Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

N1QIF0

Protein Details
Accession N1QIF0    Localization Confidence High Confidence Score 15.8
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
92-112IAPVAPPKKRGRPPKSAAPTAHydrophilic
122-142GTPVPAKRGRGRPRKDANATPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
97-137PPKKRGRPPKSAAPTAAPGPDQPGEGTPVPAKRGRGRPRKD
159-196VKRGRGRPRKDANASPAAAKVAPVAGAVKRGRGRPRKD
218-273TAKRGRGRPRKDANAVPAPVKVAPKVTATGKKRGRPAKEPPREDQPPKKRGRPSRA
333-345AKRGRGRPPGKGK
Subcellular Location(s) cyto 19.5, cyto_nucl 14, nucl 7.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR017956  AT_hook_DNA-bd_motif  
IPR002740  EVE_domain  
IPR000116  HMGA  
IPR000637  HMGI/Y_DNA-bd_CS  
IPR015947  PUA-like_sf  
IPR047197  THYN1-like_EVE  
Gene Ontology GO:0000785  C:chromatin  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
GO:0006355  P:regulation of DNA-templated transcription  
Pfam View protein in Pfam  
PF02178  AT_hook  
PF01878  EVE  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS00354  HMGI_Y  
CDD cd21133  EVE  
Amino Acid Sequences MPPMTFAVDVDADAMVNSPAAESTRAPVQDAPGPVATKKSKQTETTAATSRSNRVAAQTDLSFPDTAPEQRAKNTTAPADVKSNGTKSAVSIAPVAPPKKRGRPPKSAAPTAAPGPDQPGEGTPVPAKRGRGRPRKDANATPTATKVAPVTAPASAGVVKRGRGRPRKDANASPAAAKVAPVAGAVKRGRGRPRKDATATPAATKVAPVTAPAPSAVTAKRGRGRPRKDANAVPAPVKVAPKVTATGKKRGRPAKEPPREDQPPKKRGRPSRASALADAVPPEGEQPPRKRGLPPYGGETTKNDAEDEIAAEQLEEELMDEANDVAVPATEPAKRGRGRPPGKGKQAGAAVVADATSTSDQQFWLMKAEQEGHDEILANGDVYNTKFTIDDLRAKTSPEPWDGVRNPTAAKNMRAMRTNDLAFFYASGGKPGIVGIMEIVGEAQPDPTASDKNSYGYVANEAQRSKWCVVHVEFRMKFKKPITRTQLVAARDAGPLANLQEFTAARLSVSKVSKDEWDYINSLVEGSDDDEAENGEKGQDEQMKTRTNGSSEAVGEEPKTESPSLSVGLLAEDGTPTTDAIVSTVDDLPTSV
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.1
2 0.06
3 0.06
4 0.06
5 0.05
6 0.06
7 0.08
8 0.1
9 0.1
10 0.13
11 0.19
12 0.19
13 0.21
14 0.22
15 0.24
16 0.28
17 0.29
18 0.3
19 0.27
20 0.29
21 0.27
22 0.33
23 0.35
24 0.36
25 0.43
26 0.47
27 0.5
28 0.53
29 0.59
30 0.61
31 0.62
32 0.62
33 0.6
34 0.55
35 0.54
36 0.53
37 0.5
38 0.45
39 0.41
40 0.35
41 0.33
42 0.34
43 0.31
44 0.32
45 0.29
46 0.27
47 0.28
48 0.29
49 0.25
50 0.2
51 0.2
52 0.19
53 0.19
54 0.21
55 0.24
56 0.24
57 0.29
58 0.33
59 0.35
60 0.36
61 0.39
62 0.37
63 0.39
64 0.39
65 0.37
66 0.38
67 0.36
68 0.35
69 0.34
70 0.34
71 0.29
72 0.28
73 0.25
74 0.21
75 0.26
76 0.22
77 0.19
78 0.2
79 0.18
80 0.22
81 0.28
82 0.3
83 0.27
84 0.34
85 0.4
86 0.48
87 0.57
88 0.62
89 0.65
90 0.73
91 0.78
92 0.81
93 0.82
94 0.78
95 0.72
96 0.65
97 0.59
98 0.51
99 0.46
100 0.35
101 0.27
102 0.25
103 0.23
104 0.19
105 0.17
106 0.15
107 0.18
108 0.17
109 0.19
110 0.19
111 0.2
112 0.23
113 0.26
114 0.29
115 0.33
116 0.43
117 0.51
118 0.58
119 0.63
120 0.7
121 0.77
122 0.82
123 0.81
124 0.79
125 0.75
126 0.73
127 0.67
128 0.58
129 0.5
130 0.43
131 0.35
132 0.28
133 0.22
134 0.15
135 0.13
136 0.13
137 0.13
138 0.11
139 0.11
140 0.1
141 0.11
142 0.11
143 0.11
144 0.15
145 0.15
146 0.18
147 0.25
148 0.32
149 0.41
150 0.48
151 0.55
152 0.6
153 0.68
154 0.76
155 0.75
156 0.74
157 0.71
158 0.69
159 0.63
160 0.54
161 0.45
162 0.36
163 0.29
164 0.23
165 0.16
166 0.09
167 0.08
168 0.07
169 0.08
170 0.07
171 0.14
172 0.14
173 0.19
174 0.22
175 0.28
176 0.37
177 0.45
178 0.51
179 0.55
180 0.62
181 0.65
182 0.65
183 0.64
184 0.61
185 0.61
186 0.56
187 0.47
188 0.42
189 0.34
190 0.3
191 0.25
192 0.19
193 0.1
194 0.09
195 0.09
196 0.09
197 0.09
198 0.09
199 0.09
200 0.09
201 0.09
202 0.11
203 0.1
204 0.15
205 0.16
206 0.21
207 0.27
208 0.32
209 0.42
210 0.5
211 0.56
212 0.61
213 0.69
214 0.72
215 0.72
216 0.7
217 0.67
218 0.65
219 0.59
220 0.49
221 0.4
222 0.33
223 0.3
224 0.26
225 0.19
226 0.13
227 0.14
228 0.14
229 0.16
230 0.19
231 0.25
232 0.28
233 0.37
234 0.42
235 0.45
236 0.52
237 0.57
238 0.58
239 0.57
240 0.65
241 0.66
242 0.7
243 0.7
244 0.65
245 0.67
246 0.68
247 0.67
248 0.66
249 0.65
250 0.65
251 0.67
252 0.71
253 0.7
254 0.73
255 0.76
256 0.74
257 0.7
258 0.69
259 0.7
260 0.64
261 0.56
262 0.49
263 0.4
264 0.31
265 0.27
266 0.17
267 0.1
268 0.08
269 0.09
270 0.08
271 0.1
272 0.15
273 0.19
274 0.24
275 0.26
276 0.28
277 0.3
278 0.34
279 0.4
280 0.41
281 0.38
282 0.39
283 0.4
284 0.39
285 0.37
286 0.33
287 0.28
288 0.22
289 0.21
290 0.16
291 0.12
292 0.12
293 0.11
294 0.1
295 0.07
296 0.06
297 0.05
298 0.05
299 0.05
300 0.04
301 0.04
302 0.03
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.03
309 0.03
310 0.03
311 0.03
312 0.02
313 0.02
314 0.03
315 0.03
316 0.05
317 0.06
318 0.08
319 0.1
320 0.17
321 0.19
322 0.23
323 0.31
324 0.4
325 0.44
326 0.52
327 0.61
328 0.63
329 0.68
330 0.7
331 0.61
332 0.55
333 0.52
334 0.43
335 0.33
336 0.24
337 0.17
338 0.12
339 0.11
340 0.06
341 0.04
342 0.05
343 0.04
344 0.05
345 0.05
346 0.06
347 0.06
348 0.08
349 0.09
350 0.09
351 0.12
352 0.12
353 0.12
354 0.13
355 0.16
356 0.15
357 0.17
358 0.17
359 0.14
360 0.13
361 0.13
362 0.12
363 0.1
364 0.09
365 0.07
366 0.06
367 0.06
368 0.06
369 0.07
370 0.08
371 0.07
372 0.08
373 0.08
374 0.08
375 0.14
376 0.15
377 0.23
378 0.24
379 0.29
380 0.29
381 0.31
382 0.32
383 0.31
384 0.32
385 0.27
386 0.27
387 0.23
388 0.31
389 0.31
390 0.35
391 0.31
392 0.29
393 0.27
394 0.28
395 0.33
396 0.28
397 0.28
398 0.31
399 0.34
400 0.36
401 0.4
402 0.41
403 0.38
404 0.4
405 0.39
406 0.33
407 0.3
408 0.27
409 0.22
410 0.2
411 0.16
412 0.15
413 0.14
414 0.14
415 0.12
416 0.11
417 0.11
418 0.11
419 0.1
420 0.06
421 0.06
422 0.04
423 0.04
424 0.04
425 0.04
426 0.04
427 0.04
428 0.04
429 0.04
430 0.04
431 0.04
432 0.04
433 0.06
434 0.07
435 0.1
436 0.1
437 0.14
438 0.15
439 0.16
440 0.17
441 0.17
442 0.17
443 0.15
444 0.19
445 0.19
446 0.21
447 0.24
448 0.23
449 0.24
450 0.27
451 0.31
452 0.29
453 0.28
454 0.26
455 0.28
456 0.31
457 0.38
458 0.4
459 0.46
460 0.46
461 0.51
462 0.56
463 0.52
464 0.55
465 0.53
466 0.57
467 0.52
468 0.6
469 0.62
470 0.61
471 0.6
472 0.62
473 0.61
474 0.53
475 0.5
476 0.41
477 0.34
478 0.28
479 0.27
480 0.19
481 0.13
482 0.13
483 0.12
484 0.11
485 0.1
486 0.09
487 0.13
488 0.13
489 0.14
490 0.16
491 0.14
492 0.12
493 0.14
494 0.16
495 0.19
496 0.22
497 0.23
498 0.23
499 0.25
500 0.3
501 0.32
502 0.35
503 0.31
504 0.32
505 0.31
506 0.3
507 0.3
508 0.24
509 0.21
510 0.15
511 0.13
512 0.1
513 0.1
514 0.1
515 0.08
516 0.08
517 0.08
518 0.09
519 0.1
520 0.1
521 0.08
522 0.08
523 0.08
524 0.09
525 0.16
526 0.21
527 0.23
528 0.28
529 0.34
530 0.41
531 0.41
532 0.46
533 0.43
534 0.39
535 0.4
536 0.37
537 0.34
538 0.29
539 0.3
540 0.25
541 0.23
542 0.21
543 0.2
544 0.19
545 0.17
546 0.19
547 0.17
548 0.16
549 0.17
550 0.18
551 0.18
552 0.16
553 0.15
554 0.12
555 0.12
556 0.12
557 0.1
558 0.08
559 0.07
560 0.07
561 0.08
562 0.08
563 0.07
564 0.08
565 0.09
566 0.08
567 0.09
568 0.1
569 0.09
570 0.12
571 0.13
572 0.13