Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3DBP8

Protein Details
Accession M3DBP8    Localization Confidence Low Confidence Score 9.5
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
42-64QALPPPPPTKKRRLDEPHVITKDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) nucl 14, mito 8.5, cyto_mito 6, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR021950  Spt20  
IPR046468  Spt20-like_SEP  
Gene Ontology GO:0000124  C:SAGA complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF12090  Spt20  
Amino Acid Sequences MATAAVARPGQALRTRRDNIAPIGDRKRERDRTGGMDNNGGQALPPPPPTKKRRLDEPHVITKDYILRKFAGRPPSLVLHLHTNYFRLGSQEGSWPYDSPMKFLLADIRRERVPDQMLEELLANNVPFYDGCLIVEVHNHRGASTGKSKRNDSATSGTRYSMHNYNSYVTPSPLVEYPKQAQQEAAEKAEAEKARASNDKGKQQQQQDGPNIATLVLFPTELTRHQEMLILAKTPASQMPRRKMGTDEPTTPQLSLPPTPMAATAGRATPEDNKMCLEPEDLYDFQAEVLLATQPPLLLDTVDGPEAAQKLLESLAHPLHQAAPPSPKTRKRTTAELAADDEKAAEAERRMLVMDERIKVGGSAGATENAGTAAAAFSRFKTLQVVREKLEQQAREKEEQDKQAQKQKDEAAATAARQQKAAQELAEANAAAMKQRQQQAMLRQRQQQQAQAQQQAYQQQQAAHAHPQQNLMAQQQQAMHAAAIAQASPVVRQQTPMMNSSPMMNGNGFTMQPTTTTQGAGSPPRPTSATVPNANTAMQRQVSQQQHASRNATPQMPQATPNMGGLPNRQMSQTPRMPQASPAPGTPASNGMGGLPMQLPAGMSQEQYQMLRAQQMANQQNAMAMQSGSPGQHNLTAEQISNIAQQRAQAHFNHQMTIARNANNPAMAQAIQQRQAAMIRQQNLVQQQRMQMAQNGQSQSPHASMQGTPQMNHAHPQQSDGTQMQMTPQQLQQRQLMQQQQIRQATATLTQLQQQYGSINAIPQQILQSLPPTAQMMVRNHHQKQNAARAQQMAARAQQAQQHGQPVAGSSGGDPEYMQTLRAHQEMLRQQTAAAAAAAQGNGGMAGNMGMNMGMNNQQQQQQQQQQQQQFNNQQGGGGGGGGGNVDPLNHHLQAMHRALQQPPSNSQNGQM
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.44
2 0.47
3 0.49
4 0.54
5 0.54
6 0.52
7 0.56
8 0.56
9 0.55
10 0.6
11 0.63
12 0.62
13 0.64
14 0.69
15 0.69
16 0.67
17 0.67
18 0.65
19 0.64
20 0.69
21 0.69
22 0.61
23 0.58
24 0.54
25 0.47
26 0.41
27 0.33
28 0.24
29 0.2
30 0.2
31 0.17
32 0.22
33 0.25
34 0.32
35 0.42
36 0.51
37 0.58
38 0.66
39 0.69
40 0.75
41 0.8
42 0.82
43 0.83
44 0.84
45 0.84
46 0.77
47 0.71
48 0.6
49 0.54
50 0.53
51 0.49
52 0.44
53 0.35
54 0.35
55 0.36
56 0.44
57 0.46
58 0.48
59 0.42
60 0.42
61 0.44
62 0.46
63 0.46
64 0.4
65 0.36
66 0.35
67 0.35
68 0.36
69 0.32
70 0.29
71 0.27
72 0.26
73 0.24
74 0.18
75 0.18
76 0.16
77 0.17
78 0.23
79 0.25
80 0.27
81 0.28
82 0.26
83 0.27
84 0.33
85 0.31
86 0.26
87 0.26
88 0.24
89 0.23
90 0.23
91 0.3
92 0.27
93 0.35
94 0.36
95 0.38
96 0.37
97 0.39
98 0.39
99 0.37
100 0.37
101 0.31
102 0.32
103 0.31
104 0.3
105 0.28
106 0.28
107 0.21
108 0.17
109 0.16
110 0.11
111 0.08
112 0.07
113 0.07
114 0.06
115 0.09
116 0.1
117 0.1
118 0.1
119 0.12
120 0.13
121 0.12
122 0.18
123 0.19
124 0.2
125 0.23
126 0.23
127 0.21
128 0.24
129 0.26
130 0.26
131 0.33
132 0.38
133 0.43
134 0.48
135 0.52
136 0.54
137 0.59
138 0.55
139 0.51
140 0.51
141 0.49
142 0.5
143 0.48
144 0.43
145 0.39
146 0.37
147 0.36
148 0.34
149 0.31
150 0.29
151 0.29
152 0.31
153 0.31
154 0.33
155 0.3
156 0.24
157 0.23
158 0.19
159 0.2
160 0.2
161 0.23
162 0.22
163 0.25
164 0.27
165 0.32
166 0.34
167 0.32
168 0.3
169 0.28
170 0.34
171 0.31
172 0.3
173 0.25
174 0.23
175 0.23
176 0.28
177 0.25
178 0.2
179 0.2
180 0.19
181 0.23
182 0.28
183 0.31
184 0.34
185 0.4
186 0.48
187 0.52
188 0.58
189 0.61
190 0.63
191 0.67
192 0.64
193 0.66
194 0.62
195 0.58
196 0.51
197 0.44
198 0.38
199 0.29
200 0.23
201 0.14
202 0.1
203 0.07
204 0.07
205 0.06
206 0.08
207 0.09
208 0.11
209 0.17
210 0.18
211 0.18
212 0.18
213 0.22
214 0.2
215 0.24
216 0.23
217 0.18
218 0.16
219 0.16
220 0.16
221 0.14
222 0.17
223 0.17
224 0.23
225 0.3
226 0.38
227 0.45
228 0.47
229 0.48
230 0.48
231 0.51
232 0.54
233 0.51
234 0.47
235 0.43
236 0.45
237 0.44
238 0.41
239 0.32
240 0.26
241 0.24
242 0.21
243 0.2
244 0.17
245 0.16
246 0.16
247 0.16
248 0.16
249 0.13
250 0.13
251 0.12
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.15
257 0.21
258 0.21
259 0.21
260 0.21
261 0.21
262 0.22
263 0.21
264 0.19
265 0.13
266 0.13
267 0.17
268 0.16
269 0.16
270 0.15
271 0.14
272 0.13
273 0.12
274 0.1
275 0.05
276 0.06
277 0.06
278 0.05
279 0.06
280 0.06
281 0.05
282 0.05
283 0.06
284 0.06
285 0.05
286 0.05
287 0.07
288 0.07
289 0.08
290 0.08
291 0.07
292 0.08
293 0.09
294 0.08
295 0.07
296 0.06
297 0.06
298 0.07
299 0.07
300 0.06
301 0.09
302 0.1
303 0.11
304 0.11
305 0.11
306 0.13
307 0.14
308 0.15
309 0.15
310 0.2
311 0.23
312 0.29
313 0.37
314 0.42
315 0.47
316 0.53
317 0.6
318 0.58
319 0.62
320 0.61
321 0.63
322 0.57
323 0.53
324 0.48
325 0.4
326 0.36
327 0.28
328 0.23
329 0.13
330 0.1
331 0.09
332 0.07
333 0.06
334 0.08
335 0.08
336 0.09
337 0.09
338 0.09
339 0.1
340 0.14
341 0.17
342 0.16
343 0.16
344 0.16
345 0.16
346 0.15
347 0.15
348 0.11
349 0.07
350 0.07
351 0.07
352 0.07
353 0.07
354 0.07
355 0.07
356 0.06
357 0.05
358 0.04
359 0.03
360 0.03
361 0.03
362 0.04
363 0.04
364 0.05
365 0.09
366 0.09
367 0.1
368 0.15
369 0.17
370 0.24
371 0.31
372 0.34
373 0.31
374 0.37
375 0.37
376 0.37
377 0.4
378 0.36
379 0.33
380 0.38
381 0.4
382 0.38
383 0.39
384 0.39
385 0.39
386 0.42
387 0.44
388 0.43
389 0.43
390 0.49
391 0.5
392 0.45
393 0.45
394 0.42
395 0.4
396 0.34
397 0.3
398 0.25
399 0.23
400 0.22
401 0.24
402 0.25
403 0.21
404 0.2
405 0.2
406 0.19
407 0.21
408 0.21
409 0.15
410 0.12
411 0.12
412 0.13
413 0.13
414 0.1
415 0.07
416 0.07
417 0.07
418 0.06
419 0.06
420 0.08
421 0.12
422 0.16
423 0.17
424 0.19
425 0.23
426 0.32
427 0.41
428 0.46
429 0.46
430 0.49
431 0.55
432 0.59
433 0.57
434 0.53
435 0.48
436 0.49
437 0.49
438 0.48
439 0.42
440 0.38
441 0.38
442 0.37
443 0.33
444 0.26
445 0.22
446 0.18
447 0.21
448 0.21
449 0.21
450 0.2
451 0.24
452 0.25
453 0.25
454 0.26
455 0.23
456 0.22
457 0.22
458 0.19
459 0.18
460 0.14
461 0.15
462 0.14
463 0.14
464 0.14
465 0.13
466 0.11
467 0.08
468 0.08
469 0.07
470 0.06
471 0.05
472 0.04
473 0.04
474 0.04
475 0.05
476 0.06
477 0.08
478 0.08
479 0.09
480 0.11
481 0.15
482 0.17
483 0.19
484 0.18
485 0.16
486 0.17
487 0.17
488 0.16
489 0.12
490 0.12
491 0.1
492 0.09
493 0.09
494 0.09
495 0.08
496 0.07
497 0.07
498 0.06
499 0.07
500 0.08
501 0.1
502 0.1
503 0.1
504 0.1
505 0.11
506 0.14
507 0.16
508 0.16
509 0.17
510 0.17
511 0.18
512 0.19
513 0.18
514 0.2
515 0.24
516 0.28
517 0.29
518 0.3
519 0.3
520 0.3
521 0.29
522 0.25
523 0.19
524 0.16
525 0.13
526 0.13
527 0.14
528 0.21
529 0.23
530 0.25
531 0.29
532 0.33
533 0.38
534 0.4
535 0.42
536 0.35
537 0.37
538 0.38
539 0.34
540 0.28
541 0.27
542 0.27
543 0.24
544 0.24
545 0.22
546 0.2
547 0.2
548 0.19
549 0.17
550 0.14
551 0.14
552 0.14
553 0.17
554 0.17
555 0.16
556 0.16
557 0.17
558 0.2
559 0.27
560 0.31
561 0.3
562 0.34
563 0.36
564 0.36
565 0.37
566 0.39
567 0.36
568 0.32
569 0.29
570 0.27
571 0.26
572 0.26
573 0.23
574 0.18
575 0.14
576 0.13
577 0.13
578 0.09
579 0.09
580 0.08
581 0.09
582 0.07
583 0.06
584 0.06
585 0.06
586 0.06
587 0.05
588 0.08
589 0.08
590 0.08
591 0.09
592 0.11
593 0.12
594 0.12
595 0.13
596 0.12
597 0.12
598 0.14
599 0.14
600 0.13
601 0.14
602 0.23
603 0.26
604 0.25
605 0.25
606 0.22
607 0.22
608 0.21
609 0.19
610 0.11
611 0.07
612 0.06
613 0.07
614 0.08
615 0.08
616 0.08
617 0.08
618 0.08
619 0.11
620 0.12
621 0.12
622 0.13
623 0.14
624 0.14
625 0.13
626 0.13
627 0.11
628 0.15
629 0.16
630 0.14
631 0.13
632 0.16
633 0.19
634 0.22
635 0.24
636 0.21
637 0.25
638 0.33
639 0.34
640 0.32
641 0.29
642 0.3
643 0.29
644 0.35
645 0.33
646 0.26
647 0.28
648 0.29
649 0.29
650 0.25
651 0.23
652 0.17
653 0.15
654 0.13
655 0.13
656 0.17
657 0.2
658 0.22
659 0.23
660 0.22
661 0.21
662 0.23
663 0.24
664 0.23
665 0.25
666 0.25
667 0.26
668 0.27
669 0.3
670 0.36
671 0.39
672 0.35
673 0.32
674 0.33
675 0.35
676 0.35
677 0.33
678 0.29
679 0.28
680 0.31
681 0.34
682 0.33
683 0.3
684 0.29
685 0.29
686 0.27
687 0.25
688 0.19
689 0.15
690 0.14
691 0.14
692 0.18
693 0.25
694 0.24
695 0.23
696 0.26
697 0.29
698 0.28
699 0.31
700 0.31
701 0.29
702 0.28
703 0.31
704 0.3
705 0.26
706 0.29
707 0.27
708 0.24
709 0.19
710 0.18
711 0.17
712 0.18
713 0.19
714 0.18
715 0.21
716 0.27
717 0.3
718 0.34
719 0.37
720 0.38
721 0.41
722 0.46
723 0.49
724 0.47
725 0.49
726 0.51
727 0.55
728 0.52
729 0.48
730 0.41
731 0.36
732 0.3
733 0.28
734 0.25
735 0.19
736 0.18
737 0.22
738 0.23
739 0.22
740 0.21
741 0.19
742 0.17
743 0.16
744 0.17
745 0.12
746 0.11
747 0.14
748 0.16
749 0.15
750 0.15
751 0.15
752 0.14
753 0.15
754 0.15
755 0.14
756 0.12
757 0.12
758 0.13
759 0.13
760 0.13
761 0.15
762 0.21
763 0.22
764 0.26
765 0.34
766 0.42
767 0.45
768 0.5
769 0.51
770 0.51
771 0.56
772 0.63
773 0.62
774 0.56
775 0.55
776 0.51
777 0.49
778 0.45
779 0.41
780 0.32
781 0.28
782 0.28
783 0.26
784 0.26
785 0.29
786 0.3
787 0.31
788 0.31
789 0.34
790 0.31
791 0.3
792 0.28
793 0.24
794 0.21
795 0.16
796 0.14
797 0.09
798 0.12
799 0.12
800 0.12
801 0.1
802 0.1
803 0.14
804 0.14
805 0.15
806 0.12
807 0.16
808 0.2
809 0.21
810 0.21
811 0.18
812 0.27
813 0.33
814 0.39
815 0.38
816 0.34
817 0.33
818 0.34
819 0.33
820 0.25
821 0.18
822 0.11
823 0.09
824 0.11
825 0.11
826 0.08
827 0.07
828 0.06
829 0.06
830 0.06
831 0.05
832 0.03
833 0.04
834 0.04
835 0.04
836 0.04
837 0.04
838 0.04
839 0.04
840 0.06
841 0.11
842 0.12
843 0.16
844 0.19
845 0.24
846 0.28
847 0.34
848 0.43
849 0.47
850 0.54
851 0.6
852 0.66
853 0.7
854 0.75
855 0.74
856 0.74
857 0.72
858 0.7
859 0.66
860 0.57
861 0.48
862 0.4
863 0.36
864 0.26
865 0.18
866 0.12
867 0.07
868 0.06
869 0.06
870 0.06
871 0.05
872 0.05
873 0.05
874 0.06
875 0.1
876 0.15
877 0.16
878 0.16
879 0.17
880 0.21
881 0.3
882 0.34
883 0.35
884 0.34
885 0.37
886 0.4
887 0.47
888 0.5
889 0.46
890 0.47
891 0.48
892 0.48