Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

B0CXQ5

Protein Details
Accession B0CXQ5    Localization Confidence Medium Confidence Score 12.3
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
427-448AQRKAGKSRKSNIKDPNAPKKPHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
425-447RAAQRKAGKSRKSNIKDPNAPKK
Subcellular Location(s) nucl 16.5, cyto_nucl 11, mito 6, cyto 4.5
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR009071  HMG_box_dom  
IPR036910  HMG_box_dom_sf  
Gene Ontology GO:0005634  C:nucleus  
GO:0003677  F:DNA binding  
KEGG lbc:LACBIDRAFT_311571  -  
Pfam View protein in Pfam  
PF00505  HMG_box  
PF09011  HMG_box_2  
PROSITE View protein in PROSITE  
PS50118  HMG_BOX_2  
Amino Acid Sequences MTSGSRFRVTESTFKLRDRQNPFFASSMPSPSIIPRYFSPTRDSSSFDHYSSPDSDQMIFGPIDLEDVPPYQQWDPYTDLDADPKPAYNFTPIIPMTNYEYGPQLSPTDSHSSSFYSTDGIKSPEDSSLYLSHWINDPELPPSSPIPIPSPSDTQPSSSSSFVAYGEHVHFSADGTFSPASFAALHPLPGSMSPSSSFEDLRPSRNIVDSVSPRDTALHTPSWASQLWESVPSSLRSPSHVRPSVRHSPMTDGTTVRQRTISLRRGSLSAGQIFQSSSAPAMTDPHASSMNRSYSRRSESASVADDRDATVRRKKRSPPTEDIPVTEKPSDSTLKSVLRPPKLAPSAWQLYFTDWIQRQQASGTRKLNVAQAAKEAGQEYACLSAAEKEPYKRRSQAAKEARERELNAYMRTLTPDDIKRENAFRAAQRKAGKSRKSNIKDPNAPKKPLSAYFMFLQRIRANPQLVREIFGEETETTKQSVLAAAKWRSMTDGERQPFLAQAEQEKMEYEAARRLYEEGTTGFNSSINFSILPGSPAFPTVKIESESDENDELTWSHGEQDPNR
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.59
3 0.58
4 0.64
5 0.64
6 0.65
7 0.64
8 0.63
9 0.64
10 0.57
11 0.51
12 0.48
13 0.41
14 0.38
15 0.31
16 0.28
17 0.26
18 0.28
19 0.35
20 0.3
21 0.3
22 0.27
23 0.34
24 0.38
25 0.39
26 0.42
27 0.38
28 0.43
29 0.41
30 0.43
31 0.38
32 0.42
33 0.43
34 0.38
35 0.37
36 0.32
37 0.34
38 0.32
39 0.32
40 0.27
41 0.26
42 0.25
43 0.22
44 0.22
45 0.21
46 0.18
47 0.15
48 0.12
49 0.1
50 0.11
51 0.11
52 0.11
53 0.09
54 0.1
55 0.11
56 0.12
57 0.15
58 0.15
59 0.17
60 0.17
61 0.2
62 0.24
63 0.24
64 0.26
65 0.24
66 0.24
67 0.26
68 0.26
69 0.26
70 0.22
71 0.23
72 0.21
73 0.21
74 0.22
75 0.21
76 0.22
77 0.18
78 0.25
79 0.23
80 0.25
81 0.24
82 0.24
83 0.25
84 0.27
85 0.27
86 0.2
87 0.22
88 0.2
89 0.2
90 0.2
91 0.16
92 0.13
93 0.14
94 0.17
95 0.22
96 0.21
97 0.21
98 0.21
99 0.22
100 0.23
101 0.23
102 0.19
103 0.15
104 0.15
105 0.16
106 0.17
107 0.17
108 0.16
109 0.17
110 0.18
111 0.19
112 0.19
113 0.18
114 0.18
115 0.18
116 0.19
117 0.21
118 0.2
119 0.18
120 0.2
121 0.2
122 0.18
123 0.18
124 0.17
125 0.16
126 0.18
127 0.17
128 0.16
129 0.16
130 0.19
131 0.18
132 0.19
133 0.19
134 0.2
135 0.23
136 0.24
137 0.27
138 0.26
139 0.3
140 0.29
141 0.29
142 0.28
143 0.28
144 0.27
145 0.24
146 0.22
147 0.18
148 0.18
149 0.15
150 0.14
151 0.11
152 0.11
153 0.12
154 0.13
155 0.12
156 0.11
157 0.11
158 0.11
159 0.11
160 0.09
161 0.07
162 0.1
163 0.1
164 0.09
165 0.1
166 0.1
167 0.09
168 0.09
169 0.09
170 0.1
171 0.11
172 0.11
173 0.1
174 0.11
175 0.1
176 0.1
177 0.12
178 0.08
179 0.09
180 0.1
181 0.12
182 0.13
183 0.14
184 0.15
185 0.12
186 0.21
187 0.22
188 0.25
189 0.25
190 0.25
191 0.25
192 0.27
193 0.27
194 0.19
195 0.24
196 0.23
197 0.27
198 0.26
199 0.25
200 0.24
201 0.24
202 0.24
203 0.2
204 0.21
205 0.17
206 0.15
207 0.16
208 0.17
209 0.18
210 0.17
211 0.15
212 0.12
213 0.12
214 0.12
215 0.13
216 0.13
217 0.12
218 0.13
219 0.13
220 0.14
221 0.15
222 0.15
223 0.16
224 0.21
225 0.24
226 0.32
227 0.37
228 0.37
229 0.38
230 0.46
231 0.52
232 0.5
233 0.47
234 0.39
235 0.38
236 0.4
237 0.38
238 0.32
239 0.23
240 0.21
241 0.27
242 0.26
243 0.22
244 0.19
245 0.18
246 0.22
247 0.29
248 0.35
249 0.31
250 0.32
251 0.32
252 0.32
253 0.33
254 0.31
255 0.25
256 0.19
257 0.16
258 0.15
259 0.15
260 0.14
261 0.13
262 0.1
263 0.07
264 0.06
265 0.05
266 0.05
267 0.05
268 0.07
269 0.07
270 0.09
271 0.09
272 0.1
273 0.12
274 0.12
275 0.13
276 0.16
277 0.21
278 0.22
279 0.23
280 0.25
281 0.28
282 0.33
283 0.33
284 0.31
285 0.28
286 0.27
287 0.29
288 0.28
289 0.24
290 0.2
291 0.19
292 0.17
293 0.14
294 0.14
295 0.14
296 0.15
297 0.22
298 0.28
299 0.32
300 0.39
301 0.47
302 0.56
303 0.63
304 0.68
305 0.68
306 0.67
307 0.72
308 0.66
309 0.59
310 0.53
311 0.45
312 0.39
313 0.32
314 0.26
315 0.17
316 0.2
317 0.2
318 0.16
319 0.17
320 0.18
321 0.2
322 0.22
323 0.28
324 0.32
325 0.33
326 0.34
327 0.33
328 0.38
329 0.37
330 0.36
331 0.32
332 0.32
333 0.34
334 0.32
335 0.33
336 0.25
337 0.23
338 0.26
339 0.23
340 0.23
341 0.19
342 0.21
343 0.22
344 0.21
345 0.2
346 0.2
347 0.26
348 0.24
349 0.3
350 0.3
351 0.3
352 0.31
353 0.32
354 0.33
355 0.32
356 0.3
357 0.23
358 0.22
359 0.22
360 0.21
361 0.21
362 0.18
363 0.13
364 0.11
365 0.1
366 0.09
367 0.08
368 0.08
369 0.07
370 0.07
371 0.1
372 0.12
373 0.15
374 0.18
375 0.22
376 0.3
377 0.34
378 0.39
379 0.41
380 0.45
381 0.51
382 0.56
383 0.61
384 0.63
385 0.69
386 0.72
387 0.72
388 0.7
389 0.64
390 0.59
391 0.52
392 0.49
393 0.43
394 0.35
395 0.31
396 0.29
397 0.25
398 0.26
399 0.23
400 0.17
401 0.2
402 0.23
403 0.26
404 0.28
405 0.31
406 0.32
407 0.34
408 0.34
409 0.32
410 0.32
411 0.33
412 0.38
413 0.37
414 0.41
415 0.43
416 0.49
417 0.54
418 0.6
419 0.63
420 0.64
421 0.71
422 0.75
423 0.76
424 0.78
425 0.78
426 0.79
427 0.8
428 0.81
429 0.83
430 0.8
431 0.77
432 0.69
433 0.65
434 0.61
435 0.55
436 0.51
437 0.42
438 0.37
439 0.37
440 0.41
441 0.38
442 0.33
443 0.34
444 0.31
445 0.32
446 0.34
447 0.36
448 0.35
449 0.35
450 0.38
451 0.41
452 0.39
453 0.39
454 0.34
455 0.31
456 0.27
457 0.25
458 0.24
459 0.15
460 0.18
461 0.17
462 0.17
463 0.15
464 0.15
465 0.15
466 0.13
467 0.17
468 0.16
469 0.18
470 0.26
471 0.27
472 0.3
473 0.31
474 0.3
475 0.28
476 0.29
477 0.28
478 0.28
479 0.36
480 0.35
481 0.36
482 0.37
483 0.35
484 0.35
485 0.34
486 0.29
487 0.21
488 0.23
489 0.26
490 0.26
491 0.25
492 0.23
493 0.23
494 0.22
495 0.21
496 0.19
497 0.21
498 0.22
499 0.23
500 0.23
501 0.23
502 0.21
503 0.21
504 0.21
505 0.16
506 0.18
507 0.18
508 0.19
509 0.17
510 0.17
511 0.17
512 0.17
513 0.17
514 0.15
515 0.14
516 0.13
517 0.16
518 0.15
519 0.17
520 0.15
521 0.15
522 0.14
523 0.17
524 0.18
525 0.16
526 0.2
527 0.2
528 0.23
529 0.24
530 0.24
531 0.26
532 0.29
533 0.3
534 0.3
535 0.28
536 0.25
537 0.23
538 0.23
539 0.19
540 0.17
541 0.17
542 0.12
543 0.14
544 0.18