Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3D6D7

Protein Details
Accession M3D6D7    Localization Confidence High Confidence Score 17.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
179-199DKPLAKKRAPAKKANGTRLKKBasic
205-225DDKPLKKKAPAKKTAVKKEATBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
145-236ISIEKKAEKEAKAIRSKEAAAKKKVKKEESSDEDDKPLAKKRAPAKKANGTRLKKEEFSDDDKPLKKKAPAKKTAVKKEATTPAKKGKGKAK
380-387PAAEKKRL
423-435GRGEHPKTGKFKK
797-802KKLKKE
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto_nucl 13, cyto 11.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011010  DNA_brk_join_enz  
IPR013034  DNA_topo_DNA_db_N_dom1  
IPR013030  DNA_topo_DNA_db_N_dom2  
IPR001631  TopoI  
IPR018521  TopoI_AS  
IPR025834  TopoI_C_dom  
IPR014711  TopoI_cat_a-hlx-sub_euk  
IPR014727  TopoI_cat_a/b-sub_euk  
IPR013500  TopoI_cat_euk  
IPR008336  TopoI_DNA-bd_euk  
IPR036202  TopoI_DNA-bd_euk_N_sf  
IPR013499  TopoI_euk  
Gene Ontology GO:0005694  C:chromosome  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0003917  F:DNA topoisomerase type I (single strand cut, ATP-independent) activity  
GO:0006265  P:DNA topological change  
Pfam View protein in Pfam  
PF14370  Topo_C_assoc  
PF01028  Topoisom_I  
PF02919  Topoisom_I_N  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00176  TOPOISOMERASE_I_EUK  
CDD cd00659  Topo_IB_C  
cd03488  Topoisomer_IB_N_htopoI_like  
Amino Acid Sequences MSDSEDDRPLVAKSKPTVTQNDMDTTADSPSVLPGVSIANGPVGGMDIDTPMTNGNTNGTTNGVPHGTKRKSSLANGKSYKDHSESDEDDLPLKKRKKAAASESEDEDDVPLVKKVVKPIKATAAQLGEDSGDEPITQKLQKEKISIEKKAEKEAKAIRSKEAAAKKKVKKEESSDEDDKPLAKKRAPAKKANGTRLKKEEFSDDDKPLKKKAPAKKTAVKKEATTPAKKGKGKAKEESPAEGGEEEEEEEEYRWWEDPQKGDGTIKWTTLEHNGVVFPPEYEPLPKNVQMIYDGTPVTLHKDAEEIAHAFGSMLNSTHNVENPTFQKNFFADFKEMLDKTGHGKDRDGKQVKILKFEKCDFKPIFNHVDAERQAKKALPAAEKKRLKAEKDEAEAPYQYCKWDGRKQKVGNFRVEPPGLFRGRGEHPKTGKFKKRVLPEQITINIGKDAMVPVPPEGHTWKEVKNDQEGTWLAMWQENINGAYKYVMLAANSDIKGQSDYKKFEKARELKKHIDRIRKDYEKELKSEVMANRQRATATYLIDRFALRAGNEKGDDEADTVGCCSLKFENVTLKPPNKVIFDFLGKDSIRFYDEVDVDAQVFKNLKIFKRSPKKEGDEIFDRLTTSGLNKHLSNYMTGLTAKVFRTYNASFTMATLLKDMKAEGTVADKVLAYNAANRKVAILCNHKRTVAASHEQQMEKMEDKINGLRYQQCRIKRMMLDLEPKLKKKKGEGFFALPDGLDAEWQEKHHAALVEESKTKITKKFEKENEKLAAEGEKEMKPKELEERLQPMRELEKKLKKELKTGKVEAEGKSASIEKYEKDIEKLDTRIATLQTQAEDRDNNKEVALGTSKINYIDPRLTVVFSKKFDVPIERFFSKTLREKFDWAIKSVDEDWEF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.35
2 0.41
3 0.45
4 0.51
5 0.51
6 0.54
7 0.51
8 0.51
9 0.46
10 0.41
11 0.36
12 0.3
13 0.25
14 0.19
15 0.16
16 0.12
17 0.11
18 0.11
19 0.09
20 0.08
21 0.07
22 0.09
23 0.09
24 0.1
25 0.09
26 0.09
27 0.09
28 0.09
29 0.08
30 0.07
31 0.06
32 0.06
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.07
37 0.08
38 0.08
39 0.09
40 0.1
41 0.1
42 0.12
43 0.13
44 0.14
45 0.15
46 0.16
47 0.16
48 0.16
49 0.18
50 0.18
51 0.17
52 0.22
53 0.31
54 0.33
55 0.37
56 0.41
57 0.46
58 0.49
59 0.57
60 0.62
61 0.59
62 0.65
63 0.66
64 0.65
65 0.62
66 0.6
67 0.57
68 0.51
69 0.46
70 0.4
71 0.43
72 0.41
73 0.42
74 0.42
75 0.37
76 0.36
77 0.37
78 0.37
79 0.39
80 0.42
81 0.41
82 0.44
83 0.5
84 0.56
85 0.62
86 0.69
87 0.7
88 0.73
89 0.71
90 0.68
91 0.63
92 0.54
93 0.44
94 0.34
95 0.24
96 0.17
97 0.14
98 0.11
99 0.1
100 0.13
101 0.15
102 0.24
103 0.32
104 0.37
105 0.4
106 0.44
107 0.52
108 0.53
109 0.53
110 0.49
111 0.43
112 0.38
113 0.34
114 0.29
115 0.2
116 0.16
117 0.15
118 0.1
119 0.07
120 0.07
121 0.08
122 0.09
123 0.12
124 0.14
125 0.17
126 0.24
127 0.31
128 0.35
129 0.38
130 0.42
131 0.49
132 0.55
133 0.57
134 0.59
135 0.6
136 0.58
137 0.64
138 0.65
139 0.56
140 0.56
141 0.59
142 0.59
143 0.59
144 0.59
145 0.53
146 0.5
147 0.51
148 0.51
149 0.53
150 0.52
151 0.53
152 0.61
153 0.66
154 0.71
155 0.78
156 0.77
157 0.75
158 0.74
159 0.75
160 0.72
161 0.73
162 0.69
163 0.61
164 0.56
165 0.49
166 0.43
167 0.36
168 0.37
169 0.34
170 0.32
171 0.37
172 0.44
173 0.54
174 0.59
175 0.65
176 0.66
177 0.71
178 0.78
179 0.81
180 0.82
181 0.77
182 0.79
183 0.77
184 0.73
185 0.65
186 0.58
187 0.55
188 0.5
189 0.51
190 0.49
191 0.45
192 0.48
193 0.51
194 0.51
195 0.49
196 0.49
197 0.49
198 0.52
199 0.57
200 0.6
201 0.64
202 0.7
203 0.75
204 0.79
205 0.83
206 0.81
207 0.74
208 0.65
209 0.64
210 0.65
211 0.64
212 0.59
213 0.55
214 0.57
215 0.63
216 0.64
217 0.62
218 0.61
219 0.63
220 0.65
221 0.66
222 0.64
223 0.63
224 0.62
225 0.6
226 0.52
227 0.43
228 0.37
229 0.29
230 0.22
231 0.15
232 0.12
233 0.09
234 0.07
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.08
240 0.09
241 0.09
242 0.09
243 0.15
244 0.18
245 0.2
246 0.23
247 0.25
248 0.25
249 0.26
250 0.26
251 0.26
252 0.24
253 0.22
254 0.19
255 0.17
256 0.18
257 0.2
258 0.21
259 0.16
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.16
264 0.14
265 0.1
266 0.09
267 0.1
268 0.09
269 0.12
270 0.13
271 0.16
272 0.2
273 0.21
274 0.21
275 0.21
276 0.21
277 0.19
278 0.21
279 0.19
280 0.18
281 0.16
282 0.14
283 0.14
284 0.14
285 0.16
286 0.16
287 0.13
288 0.1
289 0.11
290 0.12
291 0.12
292 0.14
293 0.11
294 0.09
295 0.09
296 0.09
297 0.08
298 0.08
299 0.08
300 0.06
301 0.06
302 0.06
303 0.07
304 0.09
305 0.1
306 0.11
307 0.12
308 0.12
309 0.17
310 0.19
311 0.23
312 0.22
313 0.21
314 0.23
315 0.21
316 0.25
317 0.22
318 0.23
319 0.2
320 0.2
321 0.22
322 0.24
323 0.23
324 0.21
325 0.2
326 0.17
327 0.19
328 0.25
329 0.27
330 0.22
331 0.25
332 0.31
333 0.36
334 0.46
335 0.46
336 0.4
337 0.43
338 0.5
339 0.49
340 0.51
341 0.49
342 0.43
343 0.44
344 0.48
345 0.49
346 0.42
347 0.49
348 0.41
349 0.42
350 0.41
351 0.41
352 0.42
353 0.34
354 0.35
355 0.27
356 0.32
357 0.29
358 0.31
359 0.29
360 0.25
361 0.24
362 0.23
363 0.24
364 0.22
365 0.26
366 0.26
367 0.33
368 0.38
369 0.48
370 0.5
371 0.5
372 0.55
373 0.55
374 0.51
375 0.5
376 0.51
377 0.47
378 0.48
379 0.5
380 0.42
381 0.39
382 0.38
383 0.31
384 0.25
385 0.19
386 0.15
387 0.13
388 0.15
389 0.19
390 0.26
391 0.35
392 0.41
393 0.5
394 0.54
395 0.59
396 0.66
397 0.65
398 0.64
399 0.57
400 0.52
401 0.48
402 0.44
403 0.37
404 0.3
405 0.32
406 0.25
407 0.23
408 0.2
409 0.19
410 0.22
411 0.31
412 0.31
413 0.32
414 0.34
415 0.41
416 0.48
417 0.53
418 0.58
419 0.55
420 0.59
421 0.59
422 0.65
423 0.66
424 0.67
425 0.63
426 0.57
427 0.55
428 0.49
429 0.45
430 0.36
431 0.28
432 0.2
433 0.14
434 0.12
435 0.08
436 0.07
437 0.06
438 0.06
439 0.06
440 0.06
441 0.07
442 0.07
443 0.09
444 0.1
445 0.11
446 0.12
447 0.14
448 0.17
449 0.21
450 0.24
451 0.24
452 0.28
453 0.28
454 0.26
455 0.28
456 0.25
457 0.22
458 0.19
459 0.17
460 0.13
461 0.12
462 0.12
463 0.08
464 0.08
465 0.07
466 0.07
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.07
471 0.07
472 0.07
473 0.07
474 0.07
475 0.06
476 0.07
477 0.08
478 0.11
479 0.12
480 0.12
481 0.1
482 0.1
483 0.12
484 0.13
485 0.18
486 0.19
487 0.23
488 0.25
489 0.34
490 0.35
491 0.38
492 0.46
493 0.49
494 0.54
495 0.61
496 0.65
497 0.65
498 0.71
499 0.76
500 0.73
501 0.74
502 0.68
503 0.65
504 0.68
505 0.65
506 0.6
507 0.59
508 0.62
509 0.54
510 0.52
511 0.47
512 0.38
513 0.33
514 0.37
515 0.3
516 0.3
517 0.32
518 0.32
519 0.31
520 0.31
521 0.3
522 0.25
523 0.27
524 0.19
525 0.17
526 0.18
527 0.18
528 0.18
529 0.19
530 0.18
531 0.15
532 0.13
533 0.13
534 0.09
535 0.15
536 0.16
537 0.17
538 0.18
539 0.18
540 0.17
541 0.17
542 0.17
543 0.11
544 0.1
545 0.08
546 0.07
547 0.07
548 0.07
549 0.06
550 0.06
551 0.07
552 0.07
553 0.09
554 0.1
555 0.11
556 0.19
557 0.21
558 0.26
559 0.31
560 0.33
561 0.33
562 0.35
563 0.36
564 0.3
565 0.29
566 0.27
567 0.23
568 0.24
569 0.25
570 0.22
571 0.25
572 0.23
573 0.22
574 0.2
575 0.18
576 0.16
577 0.14
578 0.15
579 0.15
580 0.15
581 0.16
582 0.16
583 0.15
584 0.14
585 0.14
586 0.13
587 0.09
588 0.1
589 0.09
590 0.13
591 0.17
592 0.19
593 0.26
594 0.31
595 0.4
596 0.5
597 0.56
598 0.58
599 0.63
600 0.67
601 0.67
602 0.66
603 0.62
604 0.57
605 0.54
606 0.49
607 0.4
608 0.34
609 0.27
610 0.23
611 0.17
612 0.13
613 0.14
614 0.15
615 0.17
616 0.17
617 0.19
618 0.22
619 0.22
620 0.22
621 0.19
622 0.16
623 0.15
624 0.15
625 0.14
626 0.11
627 0.14
628 0.14
629 0.16
630 0.15
631 0.14
632 0.21
633 0.21
634 0.23
635 0.22
636 0.24
637 0.2
638 0.2
639 0.25
640 0.19
641 0.18
642 0.17
643 0.15
644 0.14
645 0.14
646 0.14
647 0.09
648 0.09
649 0.09
650 0.08
651 0.1
652 0.11
653 0.1
654 0.11
655 0.1
656 0.1
657 0.1
658 0.11
659 0.08
660 0.14
661 0.18
662 0.22
663 0.22
664 0.22
665 0.24
666 0.24
667 0.27
668 0.28
669 0.33
670 0.36
671 0.43
672 0.45
673 0.44
674 0.43
675 0.42
676 0.41
677 0.37
678 0.36
679 0.32
680 0.37
681 0.42
682 0.42
683 0.41
684 0.37
685 0.34
686 0.29
687 0.28
688 0.24
689 0.19
690 0.22
691 0.25
692 0.28
693 0.27
694 0.29
695 0.34
696 0.34
697 0.41
698 0.45
699 0.48
700 0.47
701 0.48
702 0.52
703 0.47
704 0.5
705 0.5
706 0.5
707 0.51
708 0.51
709 0.57
710 0.55
711 0.58
712 0.59
713 0.56
714 0.54
715 0.55
716 0.61
717 0.58
718 0.62
719 0.63
720 0.61
721 0.6
722 0.58
723 0.48
724 0.38
725 0.31
726 0.23
727 0.16
728 0.1
729 0.08
730 0.08
731 0.1
732 0.11
733 0.14
734 0.13
735 0.14
736 0.18
737 0.19
738 0.17
739 0.22
740 0.26
741 0.27
742 0.29
743 0.29
744 0.28
745 0.29
746 0.31
747 0.31
748 0.35
749 0.41
750 0.48
751 0.57
752 0.65
753 0.73
754 0.75
755 0.78
756 0.75
757 0.66
758 0.58
759 0.48
760 0.42
761 0.33
762 0.31
763 0.27
764 0.24
765 0.26
766 0.27
767 0.3
768 0.27
769 0.28
770 0.33
771 0.37
772 0.38
773 0.42
774 0.5
775 0.51
776 0.53
777 0.51
778 0.45
779 0.46
780 0.48
781 0.48
782 0.49
783 0.54
784 0.57
785 0.66
786 0.71
787 0.66
788 0.7
789 0.73
790 0.73
791 0.72
792 0.71
793 0.66
794 0.66
795 0.68
796 0.59
797 0.54
798 0.44
799 0.35
800 0.33
801 0.3
802 0.22
803 0.22
804 0.22
805 0.18
806 0.23
807 0.29
808 0.29
809 0.3
810 0.34
811 0.35
812 0.39
813 0.39
814 0.38
815 0.33
816 0.32
817 0.33
818 0.32
819 0.28
820 0.25
821 0.26
822 0.23
823 0.24
824 0.25
825 0.25
826 0.28
827 0.29
828 0.34
829 0.34
830 0.33
831 0.31
832 0.3
833 0.27
834 0.27
835 0.28
836 0.22
837 0.2
838 0.22
839 0.23
840 0.22
841 0.25
842 0.22
843 0.23
844 0.25
845 0.25
846 0.27
847 0.27
848 0.28
849 0.29
850 0.35
851 0.36
852 0.35
853 0.38
854 0.36
855 0.38
856 0.41
857 0.45
858 0.43
859 0.44
860 0.5
861 0.48
862 0.46
863 0.45
864 0.44
865 0.44
866 0.49
867 0.48
868 0.49
869 0.5
870 0.54
871 0.59
872 0.64
873 0.6
874 0.52
875 0.48
876 0.39
877 0.41
878 0.38