Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CTX7

Protein Details
Accession B0CTX7    Localization Confidence High Confidence Score 20.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
37-63TIDASKPAFKPRKVKKQSDAKYRDRAAHydrophilic
205-245FKPIGDGDPKKKKKKKVETEGKDGERKKKKRKVEDGSKAVNBasic
393-419EKAAGSYGKKKKGKDKKKSGGTDEDGGBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
42-63KPAFKPRKVKKQSDAKYRDRAA
167-171KEKRG
194-236AKQKGKFKPIGFKPIGDGDPKKKKKKKVETEGKDGERKKKKRK
400-413GKKKKGKDKKKSGG
423-425SKK
Subcellular Location(s) nucl 20, cyto_nucl 14.333, mito_nucl 10.999, cyto 5.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR039896  Red-like  
IPR012916  RED_N  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_305314  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF07808  RED_N  
Amino Acid Sequences MDQDSFRRLLETPGGASSSLSSRSSLLAQAAGTKPKTIDASKPAFKPRKVKKQSDAKYRDRAAERRGGEGNDYAQIEAVLEDFEKRAADAEDKDEVEAQRQYLGGDGDHTILVKGLDFALLEQNKARSLNSAEDDETLEEAFLAASSGAPSTVPKKRTREDIIRELKEKRGSKPTEDASSSKPAEEESRLLEEAKQKGKFKPIGFKPIGDGDPKKKKKKKVETEGKDGERKKKKRKVEDGSKAVNGTGVDATEKGSMLPPPVPSKALETLPPAVPEPEPLEEDFNIFADVGEYEGIGLESDDDDDDDNPKKSNDVDTPQEAEVPNMHRRWIGTDEPEPTPSTNPPESLQQNPTEPPTSHSLPPEGEEEEQQPTRLVPLASSALPSIKEFLAMEKAAGSYGKKKKGKDKKKSGGTDEDGGSDKSKKLNAEAKAERDYKRLKSYTDKKAGDSAAK
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.26
2 0.24
3 0.23
4 0.21
5 0.18
6 0.19
7 0.18
8 0.17
9 0.16
10 0.18
11 0.19
12 0.2
13 0.18
14 0.16
15 0.15
16 0.21
17 0.24
18 0.28
19 0.27
20 0.27
21 0.26
22 0.28
23 0.33
24 0.3
25 0.33
26 0.36
27 0.44
28 0.48
29 0.54
30 0.61
31 0.64
32 0.68
33 0.71
34 0.73
35 0.76
36 0.79
37 0.83
38 0.82
39 0.85
40 0.89
41 0.89
42 0.88
43 0.85
44 0.85
45 0.79
46 0.78
47 0.75
48 0.71
49 0.66
50 0.65
51 0.58
52 0.53
53 0.53
54 0.45
55 0.4
56 0.36
57 0.31
58 0.26
59 0.25
60 0.2
61 0.17
62 0.15
63 0.13
64 0.11
65 0.09
66 0.06
67 0.05
68 0.06
69 0.06
70 0.07
71 0.07
72 0.07
73 0.08
74 0.1
75 0.13
76 0.14
77 0.18
78 0.21
79 0.21
80 0.22
81 0.24
82 0.22
83 0.23
84 0.22
85 0.19
86 0.16
87 0.16
88 0.15
89 0.14
90 0.14
91 0.1
92 0.1
93 0.11
94 0.1
95 0.1
96 0.1
97 0.08
98 0.08
99 0.08
100 0.07
101 0.06
102 0.05
103 0.06
104 0.05
105 0.06
106 0.13
107 0.14
108 0.14
109 0.15
110 0.17
111 0.18
112 0.19
113 0.18
114 0.14
115 0.17
116 0.21
117 0.22
118 0.23
119 0.22
120 0.22
121 0.23
122 0.2
123 0.18
124 0.12
125 0.1
126 0.07
127 0.06
128 0.05
129 0.04
130 0.04
131 0.03
132 0.03
133 0.04
134 0.04
135 0.04
136 0.04
137 0.05
138 0.11
139 0.17
140 0.22
141 0.29
142 0.36
143 0.39
144 0.48
145 0.54
146 0.58
147 0.6
148 0.65
149 0.68
150 0.65
151 0.66
152 0.6
153 0.57
154 0.56
155 0.52
156 0.46
157 0.47
158 0.45
159 0.46
160 0.5
161 0.48
162 0.45
163 0.45
164 0.42
165 0.36
166 0.4
167 0.36
168 0.29
169 0.25
170 0.21
171 0.21
172 0.21
173 0.18
174 0.13
175 0.16
176 0.16
177 0.16
178 0.18
179 0.21
180 0.24
181 0.29
182 0.31
183 0.32
184 0.34
185 0.41
186 0.44
187 0.42
188 0.47
189 0.45
190 0.5
191 0.48
192 0.46
193 0.4
194 0.38
195 0.36
196 0.3
197 0.29
198 0.28
199 0.38
200 0.46
201 0.54
202 0.57
203 0.65
204 0.72
205 0.8
206 0.83
207 0.83
208 0.86
209 0.83
210 0.85
211 0.83
212 0.76
213 0.72
214 0.64
215 0.63
216 0.62
217 0.64
218 0.65
219 0.66
220 0.71
221 0.75
222 0.82
223 0.83
224 0.84
225 0.86
226 0.82
227 0.77
228 0.7
229 0.59
230 0.48
231 0.39
232 0.27
233 0.18
234 0.11
235 0.07
236 0.07
237 0.07
238 0.08
239 0.07
240 0.07
241 0.06
242 0.07
243 0.07
244 0.08
245 0.1
246 0.11
247 0.14
248 0.15
249 0.16
250 0.15
251 0.18
252 0.2
253 0.19
254 0.19
255 0.18
256 0.2
257 0.2
258 0.2
259 0.17
260 0.16
261 0.15
262 0.14
263 0.14
264 0.13
265 0.13
266 0.13
267 0.15
268 0.13
269 0.14
270 0.13
271 0.11
272 0.1
273 0.08
274 0.07
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.05
279 0.04
280 0.04
281 0.04
282 0.04
283 0.03
284 0.03
285 0.03
286 0.03
287 0.04
288 0.04
289 0.04
290 0.05
291 0.05
292 0.08
293 0.11
294 0.12
295 0.12
296 0.13
297 0.13
298 0.14
299 0.19
300 0.22
301 0.24
302 0.28
303 0.3
304 0.33
305 0.32
306 0.34
307 0.29
308 0.24
309 0.22
310 0.22
311 0.25
312 0.23
313 0.24
314 0.22
315 0.22
316 0.26
317 0.28
318 0.27
319 0.26
320 0.29
321 0.33
322 0.33
323 0.35
324 0.32
325 0.28
326 0.26
327 0.24
328 0.26
329 0.24
330 0.24
331 0.24
332 0.3
333 0.32
334 0.35
335 0.36
336 0.33
337 0.34
338 0.34
339 0.36
340 0.33
341 0.3
342 0.28
343 0.3
344 0.31
345 0.31
346 0.32
347 0.31
348 0.27
349 0.29
350 0.28
351 0.24
352 0.21
353 0.21
354 0.21
355 0.23
356 0.23
357 0.22
358 0.19
359 0.17
360 0.18
361 0.18
362 0.16
363 0.11
364 0.14
365 0.16
366 0.16
367 0.17
368 0.16
369 0.15
370 0.16
371 0.16
372 0.15
373 0.12
374 0.14
375 0.13
376 0.15
377 0.18
378 0.17
379 0.17
380 0.15
381 0.15
382 0.15
383 0.16
384 0.16
385 0.21
386 0.29
387 0.39
388 0.44
389 0.5
390 0.6
391 0.7
392 0.79
393 0.8
394 0.83
395 0.84
396 0.89
397 0.92
398 0.88
399 0.87
400 0.81
401 0.75
402 0.64
403 0.56
404 0.48
405 0.4
406 0.36
407 0.29
408 0.26
409 0.24
410 0.27
411 0.26
412 0.32
413 0.38
414 0.41
415 0.49
416 0.53
417 0.55
418 0.6
419 0.64
420 0.58
421 0.59
422 0.6
423 0.58
424 0.61
425 0.59
426 0.56
427 0.61
428 0.68
429 0.72
430 0.75
431 0.7
432 0.63
433 0.66