Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

A0A1D8PIJ4

Protein Details
Accession A0A1D8PIJ4    Localization Confidence High Confidence Score 15.9
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
220-252PYASGKKNDDKDKKKNKKKKKKKRGLVYADEEFBasic
413-432QSKSPPPPRPSKPSNLQSSFHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
207-243PRSPPPPRPSTKSPYASGKKNDDKDKKKNKKKKKKKR
Subcellular Location(s) nucl 22.5, cyto_nucl 13, cyto 2.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008942  ENTH_VHS  
IPR044103  GAT_LSB5  
IPR045007  LSB5  
IPR002014  VHS_dom  
Gene Ontology GO:0030479  C:actin cortical patch  
GO:0035091  F:phosphatidylinositol binding  
GO:0043130  F:ubiquitin binding  
GO:0051666  P:actin cortical patch localization  
GO:0007015  P:actin filament organization  
GO:0006897  P:endocytosis  
GO:0006886  P:intracellular protein transport  
GO:0007034  P:vacuolar transport  
KEGG cal:CAALFM_C209710CA  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00790  VHS  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50179  VHS  
CDD cd14232  GAT_LSB5  
cd16980  VHS_Lsb5  
Amino Acid Sequences MPLFSDHAYTSITIKINQLADPKRNDEIDDSIELYLSDLIELIKVQSNSGAVEAARAIRKKIKYGDSRAEQLRALQILELLVLNGGPSIGPIIARDDKLLDVLKGIINGTARTGVGVEYDCKVQKRVVAMAIGWKTELDGLDGYKYMQSLYKAIPRRKRVSSSHSGHRDRDVYDSDENSEDVLDPYADDAQLDSHASNRNVSSPRTPRSPPPPRPSTKSPYASGKKNDDKDKKKNKKKKKKKRGLVYADEEFEIPQINYKVEAPKIRELIANCYTHTTALNNLLLQLPADESPLDNDKTLEEFAKCKKIRRKVLSYLQYVGAGSPEAKSSEVAALDEEFLGSLIGANEQLVESFKRFDFRAGYSKDNPAPNYDDESDSDESYYTSEESEEEPDDVEEQDENSISARLQNATLQSKSPPPPRPSKPSNLQSSFQPRPKLDKVETSESIEGNPFGDRNAVTKSVYD
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.22
2 0.25
3 0.26
4 0.28
5 0.35
6 0.37
7 0.42
8 0.46
9 0.49
10 0.48
11 0.48
12 0.46
13 0.41
14 0.38
15 0.35
16 0.32
17 0.29
18 0.24
19 0.23
20 0.21
21 0.18
22 0.14
23 0.1
24 0.08
25 0.06
26 0.06
27 0.07
28 0.07
29 0.08
30 0.12
31 0.13
32 0.13
33 0.14
34 0.15
35 0.15
36 0.15
37 0.15
38 0.09
39 0.1
40 0.11
41 0.14
42 0.19
43 0.2
44 0.23
45 0.29
46 0.32
47 0.38
48 0.45
49 0.51
50 0.55
51 0.62
52 0.69
53 0.66
54 0.71
55 0.68
56 0.62
57 0.53
58 0.46
59 0.41
60 0.32
61 0.27
62 0.19
63 0.16
64 0.14
65 0.14
66 0.11
67 0.07
68 0.06
69 0.05
70 0.05
71 0.04
72 0.04
73 0.03
74 0.03
75 0.04
76 0.04
77 0.05
78 0.05
79 0.11
80 0.15
81 0.15
82 0.16
83 0.16
84 0.16
85 0.19
86 0.2
87 0.14
88 0.11
89 0.13
90 0.13
91 0.12
92 0.12
93 0.11
94 0.11
95 0.11
96 0.11
97 0.11
98 0.1
99 0.09
100 0.09
101 0.08
102 0.08
103 0.09
104 0.09
105 0.09
106 0.13
107 0.15
108 0.16
109 0.18
110 0.18
111 0.19
112 0.21
113 0.23
114 0.22
115 0.21
116 0.2
117 0.25
118 0.25
119 0.23
120 0.2
121 0.16
122 0.14
123 0.14
124 0.14
125 0.08
126 0.08
127 0.08
128 0.09
129 0.09
130 0.1
131 0.09
132 0.09
133 0.08
134 0.09
135 0.1
136 0.12
137 0.15
138 0.22
139 0.29
140 0.37
141 0.45
142 0.51
143 0.57
144 0.6
145 0.64
146 0.63
147 0.64
148 0.66
149 0.64
150 0.65
151 0.69
152 0.67
153 0.61
154 0.59
155 0.53
156 0.43
157 0.41
158 0.34
159 0.28
160 0.26
161 0.25
162 0.23
163 0.21
164 0.2
165 0.16
166 0.13
167 0.1
168 0.08
169 0.08
170 0.06
171 0.05
172 0.06
173 0.06
174 0.06
175 0.05
176 0.05
177 0.05
178 0.05
179 0.06
180 0.05
181 0.08
182 0.12
183 0.13
184 0.14
185 0.14
186 0.19
187 0.21
188 0.22
189 0.28
190 0.3
191 0.33
192 0.36
193 0.38
194 0.39
195 0.48
196 0.57
197 0.58
198 0.6
199 0.66
200 0.65
201 0.71
202 0.71
203 0.67
204 0.65
205 0.6
206 0.54
207 0.55
208 0.56
209 0.55
210 0.53
211 0.54
212 0.53
213 0.54
214 0.61
215 0.61
216 0.65
217 0.7
218 0.76
219 0.79
220 0.83
221 0.87
222 0.89
223 0.91
224 0.94
225 0.95
226 0.95
227 0.95
228 0.94
229 0.94
230 0.94
231 0.91
232 0.88
233 0.82
234 0.73
235 0.63
236 0.53
237 0.42
238 0.31
239 0.22
240 0.15
241 0.08
242 0.08
243 0.08
244 0.08
245 0.08
246 0.1
247 0.13
248 0.15
249 0.19
250 0.21
251 0.24
252 0.25
253 0.26
254 0.27
255 0.25
256 0.29
257 0.3
258 0.27
259 0.23
260 0.24
261 0.23
262 0.21
263 0.21
264 0.15
265 0.11
266 0.14
267 0.14
268 0.12
269 0.12
270 0.12
271 0.12
272 0.11
273 0.09
274 0.07
275 0.06
276 0.07
277 0.06
278 0.06
279 0.08
280 0.11
281 0.12
282 0.11
283 0.11
284 0.11
285 0.13
286 0.14
287 0.13
288 0.11
289 0.14
290 0.18
291 0.28
292 0.29
293 0.36
294 0.44
295 0.52
296 0.62
297 0.67
298 0.72
299 0.71
300 0.79
301 0.79
302 0.74
303 0.67
304 0.57
305 0.48
306 0.4
307 0.3
308 0.21
309 0.13
310 0.09
311 0.07
312 0.07
313 0.07
314 0.08
315 0.08
316 0.09
317 0.1
318 0.1
319 0.1
320 0.1
321 0.1
322 0.1
323 0.09
324 0.08
325 0.06
326 0.05
327 0.05
328 0.04
329 0.04
330 0.04
331 0.04
332 0.04
333 0.04
334 0.05
335 0.05
336 0.05
337 0.06
338 0.08
339 0.08
340 0.11
341 0.12
342 0.15
343 0.15
344 0.18
345 0.2
346 0.23
347 0.31
348 0.33
349 0.39
350 0.4
351 0.46
352 0.49
353 0.5
354 0.46
355 0.41
356 0.41
357 0.37
358 0.4
359 0.35
360 0.31
361 0.28
362 0.32
363 0.3
364 0.26
365 0.24
366 0.18
367 0.16
368 0.14
369 0.14
370 0.09
371 0.08
372 0.08
373 0.08
374 0.1
375 0.13
376 0.13
377 0.13
378 0.13
379 0.13
380 0.14
381 0.13
382 0.12
383 0.09
384 0.09
385 0.09
386 0.09
387 0.09
388 0.09
389 0.09
390 0.08
391 0.11
392 0.12
393 0.12
394 0.13
395 0.16
396 0.21
397 0.26
398 0.27
399 0.26
400 0.28
401 0.34
402 0.41
403 0.47
404 0.51
405 0.53
406 0.61
407 0.68
408 0.75
409 0.75
410 0.77
411 0.79
412 0.78
413 0.82
414 0.77
415 0.71
416 0.7
417 0.72
418 0.71
419 0.67
420 0.66
421 0.58
422 0.62
423 0.67
424 0.66
425 0.61
426 0.62
427 0.63
428 0.63
429 0.63
430 0.61
431 0.57
432 0.48
433 0.45
434 0.37
435 0.3
436 0.23
437 0.21
438 0.15
439 0.13
440 0.16
441 0.14
442 0.15
443 0.2
444 0.21