FuNGI

B0CRQ3

Protein Details

Accession

B0CRQ3

Localization Confidence

High

Confidence Score

18.8

NoLS Segment(s)

Position	Sequence	Protein Nature
499-548	KEDKKARKTAVKAERQTRRAEKKTTKVQFGAEVKDQMKRIVNKEKRLKKL	Hydrophilic

NLS Segment(s)

Position	Sequence
491-525	IARPRNEDKEDKKARKTAVKAERQTRRAEKKTTKV
532-548	KDQMKRIVNKEKRLKKL

Subcellular Location(s)

nucl 22, mito 3

Family & Domain DBs

InterPro	View protein in InterPro IPR007307 Ltv1
Gene Ontology	GO:0042274 P:ribosomal small subunit biogenesis
KEGG	lbc:LACBIDRAFT_301251 -
Pfam	View protein in Pfam PF04180 LTV

Amino Acid Sequences

MPQKSIFRQPGAKHFQLVHRSQRDPLINDPDASKHVLKEFERENTKKGKSRADLEALLDSSEIADQRRNIGEAASYGVYYDDTEYDYMQHLRQVGIQEDGVESMLIEAPATLSKKSQARTKRHDGIELIDLPEGVLASTSELPRTYESQQAIPESIAGFQPDMDPHLRQVLEALEDDAFVDDGLKDDFFGELIADGARGSDEAFDFEFEEDHEGAVDKEEEGNDESTWEGRFAKFKQDHRNEAQSDDGYDSEGQDTIGKLPETSVIGGKRRKRTSDASGYSMSSSSMFRNEALQTLDERFDQMILKQYNEDNDNEEDLSDEDPDTDEAPELITSREDFDSMVKEFLNDFEILGRKMRPKLEGESGVDKLDSLRRAMGRDERVRVEDDDKEENYDDLLLSEDEDKKDRWDCETILTTYSNLENHPRLIRARDQKPVPKVLLDRKTGFPVLAPTKSLENKSTERRVSLRSSSGTEGSDESDSESLTNGHRRTIARPRNEDKEDKKARKTAVKAERQTRRAEKKTTKVQFGAEVKDQMKRIVNKEKRLKKL

FASTA Sequence
with NoLS information

AlphaFold Structure
with highlighted NoLS

NoLS Predictions per Residue

Residue Number	Score
1	0.56
2	0.58
3	0.59
4	0.61
5	0.61
6	0.6
7	0.6
8	0.59
9	0.63
10	0.61
11	0.56
12	0.56
13	0.55
14	0.49
15	0.48
16	0.46
17	0.41
18	0.36
19	0.38
20	0.32
21	0.25
22	0.27
23	0.33
24	0.32
25	0.37
26	0.4
27	0.44
28	0.52
29	0.52
30	0.54
31	0.56
32	0.63
33	0.64
34	0.64
35	0.65
36	0.62
37	0.65
38	0.67
39	0.64
40	0.58
41	0.53
42	0.51
43	0.42
44	0.35
45	0.29
46	0.21
47	0.15
48	0.14
49	0.12
50	0.09
51	0.13
52	0.13
53	0.18
54	0.2
55	0.21
56	0.19
57	0.19
58	0.19
59	0.16
60	0.18
61	0.14
62	0.12
63	0.11
64	0.11
65	0.11
66	0.1
67	0.11
68	0.08
69	0.09
70	0.1
71	0.1
72	0.11
73	0.13
74	0.15
75	0.14
76	0.16
77	0.15
78	0.15
79	0.18
80	0.2
81	0.19
82	0.19
83	0.18
84	0.16
85	0.16
86	0.15
87	0.13
88	0.09
89	0.08
90	0.06
91	0.07
92	0.06
93	0.06
94	0.05
95	0.05
96	0.09
97	0.1
98	0.1
99	0.1
100	0.16
101	0.21
102	0.25
103	0.33
104	0.39
105	0.48
106	0.57
107	0.66
108	0.69
109	0.67
110	0.68
111	0.61
112	0.55
113	0.51
114	0.44
115	0.35
116	0.26
117	0.23
118	0.18
119	0.17
120	0.13
121	0.07
122	0.05
123	0.04
124	0.06
125	0.08
126	0.09
127	0.1
128	0.1
129	0.12
130	0.14
131	0.18
132	0.18
133	0.21
134	0.23
135	0.25
136	0.26
137	0.26
138	0.25
139	0.21
140	0.2
141	0.14
142	0.13
143	0.11
144	0.1
145	0.08
146	0.07
147	0.09
148	0.08
149	0.11
150	0.12
151	0.12
152	0.12
153	0.16
154	0.16
155	0.15
156	0.16
157	0.14
158	0.13
159	0.13
160	0.13
161	0.09
162	0.09
163	0.09
164	0.08
165	0.07
166	0.05
167	0.05
168	0.04
169	0.05
170	0.05
171	0.05
172	0.05
173	0.05
174	0.05
175	0.05
176	0.05
177	0.04
178	0.04
179	0.04
180	0.04
181	0.04
182	0.04
183	0.04
184	0.03
185	0.03
186	0.04
187	0.04
188	0.04
189	0.06
190	0.06
191	0.07
192	0.07
193	0.07
194	0.07
195	0.07
196	0.09
197	0.08
198	0.08
199	0.08
200	0.07
201	0.07
202	0.08
203	0.08
204	0.05
205	0.06
206	0.06
207	0.07
208	0.08
209	0.09
210	0.08
211	0.08
212	0.08
213	0.09
214	0.09
215	0.09
216	0.08
217	0.08
218	0.12
219	0.13
220	0.23
221	0.28
222	0.35
223	0.44
224	0.5
225	0.56
226	0.57
227	0.64
228	0.55
229	0.5
230	0.46
231	0.35
232	0.29
233	0.23
234	0.18
235	0.12
236	0.11
237	0.1
238	0.08
239	0.07
240	0.07
241	0.06
242	0.07
243	0.06
244	0.08
245	0.08
246	0.07
247	0.08
248	0.09
249	0.09
250	0.09
251	0.11
252	0.11
253	0.17
254	0.23
255	0.29
256	0.36
257	0.39
258	0.41
259	0.43
260	0.46
261	0.49
262	0.54
263	0.51
264	0.46
265	0.44
266	0.41
267	0.37
268	0.31
269	0.23
270	0.14
271	0.12
272	0.08
273	0.09
274	0.09
275	0.09
276	0.11
277	0.11
278	0.12
279	0.12
280	0.12
281	0.12
282	0.13
283	0.13
284	0.11
285	0.11
286	0.1
287	0.09
288	0.09
289	0.08
290	0.15
291	0.15
292	0.15
293	0.16
294	0.17
295	0.19
296	0.2
297	0.2
298	0.15
299	0.16
300	0.16
301	0.15
302	0.14
303	0.12
304	0.1
305	0.1
306	0.08
307	0.06
308	0.06
309	0.06
310	0.07
311	0.07
312	0.06
313	0.06
314	0.05
315	0.06
316	0.06
317	0.06
318	0.06
319	0.06
320	0.06
321	0.08
322	0.08
323	0.08
324	0.08
325	0.09
326	0.11
327	0.12
328	0.12
329	0.1
330	0.1
331	0.1
332	0.11
333	0.12
334	0.09
335	0.08
336	0.1
337	0.12
338	0.12
339	0.14
340	0.15
341	0.17
342	0.21
343	0.24
344	0.24
345	0.26
346	0.3
347	0.35
348	0.37
349	0.36
350	0.36
351	0.35
352	0.32
353	0.28
354	0.24
355	0.19
356	0.19
357	0.16
358	0.13
359	0.16
360	0.17
361	0.18
362	0.22
363	0.28
364	0.32
365	0.37
366	0.4
367	0.38
368	0.39
369	0.4
370	0.39
371	0.35
372	0.3
373	0.29
374	0.29
375	0.27
376	0.28
377	0.26
378	0.23
379	0.2
380	0.17
381	0.13
382	0.08
383	0.09
384	0.07
385	0.07
386	0.1
387	0.13
388	0.14
389	0.16
390	0.16
391	0.19
392	0.24
393	0.24
394	0.25
395	0.26
396	0.26
397	0.29
398	0.33
399	0.3
400	0.28
401	0.27
402	0.23
403	0.21
404	0.22
405	0.17
406	0.14
407	0.18
408	0.18
409	0.21
410	0.23
411	0.24
412	0.25
413	0.29
414	0.37
415	0.41
416	0.45
417	0.5
418	0.55
419	0.6
420	0.64
421	0.66
422	0.59
423	0.54
424	0.56
425	0.57
426	0.57
427	0.55
428	0.53
429	0.49
430	0.52
431	0.47
432	0.4
433	0.32
434	0.32
435	0.31
436	0.29
437	0.28
438	0.25
439	0.3
440	0.34
441	0.36
442	0.32
443	0.32
444	0.37
445	0.44
446	0.52
447	0.48
448	0.49
449	0.49
450	0.51
451	0.52
452	0.51
453	0.48
454	0.42
455	0.43
456	0.42
457	0.4
458	0.36
459	0.3
460	0.26
461	0.23
462	0.2
463	0.17
464	0.15
465	0.14
466	0.13
467	0.12
468	0.12
469	0.1
470	0.14
471	0.21
472	0.2
473	0.22
474	0.27
475	0.29
476	0.36
477	0.46
478	0.51
479	0.53
480	0.62
481	0.67
482	0.71
483	0.76
484	0.78
485	0.73
486	0.75
487	0.77
488	0.75
489	0.76
490	0.74
491	0.75
492	0.74
493	0.74
494	0.74
495	0.73
496	0.76
497	0.77
498	0.8
499	0.82
500	0.77
501	0.8
502	0.8
503	0.8
504	0.78
505	0.79
506	0.79
507	0.79
508	0.86
509	0.85
510	0.82
511	0.75
512	0.7
513	0.69
514	0.64
515	0.6
516	0.54
517	0.52
518	0.46
519	0.48
520	0.46
521	0.42
522	0.46
523	0.46
524	0.49
525	0.54
526	0.61
527	0.66
528	0.75

B0CRQ3

3D AlphaFold-predicted Structure Viewer