Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0D9T9

Protein Details
Accession B0D9T9    Localization Confidence Low Confidence Score 7.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
18-38LRDHCRCPKCFHPATKQRLLDHydrophilic
NLS Segment(s)
Subcellular Location(s) mito 9, nucl 8.5, cyto_nucl 6.5, pero 5, cyto 3.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR010376  GBBH-like_N  
IPR038492  GBBH-like_N_sf  
IPR042098  TauD-like_sf  
IPR003819  TauD/TfdA-like  
IPR012776  Trimethyllysine_dOase  
Gene Ontology GO:0005506  F:iron ion binding  
GO:0050353  F:trimethyllysine dioxygenase activity  
GO:0045329  P:carnitine biosynthetic process  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_249619  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF06155  GBBH-like_N  
PF02668  TauD  
CDD cd00250  CAS_like  
Amino Acid Sequences MNSFRFPYTSVYSHNIWLRDHCRCPKCFHPATKQRLLDTFEIPTDIAPLHIEAKVEGLEVTWPSQDPHVSLYPWSWLQRHSYDPSLSGKDASQEKVLWGSTIQKSPPTVAYEEVMAKDDQGLFKWLSNVDRFGFSFVSGVPETPEATEALSERIGFIRETQYGRFWEITSDLAKGDTAYTTLALGAHTDNTYFTDPCGLQLFHLLSHTGGTGGATLLVDGFYVANIMKELHPEAYDLLSRIPVPAHAAGESSALYRPSPPSGYPVLGHDAFTGELTQVRWNNDDRSVMSHLTSDLVEKWYDAIRTWNKCLTSPDSQYWVQLQPGTAVVVDNHRVLHGRSAFDGRRRMCGAYIGVDEYRSKLAVLSEKFAPDPVLVATEKIPLSTANGRSIWNAAL
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.43
2 0.4
3 0.36
4 0.41
5 0.43
6 0.47
7 0.54
8 0.58
9 0.61
10 0.62
11 0.67
12 0.68
13 0.71
14 0.72
15 0.72
16 0.73
17 0.75
18 0.81
19 0.84
20 0.79
21 0.72
22 0.68
23 0.64
24 0.56
25 0.49
26 0.42
27 0.33
28 0.3
29 0.26
30 0.21
31 0.18
32 0.14
33 0.11
34 0.09
35 0.1
36 0.11
37 0.12
38 0.12
39 0.11
40 0.12
41 0.12
42 0.11
43 0.1
44 0.08
45 0.09
46 0.1
47 0.11
48 0.1
49 0.11
50 0.11
51 0.14
52 0.15
53 0.13
54 0.17
55 0.19
56 0.18
57 0.19
58 0.19
59 0.21
60 0.23
61 0.25
62 0.22
63 0.22
64 0.27
65 0.29
66 0.34
67 0.34
68 0.36
69 0.34
70 0.35
71 0.38
72 0.36
73 0.33
74 0.29
75 0.25
76 0.25
77 0.27
78 0.27
79 0.24
80 0.21
81 0.21
82 0.22
83 0.22
84 0.17
85 0.14
86 0.19
87 0.2
88 0.24
89 0.24
90 0.24
91 0.25
92 0.26
93 0.29
94 0.25
95 0.23
96 0.2
97 0.2
98 0.19
99 0.2
100 0.18
101 0.17
102 0.13
103 0.12
104 0.12
105 0.13
106 0.11
107 0.11
108 0.13
109 0.12
110 0.13
111 0.15
112 0.15
113 0.17
114 0.18
115 0.19
116 0.18
117 0.19
118 0.19
119 0.19
120 0.18
121 0.14
122 0.13
123 0.11
124 0.14
125 0.12
126 0.12
127 0.1
128 0.11
129 0.11
130 0.1
131 0.11
132 0.07
133 0.07
134 0.07
135 0.07
136 0.08
137 0.08
138 0.07
139 0.07
140 0.08
141 0.08
142 0.08
143 0.09
144 0.11
145 0.14
146 0.16
147 0.16
148 0.18
149 0.19
150 0.21
151 0.2
152 0.17
153 0.15
154 0.14
155 0.15
156 0.13
157 0.12
158 0.1
159 0.09
160 0.09
161 0.08
162 0.08
163 0.06
164 0.05
165 0.05
166 0.05
167 0.05
168 0.05
169 0.05
170 0.04
171 0.05
172 0.05
173 0.05
174 0.05
175 0.05
176 0.06
177 0.07
178 0.09
179 0.08
180 0.08
181 0.1
182 0.1
183 0.11
184 0.13
185 0.11
186 0.1
187 0.12
188 0.13
189 0.1
190 0.1
191 0.09
192 0.07
193 0.07
194 0.07
195 0.05
196 0.04
197 0.04
198 0.04
199 0.04
200 0.04
201 0.03
202 0.03
203 0.03
204 0.03
205 0.03
206 0.03
207 0.03
208 0.02
209 0.03
210 0.03
211 0.03
212 0.04
213 0.05
214 0.05
215 0.06
216 0.08
217 0.08
218 0.08
219 0.09
220 0.09
221 0.09
222 0.1
223 0.09
224 0.08
225 0.08
226 0.08
227 0.08
228 0.08
229 0.07
230 0.09
231 0.1
232 0.1
233 0.09
234 0.1
235 0.1
236 0.1
237 0.1
238 0.08
239 0.08
240 0.08
241 0.08
242 0.09
243 0.11
244 0.13
245 0.14
246 0.14
247 0.17
248 0.19
249 0.2
250 0.19
251 0.2
252 0.22
253 0.21
254 0.21
255 0.17
256 0.15
257 0.13
258 0.13
259 0.11
260 0.06
261 0.08
262 0.08
263 0.13
264 0.15
265 0.17
266 0.19
267 0.21
268 0.24
269 0.25
270 0.26
271 0.23
272 0.24
273 0.26
274 0.24
275 0.22
276 0.2
277 0.18
278 0.17
279 0.16
280 0.12
281 0.1
282 0.11
283 0.11
284 0.1
285 0.12
286 0.13
287 0.13
288 0.13
289 0.2
290 0.27
291 0.32
292 0.36
293 0.39
294 0.37
295 0.39
296 0.44
297 0.41
298 0.41
299 0.41
300 0.4
301 0.41
302 0.41
303 0.4
304 0.39
305 0.34
306 0.28
307 0.25
308 0.22
309 0.17
310 0.18
311 0.17
312 0.13
313 0.12
314 0.11
315 0.13
316 0.15
317 0.14
318 0.14
319 0.14
320 0.16
321 0.16
322 0.23
323 0.23
324 0.22
325 0.24
326 0.32
327 0.35
328 0.4
329 0.48
330 0.41
331 0.45
332 0.46
333 0.45
334 0.38
335 0.38
336 0.33
337 0.29
338 0.3
339 0.26
340 0.24
341 0.24
342 0.23
343 0.21
344 0.2
345 0.16
346 0.15
347 0.13
348 0.16
349 0.23
350 0.25
351 0.27
352 0.28
353 0.3
354 0.3
355 0.3
356 0.27
357 0.19
358 0.18
359 0.15
360 0.15
361 0.14
362 0.15
363 0.15
364 0.18
365 0.18
366 0.17
367 0.17
368 0.14
369 0.19
370 0.26
371 0.28
372 0.29
373 0.31
374 0.32
375 0.33