Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3D706

Protein Details
Accession M3D706    Localization Confidence High Confidence Score 24
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
143-162LATGKKGPSKRERQFRVLTHHydrophilic
220-248KAAAAKLRARNEKKGKGKRSKTRDWSYEAHydrophilic
366-392FSKAEEALEKKKKKKKEKKGVDTAMSEBasic
1101-1123MISPVKKRATRARSRTSNGKRATHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
219-241KKAAAAKLRARNEKKGKGKRSKT
374-384EKKKKKKKEKK
1106-1116KKRATRARSRT
Subcellular Location(s) nucl 19, mito 5, cyto 3
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR018327  BHD_2  
IPR004583  DNA_repair_Rad4  
IPR038765  Papain-like_cys_pep_sf  
IPR018325  Rad4/PNGase_transGLS-fold  
IPR018326  Rad4_beta-hairpin_dom1  
IPR018328  Rad4_beta-hairpin_dom3  
IPR042488  Rad4_BHD3_sf  
IPR036985  Transglutaminase-like_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003684  F:damaged DNA binding  
GO:0006289  P:nucleotide-excision repair  
Pfam View protein in Pfam  
PF10403  BHD_1  
PF10404  BHD_2  
PF10405  BHD_3  
PF03835  Rad4  
Amino Acid Sequences MAPAKRPRTQTKAHRSTLFDAADTPPPKQTTSAAETKKFLESLDNDDDDDESLSDLDSDDFEDVAPARKKPKMAHIDSAQIGQDERANDDDDDDDDDDDGMDWEDATTAHPNVVPSSKPDVEIADIDVSLNEDGVYVEPELSLATGKKGPSKRERQFRVLTHCLHVQSLMWHNTVRNSWLNDTEVQKILVDGLGDGVKKEITRWRENMGILTKEELEAKKAAAAKLRARNEKKGKGKRSKTRDWSYEAEHLDQGVPNLSQGDPLLRLLKVLAAYWRKRFTVTAPAFRKQGYMPLKRLRDEIQHWSKNMGDADEHGERIENLDAFRNLAKSCEGSRDVGAQLFVALLRAIGLETRMVANLQPAGTGFSKAEEALEKKKKKKKEKKGVDTAMSEKEDDDLPSAKTSKVAQKATPTSKTGTSNGKSARGAKTKPINLEESGSELSELPLEAEEDDVSLVDITTPSSLPQKKAHKKYDRDLAFPTYWTEVCSPVSHKWIPVDPIVLSTIASTDELLQTFEPRGKKADMAKQVMCYTIAFSADGSAKDVTVRYLKKHQLPGKTRGMRIVAEKVPIYNKRGKVKKYENYDWFRTVMSSYDRPQTKRTAADDLEEQTDLKPWKPVKEAKEVEKESLQWYKQSAEFVLEQHLRREEAIVPGAKPVRDFIAGKGDKAVTHPVYKRSDVATCKTVESWHKEGREVKVGEHPMKHVPVRAVTLLRKREMEEHFKEHGEKLQQGLYSWDQTDWIIPPPIHNGVIPKNAFGNMDVYVDTMVPAGAVHLPLKGSAKICRKLEIDYAEACVGFEFGKQRAVPVLSGVVVAEEHEILVRDAWKEQQIEIKRKEDTKRTAAALHWWRKMVMGMRIVERMRAEYDETSGDPDASNPFARKATAQARHVPAVVVEEDVGAGGFFPPGHVEEESREHERQLRREAPSEDVNGNGSGGFFAGSEDEGSAAGDGGFLVVEEGPDGDTSTRPSVATPFTPMSLQSVHQAPEPDEAYRSNGAGGFLVDNSEQEEDEEEEQAPNPGVVKRSRTASRAPAMKATRMAEKPAIRQTPARSAVSRKAPALTTPSSDSNLSELEDDEDPGDTGKPALAPLRRERSSPQVMISPVKKRATRARSRTSNGKRATPVKSQYFEHDDNGVDEDENNNHHNEDDENDSEPEVVRPTRTTARTRNRR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.8
2 0.76
3 0.73
4 0.71
5 0.62
6 0.51
7 0.43
8 0.39
9 0.41
10 0.37
11 0.34
12 0.31
13 0.32
14 0.32
15 0.32
16 0.32
17 0.31
18 0.36
19 0.44
20 0.45
21 0.47
22 0.48
23 0.49
24 0.49
25 0.42
26 0.35
27 0.33
28 0.29
29 0.33
30 0.37
31 0.35
32 0.32
33 0.32
34 0.32
35 0.25
36 0.23
37 0.16
38 0.1
39 0.09
40 0.08
41 0.08
42 0.08
43 0.08
44 0.07
45 0.08
46 0.08
47 0.08
48 0.08
49 0.09
50 0.1
51 0.18
52 0.21
53 0.23
54 0.29
55 0.32
56 0.38
57 0.41
58 0.51
59 0.53
60 0.57
61 0.63
62 0.61
63 0.65
64 0.61
65 0.58
66 0.48
67 0.38
68 0.32
69 0.24
70 0.23
71 0.16
72 0.17
73 0.17
74 0.18
75 0.18
76 0.18
77 0.18
78 0.16
79 0.19
80 0.17
81 0.16
82 0.13
83 0.13
84 0.12
85 0.11
86 0.11
87 0.08
88 0.07
89 0.06
90 0.06
91 0.07
92 0.06
93 0.08
94 0.11
95 0.11
96 0.12
97 0.13
98 0.14
99 0.17
100 0.2
101 0.19
102 0.2
103 0.28
104 0.28
105 0.28
106 0.28
107 0.27
108 0.27
109 0.27
110 0.24
111 0.17
112 0.16
113 0.15
114 0.14
115 0.13
116 0.11
117 0.1
118 0.07
119 0.06
120 0.06
121 0.07
122 0.08
123 0.07
124 0.07
125 0.07
126 0.07
127 0.07
128 0.07
129 0.08
130 0.07
131 0.1
132 0.13
133 0.15
134 0.23
135 0.29
136 0.38
137 0.46
138 0.57
139 0.63
140 0.71
141 0.78
142 0.78
143 0.81
144 0.8
145 0.79
146 0.75
147 0.69
148 0.62
149 0.59
150 0.51
151 0.43
152 0.36
153 0.28
154 0.25
155 0.29
156 0.28
157 0.25
158 0.25
159 0.26
160 0.29
161 0.3
162 0.29
163 0.27
164 0.28
165 0.29
166 0.31
167 0.33
168 0.33
169 0.35
170 0.34
171 0.3
172 0.27
173 0.24
174 0.21
175 0.18
176 0.15
177 0.12
178 0.08
179 0.08
180 0.09
181 0.09
182 0.09
183 0.1
184 0.1
185 0.1
186 0.13
187 0.18
188 0.24
189 0.31
190 0.34
191 0.37
192 0.41
193 0.42
194 0.45
195 0.44
196 0.39
197 0.33
198 0.32
199 0.28
200 0.24
201 0.28
202 0.22
203 0.19
204 0.18
205 0.17
206 0.19
207 0.22
208 0.23
209 0.25
210 0.3
211 0.36
212 0.44
213 0.52
214 0.58
215 0.6
216 0.69
217 0.72
218 0.77
219 0.79
220 0.81
221 0.83
222 0.84
223 0.89
224 0.89
225 0.89
226 0.89
227 0.89
228 0.88
229 0.83
230 0.78
231 0.72
232 0.67
233 0.65
234 0.57
235 0.49
236 0.4
237 0.34
238 0.29
239 0.25
240 0.2
241 0.15
242 0.12
243 0.1
244 0.11
245 0.1
246 0.1
247 0.09
248 0.11
249 0.1
250 0.12
251 0.14
252 0.12
253 0.12
254 0.12
255 0.13
256 0.12
257 0.12
258 0.17
259 0.23
260 0.28
261 0.35
262 0.38
263 0.37
264 0.38
265 0.39
266 0.35
267 0.38
268 0.4
269 0.43
270 0.45
271 0.48
272 0.48
273 0.47
274 0.45
275 0.34
276 0.37
277 0.36
278 0.38
279 0.43
280 0.5
281 0.54
282 0.54
283 0.56
284 0.51
285 0.49
286 0.47
287 0.49
288 0.51
289 0.51
290 0.5
291 0.49
292 0.46
293 0.42
294 0.38
295 0.28
296 0.19
297 0.16
298 0.2
299 0.19
300 0.19
301 0.15
302 0.15
303 0.13
304 0.15
305 0.15
306 0.1
307 0.1
308 0.14
309 0.14
310 0.15
311 0.16
312 0.16
313 0.14
314 0.15
315 0.15
316 0.14
317 0.15
318 0.19
319 0.2
320 0.2
321 0.21
322 0.22
323 0.22
324 0.2
325 0.19
326 0.13
327 0.11
328 0.09
329 0.08
330 0.06
331 0.05
332 0.04
333 0.04
334 0.04
335 0.04
336 0.04
337 0.04
338 0.04
339 0.05
340 0.05
341 0.06
342 0.06
343 0.06
344 0.07
345 0.08
346 0.08
347 0.08
348 0.08
349 0.11
350 0.11
351 0.12
352 0.11
353 0.1
354 0.1
355 0.1
356 0.11
357 0.11
358 0.14
359 0.22
360 0.32
361 0.39
362 0.47
363 0.55
364 0.64
365 0.72
366 0.8
367 0.82
368 0.84
369 0.88
370 0.9
371 0.93
372 0.91
373 0.84
374 0.77
375 0.69
376 0.63
377 0.52
378 0.42
379 0.31
380 0.24
381 0.2
382 0.16
383 0.15
384 0.11
385 0.11
386 0.13
387 0.14
388 0.13
389 0.14
390 0.17
391 0.22
392 0.28
393 0.3
394 0.3
395 0.37
396 0.45
397 0.49
398 0.49
399 0.44
400 0.39
401 0.4
402 0.41
403 0.37
404 0.37
405 0.33
406 0.36
407 0.36
408 0.37
409 0.35
410 0.37
411 0.4
412 0.38
413 0.38
414 0.39
415 0.46
416 0.46
417 0.48
418 0.47
419 0.42
420 0.37
421 0.37
422 0.3
423 0.25
424 0.22
425 0.17
426 0.14
427 0.11
428 0.1
429 0.09
430 0.08
431 0.05
432 0.05
433 0.05
434 0.05
435 0.05
436 0.05
437 0.04
438 0.04
439 0.04
440 0.04
441 0.04
442 0.03
443 0.03
444 0.03
445 0.04
446 0.04
447 0.04
448 0.05
449 0.13
450 0.15
451 0.18
452 0.26
453 0.36
454 0.45
455 0.55
456 0.65
457 0.67
458 0.72
459 0.75
460 0.78
461 0.7
462 0.63
463 0.57
464 0.51
465 0.42
466 0.36
467 0.31
468 0.23
469 0.2
470 0.19
471 0.16
472 0.13
473 0.13
474 0.14
475 0.16
476 0.16
477 0.21
478 0.2
479 0.2
480 0.21
481 0.22
482 0.23
483 0.2
484 0.2
485 0.14
486 0.14
487 0.14
488 0.12
489 0.1
490 0.08
491 0.07
492 0.06
493 0.06
494 0.05
495 0.05
496 0.06
497 0.06
498 0.07
499 0.07
500 0.07
501 0.08
502 0.11
503 0.12
504 0.12
505 0.15
506 0.15
507 0.18
508 0.23
509 0.31
510 0.34
511 0.38
512 0.38
513 0.38
514 0.38
515 0.34
516 0.29
517 0.21
518 0.15
519 0.11
520 0.1
521 0.07
522 0.07
523 0.08
524 0.08
525 0.08
526 0.09
527 0.08
528 0.08
529 0.08
530 0.09
531 0.09
532 0.13
533 0.14
534 0.16
535 0.23
536 0.29
537 0.34
538 0.42
539 0.46
540 0.5
541 0.54
542 0.59
543 0.61
544 0.61
545 0.56
546 0.51
547 0.47
548 0.39
549 0.36
550 0.34
551 0.25
552 0.22
553 0.21
554 0.19
555 0.22
556 0.23
557 0.25
558 0.26
559 0.3
560 0.36
561 0.42
562 0.44
563 0.49
564 0.56
565 0.59
566 0.61
567 0.64
568 0.65
569 0.64
570 0.65
571 0.57
572 0.48
573 0.41
574 0.33
575 0.25
576 0.18
577 0.16
578 0.15
579 0.16
580 0.21
581 0.24
582 0.26
583 0.28
584 0.31
585 0.3
586 0.32
587 0.33
588 0.32
589 0.29
590 0.29
591 0.28
592 0.25
593 0.23
594 0.18
595 0.16
596 0.1
597 0.14
598 0.13
599 0.12
600 0.15
601 0.16
602 0.19
603 0.25
604 0.3
605 0.31
606 0.41
607 0.44
608 0.45
609 0.53
610 0.51
611 0.47
612 0.42
613 0.38
614 0.31
615 0.33
616 0.27
617 0.19
618 0.19
619 0.19
620 0.19
621 0.19
622 0.16
623 0.13
624 0.14
625 0.13
626 0.17
627 0.19
628 0.18
629 0.19
630 0.2
631 0.18
632 0.17
633 0.18
634 0.14
635 0.13
636 0.15
637 0.15
638 0.14
639 0.16
640 0.18
641 0.16
642 0.15
643 0.14
644 0.12
645 0.14
646 0.14
647 0.12
648 0.22
649 0.22
650 0.22
651 0.23
652 0.21
653 0.19
654 0.2
655 0.24
656 0.15
657 0.21
658 0.23
659 0.27
660 0.3
661 0.31
662 0.31
663 0.28
664 0.32
665 0.29
666 0.31
667 0.28
668 0.25
669 0.25
670 0.24
671 0.25
672 0.25
673 0.28
674 0.31
675 0.32
676 0.32
677 0.36
678 0.39
679 0.39
680 0.42
681 0.36
682 0.32
683 0.33
684 0.37
685 0.36
686 0.33
687 0.32
688 0.27
689 0.29
690 0.29
691 0.24
692 0.21
693 0.2
694 0.21
695 0.21
696 0.21
697 0.23
698 0.3
699 0.31
700 0.31
701 0.31
702 0.3
703 0.35
704 0.36
705 0.4
706 0.38
707 0.4
708 0.41
709 0.41
710 0.41
711 0.35
712 0.34
713 0.28
714 0.24
715 0.2
716 0.2
717 0.2
718 0.18
719 0.21
720 0.18
721 0.17
722 0.17
723 0.15
724 0.13
725 0.12
726 0.13
727 0.11
728 0.12
729 0.12
730 0.12
731 0.13
732 0.16
733 0.17
734 0.17
735 0.16
736 0.17
737 0.18
738 0.25
739 0.24
740 0.21
741 0.21
742 0.21
743 0.21
744 0.18
745 0.16
746 0.1
747 0.1
748 0.1
749 0.09
750 0.08
751 0.08
752 0.07
753 0.06
754 0.05
755 0.04
756 0.04
757 0.04
758 0.04
759 0.05
760 0.05
761 0.06
762 0.06
763 0.07
764 0.1
765 0.11
766 0.12
767 0.19
768 0.27
769 0.34
770 0.35
771 0.38
772 0.38
773 0.38
774 0.42
775 0.37
776 0.32
777 0.26
778 0.27
779 0.22
780 0.21
781 0.18
782 0.13
783 0.1
784 0.07
785 0.08
786 0.08
787 0.09
788 0.13
789 0.13
790 0.14
791 0.16
792 0.17
793 0.16
794 0.14
795 0.14
796 0.1
797 0.11
798 0.1
799 0.07
800 0.06
801 0.06
802 0.06
803 0.04
804 0.04
805 0.04
806 0.05
807 0.05
808 0.06
809 0.08
810 0.08
811 0.09
812 0.11
813 0.15
814 0.15
815 0.16
816 0.23
817 0.3
818 0.38
819 0.42
820 0.44
821 0.43
822 0.49
823 0.54
824 0.55
825 0.55
826 0.52
827 0.52
828 0.5
829 0.49
830 0.43
831 0.47
832 0.47
833 0.48
834 0.44
835 0.4
836 0.38
837 0.36
838 0.39
839 0.34
840 0.29
841 0.27
842 0.26
843 0.27
844 0.32
845 0.32
846 0.31
847 0.26
848 0.23
849 0.19
850 0.19
851 0.19
852 0.15
853 0.17
854 0.16
855 0.16
856 0.17
857 0.15
858 0.14
859 0.12
860 0.12
861 0.12
862 0.13
863 0.15
864 0.13
865 0.15
866 0.15
867 0.16
868 0.16
869 0.22
870 0.29
871 0.34
872 0.37
873 0.43
874 0.46
875 0.47
876 0.47
877 0.39
878 0.3
879 0.26
880 0.22
881 0.14
882 0.1
883 0.08
884 0.08
885 0.07
886 0.07
887 0.04
888 0.04
889 0.03
890 0.04
891 0.03
892 0.04
893 0.05
894 0.07
895 0.09
896 0.1
897 0.11
898 0.14
899 0.19
900 0.24
901 0.27
902 0.27
903 0.26
904 0.32
905 0.38
906 0.41
907 0.45
908 0.48
909 0.47
910 0.53
911 0.54
912 0.51
913 0.49
914 0.47
915 0.38
916 0.32
917 0.29
918 0.23
919 0.21
920 0.16
921 0.11
922 0.07
923 0.07
924 0.06
925 0.04
926 0.05
927 0.05
928 0.05
929 0.06
930 0.06
931 0.06
932 0.06
933 0.06
934 0.05
935 0.05
936 0.04
937 0.04
938 0.04
939 0.04
940 0.03
941 0.03
942 0.04
943 0.03
944 0.04
945 0.04
946 0.04
947 0.05
948 0.05
949 0.06
950 0.06
951 0.07
952 0.11
953 0.13
954 0.14
955 0.13
956 0.14
957 0.17
958 0.2
959 0.2
960 0.22
961 0.21
962 0.21
963 0.22
964 0.21
965 0.21
966 0.19
967 0.18
968 0.17
969 0.19
970 0.19
971 0.21
972 0.23
973 0.21
974 0.25
975 0.25
976 0.22
977 0.21
978 0.21
979 0.22
980 0.22
981 0.2
982 0.16
983 0.16
984 0.16
985 0.14
986 0.14
987 0.11
988 0.09
989 0.11
990 0.1
991 0.09
992 0.1
993 0.11
994 0.1
995 0.09
996 0.11
997 0.12
998 0.13
999 0.15
1000 0.13
1001 0.13
1002 0.14
1003 0.15
1004 0.13
1005 0.11
1006 0.12
1007 0.13
1008 0.16
1009 0.2
1010 0.25
1011 0.27
1012 0.34
1013 0.39
1014 0.4
1015 0.45
1016 0.49
1017 0.53
1018 0.54
1019 0.53
1020 0.54
1021 0.53
1022 0.53
1023 0.52
1024 0.46
1025 0.46
1026 0.42
1027 0.44
1028 0.43
1029 0.44
1030 0.46
1031 0.51
1032 0.52
1033 0.46
1034 0.5
1035 0.51
1036 0.53
1037 0.54
1038 0.52
1039 0.46
1040 0.48
1041 0.53
1042 0.57
1043 0.56
1044 0.48
1045 0.45
1046 0.42
1047 0.42
1048 0.43
1049 0.37
1050 0.32
1051 0.32
1052 0.33
1053 0.32
1054 0.32
1055 0.29
1056 0.25
1057 0.23
1058 0.2
1059 0.16
1060 0.14
1061 0.15
1062 0.15
1063 0.15
1064 0.13
1065 0.13
1066 0.12
1067 0.12
1068 0.12
1069 0.09
1070 0.09
1071 0.09
1072 0.09
1073 0.1
1074 0.17
1075 0.21
1076 0.26
1077 0.36
1078 0.45
1079 0.45
1080 0.48
1081 0.51
1082 0.54
1083 0.58
1084 0.54
1085 0.48
1086 0.44
1087 0.45
1088 0.5
1089 0.52
1090 0.5
1091 0.5
1092 0.54
1093 0.54
1094 0.55
1095 0.63
1096 0.66
1097 0.7
1098 0.72
1099 0.75
1100 0.78
1101 0.82
1102 0.86
1103 0.86
1104 0.85
1105 0.79
1106 0.77
1107 0.74
1108 0.72
1109 0.71
1110 0.7
1111 0.68
1112 0.67
1113 0.66
1114 0.61
1115 0.61
1116 0.62
1117 0.58
1118 0.51
1119 0.45
1120 0.37
1121 0.34
1122 0.34
1123 0.27
1124 0.19
1125 0.17
1126 0.17
1127 0.17
1128 0.19
1129 0.2
1130 0.18
1131 0.18
1132 0.18
1133 0.19
1134 0.17
1135 0.18
1136 0.21
1137 0.21
1138 0.23
1139 0.23
1140 0.24
1141 0.23
1142 0.22
1143 0.2
1144 0.19
1145 0.19
1146 0.18
1147 0.19
1148 0.25
1149 0.33
1150 0.39
1151 0.46
1152 0.52