Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DGA3

Protein Details
Accession B0DGA3    Localization Confidence Low Confidence Score 6.1
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
39-58NNSHHRQPQKYPQSLRQDIHHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) cysk 15, cyto 9, nucl 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR016024  ARM-type_fold  
IPR000547  Clathrin_H-chain/VPS_repeat  
IPR011990  TPR-like_helical_dom_sf  
IPR016528  VPS11  
IPR024763  VPS11_C  
IPR036322  WD40_repeat_dom_sf  
IPR001841  Znf_RING  
Gene Ontology GO:0046872  F:metal ion binding  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0016192  P:vesicle-mediated transport  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_251110  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00637  Clathrin  
PF12451  VPS11_C  
PF17122  zf-C3H2C3  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50236  CHCR  
PS50089  ZF_RING_2  
CDD cd16688  RING-H2_Vps11  
Amino Acid Sequences WRQFSFFDVVPVKDVHDLDSPPYIFKVRASSSLRITTLNNSHHRQPQKYPQSLRQDIHGSIHLLNRDFESTNSWVAHVSGRVTHMVERQGVLVTLGEEDNVKSPLLKIWDMQNTDKKTGSPHLLRSTKVQLSNRPHPVTTIALSASLSHLAIGLGDGTVLLYRHLDQSLASSTSLTSLPKPRTVHESPTEPITGLGFREPTEDIVNAYLFVVTTNRVLSYQASGRGSGGSATVVDEVGSGLGCATMDWRKRDIVVARDEAIYICGIDGRGACYAYEGHKSSVHTHQNYLVIVSPPFFPTATAASATVRNFVARSANPGETDITKVNVFDLENKLVAYSGTFKQGVKEVISQWGEIYVLATDGTLTCLEEKSTADKLDMLYRKSLYLLALNMAKTQNLDVASVSDIHKQYGDHLYGKGDYDGAMQQFVQTIGHLQPSYVIRKFLDAQRIHNLVTYLQELHSLGLANSDHTTLLLNTYTKLKDVSRLDTFIKTESRRGDDSDELPFDLETAIRVCRQAGYFEHAGYLAKKYQRHEDYLRIQIEDAGNYKDALVYLRKLGSEAAESNLARYGRAMLNSLPEETTQLLIDLCTSTGPLISEPEEITPKSPAAAAAPSGPSYLSYLALNRNSPLGSVLGGVSISGTITPPPTTTDNIPPSKSNTPFAPPPKSPSPTPHHRLSPKLYFPHFVDNVDQFLVFLETVAVRRWNQSVDPTPPTPGMVGVLGGVEPPDASDEVGVEMDRRDQVAVWNTLLELYLTLPLPGGARKEAMRVLRSGKIPYEPMHALILCSTHSFTDGLVLLYEKMGMYEDVLRFWMDKHNQASSPGASAKVVEHLMHYGNQHPHLYPLVLRFLTSTPELLREHQEDVRGILEYIDQEEMMSPLSVVQVLSRNGVASVGLVKEWLVGRIKEARGIIQSDQELITSYRTETTTKLKQVEALSDPDNAHVFHVTRCSACHAQLDLPSVHFMCDHSYHQRCIAEHETECPNCAQEHGVIREIRRNNERLADQHDVFLSEVKEGGFEAVAGAFGRGLMNMGRVEEVV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.28
2 0.24
3 0.25
4 0.25
5 0.25
6 0.32
7 0.3
8 0.27
9 0.29
10 0.27
11 0.23
12 0.24
13 0.29
14 0.25
15 0.34
16 0.39
17 0.41
18 0.46
19 0.51
20 0.5
21 0.44
22 0.43
23 0.42
24 0.44
25 0.48
26 0.49
27 0.48
28 0.54
29 0.6
30 0.67
31 0.65
32 0.66
33 0.69
34 0.72
35 0.77
36 0.77
37 0.78
38 0.8
39 0.82
40 0.74
41 0.69
42 0.64
43 0.56
44 0.52
45 0.46
46 0.38
47 0.33
48 0.36
49 0.33
50 0.29
51 0.28
52 0.26
53 0.26
54 0.24
55 0.22
56 0.24
57 0.23
58 0.25
59 0.25
60 0.23
61 0.2
62 0.21
63 0.23
64 0.19
65 0.18
66 0.16
67 0.18
68 0.2
69 0.21
70 0.23
71 0.24
72 0.27
73 0.27
74 0.25
75 0.24
76 0.23
77 0.21
78 0.18
79 0.14
80 0.11
81 0.1
82 0.1
83 0.09
84 0.09
85 0.09
86 0.11
87 0.12
88 0.11
89 0.1
90 0.11
91 0.15
92 0.19
93 0.2
94 0.19
95 0.26
96 0.34
97 0.37
98 0.44
99 0.48
100 0.49
101 0.51
102 0.5
103 0.43
104 0.41
105 0.43
106 0.45
107 0.42
108 0.45
109 0.52
110 0.54
111 0.55
112 0.55
113 0.57
114 0.54
115 0.56
116 0.53
117 0.53
118 0.58
119 0.67
120 0.7
121 0.66
122 0.59
123 0.54
124 0.51
125 0.46
126 0.38
127 0.31
128 0.22
129 0.19
130 0.19
131 0.17
132 0.15
133 0.13
134 0.11
135 0.08
136 0.08
137 0.07
138 0.07
139 0.06
140 0.05
141 0.04
142 0.04
143 0.04
144 0.04
145 0.05
146 0.05
147 0.05
148 0.06
149 0.08
150 0.1
151 0.1
152 0.1
153 0.1
154 0.13
155 0.16
156 0.17
157 0.16
158 0.14
159 0.13
160 0.15
161 0.16
162 0.14
163 0.16
164 0.22
165 0.25
166 0.32
167 0.34
168 0.34
169 0.42
170 0.44
171 0.48
172 0.46
173 0.47
174 0.42
175 0.44
176 0.42
177 0.34
178 0.3
179 0.23
180 0.18
181 0.14
182 0.15
183 0.12
184 0.12
185 0.14
186 0.14
187 0.15
188 0.16
189 0.15
190 0.14
191 0.15
192 0.15
193 0.12
194 0.12
195 0.1
196 0.07
197 0.07
198 0.07
199 0.07
200 0.08
201 0.08
202 0.09
203 0.09
204 0.1
205 0.11
206 0.14
207 0.17
208 0.21
209 0.21
210 0.21
211 0.21
212 0.21
213 0.2
214 0.16
215 0.13
216 0.08
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.05
225 0.05
226 0.04
227 0.03
228 0.03
229 0.03
230 0.03
231 0.06
232 0.12
233 0.17
234 0.2
235 0.22
236 0.23
237 0.24
238 0.3
239 0.33
240 0.33
241 0.35
242 0.35
243 0.34
244 0.34
245 0.33
246 0.27
247 0.23
248 0.16
249 0.1
250 0.07
251 0.06
252 0.06
253 0.07
254 0.07
255 0.08
256 0.09
257 0.09
258 0.09
259 0.09
260 0.11
261 0.12
262 0.17
263 0.17
264 0.18
265 0.21
266 0.23
267 0.26
268 0.34
269 0.4
270 0.36
271 0.36
272 0.38
273 0.38
274 0.36
275 0.33
276 0.26
277 0.19
278 0.17
279 0.17
280 0.14
281 0.12
282 0.13
283 0.12
284 0.1
285 0.1
286 0.12
287 0.12
288 0.12
289 0.12
290 0.12
291 0.16
292 0.16
293 0.16
294 0.14
295 0.13
296 0.12
297 0.13
298 0.16
299 0.13
300 0.19
301 0.21
302 0.22
303 0.22
304 0.23
305 0.24
306 0.2
307 0.22
308 0.17
309 0.15
310 0.14
311 0.13
312 0.13
313 0.13
314 0.12
315 0.13
316 0.16
317 0.16
318 0.16
319 0.16
320 0.16
321 0.14
322 0.14
323 0.1
324 0.11
325 0.1
326 0.13
327 0.15
328 0.15
329 0.16
330 0.19
331 0.2
332 0.19
333 0.2
334 0.18
335 0.24
336 0.24
337 0.23
338 0.19
339 0.18
340 0.16
341 0.13
342 0.12
343 0.05
344 0.05
345 0.04
346 0.04
347 0.04
348 0.04
349 0.05
350 0.05
351 0.05
352 0.06
353 0.06
354 0.07
355 0.08
356 0.08
357 0.11
358 0.14
359 0.14
360 0.13
361 0.14
362 0.15
363 0.22
364 0.24
365 0.22
366 0.22
367 0.22
368 0.22
369 0.22
370 0.22
371 0.15
372 0.13
373 0.12
374 0.12
375 0.13
376 0.13
377 0.15
378 0.14
379 0.13
380 0.12
381 0.11
382 0.12
383 0.1
384 0.1
385 0.08
386 0.09
387 0.09
388 0.11
389 0.11
390 0.14
391 0.14
392 0.13
393 0.14
394 0.13
395 0.16
396 0.19
397 0.2
398 0.17
399 0.17
400 0.18
401 0.18
402 0.18
403 0.16
404 0.11
405 0.09
406 0.09
407 0.1
408 0.09
409 0.09
410 0.08
411 0.08
412 0.08
413 0.08
414 0.07
415 0.05
416 0.06
417 0.07
418 0.09
419 0.09
420 0.08
421 0.11
422 0.14
423 0.19
424 0.18
425 0.19
426 0.16
427 0.19
428 0.22
429 0.22
430 0.29
431 0.25
432 0.28
433 0.33
434 0.35
435 0.32
436 0.31
437 0.28
438 0.19
439 0.19
440 0.16
441 0.11
442 0.09
443 0.1
444 0.09
445 0.09
446 0.09
447 0.07
448 0.06
449 0.07
450 0.07
451 0.07
452 0.07
453 0.08
454 0.07
455 0.07
456 0.07
457 0.05
458 0.06
459 0.07
460 0.07
461 0.07
462 0.1
463 0.11
464 0.1
465 0.12
466 0.12
467 0.17
468 0.2
469 0.24
470 0.23
471 0.25
472 0.27
473 0.26
474 0.27
475 0.22
476 0.25
477 0.21
478 0.23
479 0.23
480 0.25
481 0.24
482 0.25
483 0.26
484 0.24
485 0.24
486 0.23
487 0.21
488 0.17
489 0.16
490 0.14
491 0.11
492 0.09
493 0.07
494 0.04
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.06
499 0.07
500 0.08
501 0.09
502 0.1
503 0.1
504 0.14
505 0.15
506 0.14
507 0.15
508 0.13
509 0.13
510 0.12
511 0.12
512 0.11
513 0.14
514 0.17
515 0.18
516 0.27
517 0.29
518 0.34
519 0.35
520 0.39
521 0.41
522 0.45
523 0.44
524 0.36
525 0.33
526 0.3
527 0.27
528 0.21
529 0.17
530 0.11
531 0.1
532 0.1
533 0.1
534 0.08
535 0.08
536 0.08
537 0.08
538 0.08
539 0.09
540 0.1
541 0.1
542 0.1
543 0.1
544 0.09
545 0.1
546 0.1
547 0.09
548 0.12
549 0.12
550 0.12
551 0.14
552 0.13
553 0.12
554 0.11
555 0.13
556 0.11
557 0.12
558 0.13
559 0.1
560 0.14
561 0.14
562 0.15
563 0.12
564 0.11
565 0.12
566 0.11
567 0.11
568 0.07
569 0.07
570 0.06
571 0.06
572 0.06
573 0.05
574 0.05
575 0.04
576 0.04
577 0.04
578 0.04
579 0.05
580 0.05
581 0.06
582 0.07
583 0.08
584 0.08
585 0.09
586 0.11
587 0.11
588 0.12
589 0.11
590 0.1
591 0.1
592 0.1
593 0.08
594 0.08
595 0.08
596 0.08
597 0.08
598 0.09
599 0.09
600 0.09
601 0.09
602 0.08
603 0.08
604 0.09
605 0.08
606 0.07
607 0.09
608 0.13
609 0.15
610 0.15
611 0.14
612 0.14
613 0.13
614 0.13
615 0.12
616 0.09
617 0.07
618 0.07
619 0.07
620 0.06
621 0.06
622 0.05
623 0.04
624 0.04
625 0.03
626 0.03
627 0.03
628 0.04
629 0.05
630 0.05
631 0.06
632 0.09
633 0.11
634 0.13
635 0.16
636 0.23
637 0.29
638 0.32
639 0.33
640 0.32
641 0.35
642 0.4
643 0.39
644 0.34
645 0.29
646 0.3
647 0.35
648 0.4
649 0.42
650 0.36
651 0.41
652 0.45
653 0.47
654 0.44
655 0.45
656 0.47
657 0.5
658 0.54
659 0.53
660 0.54
661 0.55
662 0.59
663 0.58
664 0.58
665 0.55
666 0.56
667 0.52
668 0.47
669 0.45
670 0.47
671 0.41
672 0.34
673 0.31
674 0.26
675 0.25
676 0.22
677 0.2
678 0.12
679 0.11
680 0.11
681 0.07
682 0.06
683 0.05
684 0.05
685 0.06
686 0.08
687 0.1
688 0.1
689 0.12
690 0.13
691 0.14
692 0.15
693 0.2
694 0.25
695 0.28
696 0.32
697 0.31
698 0.32
699 0.3
700 0.3
701 0.24
702 0.18
703 0.14
704 0.09
705 0.08
706 0.06
707 0.06
708 0.05
709 0.05
710 0.04
711 0.03
712 0.03
713 0.03
714 0.04
715 0.05
716 0.05
717 0.05
718 0.05
719 0.06
720 0.06
721 0.06
722 0.06
723 0.06
724 0.08
725 0.08
726 0.08
727 0.08
728 0.08
729 0.12
730 0.18
731 0.19
732 0.18
733 0.17
734 0.17
735 0.17
736 0.16
737 0.12
738 0.06
739 0.05
740 0.07
741 0.07
742 0.07
743 0.07
744 0.07
745 0.08
746 0.09
747 0.1
748 0.09
749 0.11
750 0.12
751 0.15
752 0.18
753 0.22
754 0.22
755 0.23
756 0.26
757 0.3
758 0.32
759 0.31
760 0.29
761 0.28
762 0.29
763 0.28
764 0.3
765 0.25
766 0.25
767 0.25
768 0.23
769 0.2
770 0.18
771 0.17
772 0.11
773 0.12
774 0.11
775 0.08
776 0.09
777 0.09
778 0.08
779 0.11
780 0.11
781 0.1
782 0.1
783 0.1
784 0.09
785 0.09
786 0.1
787 0.06
788 0.06
789 0.06
790 0.06
791 0.07
792 0.12
793 0.12
794 0.13
795 0.14
796 0.14
797 0.13
798 0.14
799 0.22
800 0.2
801 0.26
802 0.29
803 0.32
804 0.33
805 0.35
806 0.37
807 0.29
808 0.3
809 0.24
810 0.22
811 0.17
812 0.17
813 0.15
814 0.15
815 0.16
816 0.12
817 0.12
818 0.13
819 0.15
820 0.16
821 0.17
822 0.2
823 0.23
824 0.26
825 0.27
826 0.25
827 0.26
828 0.25
829 0.25
830 0.21
831 0.2
832 0.23
833 0.21
834 0.21
835 0.2
836 0.19
837 0.21
838 0.2
839 0.19
840 0.14
841 0.18
842 0.2
843 0.21
844 0.25
845 0.25
846 0.28
847 0.28
848 0.3
849 0.26
850 0.26
851 0.25
852 0.2
853 0.17
854 0.14
855 0.13
856 0.1
857 0.12
858 0.11
859 0.09
860 0.09
861 0.09
862 0.09
863 0.09
864 0.08
865 0.06
866 0.06
867 0.07
868 0.07
869 0.07
870 0.08
871 0.13
872 0.14
873 0.15
874 0.15
875 0.15
876 0.14
877 0.15
878 0.12
879 0.08
880 0.09
881 0.08
882 0.08
883 0.08
884 0.08
885 0.1
886 0.11
887 0.14
888 0.16
889 0.15
890 0.19
891 0.27
892 0.28
893 0.29
894 0.3
895 0.29
896 0.29
897 0.32
898 0.3
899 0.27
900 0.27
901 0.24
902 0.24
903 0.2
904 0.19
905 0.16
906 0.17
907 0.13
908 0.13
909 0.15
910 0.16
911 0.17
912 0.19
913 0.26
914 0.33
915 0.38
916 0.41
917 0.38
918 0.42
919 0.43
920 0.46
921 0.4
922 0.36
923 0.31
924 0.32
925 0.31
926 0.28
927 0.27
928 0.22
929 0.2
930 0.18
931 0.18
932 0.16
933 0.21
934 0.21
935 0.2
936 0.21
937 0.27
938 0.27
939 0.28
940 0.31
941 0.29
942 0.3
943 0.33
944 0.36
945 0.3
946 0.28
947 0.29
948 0.25
949 0.23
950 0.19
951 0.17
952 0.17
953 0.19
954 0.23
955 0.3
956 0.34
957 0.36
958 0.41
959 0.45
960 0.4
961 0.44
962 0.45
963 0.42
964 0.38
965 0.41
966 0.43
967 0.4
968 0.41
969 0.34
970 0.3
971 0.24
972 0.24
973 0.22
974 0.19
975 0.26
976 0.28
977 0.33
978 0.34
979 0.36
980 0.44
981 0.47
982 0.5
983 0.5
984 0.5
985 0.48
986 0.53
987 0.55
988 0.51
989 0.53
990 0.53
991 0.46
992 0.45
993 0.41
994 0.35
995 0.31
996 0.3
997 0.23
998 0.16
999 0.16
1000 0.13
1001 0.13
1002 0.12
1003 0.12
1004 0.09
1005 0.08
1006 0.08
1007 0.07
1008 0.07
1009 0.07
1010 0.07
1011 0.06
1012 0.06
1013 0.07
1014 0.06
1015 0.07
1016 0.07
1017 0.1
1018 0.11
1019 0.12