Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3CYT6

Protein Details
Accession M3CYT6    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
140-160VAKTAGKRRRKSKPVGDGNKMBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
70-82SAGGKVRRPSKKL
142-176KTAGKRRRKSKPVGDGNKMVMKSLSHRQGSMKRKK
Subcellular Location(s) mito 20, mito_nucl 13.333, cyto_mito 11.333, nucl 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR028160  Slx9-like  
Gene Ontology GO:0030686  C:90S preribosome  
GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030688  C:preribosome, small subunit precursor  
GO:0000462  P:maturation of SSU-rRNA from tricistronic rRNA transcript (SSU-rRNA, 5.8S rRNA, LSU-rRNA)  
Pfam View protein in Pfam  
PF15341  SLX9  
Amino Acid Sequences MAKRPTARAKASKAAASSISSPSAALSNLKSEYLAATRFGNTKKDKRIIRHGQLLAKVREGGINKQASSSAGGKVRRPSKKLKTSVKDLGDALPDVDMGDGGSVGADEIGGGEKSGVYAEDEWEGVSDEGGDDEKGDGAVAKTAGKRRRKSKPVGDGNKMVMKSLSHRQGSMKRKKVLEEKEMERFKRNLAQLASNQAVEEMKVSGGGGQEGKMNESHTQKWAALRAFIGTTMEKDKAFEGK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.51
2 0.44
3 0.38
4 0.34
5 0.28
6 0.25
7 0.21
8 0.19
9 0.17
10 0.16
11 0.14
12 0.14
13 0.12
14 0.15
15 0.16
16 0.16
17 0.16
18 0.15
19 0.16
20 0.17
21 0.16
22 0.14
23 0.15
24 0.17
25 0.21
26 0.24
27 0.3
28 0.35
29 0.42
30 0.5
31 0.56
32 0.61
33 0.64
34 0.72
35 0.74
36 0.74
37 0.75
38 0.71
39 0.68
40 0.68
41 0.68
42 0.58
43 0.49
44 0.42
45 0.33
46 0.31
47 0.28
48 0.26
49 0.26
50 0.27
51 0.25
52 0.25
53 0.25
54 0.22
55 0.23
56 0.21
57 0.18
58 0.21
59 0.23
60 0.26
61 0.33
62 0.41
63 0.44
64 0.47
65 0.53
66 0.58
67 0.66
68 0.72
69 0.75
70 0.72
71 0.74
72 0.77
73 0.7
74 0.61
75 0.52
76 0.44
77 0.35
78 0.29
79 0.21
80 0.12
81 0.1
82 0.07
83 0.06
84 0.05
85 0.03
86 0.03
87 0.03
88 0.02
89 0.02
90 0.02
91 0.02
92 0.02
93 0.02
94 0.02
95 0.02
96 0.03
97 0.03
98 0.03
99 0.03
100 0.03
101 0.03
102 0.03
103 0.03
104 0.04
105 0.04
106 0.05
107 0.05
108 0.05
109 0.05
110 0.06
111 0.06
112 0.05
113 0.05
114 0.04
115 0.03
116 0.04
117 0.04
118 0.04
119 0.03
120 0.04
121 0.04
122 0.04
123 0.04
124 0.04
125 0.04
126 0.05
127 0.05
128 0.07
129 0.09
130 0.16
131 0.24
132 0.32
133 0.39
134 0.47
135 0.58
136 0.64
137 0.71
138 0.74
139 0.78
140 0.8
141 0.81
142 0.78
143 0.71
144 0.66
145 0.61
146 0.51
147 0.4
148 0.3
149 0.22
150 0.21
151 0.25
152 0.29
153 0.26
154 0.27
155 0.33
156 0.41
157 0.51
158 0.58
159 0.59
160 0.57
161 0.59
162 0.64
163 0.68
164 0.67
165 0.65
166 0.62
167 0.58
168 0.62
169 0.66
170 0.62
171 0.58
172 0.51
173 0.46
174 0.46
175 0.43
176 0.4
177 0.36
178 0.39
179 0.36
180 0.42
181 0.4
182 0.33
183 0.3
184 0.24
185 0.22
186 0.16
187 0.15
188 0.08
189 0.07
190 0.07
191 0.07
192 0.07
193 0.08
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.12
198 0.13
199 0.14
200 0.14
201 0.16
202 0.2
203 0.24
204 0.26
205 0.26
206 0.3
207 0.3
208 0.33
209 0.38
210 0.34
211 0.31
212 0.29
213 0.28
214 0.25
215 0.24
216 0.23
217 0.17
218 0.18
219 0.21
220 0.22
221 0.2
222 0.21