Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3CJ21

Protein Details
Accession M3CJ21    Localization Confidence Medium Confidence Score 11.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
10-40LSNSQRSILSRERQRGRKRKRGQDADHDDDDHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
21-30ERQRGRKRKR
Subcellular Location(s) mito 12, nucl 10, cyto 4
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR007224  TIF_Rrn11  
Gene Ontology GO:0001164  F:RNA polymerase I core promoter sequence-specific DNA binding  
GO:0001181  F:RNA polymerase I general transcription initiation factor activity  
Pfam View protein in Pfam  
PF04090  RNA_pol_I_TF  
Amino Acid Sequences MASFAPVYRLSNSQRSILSRERQRGRKRKRGQDADHDDDDDDDEKSEAEAEDGSPKSDDEQPDKAEQPPRVLHPVNQKDPYNVAGWSREIPLPGRNFPHAAFSETVVEKRNVEEDLAQLNPPIYLLKKSPDDPAGSLRGRHLDNLTAILHRCMLRQDWKRATRAWGLILRTEIAGDGPDIRKHGRWMIGAELLMRKEQTYENSVAGSDDSESHRSVVIPDSNFQLAREYYGRLVLQHPQLQGTHYSRISAWAIHPTLLNIWIFEVQERSRRARQQLVASLDSMEAAEYSDVHSERSDNSEHQQALCQIRSRELQEASPIVQKLEELLSNPPYDTSAELLELRGMVSLWLADLHKALARMKDDSHVEKEDEDDEPGESQPFQIRHQMQAQMEHAKAKETFQKAMNAGANLSLENLAFLEGESSRLDDVEDE
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.42
2 0.43
3 0.48
4 0.5
5 0.54
6 0.55
7 0.63
8 0.68
9 0.74
10 0.81
11 0.85
12 0.87
13 0.89
14 0.9
15 0.91
16 0.93
17 0.94
18 0.91
19 0.91
20 0.9
21 0.87
22 0.79
23 0.69
24 0.58
25 0.48
26 0.41
27 0.31
28 0.22
29 0.15
30 0.12
31 0.11
32 0.11
33 0.11
34 0.09
35 0.08
36 0.08
37 0.09
38 0.15
39 0.15
40 0.16
41 0.15
42 0.15
43 0.18
44 0.23
45 0.26
46 0.26
47 0.31
48 0.34
49 0.38
50 0.4
51 0.43
52 0.44
53 0.42
54 0.42
55 0.41
56 0.42
57 0.45
58 0.45
59 0.45
60 0.49
61 0.56
62 0.58
63 0.59
64 0.56
65 0.51
66 0.51
67 0.48
68 0.38
69 0.3
70 0.24
71 0.2
72 0.21
73 0.2
74 0.21
75 0.2
76 0.19
77 0.2
78 0.24
79 0.27
80 0.29
81 0.31
82 0.31
83 0.32
84 0.31
85 0.35
86 0.3
87 0.29
88 0.25
89 0.23
90 0.26
91 0.25
92 0.26
93 0.22
94 0.22
95 0.19
96 0.19
97 0.2
98 0.15
99 0.15
100 0.15
101 0.14
102 0.15
103 0.16
104 0.15
105 0.13
106 0.13
107 0.11
108 0.11
109 0.1
110 0.08
111 0.1
112 0.12
113 0.16
114 0.19
115 0.21
116 0.25
117 0.27
118 0.28
119 0.27
120 0.3
121 0.32
122 0.29
123 0.29
124 0.26
125 0.27
126 0.25
127 0.25
128 0.23
129 0.18
130 0.18
131 0.19
132 0.19
133 0.16
134 0.16
135 0.15
136 0.16
137 0.14
138 0.14
139 0.14
140 0.16
141 0.24
142 0.31
143 0.39
144 0.46
145 0.5
146 0.53
147 0.53
148 0.54
149 0.5
150 0.45
151 0.4
152 0.35
153 0.32
154 0.3
155 0.28
156 0.24
157 0.18
158 0.16
159 0.11
160 0.07
161 0.06
162 0.05
163 0.07
164 0.08
165 0.09
166 0.11
167 0.12
168 0.13
169 0.15
170 0.18
171 0.19
172 0.19
173 0.19
174 0.2
175 0.2
176 0.19
177 0.18
178 0.17
179 0.14
180 0.13
181 0.12
182 0.09
183 0.09
184 0.11
185 0.12
186 0.14
187 0.15
188 0.15
189 0.15
190 0.15
191 0.13
192 0.12
193 0.1
194 0.07
195 0.07
196 0.08
197 0.1
198 0.1
199 0.1
200 0.1
201 0.1
202 0.1
203 0.12
204 0.14
205 0.13
206 0.13
207 0.15
208 0.15
209 0.15
210 0.15
211 0.14
212 0.1
213 0.12
214 0.12
215 0.12
216 0.11
217 0.13
218 0.13
219 0.12
220 0.13
221 0.15
222 0.18
223 0.21
224 0.21
225 0.2
226 0.2
227 0.2
228 0.24
229 0.22
230 0.22
231 0.19
232 0.19
233 0.18
234 0.2
235 0.2
236 0.16
237 0.14
238 0.16
239 0.16
240 0.16
241 0.16
242 0.14
243 0.13
244 0.14
245 0.13
246 0.08
247 0.08
248 0.09
249 0.09
250 0.09
251 0.11
252 0.11
253 0.17
254 0.2
255 0.25
256 0.3
257 0.35
258 0.4
259 0.44
260 0.48
261 0.48
262 0.52
263 0.51
264 0.46
265 0.4
266 0.36
267 0.29
268 0.24
269 0.17
270 0.1
271 0.05
272 0.05
273 0.04
274 0.04
275 0.05
276 0.08
277 0.08
278 0.09
279 0.09
280 0.1
281 0.11
282 0.14
283 0.15
284 0.14
285 0.17
286 0.22
287 0.23
288 0.23
289 0.24
290 0.26
291 0.28
292 0.29
293 0.31
294 0.26
295 0.29
296 0.32
297 0.32
298 0.32
299 0.29
300 0.27
301 0.26
302 0.27
303 0.26
304 0.27
305 0.24
306 0.19
307 0.18
308 0.16
309 0.14
310 0.15
311 0.13
312 0.1
313 0.14
314 0.16
315 0.17
316 0.17
317 0.15
318 0.15
319 0.15
320 0.14
321 0.12
322 0.1
323 0.11
324 0.11
325 0.11
326 0.11
327 0.1
328 0.09
329 0.08
330 0.07
331 0.05
332 0.05
333 0.05
334 0.04
335 0.06
336 0.07
337 0.07
338 0.07
339 0.09
340 0.1
341 0.12
342 0.15
343 0.18
344 0.2
345 0.22
346 0.23
347 0.28
348 0.31
349 0.34
350 0.37
351 0.35
352 0.34
353 0.32
354 0.32
355 0.29
356 0.25
357 0.21
358 0.17
359 0.15
360 0.15
361 0.15
362 0.14
363 0.12
364 0.13
365 0.17
366 0.18
367 0.2
368 0.28
369 0.3
370 0.34
371 0.39
372 0.45
373 0.4
374 0.44
375 0.47
376 0.44
377 0.43
378 0.42
379 0.37
380 0.34
381 0.33
382 0.31
383 0.36
384 0.33
385 0.37
386 0.36
387 0.43
388 0.39
389 0.45
390 0.45
391 0.37
392 0.33
393 0.31
394 0.28
395 0.2
396 0.21
397 0.14
398 0.1
399 0.1
400 0.09
401 0.08
402 0.07
403 0.07
404 0.08
405 0.08
406 0.1
407 0.1
408 0.11
409 0.11
410 0.11