FuNGI

B0CNU3

Protein Details

Accession

B0CNU3

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

12.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
43-66	FDNSPLRAPKKRYSDKTRGTPSGS	Hydrophilic
1150-1175	DTPTPGTPSKKSKKAKSYRATADQDD	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto 5, pero 4, mito 2

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007855 RNA-dep_RNA_pol_euk-typ
Gene Ontology	GO:0003723 F:RNA binding GO:0003968 F:RNA-dependent RNA polymerase activity GO:0031047 P:RNA-mediated gene silencing
KEGG	lbc:LACBIDRAFT_301565 -
Pfam	View protein in Pfam PF05183 RdRP

Amino Acid Sequences

MSRSSTPMVTRTGSGDLDVDSDYFNDEDALFCSAVAGLSNESFDNSPLRAPKKRYSDKTRGTPSGSTPNVASSFHATRTPESNPFAKELFATAVKKAASSASATRRQNPIPITPSKTPAKYPVKQTPVDVSSTIRKELAKIDISDSSSPSPPAKRLFVKPLASKSDEKRKMIVVGDTDSDTEELFTDTDCSPINPSSNSSFAYPLSGSNSSFSFVSSQSSSSGPSSQEGKLDRHGANSSPQKARTPFTEGVPLKSTFFCKPNTQLTSDAPISTTPPLPVATTQSVTPATPIPESVTEFCKKSLSTKLDSYIIAHCSTTQSIFEDHNIAWGTQYELARGVTHCTWTWEQVREQVPNLTGPNTTAAYKVRAVMRGKAIPLKKQNFAVWAELDREQDAIKENLSRGLGLMGPWKGDPDWHGGQVQQLAQLVKVNGSLKVQLEPLEKRRSHRFARFYGSRRIIQLRIPDDMVTKDNATVKQFLSQKFILLGRIFVPFHSKDGGVYMVETDQNSGRIPKGSCGDQYRLSFDAFMRWHNPLEYNFKQAASKFVTRYALGLSNSIPALEFSVENIIFIRDIYAEDWHGEDHKAPAEKIMTDGCGFINLTAMKIIKKKFNYDSLPTGIQGRIAGAKGMWIRHPTDDSLEPKIWIRDSQNKIKLSELDKAHRIFDLLSVSKPSSSIALSQQSILNLSFNGIPDDVLVKLLEQGIVDEVMPLLDWKRPNAMTVLWDAINKSAGVSGSRTQRVAAGASRALGFQRQDWGHDDVVADQDAETQDISGTTYTGRNEYSKAPLALHEMTMELIQAGFHPSQCKILQDKIKFMVQQTINSSVEKYRIPIKESTGGYIVADPTGLLEEGQIYYRSSVPMTDPDTEMDYFVLQGEVVLGRYPIRLPSDMQKVTAVDIPELFNWPDVIIVSTKGKFSLASLLSGGDQDGDELLVIKDKLIVDSFKNQPLTVIPSGLMESDFEREVESVPDFCCRALSLEEAASHKAFQEVLLLNLNVSQVGLYSTFHENAIWKYGYSHPETVRLAYIFCILLDSSKTGHRLKSGIFEKDRKRYVGQEEPSGILHRLLKAGRTKGDELIQAFHDACKENLVKDKAILEPYNTASNYALVTFDTNKVVGQMFLDELTRIRKHVDDAHLEFGKSANHHTPDTPTPGTPSKKSKKAKSYRATADQDDKMLAAAQKYAEPLEGIILTRDLESVMASYAYAASKSPHFAFTVAFQQICTIKAKSCKGGIAPSTREFDEARKITASFLRALNRGTDDNYYGSY

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.24
2	0.22
3	0.18
4	0.17
5	0.17
6	0.14
7	0.11
8	0.1
9	0.11
10	0.1
11	0.1
12	0.09
13	0.09
14	0.09
15	0.1
16	0.13
17	0.11
18	0.11
19	0.11
20	0.1
21	0.1
22	0.1
23	0.1
24	0.08
25	0.09
26	0.11
27	0.1
28	0.12
29	0.12
30	0.13
31	0.15
32	0.14
33	0.18
34	0.25
35	0.33
36	0.39
37	0.46
38	0.54
39	0.62
40	0.72
41	0.77
42	0.8
43	0.83
44	0.85
45	0.88
46	0.89
47	0.84
48	0.78
49	0.71
50	0.67
51	0.66
52	0.58
53	0.49
54	0.4
55	0.39
56	0.36
57	0.33
58	0.29
59	0.25
60	0.26
61	0.27
62	0.3
63	0.27
64	0.29
65	0.33
66	0.36
67	0.36
68	0.38
69	0.41
70	0.39
71	0.4
72	0.37
73	0.33
74	0.29
75	0.24
76	0.24
77	0.24
78	0.24
79	0.21
80	0.25
81	0.24
82	0.24
83	0.22
84	0.2
85	0.16
86	0.18
87	0.25
88	0.29
89	0.38
90	0.41
91	0.47
92	0.52
93	0.52
94	0.55
95	0.51
96	0.51
97	0.49
98	0.53
99	0.54
100	0.51
101	0.56
102	0.57
103	0.55
104	0.51
105	0.54
106	0.57
107	0.56
108	0.61
109	0.65
110	0.65
111	0.64
112	0.63
113	0.61
114	0.54
115	0.5
116	0.42
117	0.36
118	0.38
119	0.38
120	0.37
121	0.31
122	0.29
123	0.28
124	0.31
125	0.34
126	0.3
127	0.29
128	0.31
129	0.32
130	0.36
131	0.35
132	0.33
133	0.29
134	0.27
135	0.27
136	0.28
137	0.28
138	0.29
139	0.33
140	0.38
141	0.41
142	0.46
143	0.53
144	0.57
145	0.6
146	0.62
147	0.64
148	0.64
149	0.62
150	0.62
151	0.61
152	0.64
153	0.64
154	0.6
155	0.56
156	0.52
157	0.52
158	0.48
159	0.44
160	0.37
161	0.31
162	0.31
163	0.29
164	0.26
165	0.22
166	0.19
167	0.15
168	0.12
169	0.09
170	0.08
171	0.08
172	0.07
173	0.1
174	0.09
175	0.11
176	0.11
177	0.11
178	0.14
179	0.16
180	0.19
181	0.17
182	0.2
183	0.22
184	0.25
185	0.25
186	0.23
187	0.23
188	0.2
189	0.22
190	0.19
191	0.16
192	0.19
193	0.2
194	0.19
195	0.19
196	0.19
197	0.17
198	0.17
199	0.16
200	0.13
201	0.11
202	0.15
203	0.14
204	0.15
205	0.15
206	0.16
207	0.17
208	0.17
209	0.19
210	0.16
211	0.18
212	0.21
213	0.2
214	0.24
215	0.25
216	0.27
217	0.29
218	0.34
219	0.32
220	0.32
221	0.33
222	0.3
223	0.36
224	0.41
225	0.43
226	0.42
227	0.44
228	0.46
229	0.48
230	0.48
231	0.44
232	0.44
233	0.39
234	0.36
235	0.44
236	0.39
237	0.4
238	0.41
239	0.38
240	0.32
241	0.32
242	0.33
243	0.27
244	0.3
245	0.29
246	0.3
247	0.35
248	0.42
249	0.44
250	0.43
251	0.42
252	0.41
253	0.44
254	0.4
255	0.34
256	0.26
257	0.23
258	0.22
259	0.2
260	0.19
261	0.13
262	0.13
263	0.14
264	0.14
265	0.15
266	0.18
267	0.19
268	0.18
269	0.18
270	0.19
271	0.2
272	0.19
273	0.19
274	0.16
275	0.15
276	0.14
277	0.14
278	0.14
279	0.15
280	0.18
281	0.19
282	0.22
283	0.23
284	0.24
285	0.24
286	0.24
287	0.22
288	0.24
289	0.31
290	0.31
291	0.33
292	0.36
293	0.38
294	0.38
295	0.38
296	0.36
297	0.31
298	0.28
299	0.23
300	0.2
301	0.17
302	0.16
303	0.17
304	0.16
305	0.13
306	0.12
307	0.13
308	0.14
309	0.15
310	0.16
311	0.14
312	0.18
313	0.17
314	0.16
315	0.14
316	0.13
317	0.14
318	0.16
319	0.16
320	0.12
321	0.13
322	0.14
323	0.15
324	0.15
325	0.17
326	0.13
327	0.16
328	0.15
329	0.19
330	0.2
331	0.23
332	0.28
333	0.27
334	0.27
335	0.32
336	0.36
337	0.33
338	0.34
339	0.32
340	0.28
341	0.27
342	0.27
343	0.21
344	0.17
345	0.16
346	0.17
347	0.15
348	0.15
349	0.14
350	0.14
351	0.16
352	0.17
353	0.19
354	0.19
355	0.25
356	0.26
357	0.29
358	0.33
359	0.32
360	0.33
361	0.37
362	0.37
363	0.39
364	0.47
365	0.47
366	0.44
367	0.45
368	0.45
369	0.42
370	0.41
371	0.36
372	0.28
373	0.25
374	0.25
375	0.23
376	0.22
377	0.18
378	0.17
379	0.14
380	0.13
381	0.14
382	0.12
383	0.11
384	0.13
385	0.13
386	0.15
387	0.16
388	0.14
389	0.12
390	0.12
391	0.11
392	0.1
393	0.14
394	0.11
395	0.11
396	0.11
397	0.12
398	0.11
399	0.11
400	0.12
401	0.15
402	0.17
403	0.18
404	0.18
405	0.18
406	0.19
407	0.21
408	0.2
409	0.14
410	0.14
411	0.13
412	0.13
413	0.15
414	0.13
415	0.11
416	0.13
417	0.13
418	0.12
419	0.12
420	0.14
421	0.13
422	0.14
423	0.14
424	0.15
425	0.19
426	0.22
427	0.28
428	0.35
429	0.36
430	0.39
431	0.47
432	0.51
433	0.54
434	0.59
435	0.59
436	0.54
437	0.61
438	0.65
439	0.61
440	0.63
441	0.6
442	0.53
443	0.5
444	0.49
445	0.42
446	0.37
447	0.4
448	0.32
449	0.3
450	0.29
451	0.26
452	0.23
453	0.23
454	0.21
455	0.16
456	0.13
457	0.14
458	0.16
459	0.18
460	0.18
461	0.19
462	0.18
463	0.23
464	0.27
465	0.26
466	0.28
467	0.27
468	0.25
469	0.25
470	0.25
471	0.22
472	0.18
473	0.17
474	0.13
475	0.16
476	0.15
477	0.13
478	0.17
479	0.14
480	0.16
481	0.16
482	0.15
483	0.12
484	0.14
485	0.15
486	0.09
487	0.09
488	0.08
489	0.07
490	0.08
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.08
495	0.09
496	0.09
497	0.09
498	0.13
499	0.13
500	0.15
501	0.17
502	0.18
503	0.22
504	0.25
505	0.27
506	0.28
507	0.29
508	0.29
509	0.28
510	0.26
511	0.23
512	0.19
513	0.21
514	0.17
515	0.18
516	0.17
517	0.17
518	0.18
519	0.18
520	0.2
521	0.17
522	0.25
523	0.25
524	0.27
525	0.26
526	0.26
527	0.27
528	0.25
529	0.27
530	0.24
531	0.26
532	0.21
533	0.24
534	0.25
535	0.23
536	0.24
537	0.2
538	0.19
539	0.16
540	0.16
541	0.13
542	0.13
543	0.12
544	0.12
545	0.1
546	0.06
547	0.07
548	0.06
549	0.06
550	0.05
551	0.08
552	0.08
553	0.08
554	0.08
555	0.08
556	0.07
557	0.07
558	0.07
559	0.04
560	0.05
561	0.06
562	0.06
563	0.06
564	0.07
565	0.07
566	0.07
567	0.08
568	0.08
569	0.07
570	0.08
571	0.1
572	0.11
573	0.11
574	0.12
575	0.12
576	0.12
577	0.13
578	0.12
579	0.1
580	0.09
581	0.1
582	0.08
583	0.08
584	0.08
585	0.06
586	0.08
587	0.07
588	0.07
589	0.08
590	0.08
591	0.1
592	0.14
593	0.16
594	0.19
595	0.21
596	0.26
597	0.28
598	0.35
599	0.38
600	0.37
601	0.39
602	0.36
603	0.35
604	0.3
605	0.28
606	0.21
607	0.17
608	0.13
609	0.1
610	0.08
611	0.07
612	0.07
613	0.05
614	0.08
615	0.09
616	0.1
617	0.11
618	0.12
619	0.13
620	0.14
621	0.16
622	0.13
623	0.15
624	0.18
625	0.19
626	0.21
627	0.2
628	0.19
629	0.19
630	0.2
631	0.17
632	0.16
633	0.18
634	0.23
635	0.28
636	0.37
637	0.42
638	0.43
639	0.44
640	0.43
641	0.43
642	0.36
643	0.38
644	0.32
645	0.29
646	0.31
647	0.31
648	0.3
649	0.26
650	0.23
651	0.17
652	0.15
653	0.16
654	0.12
655	0.12
656	0.13
657	0.13
658	0.13
659	0.13
660	0.11
661	0.08
662	0.08
663	0.09
664	0.11
665	0.13
666	0.14
667	0.15
668	0.15
669	0.14
670	0.15
671	0.13
672	0.1
673	0.07
674	0.08
675	0.07
676	0.07
677	0.08
678	0.07
679	0.07
680	0.06
681	0.07
682	0.06
683	0.06
684	0.06
685	0.05
686	0.06
687	0.06
688	0.06
689	0.05
690	0.05
691	0.05
692	0.05
693	0.05
694	0.04
695	0.04
696	0.03
697	0.03
698	0.04
699	0.04
700	0.07
701	0.08
702	0.08
703	0.12
704	0.13
705	0.14
706	0.15
707	0.15
708	0.13
709	0.14
710	0.15
711	0.12
712	0.12
713	0.12
714	0.11
715	0.11
716	0.09
717	0.07
718	0.07
719	0.06
720	0.07
721	0.09
722	0.12
723	0.17
724	0.19
725	0.19
726	0.18
727	0.19
728	0.19
729	0.19
730	0.16
731	0.13
732	0.12
733	0.12
734	0.12
735	0.11
736	0.11
737	0.11
738	0.1
739	0.09
740	0.15
741	0.14
742	0.16
743	0.19
744	0.22
745	0.2
746	0.2
747	0.2
748	0.14
749	0.15
750	0.13
751	0.1
752	0.06
753	0.08
754	0.07
755	0.07
756	0.06
757	0.05
758	0.05
759	0.05
760	0.06
761	0.04
762	0.05
763	0.05
764	0.07
765	0.08
766	0.09
767	0.11
768	0.11
769	0.13
770	0.15
771	0.18
772	0.2
773	0.2
774	0.19
775	0.19
776	0.22
777	0.21
778	0.19
779	0.15
780	0.12
781	0.11
782	0.11
783	0.1
784	0.05
785	0.04
786	0.04
787	0.04
788	0.07
789	0.07
790	0.08
791	0.09
792	0.1
793	0.14
794	0.15
795	0.18
796	0.19
797	0.25
798	0.33
799	0.33
800	0.37
801	0.35
802	0.38
803	0.35
804	0.33
805	0.35
806	0.28
807	0.29
808	0.28
809	0.31
810	0.29
811	0.28
812	0.28
813	0.21
814	0.22
815	0.19
816	0.17
817	0.2
818	0.21
819	0.24
820	0.26
821	0.28
822	0.33
823	0.34
824	0.34
825	0.27
826	0.25
827	0.22
828	0.2
829	0.17
830	0.09
831	0.09
832	0.06
833	0.05
834	0.05
835	0.05
836	0.04
837	0.04
838	0.05
839	0.05
840	0.07
841	0.07
842	0.07
843	0.08
844	0.09
845	0.1
846	0.09
847	0.1
848	0.1
849	0.14
850	0.17
851	0.18
852	0.18
853	0.18
854	0.21
855	0.2
856	0.19
857	0.14
858	0.11
859	0.09
860	0.09
861	0.08
862	0.04
863	0.04
864	0.04
865	0.04
866	0.05
867	0.05
868	0.05
869	0.05
870	0.06
871	0.07
872	0.09
873	0.12
874	0.13
875	0.14
876	0.21
877	0.3
878	0.3
879	0.31
880	0.3
881	0.27
882	0.28
883	0.28
884	0.22
885	0.13
886	0.14
887	0.14
888	0.13
889	0.15
890	0.13
891	0.11
892	0.1
893	0.09
894	0.09
895	0.08
896	0.08
897	0.07
898	0.09
899	0.12
900	0.12
901	0.13
902	0.13
903	0.13
904	0.12
905	0.12
906	0.18
907	0.16
908	0.16
909	0.16
910	0.16
911	0.16
912	0.16
913	0.15
914	0.07
915	0.06
916	0.05
917	0.05
918	0.04
919	0.04
920	0.05
921	0.05
922	0.07
923	0.07
924	0.07
925	0.09
926	0.1
927	0.11
928	0.12
929	0.14
930	0.14
931	0.21
932	0.25
933	0.28
934	0.29
935	0.27
936	0.26
937	0.26
938	0.3
939	0.24
940	0.21
941	0.16
942	0.15
943	0.16
944	0.15
945	0.14
946	0.08
947	0.08
948	0.09
949	0.1
950	0.09
951	0.09
952	0.09
953	0.1
954	0.11
955	0.11
956	0.11
957	0.11
958	0.14
959	0.13
960	0.13
961	0.13
962	0.11
963	0.13
964	0.13
965	0.14
966	0.14
967	0.15
968	0.17
969	0.18
970	0.2
971	0.18
972	0.17
973	0.15
974	0.14
975	0.12
976	0.1
977	0.14
978	0.12
979	0.14
980	0.17
981	0.16
982	0.15
983	0.16
984	0.16
985	0.1
986	0.09
987	0.07
988	0.04
989	0.06
990	0.06
991	0.06
992	0.09
993	0.12
994	0.13
995	0.13
996	0.14
997	0.15
998	0.16
999	0.21
1000	0.18
1001	0.15
1002	0.18
1003	0.23
1004	0.27
1005	0.3
1006	0.34
1007	0.3
1008	0.36
1009	0.37
1010	0.36
1011	0.33
1012	0.29
1013	0.24
1014	0.19
1015	0.2
1016	0.14
1017	0.12
1018	0.12
1019	0.09
1020	0.1
1021	0.11
1022	0.11
1023	0.11
1024	0.14
1025	0.19
1026	0.21
1027	0.23
1028	0.24
1029	0.26
1030	0.26
1031	0.34
1032	0.37
1033	0.41
1034	0.45
1035	0.52
1036	0.57
1037	0.64
1038	0.67
1039	0.61
1040	0.58
1041	0.56
1042	0.58
1043	0.59
1044	0.55
1045	0.52
1046	0.49
1047	0.47
1048	0.45
1049	0.41
1050	0.33
1051	0.25
1052	0.24
1053	0.19
1054	0.21
1055	0.2
1056	0.24
1057	0.29
1058	0.34
1059	0.36
1060	0.39
1061	0.4
1062	0.4
1063	0.43
1064	0.41
1065	0.36
1066	0.33
1067	0.3
1068	0.26
1069	0.24
1070	0.21
1071	0.2
1072	0.18
1073	0.16
1074	0.2
1075	0.2
1076	0.21
1077	0.29
1078	0.32
1079	0.3
1080	0.31
1081	0.33
1082	0.3
1083	0.35
1084	0.33
1085	0.27
1086	0.27
1087	0.29
1088	0.33
1089	0.3
1090	0.28
1091	0.22
1092	0.22
1093	0.2
1094	0.17
1095	0.15
1096	0.09
1097	0.12
1098	0.13
1099	0.14
1100	0.15
1101	0.15
1102	0.14
1103	0.15
1104	0.16
1105	0.13
1106	0.12
1107	0.11
1108	0.1
1109	0.11
1110	0.11
1111	0.1
1112	0.11
1113	0.18
1114	0.18
1115	0.17
1116	0.19
1117	0.2
1118	0.24
1119	0.32
1120	0.37
1121	0.39
1122	0.42
1123	0.49
1124	0.48
1125	0.46
1126	0.42
1127	0.35
1128	0.31
1129	0.24
1130	0.26
1131	0.25
1132	0.27
1133	0.29
1134	0.3
1135	0.35
1136	0.37
1137	0.42
1138	0.39
1139	0.33
1140	0.35
1141	0.42
1142	0.46
1143	0.47
1144	0.53
1145	0.56
1146	0.63
1147	0.72
1148	0.76
1149	0.79
1150	0.84
1151	0.89
1152	0.87
1153	0.88
1154	0.87
1155	0.87
1156	0.83
1157	0.78
1158	0.76
1159	0.67
1160	0.59
1161	0.49
1162	0.4
1163	0.31
1164	0.28
1165	0.23
1166	0.16
1167	0.15
1168	0.15
1169	0.16
1170	0.17
1171	0.17
1172	0.15
1173	0.13
1174	0.13
1175	0.13
1176	0.13
1177	0.12
1178	0.11
1179	0.11
1180	0.11
1181	0.11
1182	0.11
1183	0.09
1184	0.08
1185	0.08
1186	0.07
1187	0.08
1188	0.07
1189	0.07
1190	0.07
1191	0.08
1192	0.09
1193	0.09
1194	0.09
1195	0.11
1196	0.13
1197	0.18
1198	0.2
1199	0.2
1200	0.21
1201	0.21
1202	0.22
1203	0.23
1204	0.29
1205	0.27
1206	0.25
1207	0.23
1208	0.26
1209	0.26
1210	0.27
1211	0.27
1212	0.21
1213	0.24
1214	0.32
1215	0.38
1216	0.4
1217	0.41
1218	0.44
1219	0.44
1220	0.5
1221	0.51
1222	0.51
1223	0.52
1224	0.5
1225	0.51
1226	0.47
1227	0.46
1228	0.4
1229	0.37
1230	0.39
1231	0.35
1232	0.34
1233	0.32
1234	0.32
1235	0.33
1236	0.36
1237	0.35
1238	0.28
1239	0.31
1240	0.34
1241	0.34
1242	0.35
1243	0.35
1244	0.35
1245	0.34
1246	0.33
1247	0.32
1248	0.29

B0CNU3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer