FuNGI

M3D538

Protein Details

Accession

M3D538

Localization Confidence

Low

Confidence Score

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
698-720	VRGGRNKIQKRVEQQREKTKEIQ	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Subcellular Location(s)

nucl 11, cyto_nucl 9.5, mito 6, cyto 6, pero 4

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR037700 NUP88/NUP82
Gene Ontology	GO:0005643 C:nuclear pore GO:0017056 F:structural constituent of nuclear pore GO:0051028 P:mRNA transport GO:0015031 P:protein transport GO:0000055 P:ribosomal large subunit export from nucleus GO:0000056 P:ribosomal small subunit export from nucleus

Amino Acid Sequences

MPRVLHRAPRWLDYGTPGFHFFQESSDRQASDAPAHDTASRRIAHRDNEVFYAVGKELRWSTIDILKEANEGGPPPYKVLVTPVPADRPIQQISISRDGSFVAVLTTHTCHVCILPPSESLDFSGQQSLKLKYFTVGETAHVRENSPLVSAIWHPLSPSGTGLVTITKDACVRLWELDQDNRISFSQPTVAVDLKKLANATSAKDDLGASKYGANKGYSADDVDMLVAGACFGGQGLEEEDGWSSMTLWVAMTEGDVYALCPFLPTDFWAPATLLPSLTTSVVAKATFLAYDGDASDAEKRISRQQEAWLQELDEQDPVCPPGHYDFEVYSRPKKLSPIAKLQGPFQLSPEPLDGEITDIHVIAPKVNQEDLFEDEDFEDLAVGEGLSIGIVCLATSTNQVHVCLNVEGVEAEWLPAKRPRTFQIEEAISHNLLLFETIDLATKGGSAATYPTFTTSPADRYELFTTQPSGIYSLSFRPWIAILKDELAASGGSHGIGFRVDVILKSSTTLVEDITGDVNEPLEYANAAIVVLDDADAEYIALTSVASRPLAAVLDKPSSATHGFEPDNPFQSNPLLTPEARTPYIPSPVFFKASRLPAQIEEWRRASATGVDQGNIKGAVNFSPYTLQKITAAHQIVANETHDLNTAAADLFRRMERMLNEMKAQIDRVRDLSNRVNSVTGEDEFPQSHRPGDPELVRGGRNKIQKRVEQQREKTKEIQDRVERLRNKMRNVGGKEMSLKEKQFAEEVDRIQQTLLGKQQSNPTGPTGILDMENSSLTARTEEDEEQKSLEARFEDVQRVVKQLQAQAEQIQSEREKRDEEAAVADSRPTSRATSITQGADYRQRKMDHVWALLDRESALVDAVSARLEGLQMGTREAML

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.43
2	0.36
3	0.35
4	0.34
5	0.31
6	0.3
7	0.31
8	0.24
9	0.23
10	0.28
11	0.28
12	0.32
13	0.34
14	0.34
15	0.32
16	0.35
17	0.33
18	0.3
19	0.32
20	0.29
21	0.27
22	0.28
23	0.31
24	0.3
25	0.32
26	0.33
27	0.32
28	0.3
29	0.36
30	0.41
31	0.44
32	0.5
33	0.53
34	0.49
35	0.49
36	0.48
37	0.41
38	0.35
39	0.32
40	0.23
41	0.19
42	0.16
43	0.17
44	0.17
45	0.19
46	0.2
47	0.19
48	0.22
49	0.24
50	0.26
51	0.24
52	0.24
53	0.23
54	0.23
55	0.21
56	0.18
57	0.14
58	0.13
59	0.15
60	0.19
61	0.19
62	0.2
63	0.21
64	0.21
65	0.2
66	0.25
67	0.27
68	0.25
69	0.28
70	0.3
71	0.32
72	0.33
73	0.35
74	0.32
75	0.32
76	0.31
77	0.28
78	0.27
79	0.29
80	0.34
81	0.4
82	0.39
83	0.33
84	0.31
85	0.3
86	0.28
87	0.22
88	0.16
89	0.08
90	0.07
91	0.08
92	0.1
93	0.11
94	0.12
95	0.12
96	0.13
97	0.13
98	0.13
99	0.17
100	0.19
101	0.21
102	0.21
103	0.22
104	0.26
105	0.26
106	0.26
107	0.24
108	0.23
109	0.21
110	0.2
111	0.26
112	0.22
113	0.24
114	0.29
115	0.29
116	0.29
117	0.29
118	0.28
119	0.23
120	0.25
121	0.22
122	0.23
123	0.2
124	0.2
125	0.24
126	0.25
127	0.28
128	0.26
129	0.26
130	0.22
131	0.23
132	0.21
133	0.17
134	0.16
135	0.11
136	0.13
137	0.13
138	0.16
139	0.16
140	0.16
141	0.15
142	0.16
143	0.17
144	0.16
145	0.16
146	0.13
147	0.11
148	0.11
149	0.11
150	0.11
151	0.11
152	0.11
153	0.11
154	0.11
155	0.12
156	0.12
157	0.12
158	0.12
159	0.13
160	0.15
161	0.16
162	0.19
163	0.22
164	0.26
165	0.28
166	0.29
167	0.28
168	0.28
169	0.27
170	0.24
171	0.2
172	0.17
173	0.18
174	0.16
175	0.17
176	0.18
177	0.2
178	0.19
179	0.19
180	0.22
181	0.18
182	0.19
183	0.18
184	0.15
185	0.18
186	0.19
187	0.21
188	0.22
189	0.22
190	0.21
191	0.21
192	0.21
193	0.18
194	0.19
195	0.17
196	0.12
197	0.15
198	0.18
199	0.2
200	0.22
201	0.21
202	0.19
203	0.2
204	0.21
205	0.19
206	0.17
207	0.15
208	0.13
209	0.12
210	0.11
211	0.09
212	0.07
213	0.06
214	0.04
215	0.04
216	0.03
217	0.03
218	0.02
219	0.02
220	0.02
221	0.02
222	0.03
223	0.05
224	0.06
225	0.06
226	0.07
227	0.07
228	0.07
229	0.07
230	0.07
231	0.06
232	0.06
233	0.06
234	0.06
235	0.06
236	0.06
237	0.05
238	0.05
239	0.05
240	0.04
241	0.04
242	0.04
243	0.04
244	0.05
245	0.05
246	0.05
247	0.04
248	0.04
249	0.05
250	0.05
251	0.06
252	0.08
253	0.1
254	0.11
255	0.12
256	0.13
257	0.13
258	0.14
259	0.15
260	0.13
261	0.1
262	0.1
263	0.1
264	0.1
265	0.1
266	0.1
267	0.08
268	0.09
269	0.1
270	0.09
271	0.09
272	0.08
273	0.08
274	0.07
275	0.08
276	0.07
277	0.06
278	0.07
279	0.07
280	0.07
281	0.07
282	0.07
283	0.08
284	0.09
285	0.09
286	0.1
287	0.12
288	0.19
289	0.23
290	0.25
291	0.25
292	0.31
293	0.37
294	0.39
295	0.39
296	0.32
297	0.29
298	0.29
299	0.27
300	0.22
301	0.16
302	0.13
303	0.11
304	0.11
305	0.12
306	0.1
307	0.09
308	0.09
309	0.11
310	0.13
311	0.14
312	0.15
313	0.14
314	0.17
315	0.22
316	0.24
317	0.25
318	0.26
319	0.26
320	0.26
321	0.28
322	0.32
323	0.35
324	0.38
325	0.44
326	0.44
327	0.47
328	0.47
329	0.45
330	0.42
331	0.36
332	0.31
333	0.23
334	0.23
335	0.19
336	0.2
337	0.19
338	0.15
339	0.13
340	0.13
341	0.11
342	0.09
343	0.09
344	0.08
345	0.07
346	0.06
347	0.06
348	0.08
349	0.08
350	0.08
351	0.08
352	0.09
353	0.1
354	0.11
355	0.11
356	0.1
357	0.12
358	0.14
359	0.16
360	0.14
361	0.13
362	0.13
363	0.13
364	0.12
365	0.1
366	0.07
367	0.04
368	0.04
369	0.03
370	0.03
371	0.02
372	0.02
373	0.02
374	0.02
375	0.02
376	0.02
377	0.02
378	0.02
379	0.02
380	0.02
381	0.03
382	0.03
383	0.05
384	0.06
385	0.09
386	0.1
387	0.11
388	0.11
389	0.11
390	0.12
391	0.1
392	0.1
393	0.07
394	0.07
395	0.06
396	0.06
397	0.06
398	0.04
399	0.04
400	0.07
401	0.06
402	0.08
403	0.11
404	0.14
405	0.17
406	0.2
407	0.23
408	0.29
409	0.31
410	0.31
411	0.35
412	0.33
413	0.31
414	0.31
415	0.28
416	0.2
417	0.18
418	0.16
419	0.1
420	0.08
421	0.07
422	0.05
423	0.03
424	0.04
425	0.04
426	0.04
427	0.04
428	0.05
429	0.04
430	0.04
431	0.04
432	0.03
433	0.03
434	0.03
435	0.04
436	0.05
437	0.06
438	0.06
439	0.08
440	0.08
441	0.08
442	0.1
443	0.1
444	0.12
445	0.13
446	0.15
447	0.14
448	0.17
449	0.19
450	0.18
451	0.18
452	0.16
453	0.16
454	0.15
455	0.15
456	0.12
457	0.1
458	0.1
459	0.09
460	0.1
461	0.1
462	0.1
463	0.1
464	0.1
465	0.09
466	0.1
467	0.12
468	0.11
469	0.11
470	0.11
471	0.11
472	0.12
473	0.11
474	0.11
475	0.09
476	0.08
477	0.06
478	0.06
479	0.05
480	0.04
481	0.04
482	0.04
483	0.04
484	0.04
485	0.04
486	0.03
487	0.04
488	0.04
489	0.05
490	0.07
491	0.08
492	0.08
493	0.08
494	0.09
495	0.08
496	0.09
497	0.09
498	0.07
499	0.06
500	0.07
501	0.07
502	0.07
503	0.07
504	0.06
505	0.06
506	0.06
507	0.05
508	0.05
509	0.04
510	0.04
511	0.04
512	0.04
513	0.04
514	0.03
515	0.03
516	0.03
517	0.03
518	0.03
519	0.03
520	0.03
521	0.03
522	0.02
523	0.03
524	0.03
525	0.02
526	0.02
527	0.02
528	0.02
529	0.03
530	0.02
531	0.03
532	0.04
533	0.05
534	0.05
535	0.05
536	0.05
537	0.06
538	0.07
539	0.07
540	0.08
541	0.1
542	0.12
543	0.11
544	0.12
545	0.12
546	0.14
547	0.15
548	0.14
549	0.12
550	0.16
551	0.17
552	0.2
553	0.25
554	0.25
555	0.28
556	0.27
557	0.26
558	0.22
559	0.23
560	0.2
561	0.15
562	0.16
563	0.15
564	0.14
565	0.16
566	0.18
567	0.2
568	0.21
569	0.2
570	0.2
571	0.21
572	0.28
573	0.26
574	0.24
575	0.25
576	0.27
577	0.3
578	0.26
579	0.26
580	0.24
581	0.29
582	0.32
583	0.3
584	0.29
585	0.28
586	0.32
587	0.36
588	0.34
589	0.33
590	0.31
591	0.3
592	0.28
593	0.27
594	0.23
595	0.19
596	0.18
597	0.2
598	0.19
599	0.19
600	0.19
601	0.19
602	0.19
603	0.17
604	0.14
605	0.08
606	0.09
607	0.09
608	0.11
609	0.11
610	0.11
611	0.15
612	0.15
613	0.2
614	0.2
615	0.2
616	0.19
617	0.2
618	0.22
619	0.24
620	0.25
621	0.21
622	0.22
623	0.21
624	0.2
625	0.2
626	0.19
627	0.13
628	0.12
629	0.11
630	0.11
631	0.11
632	0.1
633	0.08
634	0.08
635	0.07
636	0.07
637	0.08
638	0.08
639	0.09
640	0.09
641	0.1
642	0.1
643	0.14
644	0.15
645	0.2
646	0.25
647	0.25
648	0.27
649	0.27
650	0.28
651	0.25
652	0.26
653	0.23
654	0.2
655	0.2
656	0.21
657	0.24
658	0.23
659	0.28
660	0.34
661	0.36
662	0.35
663	0.34
664	0.33
665	0.29
666	0.3
667	0.28
668	0.21
669	0.17
670	0.16
671	0.17
672	0.16
673	0.18
674	0.2
675	0.18
676	0.19
677	0.18
678	0.19
679	0.21
680	0.27
681	0.28
682	0.26
683	0.3
684	0.3
685	0.31
686	0.32
687	0.33
688	0.33
689	0.4
690	0.43
691	0.48
692	0.53
693	0.58
694	0.65
695	0.71
696	0.76
697	0.77
698	0.8
699	0.83
700	0.82
701	0.8
702	0.77
703	0.75
704	0.73
705	0.68
706	0.69
707	0.65
708	0.66
709	0.69
710	0.7
711	0.66
712	0.64
713	0.69
714	0.66
715	0.63
716	0.63
717	0.63
718	0.63
719	0.64
720	0.65
721	0.56
722	0.53
723	0.52
724	0.48
725	0.47
726	0.42
727	0.38
728	0.34
729	0.33
730	0.32
731	0.29
732	0.27
733	0.28
734	0.28
735	0.29
736	0.33
737	0.31
738	0.3
739	0.28
740	0.28
741	0.23
742	0.23
743	0.27
744	0.26
745	0.26
746	0.29
747	0.37
748	0.39
749	0.41
750	0.38
751	0.35
752	0.31
753	0.29
754	0.27
755	0.21
756	0.17
757	0.15
758	0.13
759	0.12
760	0.11
761	0.11
762	0.11
763	0.1
764	0.09
765	0.09
766	0.1
767	0.1
768	0.1
769	0.14
770	0.17
771	0.23
772	0.26
773	0.26
774	0.26
775	0.26
776	0.27
777	0.24
778	0.24
779	0.18
780	0.18
781	0.21
782	0.23
783	0.26
784	0.28
785	0.33
786	0.32
787	0.35
788	0.33
789	0.32
790	0.33
791	0.33
792	0.36
793	0.33
794	0.33
795	0.33
796	0.34
797	0.33
798	0.29
799	0.3
800	0.28
801	0.31
802	0.33
803	0.32
804	0.32
805	0.33
806	0.39
807	0.36
808	0.33
809	0.3
810	0.3
811	0.29
812	0.26
813	0.25
814	0.2
815	0.19
816	0.19
817	0.17
818	0.17
819	0.17
820	0.2
821	0.23
822	0.29
823	0.33
824	0.33
825	0.34
826	0.33
827	0.35
828	0.41
829	0.4
830	0.39
831	0.41
832	0.41
833	0.41
834	0.46
835	0.51
836	0.48
837	0.48
838	0.48
839	0.44
840	0.45
841	0.43
842	0.38
843	0.29
844	0.22
845	0.19
846	0.14
847	0.11
848	0.08
849	0.07
850	0.07
851	0.07
852	0.07
853	0.07
854	0.07
855	0.06
856	0.07
857	0.07
858	0.08
859	0.12
860	0.13
861	0.14

M3D538

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer