FuNGI

M3DB68

Protein Details

Accession

M3DB68

Localization Confidence

Medium

Confidence Score

13.7

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
120-147	SANGSVRSRRRSRSPRNEGRRGHRSRDR	Basic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
126-146	RSRRRSRSPRNEGRRGHRSRD
172-201	PGGDRDRRAGRSRSPLRPRGGRDDRDRRGR

Subcellular Location(s)

nucl 15.5, cyto_nucl 15, cyto 11.5

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR012677 Nucleotide-bd_a/b_plait_sf IPR035979 RBD_domain_sf IPR029123 RBM39_linker IPR006509 RBM39_SF IPR000504 RRM_dom
Gene Ontology	GO:0005634 C:nucleus GO:0003723 F:RNA binding GO:0006397 P:mRNA processing
Pfam	View protein in Pfam PF15519 RBM39linker PF00076 RRM_1
PROSITE	View protein in PROSITE PS50102 RRM
CDD	cd12283 RRM1_RBM39_like cd12284 RRM2_RBM23_RBM39 cd12285 RRM3_RBM39_like

Amino Acid Sequences

MANPPTDNGYLDIADLLESEELKAKEKIAQQKAEANGNANADHHMGGTSPDVAPSPANSLDLPFRPSSRHTDSGLQRRSDADRDFMSSGRYLTHRELEDERRTRRYGRCIVTDDESDKHSANGSVRSRRRSRSPRNEGRRGHRSRDRADDHYYIQRDSRGRGPRFENDSYRPGGDRDRRAGRSRSPLRPRGGRDDRDRRGRDYHGSQSDRRHSYRGGDGGNKRKTPEPTDDERDRRTVFVQQLAARLRSRELRDFFEQVGPVVDAQIVKDRVSGRSKGVGYVEFKDEESVQKAIGLTGQKLLGIPIIAQLTEAEKNRQARTTEGTATQSNGVPFHRLYVGNIHFSITEADLKNVFEPFGELEFAQLQKEENGRSKGYGFVQFIDPAQAKEALEKMNGFELAGRPIRVGLGNDKFTTESTQTLLVKFGSHTPSAQKGSQFSGLGGRGAHAGGTGNFDRPAAARDVDKTGGASALDDTDVGGVDFHNYSREKLMKQLARTDEPEQKIAPKTQVKKPATFEQPSASRCVLIKNMYNQNEESEPGWQKELKDDVKSECEEKYGKVVHIDLALDNNDGEVYVKFDRVQGGENAFKGLNGRWFAGRMITAQYVVDAVYTMNFPKAANV

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.11
2	0.1
3	0.09
4	0.08
5	0.08
6	0.08
7	0.14
8	0.15
9	0.18
10	0.2
11	0.2
12	0.25
13	0.33
14	0.42
15	0.45
16	0.5
17	0.5
18	0.56
19	0.59
20	0.6
21	0.54
22	0.47
23	0.42
24	0.38
25	0.35
26	0.29
27	0.26
28	0.2
29	0.19
30	0.15
31	0.12
32	0.1
33	0.11
34	0.12
35	0.12
36	0.11
37	0.11
38	0.11
39	0.12
40	0.13
41	0.13
42	0.16
43	0.14
44	0.16
45	0.15
46	0.17
47	0.22
48	0.23
49	0.26
50	0.24
51	0.24
52	0.26
53	0.3
54	0.36
55	0.38
56	0.41
57	0.4
58	0.47
59	0.55
60	0.62
61	0.66
62	0.59
63	0.52
64	0.51
65	0.52
66	0.5
67	0.43
68	0.37
69	0.31
70	0.34
71	0.35
72	0.32
73	0.29
74	0.24
75	0.22
76	0.2
77	0.2
78	0.2
79	0.22
80	0.28
81	0.27
82	0.3
83	0.35
84	0.4
85	0.49
86	0.53
87	0.54
88	0.54
89	0.56
90	0.59
91	0.6
92	0.61
93	0.61
94	0.59
95	0.6
96	0.59
97	0.6
98	0.57
99	0.53
100	0.46
101	0.39
102	0.34
103	0.29
104	0.25
105	0.22
106	0.19
107	0.18
108	0.18
109	0.25
110	0.3
111	0.38
112	0.44
113	0.53
114	0.58
115	0.61
116	0.69
117	0.72
118	0.76
119	0.78
120	0.83
121	0.85
122	0.88
123	0.92
124	0.89
125	0.88
126	0.87
127	0.83
128	0.81
129	0.78
130	0.76
131	0.72
132	0.74
133	0.7
134	0.64
135	0.64
136	0.58
137	0.54
138	0.54
139	0.5
140	0.41
141	0.37
142	0.37
143	0.33
144	0.32
145	0.37
146	0.39
147	0.39
148	0.44
149	0.48
150	0.5
151	0.56
152	0.58
153	0.55
154	0.5
155	0.52
156	0.48
157	0.44
158	0.37
159	0.31
160	0.35
161	0.37
162	0.38
163	0.42
164	0.47
165	0.51
166	0.56
167	0.6
168	0.57
169	0.6
170	0.63
171	0.65
172	0.67
173	0.69
174	0.7
175	0.72
176	0.71
177	0.71
178	0.71
179	0.68
180	0.69
181	0.72
182	0.73
183	0.76
184	0.74
185	0.68
186	0.64
187	0.6
188	0.57
189	0.52
190	0.53
191	0.52
192	0.54
193	0.53
194	0.56
195	0.6
196	0.59
197	0.55
198	0.49
199	0.42
200	0.41
201	0.42
202	0.39
203	0.33
204	0.35
205	0.41
206	0.47
207	0.52
208	0.5
209	0.46
210	0.47
211	0.48
212	0.45
213	0.46
214	0.44
215	0.44
216	0.51
217	0.57
218	0.57
219	0.55
220	0.54
221	0.46
222	0.41
223	0.35
224	0.33
225	0.28
226	0.27
227	0.28
228	0.26
229	0.3
230	0.31
231	0.32
232	0.27
233	0.25
234	0.23
235	0.25
236	0.27
237	0.29
238	0.3
239	0.33
240	0.35
241	0.37
242	0.36
243	0.33
244	0.29
245	0.22
246	0.2
247	0.15
248	0.11
249	0.09
250	0.08
251	0.06
252	0.06
253	0.11
254	0.11
255	0.11
256	0.14
257	0.15
258	0.19
259	0.22
260	0.24
261	0.2
262	0.25
263	0.25
264	0.24
265	0.24
266	0.23
267	0.22
268	0.22
269	0.22
270	0.17
271	0.17
272	0.16
273	0.15
274	0.14
275	0.14
276	0.12
277	0.1
278	0.1
279	0.1
280	0.09
281	0.11
282	0.11
283	0.09
284	0.09
285	0.1
286	0.09
287	0.09
288	0.09
289	0.06
290	0.06
291	0.05
292	0.06
293	0.06
294	0.05
295	0.05
296	0.06
297	0.07
298	0.1
299	0.11
300	0.1
301	0.14
302	0.17
303	0.19
304	0.22
305	0.21
306	0.2
307	0.24
308	0.26
309	0.24
310	0.22
311	0.24
312	0.21
313	0.21
314	0.2
315	0.17
316	0.14
317	0.13
318	0.12
319	0.11
320	0.11
321	0.11
322	0.13
323	0.11
324	0.12
325	0.18
326	0.19
327	0.19
328	0.2
329	0.19
330	0.16
331	0.16
332	0.16
333	0.1
334	0.13
335	0.11
336	0.12
337	0.12
338	0.12
339	0.13
340	0.12
341	0.11
342	0.06
343	0.07
344	0.07
345	0.07
346	0.08
347	0.07
348	0.07
349	0.09
350	0.09
351	0.08
352	0.08
353	0.07
354	0.09
355	0.11
356	0.13
357	0.17
358	0.2
359	0.21
360	0.21
361	0.22
362	0.22
363	0.23
364	0.26
365	0.21
366	0.2
367	0.2
368	0.2
369	0.19
370	0.2
371	0.18
372	0.13
373	0.13
374	0.13
375	0.12
376	0.13
377	0.15
378	0.12
379	0.13
380	0.13
381	0.12
382	0.12
383	0.12
384	0.11
385	0.1
386	0.1
387	0.13
388	0.14
389	0.14
390	0.12
391	0.12
392	0.13
393	0.13
394	0.13
395	0.16
396	0.2
397	0.22
398	0.22
399	0.23
400	0.23
401	0.22
402	0.24
403	0.18
404	0.14
405	0.13
406	0.17
407	0.17
408	0.17
409	0.18
410	0.14
411	0.14
412	0.14
413	0.17
414	0.16
415	0.16
416	0.16
417	0.19
418	0.24
419	0.27
420	0.29
421	0.26
422	0.25
423	0.27
424	0.3
425	0.27
426	0.21
427	0.22
428	0.21
429	0.19
430	0.17
431	0.15
432	0.12
433	0.11
434	0.11
435	0.06
436	0.07
437	0.06
438	0.11
439	0.11
440	0.12
441	0.12
442	0.13
443	0.13
444	0.12
445	0.15
446	0.13
447	0.13
448	0.13
449	0.15
450	0.19
451	0.19
452	0.19
453	0.17
454	0.14
455	0.14
456	0.12
457	0.11
458	0.08
459	0.07
460	0.07
461	0.07
462	0.06
463	0.05
464	0.06
465	0.05
466	0.05
467	0.04
468	0.06
469	0.06
470	0.06
471	0.11
472	0.12
473	0.14
474	0.19
475	0.23
476	0.23
477	0.29
478	0.38
479	0.38
480	0.41
481	0.47
482	0.47
483	0.48
484	0.51
485	0.5
486	0.49
487	0.47
488	0.46
489	0.4
490	0.39
491	0.38
492	0.38
493	0.41
494	0.41
495	0.45
496	0.51
497	0.6
498	0.59
499	0.62
500	0.64
501	0.65
502	0.65
503	0.62
504	0.56
505	0.53
506	0.55
507	0.5
508	0.49
509	0.4
510	0.33
511	0.3
512	0.32
513	0.3
514	0.28
515	0.32
516	0.35
517	0.44
518	0.46
519	0.49
520	0.45
521	0.44
522	0.41
523	0.37
524	0.29
525	0.27
526	0.27
527	0.25
528	0.28
529	0.26
530	0.26
531	0.3
532	0.38
533	0.36
534	0.37
535	0.39
536	0.4
537	0.44
538	0.46
539	0.42
540	0.34
541	0.34
542	0.31
543	0.29
544	0.31
545	0.29
546	0.28
547	0.29
548	0.29
549	0.27
550	0.27
551	0.27
552	0.2
553	0.2
554	0.19
555	0.17
556	0.15
557	0.13
558	0.11
559	0.1
560	0.1
561	0.07
562	0.11
563	0.11
564	0.13
565	0.14
566	0.16
567	0.19
568	0.19
569	0.23
570	0.23
571	0.27
572	0.3
573	0.3
574	0.31
575	0.27
576	0.26
577	0.25
578	0.24
579	0.25
580	0.23
581	0.25
582	0.24
583	0.25
584	0.26
585	0.27
586	0.25
587	0.2
588	0.22
589	0.21
590	0.2
591	0.18
592	0.18
593	0.15
594	0.14
595	0.12
596	0.07
597	0.06
598	0.07
599	0.08
600	0.09
601	0.1
602	0.11

M3DB68

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer