Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3C5F2

Protein Details
Accession M3C5F2    Localization Confidence High Confidence Score 22.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
226-249SAEAKVFNPEKKKRKREGYEEGDWHydrophilic
375-400LKDLQDKHKKKERRRENEKKQREIVRBasic
487-507DRDTKARAKRARKEAGKNREDBasic
690-723VNARPIKKVREAKARKTLRAARRLEKLKKKSEGLHydrophilic
739-763SKLMAKASKSGKKKQPVKVIRAGGQHydrophilic
781-801DARLKKDVRGLKRADKRNKKKBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
236-241KKKRKR
326-329ARER
333-333K
381-395KHKKKERRRENEKKQ
491-503KARAKRARKEAGK
677-721KEAAAAIKEKMRAVNARPIKKVREAKARKTLRAARRLEKLKKKSE
740-801KLMAKASKSGKKKQPVKVIRAGGQNKGQGRPRGVKGKYKMVDARLKKDVRGLKRADKRNKKK
Subcellular Location(s) nucl 19.5, cyto_nucl 12, cyto 3.5, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR002877  RNA_MeTrfase_FtsJ_dom  
IPR015507  rRNA-MeTfrase_E  
IPR012920  rRNA_MeTfrase_SPB1-like_C  
IPR024576  rRNA_MeTfrase_Spb1_DUF3381  
IPR029063  SAM-dependent_MTases_sf  
IPR028589  SPB1-like  
Gene Ontology GO:0005730  C:nucleolus  
GO:0030687  C:preribosome, large subunit precursor  
GO:0070039  F:rRNA (guanosine-2'-O-)-methyltransferase activity  
GO:0008650  F:rRNA (uridine-2'-O-)-methyltransferase activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF11861  DUF3381  
PF01728  FtsJ  
PF07780  Spb1_C  
Amino Acid Sequences MAIQKKHAKARLDKYYYLAKEKGYRSRAAFKLIQLNKKYGFLQKSKCLIDLCAAPGGWLQVAAEIMPQKSLIVGVDLSPIKAIPKTITFQSDITTDKCRATIRGHLKTWKADTVIHDGAPNVGTAWVQDAFSQNELVLSSLKLATEFLAPNGNFVTKVFRSKDSAKLEWIFKQLFSKVEQTKPPSSRNVSAETFYVCQGYKAPKHLDPKFLDPHYAFMDVKEKSESAEAKVFNPEKKKRKREGYEEGDWTQFHEAAAYEFVQSQDPIEMLGTLNRIHFRRDGEDSVAQAALDMMSETTKDVRKNCEDLKVLGRADFKLLLRWRIKARERFGLKEKKTGHTKAVVEEKGEGEVGEEVAVVESMDDEMRLREELQALKDLQDKHKKKERRRENEKKQREIVRMQMGMTTPSEIGIEAGLQGGDAVFQLRDADKDSSIRRQITKGRMTALIEPEKPQQEFSEEEDSDEDGDLLERELDNMYQQYQEKLEDRDTKARAKRARKEAGKNREDAFEGFGDDDEVADSDASDDEVLVQDQDDSDWSDDEEEEEGLTTNLQPKQKDGELSSRAASFFQQDLFSGIDGLDEDEDMDDVDKARDSGIDDWEEGTTRDQPDNEGRPNIDIITAEAMTLAHQLATGKITKQQLLDDNFNKYSLRDVDGLPEWFLDDENKHARPQRPVTKEAAAAIKEKMRAVNARPIKKVREAKARKTLRAARRLEKLKKKSEGLAEDGEGTERDKANQISKLMAKASKSGKKKQPVKVIRAGGQNKGQGRPRGVKGKYKMVDARLKKDVRGLKRADKRNKKK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.65
2 0.68
3 0.64
4 0.61
5 0.54
6 0.48
7 0.5
8 0.55
9 0.6
10 0.55
11 0.57
12 0.57
13 0.64
14 0.62
15 0.6
16 0.57
17 0.53
18 0.58
19 0.59
20 0.63
21 0.57
22 0.6
23 0.55
24 0.54
25 0.53
26 0.5
27 0.51
28 0.5
29 0.55
30 0.57
31 0.63
32 0.61
33 0.61
34 0.54
35 0.47
36 0.43
37 0.39
38 0.32
39 0.28
40 0.25
41 0.22
42 0.21
43 0.21
44 0.16
45 0.12
46 0.1
47 0.08
48 0.08
49 0.08
50 0.1
51 0.12
52 0.12
53 0.12
54 0.12
55 0.11
56 0.11
57 0.12
58 0.09
59 0.08
60 0.08
61 0.08
62 0.15
63 0.15
64 0.15
65 0.15
66 0.15
67 0.14
68 0.15
69 0.16
70 0.13
71 0.17
72 0.21
73 0.24
74 0.28
75 0.29
76 0.28
77 0.29
78 0.28
79 0.27
80 0.26
81 0.27
82 0.25
83 0.24
84 0.26
85 0.26
86 0.27
87 0.29
88 0.36
89 0.41
90 0.48
91 0.52
92 0.57
93 0.59
94 0.62
95 0.62
96 0.56
97 0.48
98 0.43
99 0.41
100 0.43
101 0.4
102 0.34
103 0.3
104 0.26
105 0.25
106 0.22
107 0.18
108 0.1
109 0.08
110 0.07
111 0.07
112 0.1
113 0.09
114 0.09
115 0.1
116 0.13
117 0.15
118 0.16
119 0.16
120 0.13
121 0.13
122 0.13
123 0.12
124 0.1
125 0.08
126 0.09
127 0.09
128 0.09
129 0.09
130 0.09
131 0.09
132 0.12
133 0.13
134 0.12
135 0.19
136 0.19
137 0.19
138 0.2
139 0.2
140 0.16
141 0.16
142 0.22
143 0.17
144 0.24
145 0.26
146 0.28
147 0.34
148 0.38
149 0.47
150 0.47
151 0.47
152 0.46
153 0.47
154 0.48
155 0.46
156 0.47
157 0.39
158 0.33
159 0.35
160 0.31
161 0.28
162 0.28
163 0.32
164 0.33
165 0.38
166 0.43
167 0.45
168 0.52
169 0.55
170 0.56
171 0.56
172 0.56
173 0.56
174 0.53
175 0.53
176 0.46
177 0.42
178 0.39
179 0.33
180 0.29
181 0.23
182 0.21
183 0.15
184 0.14
185 0.16
186 0.22
187 0.23
188 0.28
189 0.33
190 0.37
191 0.46
192 0.5
193 0.54
194 0.51
195 0.55
196 0.56
197 0.52
198 0.51
199 0.42
200 0.41
201 0.35
202 0.35
203 0.27
204 0.21
205 0.27
206 0.22
207 0.23
208 0.22
209 0.19
210 0.17
211 0.21
212 0.21
213 0.18
214 0.23
215 0.23
216 0.22
217 0.31
218 0.33
219 0.33
220 0.41
221 0.47
222 0.52
223 0.62
224 0.71
225 0.73
226 0.81
227 0.85
228 0.85
229 0.86
230 0.83
231 0.79
232 0.74
233 0.67
234 0.57
235 0.48
236 0.4
237 0.31
238 0.23
239 0.16
240 0.11
241 0.1
242 0.09
243 0.1
244 0.09
245 0.08
246 0.08
247 0.09
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.08
252 0.07
253 0.07
254 0.06
255 0.06
256 0.05
257 0.07
258 0.07
259 0.08
260 0.09
261 0.13
262 0.14
263 0.16
264 0.18
265 0.19
266 0.23
267 0.26
268 0.27
269 0.28
270 0.29
271 0.27
272 0.26
273 0.23
274 0.18
275 0.14
276 0.11
277 0.06
278 0.05
279 0.04
280 0.03
281 0.03
282 0.03
283 0.04
284 0.07
285 0.1
286 0.14
287 0.16
288 0.22
289 0.26
290 0.32
291 0.34
292 0.38
293 0.37
294 0.36
295 0.38
296 0.36
297 0.32
298 0.3
299 0.29
300 0.22
301 0.22
302 0.22
303 0.18
304 0.2
305 0.22
306 0.27
307 0.27
308 0.31
309 0.34
310 0.4
311 0.47
312 0.49
313 0.51
314 0.52
315 0.54
316 0.55
317 0.6
318 0.61
319 0.55
320 0.55
321 0.54
322 0.52
323 0.56
324 0.53
325 0.47
326 0.44
327 0.43
328 0.4
329 0.44
330 0.38
331 0.32
332 0.3
333 0.27
334 0.21
335 0.2
336 0.15
337 0.07
338 0.07
339 0.06
340 0.05
341 0.04
342 0.04
343 0.04
344 0.04
345 0.03
346 0.02
347 0.02
348 0.03
349 0.03
350 0.03
351 0.03
352 0.03
353 0.04
354 0.05
355 0.05
356 0.06
357 0.09
358 0.1
359 0.11
360 0.14
361 0.14
362 0.15
363 0.18
364 0.2
365 0.25
366 0.34
367 0.36
368 0.41
369 0.5
370 0.57
371 0.62
372 0.7
373 0.74
374 0.75
375 0.83
376 0.87
377 0.89
378 0.92
379 0.92
380 0.88
381 0.84
382 0.79
383 0.73
384 0.64
385 0.59
386 0.53
387 0.45
388 0.39
389 0.33
390 0.26
391 0.23
392 0.2
393 0.14
394 0.08
395 0.08
396 0.08
397 0.06
398 0.06
399 0.04
400 0.04
401 0.03
402 0.03
403 0.03
404 0.03
405 0.03
406 0.02
407 0.02
408 0.02
409 0.03
410 0.03
411 0.03
412 0.04
413 0.04
414 0.05
415 0.08
416 0.09
417 0.09
418 0.13
419 0.15
420 0.2
421 0.24
422 0.27
423 0.25
424 0.29
425 0.35
426 0.4
427 0.43
428 0.39
429 0.37
430 0.36
431 0.37
432 0.36
433 0.34
434 0.3
435 0.26
436 0.26
437 0.28
438 0.28
439 0.27
440 0.24
441 0.19
442 0.17
443 0.18
444 0.2
445 0.24
446 0.21
447 0.21
448 0.21
449 0.21
450 0.19
451 0.17
452 0.13
453 0.05
454 0.05
455 0.05
456 0.04
457 0.04
458 0.04
459 0.04
460 0.05
461 0.05
462 0.06
463 0.06
464 0.07
465 0.09
466 0.1
467 0.11
468 0.11
469 0.13
470 0.15
471 0.17
472 0.22
473 0.26
474 0.3
475 0.36
476 0.38
477 0.43
478 0.46
479 0.52
480 0.54
481 0.57
482 0.62
483 0.65
484 0.72
485 0.72
486 0.78
487 0.81
488 0.83
489 0.77
490 0.72
491 0.63
492 0.55
493 0.49
494 0.39
495 0.31
496 0.2
497 0.17
498 0.13
499 0.12
500 0.1
501 0.08
502 0.08
503 0.05
504 0.05
505 0.05
506 0.04
507 0.04
508 0.04
509 0.04
510 0.04
511 0.04
512 0.04
513 0.04
514 0.04
515 0.05
516 0.04
517 0.04
518 0.04
519 0.04
520 0.05
521 0.05
522 0.06
523 0.07
524 0.07
525 0.07
526 0.08
527 0.08
528 0.09
529 0.08
530 0.07
531 0.06
532 0.06
533 0.06
534 0.06
535 0.06
536 0.06
537 0.11
538 0.15
539 0.18
540 0.18
541 0.2
542 0.25
543 0.27
544 0.29
545 0.27
546 0.32
547 0.32
548 0.34
549 0.33
550 0.29
551 0.27
552 0.25
553 0.22
554 0.16
555 0.13
556 0.13
557 0.12
558 0.11
559 0.13
560 0.13
561 0.12
562 0.1
563 0.08
564 0.07
565 0.07
566 0.07
567 0.05
568 0.05
569 0.05
570 0.04
571 0.05
572 0.05
573 0.05
574 0.05
575 0.05
576 0.06
577 0.06
578 0.06
579 0.06
580 0.07
581 0.09
582 0.12
583 0.14
584 0.15
585 0.15
586 0.16
587 0.16
588 0.16
589 0.14
590 0.14
591 0.15
592 0.16
593 0.17
594 0.17
595 0.2
596 0.28
597 0.34
598 0.36
599 0.34
600 0.33
601 0.32
602 0.33
603 0.29
604 0.22
605 0.16
606 0.13
607 0.13
608 0.12
609 0.1
610 0.09
611 0.09
612 0.08
613 0.09
614 0.08
615 0.05
616 0.05
617 0.06
618 0.07
619 0.09
620 0.11
621 0.11
622 0.16
623 0.19
624 0.21
625 0.22
626 0.26
627 0.31
628 0.34
629 0.42
630 0.39
631 0.42
632 0.41
633 0.4
634 0.37
635 0.29
636 0.3
637 0.24
638 0.24
639 0.2
640 0.2
641 0.24
642 0.27
643 0.28
644 0.23
645 0.2
646 0.17
647 0.16
648 0.16
649 0.14
650 0.11
651 0.16
652 0.22
653 0.24
654 0.27
655 0.35
656 0.4
657 0.46
658 0.55
659 0.59
660 0.59
661 0.61
662 0.63
663 0.6
664 0.56
665 0.51
666 0.47
667 0.38
668 0.34
669 0.33
670 0.31
671 0.29
672 0.29
673 0.27
674 0.26
675 0.29
676 0.32
677 0.39
678 0.44
679 0.49
680 0.55
681 0.58
682 0.59
683 0.64
684 0.68
685 0.67
686 0.69
687 0.71
688 0.74
689 0.79
690 0.82
691 0.77
692 0.78
693 0.79
694 0.77
695 0.78
696 0.75
697 0.72
698 0.74
699 0.79
700 0.8
701 0.81
702 0.81
703 0.81
704 0.81
705 0.78
706 0.74
707 0.73
708 0.68
709 0.62
710 0.56
711 0.48
712 0.41
713 0.37
714 0.31
715 0.23
716 0.19
717 0.18
718 0.15
719 0.16
720 0.2
721 0.23
722 0.28
723 0.33
724 0.33
725 0.35
726 0.37
727 0.39
728 0.39
729 0.38
730 0.34
731 0.36
732 0.44
733 0.47
734 0.52
735 0.58
736 0.63
737 0.71
738 0.79
739 0.81
740 0.83
741 0.84
742 0.85
743 0.84
744 0.82
745 0.77
746 0.78
747 0.72
748 0.68
749 0.64
750 0.62
751 0.57
752 0.56
753 0.58
754 0.54
755 0.58
756 0.6
757 0.61
758 0.65
759 0.66
760 0.69
761 0.68
762 0.72
763 0.68
764 0.68
765 0.66
766 0.65
767 0.69
768 0.67
769 0.67
770 0.67
771 0.66
772 0.59
773 0.61
774 0.62
775 0.6
776 0.62
777 0.62
778 0.63
779 0.71
780 0.8
781 0.83