Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3DEF1

Protein Details
Accession M3DEF1    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.2
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
177-203DESPEKESTPKTKKSKKAKRKSNSKSSHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
126-138ERQEREKAGAKRK
186-202PKTKKSKKAKRKSNSKS
Subcellular Location(s) nucl 13.5, cyto 11, mito_nucl 8
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR011082  Exosome-assoc_fac/DNA_repair  
IPR007146  Sas10/Utp3/C1D  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003723  F:RNA binding  
GO:0006364  P:rRNA processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF04000  Sas10_Utp3  
Amino Acid Sequences MESIQPQIEDLTTNIDELESALLPIIKTALSSTTSKLPLLDKAKLYVLATYAIESILFSYLRLHGVDAKAHPVFQELTRVKEYFNKIKTAETAGVGSKNKLDTSAAGRFIKHGLSGNEKYDAERKERQEREKAGAKRKLESMSTGTHTRFDGAAKRIKAAEEGGETIVVVKASEVDDESPEKESTPKTKKSKKAKRKSNSKSS
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.14
2 0.13
3 0.12
4 0.11
5 0.13
6 0.07
7 0.07
8 0.07
9 0.08
10 0.08
11 0.08
12 0.08
13 0.06
14 0.06
15 0.07
16 0.09
17 0.11
18 0.12
19 0.15
20 0.2
21 0.22
22 0.22
23 0.23
24 0.22
25 0.27
26 0.31
27 0.33
28 0.29
29 0.29
30 0.31
31 0.31
32 0.29
33 0.22
34 0.18
35 0.15
36 0.14
37 0.12
38 0.11
39 0.09
40 0.08
41 0.07
42 0.07
43 0.07
44 0.06
45 0.06
46 0.07
47 0.08
48 0.1
49 0.1
50 0.1
51 0.12
52 0.13
53 0.16
54 0.15
55 0.19
56 0.18
57 0.18
58 0.17
59 0.15
60 0.15
61 0.13
62 0.22
63 0.18
64 0.22
65 0.25
66 0.25
67 0.24
68 0.29
69 0.34
70 0.32
71 0.34
72 0.33
73 0.31
74 0.32
75 0.33
76 0.3
77 0.25
78 0.18
79 0.17
80 0.14
81 0.16
82 0.16
83 0.15
84 0.13
85 0.12
86 0.12
87 0.11
88 0.1
89 0.08
90 0.13
91 0.16
92 0.19
93 0.19
94 0.19
95 0.19
96 0.2
97 0.19
98 0.14
99 0.14
100 0.12
101 0.18
102 0.2
103 0.21
104 0.23
105 0.23
106 0.23
107 0.26
108 0.26
109 0.25
110 0.29
111 0.34
112 0.41
113 0.47
114 0.52
115 0.55
116 0.56
117 0.57
118 0.6
119 0.61
120 0.61
121 0.62
122 0.58
123 0.52
124 0.53
125 0.49
126 0.41
127 0.37
128 0.31
129 0.28
130 0.3
131 0.3
132 0.27
133 0.25
134 0.24
135 0.22
136 0.2
137 0.18
138 0.21
139 0.22
140 0.29
141 0.28
142 0.3
143 0.29
144 0.29
145 0.29
146 0.23
147 0.22
148 0.17
149 0.18
150 0.16
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.09
156 0.07
157 0.05
158 0.06
159 0.07
160 0.08
161 0.08
162 0.09
163 0.11
164 0.13
165 0.15
166 0.17
167 0.16
168 0.17
169 0.19
170 0.23
171 0.31
172 0.38
173 0.46
174 0.54
175 0.64
176 0.73
177 0.81
178 0.87
179 0.89
180 0.91
181 0.92
182 0.93
183 0.94