Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D5E2

Protein Details
Accession B0D5E2    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
263-393SDDDRRSQKKRKHQSDDEDDKRKKRKRKKHVISSNDDESSASDSGSRKKHRRKRAKDDSDSDDCDSDEEVKKKKKKNKKRRDSSSEDDSSDDDHKKKKKKKKVKQESSDEESDRPRKRGKSSKRSSSPAAABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
270-292QKKRKHQSDDEDDKRKKRKRKKH
308-318SRKKHRRKRAK
333-343KKKKKKNKKRR
356-386HKKKKKKKKVKQESSDEESDRPRKRGKSSKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 14.5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007832  RNA_pol_Rpc34  
IPR016049  RNA_pol_Rpc34-like  
IPR036388  WH-like_DNA-bd_sf  
IPR036390  WH_DNA-bd_sf  
Gene Ontology GO:0005666  C:RNA polymerase III complex  
GO:0006383  P:transcription by RNA polymerase III  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_317855  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF05158  RNA_pol_Rpc34  
Amino Acid Sequences MSKRPPNELESRLHQAALSSSKKEITAKQAESIISDPSARQDALNFLLGVGLFKSLKDPKGHILFRAVTKNELVATKDLTGEENLVLSHIKIAATEGIWTKHLKAKTNLHQTVIDRCLKTLVQKRLIKRVPSVQHPTRKIYMLEGLEPSIALTGGPWYTDNELDTEFIQNLTEACFKFISDLSFPKRKEGAPGALYPISNAPQYPTAQHIRNSLRKAQLTETDLTVEHVEMLLNVLVLDGKIEKLPAFGSALWDSSAIGDEDSDDDRRSQKKRKHQSDDEDDKRKKRKRKKHVISSNDDESSASDSGSRKKHRRKRAKDDSDSDDCDSDEEVKKKKKKNKKRRDSSSEDDSSDDDHKKKKKKKKVKQESSDEESDRPRKRGKSSKRSSSPAAAFDEYDTSSGGTVYRAIKAETIFLGWSETPCALCPSFEFCKDGGPVNPRECVYYGDWLTGGTVAGVEDMI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.35
3 0.35
4 0.36
5 0.34
6 0.28
7 0.29
8 0.3
9 0.33
10 0.36
11 0.36
12 0.37
13 0.42
14 0.42
15 0.44
16 0.46
17 0.44
18 0.42
19 0.38
20 0.31
21 0.22
22 0.21
23 0.17
24 0.17
25 0.2
26 0.18
27 0.17
28 0.16
29 0.19
30 0.21
31 0.23
32 0.19
33 0.16
34 0.17
35 0.16
36 0.15
37 0.11
38 0.11
39 0.09
40 0.09
41 0.15
42 0.19
43 0.24
44 0.27
45 0.3
46 0.36
47 0.46
48 0.48
49 0.43
50 0.45
51 0.45
52 0.47
53 0.52
54 0.44
55 0.37
56 0.36
57 0.35
58 0.31
59 0.28
60 0.25
61 0.19
62 0.2
63 0.19
64 0.19
65 0.18
66 0.17
67 0.16
68 0.15
69 0.13
70 0.11
71 0.1
72 0.09
73 0.09
74 0.08
75 0.08
76 0.08
77 0.08
78 0.07
79 0.09
80 0.09
81 0.09
82 0.12
83 0.13
84 0.13
85 0.15
86 0.16
87 0.18
88 0.22
89 0.26
90 0.29
91 0.35
92 0.43
93 0.51
94 0.61
95 0.61
96 0.58
97 0.59
98 0.54
99 0.54
100 0.51
101 0.47
102 0.36
103 0.34
104 0.34
105 0.3
106 0.37
107 0.38
108 0.41
109 0.44
110 0.5
111 0.54
112 0.62
113 0.67
114 0.62
115 0.58
116 0.58
117 0.54
118 0.57
119 0.62
120 0.6
121 0.63
122 0.64
123 0.64
124 0.58
125 0.55
126 0.47
127 0.4
128 0.38
129 0.3
130 0.28
131 0.24
132 0.21
133 0.18
134 0.17
135 0.15
136 0.09
137 0.07
138 0.05
139 0.04
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.06
144 0.07
145 0.09
146 0.09
147 0.1
148 0.09
149 0.1
150 0.1
151 0.11
152 0.1
153 0.09
154 0.09
155 0.08
156 0.07
157 0.07
158 0.08
159 0.11
160 0.1
161 0.11
162 0.11
163 0.11
164 0.13
165 0.14
166 0.14
167 0.13
168 0.18
169 0.22
170 0.29
171 0.29
172 0.32
173 0.33
174 0.31
175 0.35
176 0.34
177 0.34
178 0.3
179 0.31
180 0.3
181 0.29
182 0.28
183 0.23
184 0.2
185 0.15
186 0.13
187 0.12
188 0.09
189 0.11
190 0.11
191 0.12
192 0.15
193 0.18
194 0.21
195 0.23
196 0.28
197 0.32
198 0.38
199 0.4
200 0.41
201 0.41
202 0.41
203 0.41
204 0.36
205 0.34
206 0.32
207 0.29
208 0.24
209 0.2
210 0.18
211 0.17
212 0.15
213 0.1
214 0.07
215 0.06
216 0.05
217 0.04
218 0.05
219 0.04
220 0.03
221 0.03
222 0.03
223 0.03
224 0.03
225 0.03
226 0.03
227 0.03
228 0.04
229 0.04
230 0.04
231 0.05
232 0.05
233 0.06
234 0.07
235 0.07
236 0.09
237 0.1
238 0.1
239 0.1
240 0.1
241 0.09
242 0.08
243 0.08
244 0.05
245 0.05
246 0.04
247 0.04
248 0.06
249 0.07
250 0.08
251 0.08
252 0.09
253 0.14
254 0.19
255 0.26
256 0.33
257 0.39
258 0.49
259 0.6
260 0.7
261 0.75
262 0.78
263 0.82
264 0.84
265 0.87
266 0.84
267 0.83
268 0.77
269 0.75
270 0.76
271 0.75
272 0.74
273 0.74
274 0.77
275 0.78
276 0.85
277 0.89
278 0.9
279 0.93
280 0.92
281 0.89
282 0.85
283 0.78
284 0.67
285 0.56
286 0.45
287 0.35
288 0.29
289 0.21
290 0.14
291 0.12
292 0.13
293 0.2
294 0.27
295 0.35
296 0.41
297 0.52
298 0.62
299 0.71
300 0.8
301 0.85
302 0.88
303 0.91
304 0.93
305 0.91
306 0.88
307 0.85
308 0.79
309 0.72
310 0.62
311 0.51
312 0.39
313 0.31
314 0.25
315 0.21
316 0.21
317 0.22
318 0.28
319 0.37
320 0.45
321 0.53
322 0.63
323 0.7
324 0.76
325 0.83
326 0.87
327 0.89
328 0.92
329 0.95
330 0.94
331 0.92
332 0.88
333 0.86
334 0.79
335 0.68
336 0.58
337 0.48
338 0.41
339 0.37
340 0.34
341 0.29
342 0.32
343 0.39
344 0.48
345 0.58
346 0.66
347 0.72
348 0.79
349 0.86
350 0.9
351 0.93
352 0.94
353 0.95
354 0.95
355 0.92
356 0.88
357 0.84
358 0.74
359 0.66
360 0.63
361 0.61
362 0.55
363 0.52
364 0.52
365 0.52
366 0.59
367 0.67
368 0.7
369 0.72
370 0.78
371 0.84
372 0.85
373 0.85
374 0.8
375 0.79
376 0.71
377 0.65
378 0.6
379 0.5
380 0.42
381 0.37
382 0.34
383 0.25
384 0.21
385 0.17
386 0.12
387 0.1
388 0.1
389 0.09
390 0.07
391 0.11
392 0.12
393 0.15
394 0.16
395 0.17
396 0.19
397 0.19
398 0.21
399 0.18
400 0.17
401 0.14
402 0.13
403 0.16
404 0.14
405 0.14
406 0.14
407 0.14
408 0.14
409 0.14
410 0.19
411 0.16
412 0.16
413 0.17
414 0.22
415 0.26
416 0.27
417 0.29
418 0.25
419 0.3
420 0.31
421 0.33
422 0.32
423 0.35
424 0.4
425 0.4
426 0.45
427 0.4
428 0.41
429 0.38
430 0.37
431 0.33
432 0.34
433 0.32
434 0.29
435 0.28
436 0.25
437 0.24
438 0.2
439 0.17
440 0.08
441 0.07
442 0.06