FuNGI

M3DBI6

Protein Details

Accession

M3DBI6

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
49-70	ERLARLNKKRPRSISPPPVRES	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
52-74	ARLNKKRPRSISPPPVRESRKAP

Subcellular Location(s)

nucl 15, cyto 5, mito 3, pero 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR010347 Tdp1
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0008081 F:phosphoric diester hydrolase activity GO:0006281 P:DNA repair
Pfam	View protein in Pfam PF06087 Tyr-DNA_phospho
CDD	cd09122 PLDc_Tdp1_1

Amino Acid Sequences

MADHETDDEELNAAIAMSLSSQQRDSPPTIRPPPLSGLLGLDRKTMEAERLARLNKKRPRSISPPPVRESRKAPKLETTSIDLAGGARLNMLSTAVQQRGQAEKPAAAQAANHRMKTELLSASASSMSSVPTSATGGLQYPRGVIKKTWAFGHERSGNEIKIEEVLEPLSVRTAVLSAFQWDTQWILSKLRTPLNGGKTKCIFVMQAKEQKDRDQWREDASDMRHFLRLCFPNMSGLINCMHSKLMLLFHADKLRIAIPTANLLNFDWGETGQMENTVFLIDLPRLPQGQKNDLTSFGRELMFFIEMQGLDQDVRDGVLNFDFSATADIAFVHTVGGVHYKDQAARTGLLGLSRTVRQMDLVAGPSLEIDFAASSIGALTDKQLNDFHMAARGVDLLAHAREARSKAGASFFKKAGSKTVTATTNVRKKIRVYFPTKETVRSSTAGAAGTICLQREYYERNSFPKECFRDYRSTRKGLLSHNKILCARGFRSTASEHADPPGVSVAATGSPNSNPVAWVYVGSSNMSKSAWGELAAERTESKITCRNWECGVILSVPVETLPSSAGEAAFKQRDANGDSETETEDETSAQTSTPEFVNIEAFRRIIDLPFSIPGEEYKSQEPWYFKEQM

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.06
2	0.05
3	0.05
4	0.05
5	0.09
6	0.11
7	0.13
8	0.14
9	0.17
10	0.21
11	0.26
12	0.31
13	0.32
14	0.37
15	0.45
16	0.52
17	0.56
18	0.55
19	0.54
20	0.54
21	0.54
22	0.48
23	0.39
24	0.35
25	0.35
26	0.37
27	0.33
28	0.3
29	0.26
30	0.25
31	0.27
32	0.24
33	0.2
34	0.22
35	0.25
36	0.28
37	0.34
38	0.38
39	0.44
40	0.51
41	0.58
42	0.6
43	0.66
44	0.71
45	0.72
46	0.76
47	0.77
48	0.8
49	0.81
50	0.83
51	0.81
52	0.77
53	0.79
54	0.76
55	0.73
56	0.71
57	0.7
58	0.69
59	0.66
60	0.64
61	0.64
62	0.65
63	0.65
64	0.59
65	0.54
66	0.48
67	0.43
68	0.39
69	0.3
70	0.23
71	0.19
72	0.16
73	0.1
74	0.07
75	0.07
76	0.07
77	0.07
78	0.08
79	0.07
80	0.1
81	0.15
82	0.17
83	0.18
84	0.19
85	0.23
86	0.27
87	0.29
88	0.3
89	0.26
90	0.26
91	0.27
92	0.29
93	0.26
94	0.21
95	0.21
96	0.24
97	0.33
98	0.35
99	0.33
100	0.31
101	0.31
102	0.32
103	0.32
104	0.3
105	0.21
106	0.18
107	0.2
108	0.19
109	0.19
110	0.19
111	0.16
112	0.11
113	0.1
114	0.09
115	0.08
116	0.08
117	0.07
118	0.07
119	0.09
120	0.08
121	0.08
122	0.08
123	0.1
124	0.11
125	0.13
126	0.12
127	0.13
128	0.16
129	0.18
130	0.2
131	0.18
132	0.26
133	0.3
134	0.32
135	0.33
136	0.32
137	0.36
138	0.35
139	0.44
140	0.41
141	0.36
142	0.4
143	0.41
144	0.38
145	0.33
146	0.31
147	0.22
148	0.18
149	0.18
150	0.12
151	0.09
152	0.09
153	0.09
154	0.09
155	0.08
156	0.07
157	0.07
158	0.06
159	0.05
160	0.06
161	0.05
162	0.07
163	0.07
164	0.09
165	0.1
166	0.1
167	0.1
168	0.1
169	0.1
170	0.1
171	0.14
172	0.13
173	0.14
174	0.15
175	0.2
176	0.24
177	0.27
178	0.27
179	0.28
180	0.34
181	0.4
182	0.46
183	0.42
184	0.45
185	0.44
186	0.43
187	0.39
188	0.33
189	0.26
190	0.23
191	0.29
192	0.3
193	0.35
194	0.38
195	0.43
196	0.43
197	0.45
198	0.5
199	0.5
200	0.49
201	0.48
202	0.46
203	0.45
204	0.45
205	0.42
206	0.39
207	0.34
208	0.33
209	0.29
210	0.29
211	0.28
212	0.26
213	0.26
214	0.29
215	0.29
216	0.26
217	0.26
218	0.25
219	0.25
220	0.26
221	0.26
222	0.17
223	0.16
224	0.14
225	0.14
226	0.14
227	0.11
228	0.11
229	0.09
230	0.1
231	0.09
232	0.1
233	0.08
234	0.12
235	0.12
236	0.15
237	0.18
238	0.17
239	0.16
240	0.16
241	0.17
242	0.13
243	0.13
244	0.12
245	0.09
246	0.13
247	0.13
248	0.12
249	0.11
250	0.11
251	0.12
252	0.1
253	0.1
254	0.07
255	0.06
256	0.07
257	0.06
258	0.07
259	0.05
260	0.06
261	0.06
262	0.05
263	0.06
264	0.05
265	0.04
266	0.04
267	0.05
268	0.05
269	0.05
270	0.06
271	0.07
272	0.08
273	0.09
274	0.12
275	0.16
276	0.21
277	0.23
278	0.26
279	0.25
280	0.27
281	0.28
282	0.26
283	0.23
284	0.18
285	0.16
286	0.13
287	0.12
288	0.11
289	0.1
290	0.09
291	0.08
292	0.07
293	0.07
294	0.07
295	0.06
296	0.06
297	0.05
298	0.05
299	0.05
300	0.03
301	0.04
302	0.04
303	0.04
304	0.04
305	0.05
306	0.05
307	0.05
308	0.05
309	0.05
310	0.05
311	0.06
312	0.05
313	0.05
314	0.05
315	0.05
316	0.05
317	0.05
318	0.05
319	0.04
320	0.04
321	0.03
322	0.04
323	0.06
324	0.06
325	0.07
326	0.08
327	0.09
328	0.1
329	0.11
330	0.13
331	0.12
332	0.12
333	0.12
334	0.12
335	0.11
336	0.11
337	0.11
338	0.09
339	0.09
340	0.1
341	0.1
342	0.1
343	0.09
344	0.09
345	0.09
346	0.1
347	0.09
348	0.1
349	0.09
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.06
355	0.04
356	0.03
357	0.03
358	0.03
359	0.03
360	0.03
361	0.03
362	0.03
363	0.03
364	0.03
365	0.03
366	0.04
367	0.08
368	0.09
369	0.1
370	0.11
371	0.12
372	0.15
373	0.15
374	0.14
375	0.14
376	0.14
377	0.13
378	0.12
379	0.11
380	0.09
381	0.08
382	0.08
383	0.06
384	0.06
385	0.07
386	0.07
387	0.07
388	0.1
389	0.11
390	0.12
391	0.12
392	0.13
393	0.13
394	0.2
395	0.25
396	0.26
397	0.29
398	0.28
399	0.31
400	0.32
401	0.32
402	0.32
403	0.3
404	0.28
405	0.26
406	0.31
407	0.29
408	0.29
409	0.33
410	0.35
411	0.38
412	0.43
413	0.43
414	0.4
415	0.41
416	0.49
417	0.53
418	0.54
419	0.55
420	0.55
421	0.57
422	0.64
423	0.62
424	0.56
425	0.5
426	0.45
427	0.4
428	0.34
429	0.31
430	0.24
431	0.25
432	0.21
433	0.18
434	0.14
435	0.11
436	0.12
437	0.12
438	0.1
439	0.09
440	0.09
441	0.1
442	0.12
443	0.18
444	0.22
445	0.29
446	0.31
447	0.36
448	0.43
449	0.44
450	0.45
451	0.49
452	0.47
453	0.45
454	0.49
455	0.49
456	0.53
457	0.56
458	0.64
459	0.61
460	0.61
461	0.58
462	0.58
463	0.58
464	0.57
465	0.62
466	0.59
467	0.61
468	0.58
469	0.59
470	0.54
471	0.52
472	0.45
473	0.4
474	0.34
475	0.3
476	0.29
477	0.26
478	0.29
479	0.28
480	0.29
481	0.3
482	0.3
483	0.25
484	0.26
485	0.27
486	0.23
487	0.22
488	0.2
489	0.14
490	0.12
491	0.11
492	0.1
493	0.1
494	0.1
495	0.1
496	0.1
497	0.1
498	0.12
499	0.12
500	0.12
501	0.1
502	0.11
503	0.13
504	0.11
505	0.12
506	0.12
507	0.14
508	0.14
509	0.15
510	0.15
511	0.13
512	0.14
513	0.13
514	0.12
515	0.1
516	0.13
517	0.12
518	0.12
519	0.14
520	0.14
521	0.18
522	0.18
523	0.18
524	0.16
525	0.16
526	0.18
527	0.17
528	0.19
529	0.23
530	0.25
531	0.34
532	0.38
533	0.4
534	0.4
535	0.43
536	0.39
537	0.35
538	0.35
539	0.25
540	0.22
541	0.19
542	0.16
543	0.12
544	0.11
545	0.09
546	0.07
547	0.07
548	0.07
549	0.07
550	0.08
551	0.09
552	0.09
553	0.1
554	0.11
555	0.19
556	0.2
557	0.2
558	0.21
559	0.22
560	0.26
561	0.28
562	0.29
563	0.24
564	0.23
565	0.24
566	0.23
567	0.23
568	0.19
569	0.17
570	0.15
571	0.13
572	0.12
573	0.11
574	0.11
575	0.1
576	0.09
577	0.09
578	0.09
579	0.11
580	0.11
581	0.12
582	0.11
583	0.12
584	0.18
585	0.19
586	0.22
587	0.22
588	0.22
589	0.2
590	0.22
591	0.22
592	0.18
593	0.19
594	0.18
595	0.18
596	0.21
597	0.22
598	0.2
599	0.2
600	0.2
601	0.24
602	0.25
603	0.25
604	0.26
605	0.28
606	0.31
607	0.36
608	0.38
609	0.36

M3DBI6

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer