Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M3B1Q3

Protein Details
Accession M3B1Q3    Localization Confidence Medium Confidence Score 14.4
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
14-35EAEPARKKRKPATVKDQLPPLPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
19-23RKKRK
Subcellular Location(s) nucl 24.5, cyto_nucl 14
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR027521  Usb1  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0016829  F:lyase activity  
GO:1990838  F:poly(U)-specific exoribonuclease activity, producing 3' uridine cyclic phosphate ends  
GO:0034477  P:U6 snRNA 3'-end processing  
Pfam View protein in Pfam  
PF09749  HVSL  
Amino Acid Sequences MGLVDYSDSDGDDEAEPARKKRKPATVKDQLPPLPAAFRDLYSSTVRTSTHDDPSLHEGRKRVTPHIAGNWPTHVYLDWTPQPHDYRSLQDLITHAQKTTNCKDDIHSLLENDLGVRQPLHVSLSRPLALKTEHKDTFFDRLKTSISLAGVSAFSVRPLDLVWHPNEDQTRWFLVLRLRRPSCDELRILLERSNDLARQYNQPLLYGHRTFSSSHVPEAWEHDNFHISIAWSIQPHQKSASAGPVEVVISDQLLQKLKASDLTFREVKVRIGQDVHSIPLRQARKR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.11
2 0.18
3 0.21
4 0.25
5 0.35
6 0.37
7 0.44
8 0.52
9 0.61
10 0.64
11 0.72
12 0.78
13 0.8
14 0.84
15 0.82
16 0.81
17 0.73
18 0.65
19 0.57
20 0.47
21 0.4
22 0.32
23 0.31
24 0.23
25 0.21
26 0.22
27 0.21
28 0.23
29 0.23
30 0.24
31 0.21
32 0.22
33 0.22
34 0.21
35 0.27
36 0.28
37 0.31
38 0.35
39 0.34
40 0.35
41 0.42
42 0.46
43 0.41
44 0.39
45 0.36
46 0.34
47 0.4
48 0.4
49 0.37
50 0.37
51 0.39
52 0.42
53 0.46
54 0.49
55 0.46
56 0.44
57 0.42
58 0.37
59 0.33
60 0.28
61 0.2
62 0.18
63 0.17
64 0.21
65 0.22
66 0.22
67 0.24
68 0.28
69 0.3
70 0.28
71 0.31
72 0.27
73 0.28
74 0.29
75 0.3
76 0.25
77 0.24
78 0.23
79 0.22
80 0.25
81 0.21
82 0.18
83 0.19
84 0.22
85 0.27
86 0.31
87 0.33
88 0.29
89 0.3
90 0.31
91 0.34
92 0.34
93 0.32
94 0.28
95 0.22
96 0.21
97 0.2
98 0.18
99 0.13
100 0.1
101 0.06
102 0.06
103 0.05
104 0.05
105 0.06
106 0.06
107 0.09
108 0.1
109 0.11
110 0.14
111 0.17
112 0.18
113 0.18
114 0.18
115 0.17
116 0.18
117 0.21
118 0.21
119 0.26
120 0.26
121 0.27
122 0.28
123 0.28
124 0.34
125 0.34
126 0.32
127 0.25
128 0.25
129 0.25
130 0.24
131 0.23
132 0.16
133 0.12
134 0.1
135 0.1
136 0.09
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.05
141 0.05
142 0.05
143 0.05
144 0.04
145 0.05
146 0.07
147 0.08
148 0.12
149 0.13
150 0.16
151 0.16
152 0.19
153 0.2
154 0.18
155 0.17
156 0.16
157 0.17
158 0.15
159 0.15
160 0.14
161 0.19
162 0.25
163 0.29
164 0.36
165 0.36
166 0.37
167 0.42
168 0.45
169 0.45
170 0.42
171 0.38
172 0.3
173 0.34
174 0.34
175 0.3
176 0.27
177 0.23
178 0.19
179 0.2
180 0.2
181 0.16
182 0.16
183 0.19
184 0.19
185 0.24
186 0.26
187 0.28
188 0.26
189 0.27
190 0.26
191 0.26
192 0.31
193 0.27
194 0.25
195 0.22
196 0.23
197 0.23
198 0.25
199 0.3
200 0.24
201 0.24
202 0.25
203 0.25
204 0.24
205 0.29
206 0.29
207 0.22
208 0.22
209 0.22
210 0.22
211 0.21
212 0.21
213 0.17
214 0.13
215 0.12
216 0.13
217 0.14
218 0.12
219 0.15
220 0.21
221 0.21
222 0.21
223 0.23
224 0.24
225 0.24
226 0.26
227 0.32
228 0.26
229 0.25
230 0.24
231 0.23
232 0.2
233 0.17
234 0.16
235 0.08
236 0.07
237 0.08
238 0.1
239 0.12
240 0.14
241 0.15
242 0.17
243 0.19
244 0.19
245 0.24
246 0.24
247 0.27
248 0.29
249 0.35
250 0.34
251 0.33
252 0.37
253 0.33
254 0.35
255 0.35
256 0.35
257 0.32
258 0.33
259 0.33
260 0.36
261 0.36
262 0.36
263 0.33
264 0.31
265 0.29
266 0.35