Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0DK51

Protein Details
Accession B0DK51    Localization Confidence High Confidence Score 19.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
3-31PLAPRSQGKVHKKSTEKVNKKQNETNFVEHydrophilic
118-143EPLDGTKKRKRIIKPKDPNAPKRPASBasic
223-243ALATKKEKKPRAPRTTKPAAAHydrophilic
453-478AFTARLPPTHPRHPPRRNRSPTLAPLHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
123-140TKKRKRIIKPKDPNAPKR
227-238KKEKKPRAPRTT
Subcellular Location(s) nucl 16, cyto_nucl 10, mito 5, cyto 2, plas 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_294914  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MLPLAPRSQGKVHKKSTEKVNKKQNETNFVESLNKSNFPPNAIQMSTTDIAQLEQQRKELAASFNDIATVLKRSSELAASFAESILGSDAFEVLQHLQQSADPAPTKGKRKAAVTEDEPLDGTKKRKRIIKPKDPNAPKRPASSYILYQNNVRKELKEQHPEMNNADLLTMISEQWKNMTTEEKDKYNQENKVLTQQYSEEKKAYDNRTPEEVQAAKAAAEVALATKKEKKPRAPRTTKPAAAAVAPAVVPTPARPPPVVEASHSSGSEDSSDESDDEEPHPIAHLPCDKDSGPVKVVWLRSDSCFLHLLLTGVTVFLDTVILPTSTGCEKELPRLADLGHVERLFSNHSAREQLEVDIIVHTLRPKNDSINSTSIGEPLVEIATQYLTNKVVTALKPMKAEASQELFDLFNNNDSVIKGTTGTLPLHIYELRVALPDSPHSGLSVRSLSPLAFTARLPPTHPRHPPRRNRSPTLAPLLPQPHPTCLHLPHMNHRETQIPASSLLVGSRNSIQTPVSYKTWFYVNTNASPPVTSWVHPLGAAPPPGPPPAPHSPPAGPPPPTNTGYNQGSGGQGYGYSNPQGGYSPSYVAFQHTSSH
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.73
2 0.77
3 0.8
4 0.82
5 0.81
6 0.81
7 0.84
8 0.83
9 0.85
10 0.85
11 0.82
12 0.8
13 0.77
14 0.74
15 0.64
16 0.57
17 0.55
18 0.48
19 0.46
20 0.4
21 0.36
22 0.31
23 0.36
24 0.36
25 0.34
26 0.36
27 0.35
28 0.36
29 0.35
30 0.34
31 0.28
32 0.33
33 0.29
34 0.25
35 0.21
36 0.15
37 0.15
38 0.19
39 0.26
40 0.26
41 0.27
42 0.29
43 0.29
44 0.29
45 0.31
46 0.31
47 0.27
48 0.23
49 0.27
50 0.26
51 0.25
52 0.25
53 0.23
54 0.19
55 0.17
56 0.17
57 0.12
58 0.12
59 0.12
60 0.13
61 0.15
62 0.18
63 0.17
64 0.16
65 0.16
66 0.17
67 0.17
68 0.15
69 0.14
70 0.1
71 0.1
72 0.09
73 0.08
74 0.06
75 0.06
76 0.06
77 0.06
78 0.06
79 0.07
80 0.07
81 0.09
82 0.1
83 0.1
84 0.11
85 0.11
86 0.15
87 0.15
88 0.19
89 0.17
90 0.18
91 0.26
92 0.33
93 0.4
94 0.43
95 0.49
96 0.49
97 0.52
98 0.59
99 0.57
100 0.58
101 0.54
102 0.54
103 0.48
104 0.44
105 0.39
106 0.32
107 0.28
108 0.25
109 0.28
110 0.27
111 0.33
112 0.38
113 0.46
114 0.55
115 0.64
116 0.71
117 0.76
118 0.81
119 0.84
120 0.89
121 0.91
122 0.91
123 0.88
124 0.86
125 0.79
126 0.73
127 0.68
128 0.62
129 0.57
130 0.51
131 0.47
132 0.46
133 0.47
134 0.43
135 0.43
136 0.44
137 0.43
138 0.45
139 0.41
140 0.33
141 0.35
142 0.44
143 0.48
144 0.51
145 0.5
146 0.53
147 0.57
148 0.58
149 0.53
150 0.47
151 0.38
152 0.29
153 0.25
154 0.18
155 0.12
156 0.1
157 0.09
158 0.06
159 0.09
160 0.1
161 0.1
162 0.11
163 0.13
164 0.13
165 0.14
166 0.2
167 0.19
168 0.27
169 0.31
170 0.33
171 0.34
172 0.38
173 0.45
174 0.46
175 0.46
176 0.43
177 0.43
178 0.41
179 0.47
180 0.46
181 0.38
182 0.32
183 0.31
184 0.33
185 0.34
186 0.35
187 0.27
188 0.25
189 0.29
190 0.36
191 0.38
192 0.37
193 0.36
194 0.37
195 0.42
196 0.42
197 0.38
198 0.36
199 0.31
200 0.26
201 0.23
202 0.2
203 0.14
204 0.13
205 0.13
206 0.07
207 0.06
208 0.05
209 0.05
210 0.07
211 0.07
212 0.09
213 0.16
214 0.21
215 0.3
216 0.37
217 0.46
218 0.55
219 0.66
220 0.76
221 0.77
222 0.8
223 0.81
224 0.83
225 0.76
226 0.67
227 0.58
228 0.47
229 0.38
230 0.31
231 0.22
232 0.14
233 0.1
234 0.08
235 0.06
236 0.05
237 0.05
238 0.05
239 0.09
240 0.11
241 0.13
242 0.13
243 0.14
244 0.18
245 0.22
246 0.22
247 0.19
248 0.21
249 0.23
250 0.25
251 0.23
252 0.2
253 0.16
254 0.15
255 0.14
256 0.1
257 0.08
258 0.07
259 0.07
260 0.07
261 0.08
262 0.08
263 0.09
264 0.09
265 0.09
266 0.09
267 0.08
268 0.09
269 0.09
270 0.08
271 0.1
272 0.14
273 0.14
274 0.15
275 0.18
276 0.17
277 0.2
278 0.22
279 0.21
280 0.18
281 0.17
282 0.17
283 0.18
284 0.19
285 0.16
286 0.17
287 0.16
288 0.15
289 0.19
290 0.18
291 0.16
292 0.17
293 0.16
294 0.14
295 0.13
296 0.12
297 0.08
298 0.08
299 0.06
300 0.05
301 0.05
302 0.04
303 0.03
304 0.03
305 0.03
306 0.03
307 0.03
308 0.04
309 0.04
310 0.04
311 0.04
312 0.06
313 0.06
314 0.07
315 0.07
316 0.1
317 0.11
318 0.16
319 0.21
320 0.2
321 0.2
322 0.2
323 0.2
324 0.2
325 0.21
326 0.18
327 0.16
328 0.15
329 0.15
330 0.14
331 0.15
332 0.14
333 0.14
334 0.14
335 0.12
336 0.13
337 0.15
338 0.16
339 0.17
340 0.16
341 0.15
342 0.14
343 0.13
344 0.12
345 0.1
346 0.09
347 0.07
348 0.06
349 0.08
350 0.1
351 0.11
352 0.13
353 0.14
354 0.18
355 0.22
356 0.24
357 0.27
358 0.27
359 0.28
360 0.27
361 0.26
362 0.23
363 0.18
364 0.15
365 0.11
366 0.08
367 0.07
368 0.05
369 0.05
370 0.05
371 0.05
372 0.06
373 0.06
374 0.07
375 0.08
376 0.08
377 0.08
378 0.09
379 0.13
380 0.13
381 0.21
382 0.23
383 0.25
384 0.26
385 0.26
386 0.27
387 0.24
388 0.25
389 0.21
390 0.2
391 0.18
392 0.17
393 0.18
394 0.16
395 0.15
396 0.16
397 0.12
398 0.1
399 0.1
400 0.1
401 0.1
402 0.1
403 0.12
404 0.11
405 0.11
406 0.09
407 0.1
408 0.11
409 0.13
410 0.13
411 0.12
412 0.12
413 0.12
414 0.14
415 0.13
416 0.12
417 0.11
418 0.11
419 0.1
420 0.1
421 0.1
422 0.1
423 0.11
424 0.11
425 0.14
426 0.14
427 0.14
428 0.14
429 0.14
430 0.14
431 0.16
432 0.17
433 0.14
434 0.14
435 0.15
436 0.14
437 0.14
438 0.15
439 0.14
440 0.13
441 0.13
442 0.18
443 0.21
444 0.23
445 0.24
446 0.31
447 0.36
448 0.44
449 0.54
450 0.56
451 0.64
452 0.73
453 0.81
454 0.83
455 0.88
456 0.87
457 0.85
458 0.84
459 0.82
460 0.79
461 0.76
462 0.67
463 0.57
464 0.55
465 0.52
466 0.46
467 0.43
468 0.38
469 0.34
470 0.35
471 0.37
472 0.35
473 0.33
474 0.39
475 0.39
476 0.4
477 0.46
478 0.52
479 0.51
480 0.47
481 0.46
482 0.43
483 0.39
484 0.39
485 0.32
486 0.25
487 0.24
488 0.23
489 0.22
490 0.18
491 0.17
492 0.16
493 0.13
494 0.14
495 0.17
496 0.17
497 0.17
498 0.18
499 0.17
500 0.18
501 0.23
502 0.25
503 0.25
504 0.25
505 0.25
506 0.26
507 0.29
508 0.29
509 0.27
510 0.31
511 0.32
512 0.35
513 0.37
514 0.38
515 0.34
516 0.32
517 0.3
518 0.27
519 0.25
520 0.22
521 0.23
522 0.23
523 0.23
524 0.23
525 0.23
526 0.2
527 0.23
528 0.24
529 0.2
530 0.2
531 0.22
532 0.24
533 0.25
534 0.22
535 0.25
536 0.32
537 0.37
538 0.37
539 0.4
540 0.41
541 0.46
542 0.52
543 0.52
544 0.47
545 0.44
546 0.48
547 0.49
548 0.49
549 0.46
550 0.42
551 0.43
552 0.42
553 0.41
554 0.35
555 0.3
556 0.28
557 0.26
558 0.22
559 0.14
560 0.12
561 0.12
562 0.13
563 0.14
564 0.14
565 0.15
566 0.15
567 0.16
568 0.16
569 0.17
570 0.2
571 0.19
572 0.2
573 0.2
574 0.22
575 0.21
576 0.24
577 0.24