 0.69
54 0.73
55 0.8
56 0.83
57 0.86
58 0.87
59 0.88
60 0.85
61 0.84
62 0.84
63 0.82
64 0.77
65 0.69
66 0.62
67 0.56
68 0.49
69 0.42
70 0.32
71 0.24
72 0.18
73 0.18
74 0.16
75 0.11
76 0.1
77 0.09
78 0.08
79 0.09
80 0.1
81 0.07
82 0.07
83 0.07
84 0.08
85 0.08
86 0.08
87 0.06
88 0.05
89 0.05
90 0.06
91 0.06
92 0.05
93 0.05
94 0.05
95 0.05
96 0.05
97 0.06
98 0.05
99 0.05
100 0.05
101 0.04
102 0.04
103 0.04
104 0.04
105 0.03
106 0.03
107 0.04
108 0.04
109 0.04
110 0.05
111 0.05
112 0.05
113 0.06
114 0.07
115 0.06
116 0.07
117 0.08
118 0.07
119 0.08
120 0.08
121 0.07
122 0.07
123 0.07
124 0.08
125 0.09
126 0.09
127 0.09
128 0.08
129 0.08
130 0.08
131 0.08
132 0.08
133 0.08
134 0.08
135 0.08
136 0.09
137 0.13
138 0.19
139 0.21
140 0.23
141 0.3
142 0.32
143 0.34
144 0.39
145 0.36
146 0.38
147 0.42
148 0.42
149 0.43
150 0.48
151 0.52
152 0.53
153 0.59
154 0.61
155 0.56
156 0.56
157 0.49
158 0.44
159 0.41
160 0.35
161 0.3
162 0.19
163 0.19
164 0.17
165 0.13
166 0.1
167 0.08
168 0.07
169 0.06
170 0.07
171 0.07
172 0.08
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.15
178 0.16
179 0.17
180 0.25
181 0.26
182 0.28
183 0.29
184 0.29
185 0.25
186 0.26
187 0.27
188 0.19
189 0.18
190 0.16
191 0.14
192 0.15
193 0.14
194 0.13
195 0.11
196 0.11
197 0.1
198 0.15
199 0.18
200 0.21
201 0.3
202 0.34
203 0.34
204 0.43
205 0.51
206 0.53
207 0.57
208 0.54
209 0.51
210 0.5
211 0.49
212 0.39
213 0.31
214 0.24
215 0.18
216 0.16
217 0.09
218 0.06
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.02
223 0.02
224 0.02
225 0.02
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.05
230 0.05
231 0.07
232 0.07
233 0.1
234 0.1
235 0.11
236 0.15
237 0.2
238 0.21
239 0.21
240 0.22
241 0.2
242 0.21
243 0.21
244 0.23
245 0.23
246 0.28
247 0.3
248 0.31
249 0.31
250 0.33
251 0.31
252 0.29
253 0.23
254 0.18
255 0.17
256 0.2
257 0.22
258 0.22
259 0.28
260 0.32
261 0.38
262 0.45
263 0.5
264 0.55
265 0.6
266 0.62
267 0.66
268 0.65
269 0.66
270 0.65
271 0.65
272 0.64
273 0.66
274 0.68
275 0.67
276 0.64
277 0.57
278 0.56
279 0.52
280 0.52
281 0.49
282 0.48
283 0.47
284 0.52
285 0.55
286 0.57
287 0.59
288 0.54
289 0.55
290 0.52
291 0.52
292 0.57
293 0.63
294 0.66
295 0.71
296 0.71
297 0.7
298 0.75
299 0.76
300 0.76
301 0.75
302 0.72
303 0.67
304 0.69
305 0.65
306 0.57
307 0.5
308 0.42
309 0.36
310 0.27
311 0.26
312 0.23
313 0.2
314 0.21
315 0.21
316 0.17
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.14
321 0.15
322 0.21
323 0.26
324 0.26
325 0.3
326 0.31
327 0.3
328 0.35
329 0.36
330 0.29
331 0.27
332 0.27
333 0.26
334 0.27
335 0.25
336 0.18
337 0.16
338 0.14
339 0.11
340 0.09
341 0.07
342 0.05
343 0.06
344 0.07
345 0.07
346 0.08
347 0.09
348 0.11
349 0.12
350 0.14
351 0.15
352 0.15
353 0.16
354 0.15
355 0.15
356 0.13
357 0.12
358 0.1
359 0.08
360 0.07
361 0.06
362 0.07
363 0.06
364 0.06
365 0.05
366 0.05
367 0.05
368 0.05
369 0.04
370 0.05
371 0.05
372 0.05
373 0.05
374 0.06
375 0.06
376 0.07
377 0.11
378 0.14
379 0.23
380 0.33
381 0.4
382 0.44
383 0.52
384 0.58
385 0.65
386 0.73
387 0.75
388 0.77
389 0.78
390 0.81
391 0.84
392 0.85
393 0.82
394 0.8
395 0.8
396 0.79
397 0.82