Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3CP52

Protein Details
Accession M3CP52    Localization Confidence Medium Confidence Score 10.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
695-719KENGHGRGRHGRKQHHHNDRDQQYABasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
699-706HGRGRHGR
Subcellular Location(s) cyto 10, cyto_nucl 9.5, nucl 7, mito 7
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR006569  CID_dom  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR012677  Nucleotide-bd_a/b_plait_sf  
IPR045154  PCF11-like  
IPR035979  RBD_domain_sf  
IPR000504  RRM_dom  
Gene Ontology GO:0003729  F:mRNA binding  
GO:0000993  F:RNA polymerase II complex binding  
GO:0006379  P:mRNA cleavage  
GO:0006378  P:mRNA polyadenylation  
GO:0006369  P:termination of RNA polymerase II transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF04818  CID  
PF00076  RRM_1  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS51391  CID  
PS50102  RRM  
CDD cd16984  CID_Nrd1_like  
Amino Acid Sequences MMALPKLDDLDNLLASLNQLKPPGASKNKIQTITALSVNNIKAEVSIVQCLYRALKKAPVTHKLGSLYVVDSVVRQWIEKAKVAGQELQFDGRGEPGTYSAAVKRVTELMPALFDDTIKGLPADQKPKLENMVAIWERGNTFPLKLLQDFKSKLNSIPKLNGAPSQQTAAPNVNGAATQMTASSSTSSGEKYVAPRPSRPLLTPIGFPPGHVYDHGFLPGRFKPGQTNGAPNPATQPSFDPRRPQPPQPPQLPPSQPTTQDTAQAEIHGILAALAKAGVATAPATTLAPGNPITRPPPPQVGQVPPNIAELLGQAGPSVPQPLPQMAQPSPYGYSAPSSAPPMAIPAYQPPQQTMYWPQAPYAPQPPPSIPPQYAVAPPPPPQASQSDPLGPLRGILPENILNDHDKLVPALKLLQDLQKDGIAPEKWGPVLEAFQQQYQPRPHAFGDRNRGRSRSPERNGSGGRASPVYGTYEDHAAKQGDGGRDVRNGGSGGRGRYRQRSPMRSGLGQPTNGRPMQPKNIGYDESLPRDNIKVLSRTLFVGGANGTQQEIQEVFERFGRVQTCIANRDKRHAFVKMTTRDYALAAKQGMEELQNRNDREVMSVARQTKWGVGFGPRECCDYLRGESIIPINKLTEADNKWLHTAEYGGTGGKPLEGGMVLEEPDIEIGAGVSSKAMSKRVGPDNNAQPKHHQKENGHGRGRHGRKQHHHNDRDQQYAGGYSGVSGGPSPLDYSSLARPEPVAVATPPAVPGFGFGWASQSTQHPYR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.15
3 0.2
4 0.18
5 0.17
6 0.18
7 0.18
8 0.2
9 0.25
10 0.34
11 0.37
12 0.39
13 0.45
14 0.54
15 0.62
16 0.62
17 0.58
18 0.52
19 0.5
20 0.49
21 0.45
22 0.36
23 0.29
24 0.33
25 0.33
26 0.3
27 0.23
28 0.19
29 0.15
30 0.16
31 0.18
32 0.14
33 0.17
34 0.17
35 0.17
36 0.17
37 0.19
38 0.21
39 0.23
40 0.25
41 0.24
42 0.31
43 0.36
44 0.45
45 0.52
46 0.56
47 0.58
48 0.57
49 0.59
50 0.54
51 0.5
52 0.42
53 0.35
54 0.28
55 0.22
56 0.2
57 0.15
58 0.12
59 0.12
60 0.15
61 0.13
62 0.13
63 0.14
64 0.21
65 0.25
66 0.28
67 0.3
68 0.31
69 0.35
70 0.37
71 0.41
72 0.35
73 0.36
74 0.33
75 0.33
76 0.29
77 0.25
78 0.23
79 0.18
80 0.18
81 0.14
82 0.13
83 0.12
84 0.13
85 0.13
86 0.15
87 0.15
88 0.18
89 0.19
90 0.19
91 0.19
92 0.21
93 0.21
94 0.21
95 0.21
96 0.17
97 0.17
98 0.17
99 0.17
100 0.13
101 0.12
102 0.11
103 0.11
104 0.11
105 0.1
106 0.09
107 0.09
108 0.16
109 0.23
110 0.3
111 0.32
112 0.37
113 0.38
114 0.41
115 0.43
116 0.38
117 0.32
118 0.26
119 0.32
120 0.28
121 0.27
122 0.24
123 0.22
124 0.22
125 0.21
126 0.22
127 0.13
128 0.13
129 0.16
130 0.2
131 0.21
132 0.23
133 0.28
134 0.29
135 0.36
136 0.38
137 0.38
138 0.4
139 0.38
140 0.41
141 0.46
142 0.48
143 0.44
144 0.46
145 0.48
146 0.44
147 0.45
148 0.43
149 0.37
150 0.35
151 0.31
152 0.29
153 0.27
154 0.25
155 0.26
156 0.25
157 0.22
158 0.19
159 0.18
160 0.15
161 0.13
162 0.12
163 0.1
164 0.07
165 0.06
166 0.06
167 0.06
168 0.07
169 0.07
170 0.08
171 0.08
172 0.08
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.11
177 0.12
178 0.15
179 0.21
180 0.28
181 0.3
182 0.33
183 0.38
184 0.43
185 0.44
186 0.42
187 0.4
188 0.38
189 0.37
190 0.36
191 0.32
192 0.33
193 0.29
194 0.28
195 0.28
196 0.23
197 0.22
198 0.21
199 0.22
200 0.16
201 0.17
202 0.2
203 0.17
204 0.15
205 0.19
206 0.2
207 0.23
208 0.22
209 0.22
210 0.25
211 0.29
212 0.37
213 0.34
214 0.39
215 0.36
216 0.43
217 0.43
218 0.37
219 0.35
220 0.31
221 0.29
222 0.22
223 0.24
224 0.23
225 0.3
226 0.32
227 0.36
228 0.38
229 0.48
230 0.52
231 0.57
232 0.61
233 0.64
234 0.7
235 0.7
236 0.71
237 0.64
238 0.68
239 0.63
240 0.54
241 0.51
242 0.46
243 0.41
244 0.37
245 0.4
246 0.32
247 0.33
248 0.32
249 0.28
250 0.25
251 0.22
252 0.2
253 0.15
254 0.14
255 0.09
256 0.08
257 0.05
258 0.05
259 0.05
260 0.04
261 0.04
262 0.03
263 0.03
264 0.03
265 0.03
266 0.02
267 0.03
268 0.03
269 0.03
270 0.04
271 0.04
272 0.05
273 0.05
274 0.05
275 0.07
276 0.08
277 0.09
278 0.1
279 0.12
280 0.14
281 0.17
282 0.21
283 0.22
284 0.28
285 0.28
286 0.32
287 0.35
288 0.37
289 0.37
290 0.36
291 0.35
292 0.29
293 0.28
294 0.23
295 0.18
296 0.13
297 0.09
298 0.09
299 0.07
300 0.06
301 0.05
302 0.05
303 0.06
304 0.06
305 0.08
306 0.06
307 0.08
308 0.1
309 0.11
310 0.12
311 0.13
312 0.17
313 0.15
314 0.18
315 0.16
316 0.16
317 0.16
318 0.16
319 0.15
320 0.11
321 0.12
322 0.11
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.1
329 0.1
330 0.1
331 0.09
332 0.09
333 0.1
334 0.13
335 0.17
336 0.17
337 0.17
338 0.19
339 0.19
340 0.2
341 0.21
342 0.23
343 0.24
344 0.24
345 0.23
346 0.23
347 0.24
348 0.25
349 0.26
350 0.23
351 0.22
352 0.24
353 0.24
354 0.24
355 0.27
356 0.28
357 0.23
358 0.22
359 0.2
360 0.21
361 0.21
362 0.2
363 0.19
364 0.17
365 0.18
366 0.2
367 0.19
368 0.17
369 0.18
370 0.19
371 0.2
372 0.2
373 0.21
374 0.19
375 0.19
376 0.19
377 0.18
378 0.15
379 0.12
380 0.1
381 0.1
382 0.09
383 0.08
384 0.09
385 0.1
386 0.11
387 0.11
388 0.12
389 0.11
390 0.11
391 0.12
392 0.11
393 0.09
394 0.09
395 0.09
396 0.09
397 0.08
398 0.09
399 0.08
400 0.09
401 0.1
402 0.14
403 0.13
404 0.14
405 0.14
406 0.13
407 0.13
408 0.12
409 0.16
410 0.12
411 0.13
412 0.13
413 0.13
414 0.13
415 0.13
416 0.13
417 0.09
418 0.1
419 0.11
420 0.14
421 0.14
422 0.15
423 0.19
424 0.19
425 0.25
426 0.26
427 0.27
428 0.23
429 0.26
430 0.26
431 0.31
432 0.35
433 0.36
434 0.44
435 0.48
436 0.54
437 0.53
438 0.54
439 0.47
440 0.51
441 0.53
442 0.53
443 0.5
444 0.52
445 0.52
446 0.56
447 0.56
448 0.49
449 0.43
450 0.33
451 0.3
452 0.21
453 0.19
454 0.13
455 0.13
456 0.12
457 0.11
458 0.11
459 0.1
460 0.14
461 0.14
462 0.14
463 0.16
464 0.15
465 0.14
466 0.15
467 0.18
468 0.15
469 0.17
470 0.18
471 0.17
472 0.18
473 0.19
474 0.17
475 0.14
476 0.13
477 0.11
478 0.14
479 0.16
480 0.17
481 0.2
482 0.25
483 0.27
484 0.35
485 0.39
486 0.43
487 0.5
488 0.55
489 0.57
490 0.6
491 0.61
492 0.56
493 0.56
494 0.54
495 0.49
496 0.44
497 0.4
498 0.35
499 0.36
500 0.34
501 0.32
502 0.28
503 0.29
504 0.35
505 0.39
506 0.38
507 0.37
508 0.4
509 0.4
510 0.37
511 0.38
512 0.34
513 0.31
514 0.3
515 0.26
516 0.24
517 0.24
518 0.24
519 0.2
520 0.2
521 0.19
522 0.19
523 0.21
524 0.21
525 0.2
526 0.2
527 0.18
528 0.14
529 0.13
530 0.11
531 0.1
532 0.09
533 0.09
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.08
540 0.12
541 0.13
542 0.13
543 0.15
544 0.17
545 0.15
546 0.19
547 0.19
548 0.16
549 0.18
550 0.22
551 0.24
552 0.28
553 0.35
554 0.4
555 0.4
556 0.47
557 0.48
558 0.48
559 0.48
560 0.48
561 0.44
562 0.43
563 0.51
564 0.5
565 0.51
566 0.48
567 0.45
568 0.4
569 0.38
570 0.34
571 0.26
572 0.22
573 0.18
574 0.17
575 0.16
576 0.16
577 0.15
578 0.14
579 0.17
580 0.17
581 0.24
582 0.3
583 0.3
584 0.31
585 0.32
586 0.3
587 0.28
588 0.27
589 0.22
590 0.21
591 0.26
592 0.27
593 0.27
594 0.28
595 0.26
596 0.27
597 0.26
598 0.23
599 0.19
600 0.22
601 0.27
602 0.29
603 0.36
604 0.33
605 0.35
606 0.34
607 0.33
608 0.3
609 0.28
610 0.28
611 0.24
612 0.24
613 0.21
614 0.22
615 0.27
616 0.29
617 0.26
618 0.23
619 0.2
620 0.2
621 0.21
622 0.21
623 0.24
624 0.22
625 0.28
626 0.3
627 0.31
628 0.32
629 0.32
630 0.29
631 0.22
632 0.2
633 0.14
634 0.14
635 0.13
636 0.12
637 0.11
638 0.12
639 0.11
640 0.1
641 0.09
642 0.07
643 0.07
644 0.06
645 0.07
646 0.07
647 0.08
648 0.08
649 0.08
650 0.08
651 0.07
652 0.07
653 0.07
654 0.05
655 0.04
656 0.04
657 0.04
658 0.04
659 0.04
660 0.04
661 0.05
662 0.08
663 0.1
664 0.12
665 0.14
666 0.18
667 0.27
668 0.36
669 0.43
670 0.44
671 0.52
672 0.6
673 0.69
674 0.68
675 0.62
676 0.62
677 0.67
678 0.69
679 0.66
680 0.64
681 0.57
682 0.64
683 0.73
684 0.74
685 0.71
686 0.67
687 0.68
688 0.71
689 0.75
690 0.71
691 0.69
692 0.7
693 0.71
694 0.8
695 0.83
696 0.83
697 0.84
698 0.85
699 0.87
700 0.83
701 0.79
702 0.69
703 0.59
704 0.49
705 0.43
706 0.34
707 0.24
708 0.17
709 0.11
710 0.11
711 0.1
712 0.09
713 0.08
714 0.08
715 0.08
716 0.08
717 0.1
718 0.08
719 0.1
720 0.11
721 0.15
722 0.2
723 0.23
724 0.23
725 0.22
726 0.23
727 0.23
728 0.23
729 0.21
730 0.18
731 0.14
732 0.18
733 0.19
734 0.19
735 0.18
736 0.17
737 0.16
738 0.13
739 0.14
740 0.11
741 0.13
742 0.13
743 0.12
744 0.15
745 0.16
746 0.17
747 0.17
748 0.21