Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3CHX6

Protein Details
Accession M3CHX6    Localization Confidence High Confidence Score 16.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
257-283VTDIKKAEEVRQKKRRDRGRPDEDGQDBasic
NLS Segment(s)
PositionSequence
267-275RQKKRRDRG
Subcellular Location(s) nucl 22, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR013260  mRNA_splic_SYF2  
Gene Ontology GO:0005681  C:spliceosomal complex  
GO:0000398  P:mRNA splicing, via spliceosome  
Pfam View protein in Pfam  
PF08231  SYF2  
Amino Acid Sequences MPVTRKRKGSPGLEETAAESSKRRFAETEVEAEAEAEAEAEAEEEAEAEAEVEAESSSSVNAKEPTATSAADERAARFAALRARNAASRKSNLQDTKHEMQRAAVDPSQLTSLNRRKDIAQHKLLKSEIEEGGQDFERKRAWDWTIEESERWDERLAEKARKRDENQFADYNKEAGKVYERQLGQMAKAGFDERLASYEQNKRDAINRAVASGGLELVETQDGELIAVDKDGTFYSTNDSAAFTAGKPSKEAVDRLVTDIKKAEEVRQKKRRDRGRPDEDGQDITFINEKNKQFNMKLARFYNKYTADIRESFERGTAI
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.56
2 0.49
3 0.44
4 0.36
5 0.27
6 0.23
7 0.2
8 0.25
9 0.26
10 0.26
11 0.23
12 0.26
13 0.35
14 0.35
15 0.37
16 0.32
17 0.31
18 0.29
19 0.28
20 0.24
21 0.15
22 0.11
23 0.07
24 0.05
25 0.04
26 0.04
27 0.04
28 0.04
29 0.04
30 0.04
31 0.04
32 0.04
33 0.04
34 0.04
35 0.04
36 0.04
37 0.04
38 0.04
39 0.04
40 0.04
41 0.04
42 0.04
43 0.04
44 0.05
45 0.06
46 0.06
47 0.09
48 0.11
49 0.11
50 0.13
51 0.13
52 0.16
53 0.16
54 0.16
55 0.15
56 0.17
57 0.18
58 0.19
59 0.19
60 0.17
61 0.17
62 0.18
63 0.16
64 0.13
65 0.15
66 0.2
67 0.23
68 0.23
69 0.24
70 0.26
71 0.3
72 0.32
73 0.36
74 0.33
75 0.34
76 0.37
77 0.38
78 0.44
79 0.46
80 0.47
81 0.47
82 0.5
83 0.54
84 0.54
85 0.52
86 0.44
87 0.4
88 0.41
89 0.36
90 0.32
91 0.26
92 0.22
93 0.2
94 0.2
95 0.2
96 0.16
97 0.15
98 0.19
99 0.25
100 0.3
101 0.31
102 0.31
103 0.31
104 0.39
105 0.47
106 0.47
107 0.49
108 0.53
109 0.53
110 0.55
111 0.54
112 0.46
113 0.38
114 0.33
115 0.24
116 0.16
117 0.15
118 0.12
119 0.14
120 0.14
121 0.14
122 0.1
123 0.11
124 0.12
125 0.13
126 0.14
127 0.16
128 0.17
129 0.21
130 0.23
131 0.27
132 0.29
133 0.29
134 0.28
135 0.24
136 0.26
137 0.21
138 0.19
139 0.15
140 0.11
141 0.12
142 0.2
143 0.22
144 0.27
145 0.3
146 0.36
147 0.4
148 0.46
149 0.48
150 0.49
151 0.54
152 0.52
153 0.53
154 0.52
155 0.47
156 0.45
157 0.42
158 0.34
159 0.25
160 0.21
161 0.16
162 0.12
163 0.15
164 0.15
165 0.17
166 0.21
167 0.21
168 0.21
169 0.24
170 0.24
171 0.21
172 0.22
173 0.2
174 0.14
175 0.15
176 0.14
177 0.1
178 0.1
179 0.11
180 0.07
181 0.08
182 0.09
183 0.1
184 0.15
185 0.21
186 0.23
187 0.25
188 0.26
189 0.25
190 0.29
191 0.35
192 0.32
193 0.33
194 0.31
195 0.27
196 0.27
197 0.26
198 0.21
199 0.15
200 0.12
201 0.05
202 0.05
203 0.04
204 0.05
205 0.05
206 0.04
207 0.04
208 0.04
209 0.04
210 0.04
211 0.05
212 0.05
213 0.05
214 0.05
215 0.05
216 0.04
217 0.05
218 0.05
219 0.07
220 0.08
221 0.08
222 0.12
223 0.14
224 0.14
225 0.14
226 0.15
227 0.13
228 0.13
229 0.13
230 0.09
231 0.16
232 0.19
233 0.19
234 0.19
235 0.2
236 0.23
237 0.26
238 0.27
239 0.23
240 0.26
241 0.27
242 0.3
243 0.36
244 0.32
245 0.3
246 0.32
247 0.28
248 0.28
249 0.28
250 0.32
251 0.35
252 0.44
253 0.53
254 0.6
255 0.69
256 0.72
257 0.81
258 0.84
259 0.85
260 0.87
261 0.87
262 0.88
263 0.86
264 0.82
265 0.79
266 0.71
267 0.63
268 0.52
269 0.43
270 0.33
271 0.26
272 0.26
273 0.2
274 0.22
275 0.26
276 0.27
277 0.32
278 0.37
279 0.42
280 0.39
281 0.47
282 0.53
283 0.51
284 0.57
285 0.57
286 0.62
287 0.58
288 0.61
289 0.62
290 0.55
291 0.53
292 0.49
293 0.48
294 0.46
295 0.45
296 0.44
297 0.41
298 0.4
299 0.37