Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3B6V2

Protein Details
Accession M3B6V2    Localization Confidence Medium Confidence Score 14
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
343-374KIKNDEKRKNSHASGKRKKSKKGINSAGPSPTHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
346-365NDEKRKNSHASGKRKKSKKG
Subcellular Location(s) nucl 15, cyto 7, mito 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007018  Mediator_Med6  
IPR038566  Mediator_Med6_sf  
Gene Ontology GO:0016592  C:mediator complex  
GO:0003712  F:transcription coregulator activity  
GO:0006357  P:regulation of transcription by RNA polymerase II  
Pfam View protein in Pfam  
PF04934  Med6  
Amino Acid Sequences MAATAPAKDEIVHAHPGIVDWWVNEMGGKAMDENMIHRYMTESPFFEWSSKNGLLFEQGKVDWAIHTMCNNRKALEENLRQKPGLEFMIVQEPQPVADKELAAQGVTTGVYVIRKQDRQRATPGPRVRPPSVILEDRWELTVLGTYFIVGQNVYQSPSVFDVIENRLLSAASTLNKFVDTTLALPRYSPASGYSYLPQSQTSKRTAAVSLAGSPAGSREGSVVPGTDAHSLRSGSLVPDSTMATSKAASDYDQIRLLATSLAMSINYADDYTDENPLMGEPGNFKFAMTEAAVKKRRGEEEVAAAKAHAEKQSSLNSRADAARAETVPPKVEKAPAAFSTETKIKNDEKRKNSHASGKRKKSKKGINSAGPSPTTPSASSAPTPKAG
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.21
2 0.2
3 0.21
4 0.2
5 0.17
6 0.14
7 0.1
8 0.13
9 0.12
10 0.12
11 0.12
12 0.12
13 0.11
14 0.11
15 0.11
16 0.09
17 0.09
18 0.11
19 0.11
20 0.13
21 0.15
22 0.15
23 0.15
24 0.14
25 0.16
26 0.19
27 0.23
28 0.24
29 0.22
30 0.23
31 0.27
32 0.28
33 0.27
34 0.24
35 0.23
36 0.27
37 0.26
38 0.25
39 0.22
40 0.21
41 0.26
42 0.27
43 0.25
44 0.21
45 0.2
46 0.21
47 0.2
48 0.2
49 0.14
50 0.14
51 0.15
52 0.13
53 0.17
54 0.23
55 0.28
56 0.34
57 0.35
58 0.34
59 0.34
60 0.37
61 0.4
62 0.43
63 0.47
64 0.5
65 0.57
66 0.59
67 0.57
68 0.54
69 0.48
70 0.41
71 0.33
72 0.25
73 0.17
74 0.16
75 0.25
76 0.24
77 0.22
78 0.21
79 0.19
80 0.18
81 0.21
82 0.19
83 0.13
84 0.14
85 0.15
86 0.13
87 0.16
88 0.15
89 0.12
90 0.11
91 0.09
92 0.08
93 0.08
94 0.07
95 0.04
96 0.05
97 0.06
98 0.07
99 0.13
100 0.18
101 0.23
102 0.27
103 0.36
104 0.42
105 0.44
106 0.51
107 0.56
108 0.57
109 0.61
110 0.65
111 0.64
112 0.64
113 0.67
114 0.62
115 0.55
116 0.5
117 0.47
118 0.45
119 0.39
120 0.34
121 0.31
122 0.3
123 0.28
124 0.26
125 0.19
126 0.14
127 0.12
128 0.14
129 0.1
130 0.09
131 0.09
132 0.08
133 0.08
134 0.09
135 0.09
136 0.05
137 0.05
138 0.07
139 0.08
140 0.09
141 0.09
142 0.09
143 0.09
144 0.11
145 0.12
146 0.09
147 0.09
148 0.11
149 0.13
150 0.16
151 0.15
152 0.14
153 0.13
154 0.13
155 0.12
156 0.1
157 0.1
158 0.08
159 0.08
160 0.09
161 0.09
162 0.09
163 0.09
164 0.08
165 0.08
166 0.07
167 0.08
168 0.12
169 0.13
170 0.13
171 0.13
172 0.13
173 0.14
174 0.13
175 0.12
176 0.09
177 0.11
178 0.12
179 0.13
180 0.14
181 0.15
182 0.16
183 0.16
184 0.16
185 0.17
186 0.19
187 0.22
188 0.23
189 0.22
190 0.22
191 0.23
192 0.22
193 0.2
194 0.18
195 0.15
196 0.13
197 0.12
198 0.11
199 0.09
200 0.08
201 0.08
202 0.07
203 0.06
204 0.05
205 0.06
206 0.06
207 0.08
208 0.08
209 0.08
210 0.07
211 0.08
212 0.09
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.13
217 0.13
218 0.13
219 0.13
220 0.12
221 0.09
222 0.1
223 0.1
224 0.08
225 0.09
226 0.09
227 0.09
228 0.1
229 0.1
230 0.09
231 0.09
232 0.09
233 0.09
234 0.09
235 0.09
236 0.11
237 0.12
238 0.14
239 0.16
240 0.15
241 0.14
242 0.14
243 0.14
244 0.11
245 0.09
246 0.06
247 0.05
248 0.05
249 0.05
250 0.05
251 0.05
252 0.05
253 0.05
254 0.05
255 0.04
256 0.05
257 0.08
258 0.09
259 0.11
260 0.1
261 0.1
262 0.1
263 0.1
264 0.1
265 0.08
266 0.08
267 0.09
268 0.11
269 0.13
270 0.13
271 0.13
272 0.12
273 0.12
274 0.14
275 0.12
276 0.17
277 0.18
278 0.28
279 0.34
280 0.34
281 0.38
282 0.41
283 0.43
284 0.41
285 0.42
286 0.36
287 0.4
288 0.44
289 0.41
290 0.35
291 0.32
292 0.29
293 0.26
294 0.26
295 0.19
296 0.16
297 0.17
298 0.21
299 0.3
300 0.34
301 0.36
302 0.35
303 0.33
304 0.34
305 0.34
306 0.31
307 0.23
308 0.21
309 0.21
310 0.2
311 0.22
312 0.23
313 0.24
314 0.26
315 0.26
316 0.27
317 0.25
318 0.28
319 0.29
320 0.29
321 0.33
322 0.31
323 0.35
324 0.33
325 0.31
326 0.34
327 0.36
328 0.35
329 0.31
330 0.34
331 0.36
332 0.45
333 0.56
334 0.6
335 0.62
336 0.69
337 0.74
338 0.78
339 0.77
340 0.78
341 0.77
342 0.78
343 0.81
344 0.83
345 0.86
346 0.85
347 0.88
348 0.88
349 0.89
350 0.88
351 0.88
352 0.87
353 0.87
354 0.86
355 0.81
356 0.76
357 0.67
358 0.58
359 0.52
360 0.44
361 0.37
362 0.31
363 0.3
364 0.27
365 0.29
366 0.32
367 0.33