Nucleolar Localized Proteins

Nucleolar localized proteins available in the database.

M2RTD6

Protein Details
Accession M2RTD6    Localization Confidence Low Confidence Score 8.6
NoLS Segment(s)
PositionSequenceProtein Nature
422-451NKEPDQTKSNLKKGKAKKKVAFQSDRPDLYHydrophilic
NLS Segment(s)
PositionSequence
433-440KKGKAKKK
Subcellular Location(s) mito 21.5, cyto_mito 12, nucl 2
Family & Domain DBs
InterPro View protein in InterPro  
IPR008728  Elongator_complex_protein_4  
IPR027417  P-loop_NTPase  
Gene Ontology GO:0005737  C:cytoplasm  
GO:0033588  C:elongator holoenzyme complex  
GO:0005634  C:nucleus  
GO:0002098  P:tRNA wobble uridine modification  
Pfam View protein in Pfam  
PF05625  PAXNEB  
CDD cd19494  Elp4  
Amino Acid Sequences MSSFKRKATTQASPLSGGTRVSPGSTSTAITSTGIPSFDDILGGGLPLSCSLVVLAPDAHSAYGELVQKYFVAQGMASGQRVCVIDDHAKDFLAECMWMPASTPGPSAAPDEDEDKTKDEEDTRIKIAWRYEQMKQFKTTVAASPQSTEDYCRVFDLTNRMPETVLNDARKHKQLLELDVSGDSGRNAPHKLLEQLAHILANDAKHNANPLPLRICVPSLGSFQWGDVDAHVICQFLHGLRRLLRRFPHACASVSLPPHMCLDSWGGPGWIQKLGWLSDASISLSAFTADPSLSSMFSSHHGFVHIHALPSPHTLLPPSDRFSTLRGLSSSGENNLAFKCMRKRFVIETLHLDLEGGIGERRTTPATNTLVPASAARTHEAAPHHEHGGHDHPQSLKGNAAVEVRIEQLGGSVKAMILSEENKEPDQTKSNLKKGKAKKKVAFQSDRPDLYDF
FASTA Sequence
with NoLS information
AlphaFold Structure
with highlighted NoLS
NoLS Predictions per Residue
Residue Number Score
1 0.54
2 0.47
3 0.4
4 0.32
5 0.25
6 0.21
7 0.18
8 0.17
9 0.17
10 0.17
11 0.19
12 0.2
13 0.19
14 0.17
15 0.18
16 0.18
17 0.18
18 0.17
19 0.15
20 0.16
21 0.15
22 0.14
23 0.14
24 0.16
25 0.14
26 0.13
27 0.11
28 0.1
29 0.1
30 0.09
31 0.08
32 0.05
33 0.06
34 0.06
35 0.07
36 0.05
37 0.05
38 0.06
39 0.07
40 0.07
41 0.09
42 0.09
43 0.09
44 0.1
45 0.11
46 0.1
47 0.09
48 0.09
49 0.09
50 0.13
51 0.16
52 0.16
53 0.15
54 0.16
55 0.16
56 0.16
57 0.16
58 0.12
59 0.09
60 0.08
61 0.09
62 0.13
63 0.15
64 0.15
65 0.14
66 0.13
67 0.16
68 0.17
69 0.16
70 0.12
71 0.15
72 0.21
73 0.23
74 0.26
75 0.23
76 0.23
77 0.22
78 0.22
79 0.18
80 0.13
81 0.11
82 0.08
83 0.1
84 0.1
85 0.1
86 0.1
87 0.11
88 0.13
89 0.13
90 0.14
91 0.12
92 0.12
93 0.14
94 0.15
95 0.13
96 0.13
97 0.13
98 0.16
99 0.16
100 0.18
101 0.19
102 0.19
103 0.19
104 0.18
105 0.19
106 0.18
107 0.23
108 0.26
109 0.28
110 0.28
111 0.29
112 0.29
113 0.31
114 0.32
115 0.32
116 0.34
117 0.35
118 0.39
119 0.46
120 0.51
121 0.52
122 0.52
123 0.47
124 0.41
125 0.39
126 0.35
127 0.3
128 0.28
129 0.27
130 0.25
131 0.24
132 0.24
133 0.23
134 0.22
135 0.2
136 0.17
137 0.16
138 0.16
139 0.15
140 0.15
141 0.13
142 0.16
143 0.21
144 0.23
145 0.28
146 0.28
147 0.28
148 0.27
149 0.27
150 0.28
151 0.26
152 0.27
153 0.24
154 0.26
155 0.3
156 0.35
157 0.38
158 0.36
159 0.31
160 0.33
161 0.32
162 0.34
163 0.34
164 0.3
165 0.27
166 0.26
167 0.25
168 0.18
169 0.15
170 0.1
171 0.07
172 0.07
173 0.09
174 0.1
175 0.1
176 0.12
177 0.13
178 0.14
179 0.16
180 0.16
181 0.14
182 0.15
183 0.15
184 0.13
185 0.11
186 0.11
187 0.1
188 0.09
189 0.09
190 0.09
191 0.09
192 0.08
193 0.11
194 0.1
195 0.13
196 0.13
197 0.15
198 0.16
199 0.16
200 0.17
201 0.16
202 0.16
203 0.13
204 0.13
205 0.13
206 0.13
207 0.12
208 0.12
209 0.11
210 0.11
211 0.11
212 0.1
213 0.09
214 0.07
215 0.08
216 0.06
217 0.07
218 0.07
219 0.07
220 0.06
221 0.06
222 0.06
223 0.05
224 0.08
225 0.09
226 0.12
227 0.16
228 0.24
229 0.26
230 0.3
231 0.32
232 0.37
233 0.38
234 0.39
235 0.41
236 0.36
237 0.35
238 0.32
239 0.33
240 0.29
241 0.27
242 0.26
243 0.2
244 0.18
245 0.18
246 0.17
247 0.13
248 0.1
249 0.13
250 0.14
251 0.14
252 0.13
253 0.12
254 0.13
255 0.14
256 0.14
257 0.11
258 0.09
259 0.09
260 0.11
261 0.12
262 0.12
263 0.11
264 0.11
265 0.11
266 0.11
267 0.1
268 0.09
269 0.08
270 0.07
271 0.07
272 0.07
273 0.06
274 0.05
275 0.06
276 0.05
277 0.05
278 0.07
279 0.07
280 0.07
281 0.07
282 0.08
283 0.08
284 0.11
285 0.13
286 0.13
287 0.12
288 0.14
289 0.14
290 0.14
291 0.2
292 0.19
293 0.17
294 0.17
295 0.17
296 0.17
297 0.19
298 0.2
299 0.13
300 0.12
301 0.13
302 0.14
303 0.19
304 0.22
305 0.23
306 0.23
307 0.25
308 0.25
309 0.26
310 0.3
311 0.26
312 0.25
313 0.22
314 0.22
315 0.21
316 0.24
317 0.23
318 0.18
319 0.2
320 0.17
321 0.18
322 0.16
323 0.17
324 0.14
325 0.17
326 0.25
327 0.29
328 0.33
329 0.34
330 0.39
331 0.42
332 0.51
333 0.52
334 0.46
335 0.46
336 0.46
337 0.43
338 0.38
339 0.33
340 0.23
341 0.18
342 0.14
343 0.09
344 0.06
345 0.06
346 0.06
347 0.07
348 0.09
349 0.12
350 0.12
351 0.14
352 0.2
353 0.24
354 0.26
355 0.27
356 0.26
357 0.24
358 0.24
359 0.22
360 0.18
361 0.18
362 0.18
363 0.18
364 0.18
365 0.18
366 0.22
367 0.24
368 0.26
369 0.28
370 0.29
371 0.3
372 0.3
373 0.29
374 0.3
375 0.34
376 0.35
377 0.3
378 0.31
379 0.3
380 0.34
381 0.36
382 0.32
383 0.28
384 0.24
385 0.24
386 0.23
387 0.24
388 0.19
389 0.18
390 0.18
391 0.17
392 0.15
393 0.13
394 0.1
395 0.11
396 0.14
397 0.13
398 0.13
399 0.11
400 0.11
401 0.12
402 0.13
403 0.11
404 0.1
405 0.12
406 0.15
407 0.19
408 0.22
409 0.22
410 0.25
411 0.26
412 0.28
413 0.33
414 0.33
415 0.4
416 0.46
417 0.55
418 0.59
419 0.64
420 0.69
421 0.74
422 0.81
423 0.81
424 0.82
425 0.81
426 0.84
427 0.89
428 0.89
429 0.88
430 0.85
431 0.85
432 0.83
433 0.77